據中國知網發(fā)布的《中國學術期刊影響因子年報(自然科學與工程技術)》，《長江科學院院報》(以下簡稱《院報》)在該年報的2015版、2016版、2017版、2018版復合影響因子分別為：0.637，0.687，0.766，0.906；期刊綜合影響因子分別為：0.407，0.439，0.524，0.671；影響力指數(CI)學科(水利工程)排名分別為：第11名、第11名、第12名、第7名。2018版的影響因子及影響力指數較2017版的增長幅度明顯增大，復合影響因子和綜合影響因子分別提高了18%和28%、影響力指數排名提升了5名。在水利工程類70余種期刊影響力指數綜合排序中進入前10名。

中國學術期刊影響因子年報是由清華大學中國學術期刊(光盤版)電子雜志社有限公司、中國科學文獻計量評價研究中心編制出版。在國內權威的大型數據庫指標統(tǒng)計中，《院報》的影響因子和排名均有明顯提升。這表明《院報》在國內科技和學術期刊中的影響力和地位在不斷地提高，反映出《院報》在提升論文質量、擴大期刊社會影響力及期刊新媒體融合等方面所做的工作取得了較好的成效。