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        GABAARG2基因單核苷酸多態(tài)性與兒童癲癇易感性的關(guān)系

        2019-03-21 02:35:24尹明姬李香丹崔允美池永學(xué)李今子
        關(guān)鍵詞:全面性等位基因多態(tài)性

        尹明姬,李香丹,崔允美,池永學(xué),李今子

        (延邊大學(xué)附屬醫(yī)院 兒科,吉林 延邊 133002)

        癲癇是神經(jīng)系統(tǒng)常見(jiàn)疾病,其發(fā)病率與年齡有關(guān),<1歲發(fā)病率最高,其次為1~10歲。癲癇的發(fā)病類(lèi)型眾多,病因非常復(fù)雜,其發(fā)生、發(fā)展及易感的傾向性尚不十分明確[1]。相關(guān)研究顯示,全面性癲癇伴熱性驚厥疊加綜合征的形成可能與GABAARG2基因變異或表達(dá)下調(diào)有關(guān),而熱性驚厥的易感因素有可能是GABAARG2基因C588T單核苷酸多態(tài)性[2-3]。GABAARG2是γ2的編碼基因,包括9個(gè)外顯子和8個(gè)內(nèi)含子[4]。癲癇是一種存在遺傳傾向的疾病,但是目前國(guó)內(nèi)鮮有研究報(bào)道GABAARG2基因多態(tài)性與癲癇關(guān)系。因此,本研究首次通過(guò)分析我國(guó)北方兒童GABAARG2基因C588T多態(tài)性與癲癇的關(guān)系,為防治癲癇提供科學(xué)依據(jù)。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        選取2013年3月—2018年6月于延邊大學(xué)附屬醫(yī)院兒科門(mén)診和/或住院部收治的189例年齡≤12歲的癲癇患兒作為癲癇組。納入標(biāo)準(zhǔn):①符合國(guó)際抗癲癇聯(lián)盟(International League Against Epilepsy, ILAE)關(guān)于癲癇的診斷標(biāo)準(zhǔn)[5];②頭顱MRI檢查(型號(hào):1.5T Multiva,荷蘭皇家飛利浦電子公司)、神經(jīng)系統(tǒng)體格檢查、癲癇病史等臨床資料完整。排除標(biāo)準(zhǔn):①由顱腦外傷、腦出血及腫瘤等顱內(nèi)病變導(dǎo)致癲癇;②合并惡性腫瘤或其他肝腎、精神性嚴(yán)重疾病。根據(jù)ILAE關(guān)于癲癇發(fā)作分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn),將癲癇組患者分為全面性發(fā)作組和部分性發(fā)作組,分別為82和107例。選取同期于本院兒科門(mén)診治療的年齡≤12歲非癲癇兒童113例作為對(duì)照組,納入兒童均無(wú)癲癇病史、家族史及嚴(yán)重疾病。本研究符合相關(guān)倫理學(xué)標(biāo)準(zhǔn),所有兒童是我國(guó)北方地區(qū)的漢族人,本研究已獲得本院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)通過(guò),兒童家長(zhǎng)均已簽署知情同意書(shū)。

        1.2 基因組DNA提取

        抽取兒童靜脈血5 ml,置于EDTA抗凝管,提取外周血白細(xì)胞的基因組DNA(中國(guó)上海賽默飛世爾科技有限公司),于-20℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)

        依據(jù)GABAARG2基因C588T位點(diǎn)上下游序列進(jìn)行正反向引物的設(shè)計(jì),正向引物:5‘-GTGTTCAATC AGAATGTG-3’,反向引物:5‘-CAATCAGAAAG ACTGCG-3’,引物均由上海生工生物工程股份有限公司合成。采用25μl PCR反應(yīng)體系,反應(yīng)如下:95℃預(yù)變性2 min,95℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,共37個(gè)循環(huán)。所有經(jīng)過(guò)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后的PCR產(chǎn)物送深圳華大基因科技有限公司進(jìn)行基因測(cè)序。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        數(shù)據(jù)分析采用SPSS 21.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,比較用方差分析;計(jì)數(shù)資料以率(%)或構(gòu)成比表示,比較用χ2檢驗(yàn);對(duì)各組的基因型頻率和等位基因頻率分布進(jìn)行χ2檢驗(yàn),分析是否符合Hardy-Weinberg平衡,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 3組患者一般資料比較

        部分性發(fā)作組男性58例,女性49例;平均年齡(8.0±2.6)歲;平均病程(2.0±1.6)年。全面性發(fā)作組男性49例,女性33例;平均年齡(8.2±3.1)歲;平均病程(3.5+1.1)年。對(duì)照組男性61例,女性52例;平均年齡(7.8±3.4)歲。3組患者的性別、年齡比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。3組患者病程、24 h腦電圖中度以上異常比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),全面性發(fā)作組高于部分性發(fā)作組。見(jiàn)表1。

        2.2 GABAARG2基因C588T位點(diǎn)測(cè)序結(jié)果

        以兒童血液基因組DNA為模板,PCR特異性擴(kuò)增含有GABAARG2基因C588T位點(diǎn)的產(chǎn)物,PCR產(chǎn)物片段長(zhǎng)度為296 bp,并對(duì)各組的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。見(jiàn)附圖。

        2.3 3組患者C588T位點(diǎn)基因型頻率、等位基因頻率比較

        研究對(duì)象GABAARG2外顯子5的C588T多態(tài)位點(diǎn)基因型和等位基因頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。3組患者CC、CT和TT基因型頻率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);3組患者的等位基因C、T頻率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);部分性發(fā)作組與對(duì)照組CC、CT和TT基因型頻率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=13.602,P=0.001);部分性發(fā)作組與對(duì)照組等位基因C、T頻率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=15.724,P=0.000);全面性發(fā)作組與對(duì)照組CC、CT和TT基因型頻率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=12.517,P=0.002);全面性發(fā)作組與對(duì)照組等位基因C、T頻率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=14.536,P=0.000);全面性發(fā)作組與部分性發(fā)作組CC、CT和TT基因型頻率比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.011,P=0.995);全面性發(fā)作組與部分性發(fā)作組等位基因C、T頻率比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.012,P=0.912)。見(jiàn)表2。

        表1 3組患者一般資料比較

        附圖 GABAARG2基因C588T位點(diǎn)測(cè)序圖

        2.4 不同基因模型下C588T單核苷酸多態(tài)性與兒童癲癇的關(guān)系

        癲癇患者中,相比于CC基因型,CT基因型引發(fā)癲癇的風(fēng)險(xiǎn)是其2.127倍[(95%CI:1.232,3.615)P=0.000];而TT基因型引發(fā)癲癇風(fēng)險(xiǎn)則更是CC基因型的 3.926 倍 [(95%CI:2.019,7.512),P=0.000];對(duì)患者的等位基因進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),相比于T等位基因,攜帶C等位基因其癲癇患病風(fēng)險(xiǎn)提高至2.191倍[(95%CI:1.554,3.094),P=0.000],表明GABAARG2基因C588T多態(tài)性與癲癇的發(fā)生有關(guān)。

        表2 3組患者C588T位點(diǎn)基因型頻率、等位基因頻率比較 例(%)

        3 討論

        兒童和青少年是癲癇的高發(fā)人群,嚴(yán)重危害其身心健康和認(rèn)知功能[6]。據(jù)流行病學(xué)調(diào)查顯示,遺傳因素是癲癇發(fā)病的重要影響因素之一,一些基因位點(diǎn)的變化可能提高癲癇發(fā)作的風(fēng)險(xiǎn)[7-8]。GABAAR多態(tài)性在癲癇的用藥指導(dǎo)中起著重要作用,其由5個(gè)亞基組成的多肽大分子配體門(mén)控離子通道受體,由苯二氮卓類(lèi)藥物識(shí)別點(diǎn)、GABA識(shí)別點(diǎn)和氯離子門(mén)控通道組成,其亞基主要包括:α1、α2、α3、α4、α5、α6、β1、β2、β3、β4、γ1、γ2及γ3等[9]。

        動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),GABAAR亞基在抗癲癇藥物敏感的大鼠與耐藥組的大鼠中的表達(dá)存在差異,暗示GABAAR表達(dá)的變化可能與癲癇發(fā)生有關(guān)[10-11]。癲癇發(fā)作往往會(huì)改變GABAAR的轉(zhuǎn)運(yùn)及亞基表達(dá),這些表達(dá)變化與GABAAR亞基類(lèi)型及患者癲癇發(fā)生的狀態(tài)密切相關(guān)[12-13]。

        本研究對(duì)我國(guó)北方兒童人群中GABAARG2基因單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行分析,選取≤12歲的癲癇兒童189例,并選取同時(shí)期非癲癇患兒113例作為對(duì)照組,比較兩組的一般資料發(fā)現(xiàn),兩組的年齡、性別無(wú)差異;全面性發(fā)作組患兒的平均病程高于部分性發(fā)作組;并且全面性發(fā)作組患兒24 h腦電圖中度異常率高于部分性發(fā)作組;3組患者CC、CT和TT基因型頻率及等位基因C、T頻率有差異;部分性發(fā)作組、全面性發(fā)作組與對(duì)照組CC、CT和TT基因型頻率及等位基因C、T頻率有差異;而部分性發(fā)作組與全面性發(fā)作組CC、CT和TT基因型頻率及等位基因C、T頻率無(wú)差異;對(duì)各組患者基因型進(jìn)一步比較分析發(fā)現(xiàn),在患兒中相比于CC基因型,CT基因型引發(fā)癲癇風(fēng)險(xiǎn)是其2.127倍;而TT基因型引發(fā)癲癇風(fēng)險(xiǎn)則是CC基因型的3.926倍;對(duì)各組的等位基因進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),相比于T等位基因,攜帶C等位基因其癲癇患病風(fēng)險(xiǎn)提高至2.191倍,這暗示著GABAARG2 C588T多態(tài)性與癲癇的發(fā)生相關(guān),其中C等位基因是癲癇患病的高危因素,這與其他學(xué)者研究結(jié)果類(lèi)似[14-16]。

        綜上所述,在我國(guó)北方兒童中GABAARG2基因C588T多態(tài)性與癲癇易感性相關(guān),相比CC基因型,CT和TT基因型均能顯著提高患病風(fēng)險(xiǎn),為理解癲癇的遺傳性提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù),但GABAARG2基因C588T多態(tài)性的作用機(jī)制及與其他基因的相互作用還未十分清楚。

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