余學高 鄧間開 何小洪 陳培松 崔丹荔 黃彬★
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是嚴重的公共衛(wèi)生問題。全球約有20億人曾感染過HBV,其中超過10%為慢性HBV感染者[1]。每年約有80萬人死于HBV感染所致的相關疾病[2]。HBV DNA定量檢測在早期診斷HBV感染、判斷疾病活動性、制定抗病毒治療方案、治療監(jiān)測以及判斷治療終點中均起到重要作用[3]。
近年來亞太肝病研究學會、歐洲肝病研究學會和我國發(fā)布的慢性乙型肝炎防治指南均推薦用高敏檢測方法檢測HBV DNA載量,前兩者發(fā)布的指南明確要求檢測方法的靈敏度應達到10~15 IU/mL[4-5]。而目前國內各單位常用的HBV DNA定量檢測方法的靈敏度在100~1 000 IU/mL之間,不能很好地滿足臨床對慢性乙肝患者管理的要求。因此,應采用高靈敏度的HBV DNA試劑對患者血清/血漿中的HBV DNA進行檢測,以滿足臨床對慢性乙肝治療監(jiān)測和判斷治療終點等的需要。Pre-NAT全自動核酸檢測系統(tǒng)采用磁珠法進行HBV核酸提取、純化,采用轉移磁珠、防倒吸、尿嘧啶N糖基化酶-脫氧尿嘧啶核苷三磷酸(uracil N glycosylase-deoxyuridine nucleoside triphosphate,UNG-dUTP)等有效防污染措施,結合HBV DNA高敏定量檢測試劑對血清/血漿中的HBV DNA進行定量檢測。本研究對基于Pre-NAT系統(tǒng)的HBV DNA高敏定量檢測試劑盒進行方法學性能驗證與臨床檢測性能評價。
定值高濃度HBV假病毒顆粒(7.5×1010IU/mL)由美國Perkin Elmer醫(yī)學診斷事業(yè)部上海浩源公司提供。
收集2018年5月至7月間在中山大學附屬第一醫(yī)院檢測的HBV DNA高值樣本和陰性樣本,用于制備高/中/低值混合血清。收集慢性乙型肝炎患者血清64份,涵蓋不同的病毒載量范圍。
Pre-NAT全自動核酸提取儀由美國Perkin Elmer公司提供,COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan 48病毒載量系統(tǒng)購自瑞士羅氏公司,ABI ViiA7型熒光定量PCR儀購自美國Life Technologies公司,低溫高速離心機購自德國Eppendorf公司;HBV DNA高敏檢測試劑盒由美國Perkin Elmer醫(yī)學診斷事業(yè)部上海浩源公司提供,其說明書聲明的靈敏度為 20 IU/mL,線性范圍為 20~(1.0×109)IU/mL;COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan HBV核酸檢測試劑盒購自瑞士羅氏公司,其說明書聲明的靈敏度為 20 IU/mL,線性范圍為 20~(1.7×108)IU/mL。
1.4.1 精密度評價
參考 EP15-A2[6]文件。每天重復檢測高(108IU/mL)、中(105IU/mL)、低(103IU/mL)3個水平的混合血清各5次、連續(xù)測5天,由公式①計算批內不精密度(within-run imprecision,sr),由公式②計算室內不精密度(within-laboratory imprecision,s1),并分別與由公式③、公式④計算得出的廠家聲明的批內標準偏差(performance claim repeatability standard deviation,σr)和廠家聲明的室內標準偏差(manufactur's claim of laboratory required standard deviation,σl)進行比較,若小于廠家提供的標準偏差,結果可以接受。若大于廠家提供的標準偏差,則進行統(tǒng)計學分析。Sr:批內不精密度;sl:室內不精密度;D:實驗天數(shù);n:實驗次數(shù);Sb:批間不精密度;x:總均值;σr:廠家聲明的批內標準偏差;σl:廠家聲明的室內標準偏差;CVr:廠家聲明的批內變異系數(shù);CVl:廠家聲明的室內變異系數(shù)。1.4.2 正確度評價
參考EP15-A2[6]文件。收集乙型肝炎患者血清20份,每天分別用高敏檢測試劑和COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan系統(tǒng)檢測,每天檢測5個樣本,連續(xù)測4天,由公式⑤計算偏倚標準差(standard deviation of bias,Sb),并與廠家聲明的偏倚進行比較。Sb:偏倚標準差;bi=試驗方法結果i-比較方法結果i;:平均偏倚;n:實驗次數(shù)。
1.4.3 分析測量范圍(analytical measurement range,AMR)評價
參考EP6-A[7]。將定值高濃度標準品(7.5×1010IU/mL)用HBV陰性血清作系列稀釋,稀釋后HBV DNA 濃度分別為 109、108、107、106、105、104、103、102、50、25、20、10、5、2.5 IU/mL,與陰性質控品一同重復檢測3次。采用平均斜率法進行線性評價。
1.4.4 臨床可報告范圍(clinical reportable range,CRR)評價
參考EP6-A[7]。選擇濃度在廠家說明書聲明的分析測量范圍內的高值標本5份,用陰性血清分別進行 1∶10、1∶20、1∶40、1∶80、1∶160、1∶320、1∶640稀釋并檢測,根據(jù)預期值和實測值計算稀釋回收率,回收率在90%~110%為合格,確定最大稀釋度。將定值高濃度標準品(7.5×1010IU/mL)系列稀釋為100、50、25、20、10、5 IU/mL并進行檢測,連續(xù)檢測6天,每天檢測1次,計算重復檢測變異系數(shù)(coefficient of variation,CV),得出功能靈敏度(即天間重復測量時變異系數(shù)為20%的檢測限)。結合功能靈敏度、分析測量范圍及最大稀釋度確定臨床可報告范圍。
1.4.5 最低檢測限評價
參考 EP17-A[8]。將定值高濃度標準品(7.5×1010IU/mL)用HBV陰性血清系列稀釋為100、50、25、20、10、5、2.5 IU/mL 并進行檢測,重復檢測6次,計算HBV DNA檢出率及與理論值的偏倚。
1.4.6 儀器間比對及相關性評價
參考EP9-A2[9]。選取臨床慢性乙肝患者血清樣本44份,樣本濃度盡量覆蓋試劑盒的線性檢測范圍,分別用高敏試劑和COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan系統(tǒng)檢測,分析2種方法的相關性。
采用Microsoft Excel 2010和MedCalc等軟件進行統(tǒng)計學分析。計算計量資料的均數(shù)、方差、標準差和CV,線性范圍采用平均斜率法,2種定量檢測結果比對采用Deming回歸分析相關性。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
批內精密度:高、中、低值標本的批內不精密度 sr分別為 0.069、0.085、0.059,均分別小于廠家聲明的標準差 σ(0.799、0.592、0.398)。室內精密度:高、中、低值標本的室內不精密度sl分別為0.083、0.138、0.117,均分別小于廠家聲明的標準差σ(0.799、0.592、0.398)。
采用高敏試劑和COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan檢測系統(tǒng)同時檢測20例患者標本,所得結果作偏倚圖(見圖1),可知2種檢測方法的結果一致,偏倚標準差(standard deviation of bias,Sb)為 0.25 lg值,小于廠家聲明的偏倚0.45 lg值。
圖1 高敏試劑和COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan檢測系統(tǒng)檢測結果的偏倚圖Figure 1 Bias diagram of the results of high sensitivity test kit and COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan Detection system
對各梯度濃度測量結果做平均斜率法以驗證分析測量范圍。計算各組測量結果的變異系數(shù)CV,與廠家聲明的精密度(10%)比較。以預期濃度lg值為X,測量濃度均值lg值為Y,做散點圖(圖2),為直線關系,然后作直線回歸?;貧w方程為y=1.027 7x-0.082,斜率b1=1.027 7,在0.97~1.03 之間,截距b0=0.082,r2=0.999 6。該方法在實驗所涉及的濃度范圍內25~(1.0×109)IU/mL成線性。
圖2 HBV DNA定量預期值和測量均值散點圖Figure 2 HBV DNA quantitative expected value and measured mean scattered plot
2.4.1 回收率及最大稀釋度
對3個標本的原血清和各稀釋度血清進行檢測后,計算稀釋回收率:稀釋回收率=(實測值/預期值)×100%,回收率在90%~110%為合格,得出最大稀釋度為1∶80。
2.4.2 功能靈敏度
對各濃度的樣本重復檢測6次,計算CV,10 IU/mL濃度組的CV為18.10%,小于20%,符合廠家聲明的功能靈敏度(20 IU/mL)。
2.4.3 臨床可報告范圍
臨床可報告范圍上限為分析測量范圍上限乘以最大稀釋度,結合上述實驗得到的功能靈敏度10 IU/mL,高敏試劑的臨床可報告范圍為10~(8.0×1010)IU/mL。
高敏試劑對 100、50、25、20、10、5 IU/mL 6個濃度水平樣本的檢出率均為100%,2.5 IU/mL濃度水平檢出率為66.67%,最低檢測限為5 IU/mL,符合廠家聲明的檢測下限(20 IU/mL)。
將44份慢性乙肝患者血清樣本同時用高敏試劑和COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan系統(tǒng)檢測,對測定結果做Deming回歸分析,回歸方程為y=0.987 6x+0.189 4,相關系數(shù)r=0.975 4(P<0.05),可知高敏試劑和 COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan檢測系統(tǒng)的相關性好,結果見圖3。
圖3 Deming線性回歸圖Figure 3 Deming linear regression diagram
HBV感染的病原學診斷方法目前主要有免疫學方法檢測HBV的血清學標志物和分子生物學方法檢測HBV核酸[10-11]。免疫學方法檢測病毒抗原或抗體僅提供HBV感染的間接證據(jù),其出現(xiàn)晚于HBV DNA的出現(xiàn),且在病毒感染的窗口期不能檢測到抗體,這在很大程度上限制了免疫學方法的應用[12]。采用分子生物學方法檢測HBV DNA,可為早期診斷HBV感染、判斷病毒復制程度、進行HBV基因分型及耐藥性檢測等提供更多的信息[13-16]。熒光定量PCR法定量檢測HBV DNA,能準確地反映HBV DNA的復制水平,在治療監(jiān)測、判斷治療終點等中有重要的應用價值[17-18]。最新國際和國內的乙型肝炎防治指南推薦使用高敏檢測方法檢測HBV DNA,以幫助判斷治療終點。如亞太肝病研究學會建議,對于應用核苷酸類藥物治療的HBeAg陽性者,當HBeAg發(fā)生血清學轉換,且HBV DNA至少12個月低于檢測水平(10~15 IU/mL)時,可考慮停藥[4-5]。我國藥物監(jiān)督管理局在2013年《乙型肝炎病毒DNA定量檢測試劑注冊申報資料技術指導原則》中將HBV DNA的最低檢測限定為不大于30 IU/mL[19]。高敏HBV DNA定量檢測在臨床中的作用越來越重要,未來將逐步取代傳統(tǒng)低敏試劑檢測[20]。
區(qū)別于傳統(tǒng)的手工提取核酸方法,Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)可自動進行核酸提取、擴增前PCR反應體系構建等全過程,所需的人工操作僅為樣本與試劑的準備和擺放。Pre-NAT系統(tǒng)分為4大模塊,包括樣本加載、試劑分裝、核酸提取和PCR體系構建等模塊。其采用獨家專利的聚乙烯醇磁珠,在低鹽環(huán)境下展現(xiàn)出對DNA的獨特吸附能力,對蛋白的結合非常弱,并且轉移磁珠的方法減少了液體或氣溶膠暴露而產(chǎn)生的污染,保證了核酸提取的得率、純度、安全性和穩(wěn)定性。另外,Pre-NAT系統(tǒng)還具有樣本通量大(96),滿通量處理時間較短(140 min)、樣本用量少和紫外燈防污染等特點,能夠很好地提高實驗效率和質量,節(jié)約勞動力,減少手工操作帶來的污染和誤差。
本研究主要參考CLSI的EP6-A、EP9-A2、EP15-A2和EP17-A等文件[6-9],對基于Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)的HBV DNA高敏定量檢測試劑盒進行性能驗證。本研究得到的數(shù)據(jù)顯示:高、中、低值標本的批內不精密度sr和室內不精密度sl均分別小于廠家聲明的標準差σ,表明精密度通過驗證,可以在臨床應用。實驗室對正確度的評價過程實際上就是偏倚計算的過程,根據(jù)檢測數(shù)據(jù)計算得出的偏倚小于廠家聲明的偏倚,表明該實驗方法得到的偏倚滿足要求,正確度通過驗證。本研究采用平均斜率法回歸分析進行分析測量范圍(AMR)的評價,根據(jù)統(tǒng)計結果得知預期值與測量值之間相關性較好,且在25~1.0×109IU/mL內成線性,與廠家聲明的線性范圍20~(1.0×109)IU/mL相較,AMR下限不符合廠家聲明,考慮可能是由高值標準品稀釋到相應低濃度水平引起的誤差,需要后續(xù)補充試驗進一步驗證。高敏試劑盒檢測低限為25 IU/mL,與羅氏COBAS系統(tǒng)檢測靈敏度(20 IU/mL)幾乎相當,比目前國內常用HBV定量試劑盒更靈敏,達到2013年國家食品藥品監(jiān)督管理總局技術評審中心提出的HBV DNA最低檢測限應小于30 IU/mL的要求[19]。本研究主要設計了兩方面實驗以驗證Pre-NAT系統(tǒng)的臨床可報告范圍(CRR),包括最大稀釋度的確定和功能靈敏度的驗證。最大稀釋度的確定主要通過計算回收率,依據(jù)結果可知1∶160稀釋度組的回收率已超過合格范圍,因此選擇1∶80作為最大稀釋度,其乘以AMR上限即為CRR上限。因此本實驗得到的功能靈敏度為10 IU/mL,低于廠家聲明的功能靈敏度20 IU/mL。由最低檢測限實驗結果可見,5 IU/mL濃度水平及以上的檢出率均為100%,符合廠家聲明的檢測下限(20 IU/mL)。方法學比對中選擇COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan 48病毒載量系統(tǒng)作為比較方法,選用Deming線性回歸分析法,使用統(tǒng)計軟件得出回歸方程為y=0.987 6x+0.189 4,r=0.975 4,(P<0.05),可知兩者相關性較好,說明2種方法的結果具有可比性。另外,本研究未涉及Pre-NAT系統(tǒng)及該試劑盒抗干擾能力的評價,期待后續(xù)實驗補充完善。
綜上所述,對基于Pre-NAT全自動核酸提取系統(tǒng)的HBV DNA高敏定量檢測試劑盒的精密度、正確度、分析測量范圍、臨床可報告范圍、最低檢測限及方法學比對等性能進行驗證,均表現(xiàn)良好,與廠家聲明基本一致,達到了應用于臨床的要求,也為分子生物學檢驗實現(xiàn)自動化作出了貢獻。