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        一株大蒜根際細(xì)菌特性研究及其對(duì)田間大蒜產(chǎn)量和土壤酶活性的影響

        2019-03-12 01:50:24尹彥舒張夢(mèng)琦陳云云馬蓮菊
        中國(guó)土壤與肥料 2019年1期
        關(guān)鍵詞:根腐病根際大蒜

        崔 曼,尹彥舒,張夢(mèng)琦,卜 寧,陳云云,高 淼*,馬蓮菊*

        (1.沈陽(yáng)師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,遼寧 沈陽(yáng) 110034;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)業(yè)微生物資源收集與保藏重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100081)

        植物根際促生細(xì)菌(PGPR)是定殖在植物根部周圍,具有促進(jìn)植物生長(zhǎng),增加植物產(chǎn)量,抵抗植物病害等功能的一類有益菌群[1-2]。大部分PGPR具有生物固氮、溶磷、產(chǎn)生植物激素和分泌抗生素等特性及生防作用或其中之一的某種特性[3]。根際環(huán)境中,植物與微生物形成的有益關(guān)系可使植物健康生長(zhǎng)并且維持土壤肥力[4]。近年來(lái)植物根際促生菌的篩選成為研究熱點(diǎn)[5]。到目前為止關(guān)于PGPR的報(bào)道遍布國(guó)內(nèi)外,其中包括常見的芽孢桿菌屬(Bacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、固氮菌屬(Azotobacter)、腸桿菌屬(Enterobacter)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)等[1-2,6-10]。大蒜是一種忌連作的蔬菜,作物連作是導(dǎo)致大蒜品質(zhì)和產(chǎn)量下降的主要因素。連作障礙產(chǎn)生的主要原因是由于土壤養(yǎng)分元素的不均衡、化感物質(zhì)積累、土壤微生態(tài)及微生物區(qū)系變化等方面導(dǎo)致的[11]。前人研究發(fā)現(xiàn),大蒜連作15~20年后,可導(dǎo)致土壤中酶活性降低,產(chǎn)生明顯的連作障礙現(xiàn)象[12]。連作障礙產(chǎn)生后,大蒜根腐病的發(fā)病情況也隨之增加[13]。本研究中的根際細(xì)菌為前期實(shí)驗(yàn)室人員在山東省金鄉(xiāng)縣大蒜田中收集的連作大蒜根際土壤,在連作土壤中分離獲得的根際細(xì)菌。篩選出對(duì)大蒜根腐病和其他植物上的病害病原菌具有拮抗作用的菌株進(jìn)行功能特性、田間增產(chǎn)及對(duì)土壤有改良作用的菌株,為更好的改善土壤,解決大蒜產(chǎn)量及病害等多重問(wèn)題發(fā)掘潛在菌株。

        1 材料與方法

        1.1 供試材料

        根際微生物:連作大蒜根部中分離純化的細(xì)菌。

        大蒜根腐病病原真菌:H5(Setophoma terrestris)為前期實(shí)驗(yàn)室人員在有根腐病的大蒜根部分離得到的大蒜病原真菌,H9(Fusarium solani)由中國(guó)農(nóng)業(yè)微生物菌株保藏中心提供。

        1.2 培養(yǎng)基

        對(duì)峙檢驗(yàn):PDA 培養(yǎng)基:馬鈴薯 200 g,葡萄糖 20 g,蒸餾水 1 L,瓊脂 15 ~ 20 g,pH 值 7.0。

        產(chǎn) HCN 能力檢驗(yàn):King’s B 培養(yǎng)基:MgSO4·7H2O 1.5 g,K2HPO41.5 g,甘油 10 mL[14],1.8% 瓊脂,蛋白胨 20 g,pH 值 7.2。

        產(chǎn)蛋白酶能力檢驗(yàn):蛋白酶檢測(cè)培養(yǎng)基[14]。

        溶解磷能力檢驗(yàn):溶解有機(jī)磷能力:有機(jī)磷卵黃培養(yǎng)基[14];溶解無(wú)機(jī)磷能力:無(wú)機(jī)磷培養(yǎng)基[14]。

        IAA能力測(cè)定:DF培養(yǎng)基[14]。

        ACC 能力測(cè)定:ADF 培養(yǎng)基[14]。

        固氮能力檢驗(yàn):無(wú)氮培養(yǎng)基[15]。

        1.3 測(cè)定菌株對(duì)病原真菌的拮抗能力

        采用兩點(diǎn)對(duì)峙法[16]。在PDA平板上,用直徑5 mm打孔器取大蒜根腐病病原真菌菌餅接于距離平板圓2 cm處的一點(diǎn)上,在同一直線距圓心等距反方向的另一點(diǎn)上滴加 2 μL待測(cè)菌液,每組設(shè)置3個(gè)重復(fù)。H9及處理置于28℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)7 d,H5及處理置于28℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)14 d,測(cè)定抑菌半徑,計(jì)算抑菌率。

        抑菌直徑和抑菌率計(jì)算公式:

        抑菌直徑=對(duì)照菌落直徑-處理菌落直徑

        抑菌率(%)=(對(duì)照菌落直徑-處理菌落直徑)/對(duì)照菌落直徑×100

        1.4 菌株16S rRNA基因序列測(cè)定

        1.4.1 菌株16S rDNA的PCR擴(kuò)增

        取單菌落,于裝有100 μL 無(wú)菌水的EP管中混勻,95℃水浴15 min后,于-20℃冰箱冷凍1 min,12 000 r/min 條件下離心 2 min,4℃冰箱保存,模板為上清液[14]。PCR 擴(kuò)增引物采用通用引物。擴(kuò)增后的樣品送往北京生工有限公司進(jìn)行測(cè)序,在EzTaxon數(shù)據(jù)庫(kù)上將獲得的序列進(jìn)行序列比對(duì)。

        1.4.2 菌株gyrB基因的PCR擴(kuò)增

        采用細(xì)菌DNA試劑盒方法提取菌株DNA,引物為:UP-1和UP-2r。反應(yīng)過(guò)程為:95℃ 5 min,94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 2 min,30 個(gè)循環(huán),72℃ 10 min。擴(kuò)增后的樣品處理同 1.4.1。

        1.5 菌株促生特性測(cè)定及方法

        1.5.1 溶解磷能力測(cè)定

        收集了2 μL的細(xì)菌懸浮液,然后將其接到有機(jī)磷和無(wú)機(jī)磷培養(yǎng)基中。Ca3(PO4)2作為無(wú)機(jī)磷源,新鮮蛋黃溶液作為有機(jī)磷源。每組3次重復(fù),放入培養(yǎng)箱28℃,14 d。是否有透明圈圍繞形成,來(lái)判定其是否具有溶解磷的能力。

        1.5.2 固氮能力測(cè)定

        挑取單菌落在無(wú)氮平板上劃線,28℃培養(yǎng),在第3 d時(shí)觀察平板上菌株生長(zhǎng)狀況,菌落可在無(wú)氮培養(yǎng)基中生長(zhǎng)表示其具有固氮能力。對(duì)有固氮能力的細(xì)菌進(jìn)行乙炔還原法測(cè)定固氮酶活性[17]。并對(duì)具有固氮酶活性的菌株進(jìn)行nifH基因的擴(kuò)增,反應(yīng)過(guò)程為:95℃ 1 min。58℃ 1 min,72℃ 1 min,共 35個(gè)循環(huán)。

        固 氮 酶 活 性[nmol/(mg·h),protein]=C2H4(nmol)/[菌體蛋白量(mg,protein)× 反應(yīng)時(shí)間(h)]。

        1.5.3 IAA能力測(cè)定

        IAA產(chǎn)生的能力用比色法測(cè)定[18]。在DF培養(yǎng)基中接種菌株生長(zhǎng)24 h后轉(zhuǎn)移到含有0.1% L色氨酸的DF培養(yǎng)基中。置于28℃培養(yǎng)箱中,7 d后,8 000 r/min 離心 10 min。

        懸浮液與Fe-H2SO4溶液(1∶2)混合,暗室放置45 min,通過(guò)測(cè)量450 nm處樣品吸光度和標(biāo)準(zhǔn)吸光度,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。

        1.5.4 ACC脫氨酶活性菌株的篩選

        參考 Glick[19]的方法,在 5 mL固氮液體培養(yǎng)基上接入菌種,28℃ 200 r/min條件下振蕩培養(yǎng)1 d,吸取0.1 mL懸浮液至5 mL的DF培養(yǎng)基中,同條件繼續(xù)培養(yǎng)1 d后,吸取0.1 mL懸浮液至5 mL的ADF培養(yǎng)基中,同條件繼續(xù)培養(yǎng)1~2 d。將可在ADF培養(yǎng)基中生長(zhǎng)的菌種再轉(zhuǎn)接一次,用不含ACC的ADF培養(yǎng)基為陰性對(duì)照。分別以不接菌的ADF和不含ACC的ADF培養(yǎng)基為對(duì)照,測(cè)定600 nm處菌液的吸光度值,確定ACC脫氨酶的陽(yáng)性菌株。

        1.5.5 產(chǎn)鐵載體能力檢測(cè)

        采用藍(lán)色定性檢測(cè)培養(yǎng)基對(duì)菌株產(chǎn)鐵載體能力進(jìn)行定性測(cè)定[20]。在CAS試驗(yàn)板上能產(chǎn)生橙色暈圈的菌株被鑒定為可產(chǎn)鐵載體的陽(yáng)性菌株。具有產(chǎn)鐵載體能力。

        1.6 田間接種

        在田間小區(qū)(每個(gè)小區(qū)6 m2)中設(shè)置2組試驗(yàn):第一組:施用DS7菌劑;第二組:不施用DS7菌劑的對(duì)照組。每塊小區(qū)前后間隔5 m,每組試驗(yàn)進(jìn)行3個(gè)平行重復(fù)。

        1.7 土壤樣品采集和酶活性測(cè)定

        用蛇形5點(diǎn)采樣法,在田間小區(qū)中采集5~20 cm土樣,用于土壤酶活性的測(cè)定。播種前在小區(qū)內(nèi)隨機(jī)取樣,采集大蒜根際土壤樣品。

        采用高錳酸鉀滴定法測(cè)定土壤過(guò)氧化氫酶活性;采用苯酚鈉-次氯酸鈉比色法測(cè)定脲酶活性;土壤蔗糖酶活性用3,5-二硝基水楊酸比色法測(cè)定[21]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 拮抗菌株的篩選

        供試根際細(xì)菌為前期在山東省金鄉(xiāng)縣大蒜田中采集的連作大蒜根際土壤中分離純化的細(xì)菌,在PDA培養(yǎng)基上進(jìn)行對(duì)峙實(shí)驗(yàn),經(jīng)兩點(diǎn)對(duì)峙實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)菌株DS7對(duì)兩種大蒜根腐病病原真菌均有拮抗效果,DS7對(duì)H5(Setophoma terrestris)抑制率達(dá)到 51.72%,對(duì) H9(Fusarium solani)抑制率達(dá)到42.31%(圖 1)。

        圖1 菌株DS7對(duì)大蒜根腐病病原真菌的拮抗能力

        2.2 菌株DS7的16S rRNA基因序列分析

        將菌株DS7基于16S rDNA獲得的基因序列和基于gyrB獲得的基因序列,分別與相近種屬的基因序列在EzTaxon數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行比對(duì)后,根據(jù)鄰近法則結(jié)合MEGA 7.0軟件建立系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,如圖2、圖3。結(jié)合其菌落形態(tài)確定菌株DS7為解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)[22]。

        圖2 基于16S rDNA基因序列構(gòu)建菌株DS7系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹

        圖3 基于gyrB基因序列構(gòu)建菌株DS7系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹

        2.3 菌株DS7的功能特性研究

        菌株DS7能在蛋白酶檢測(cè)平板上出現(xiàn)明顯透明水解圈,表明其具有蛋白水解能力;在 King’s B 培養(yǎng)基上,含菌株DS7的濾紙出現(xiàn)深黃色變化,說(shuō)明其具有產(chǎn)HCN能力;菌株DS7可以使CAS 藍(lán)色檢測(cè)液產(chǎn)生橘黃色透明圈,說(shuō)明其具有產(chǎn)鐵載體能力。DS7具有產(chǎn)鐵載體的能力;具有溶解有機(jī)磷和無(wú)機(jī)磷的能力;具有水解蛋白能力;有產(chǎn)IAA能力;不具有產(chǎn)生ACC脫氨酶的能力,結(jié)果如表1所示。菌株DS7在平板上的情況,如圖4所示。

        表1 菌株Bacillus sp. DS7的功能機(jī)制

        圖 4 菌株 Bacillus sp. DS7 的功能特性

        DS7可以在無(wú)氮培養(yǎng)基中培養(yǎng),其固氮酶活性為(0.41±0.09)nmol/(mg·h);菌株和陽(yáng)性對(duì)照固氮菌株的固氮酶nifH基因擴(kuò)增結(jié)果如圖5所示。從分子學(xué)角度上再一次確定菌株DS7為固氮菌,具有固氮能力。

        圖5 菌株 Bacillus sp. DS7固氮酶nifH基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果

        2.4 接種菌株DS7對(duì)田間大蒜產(chǎn)量的影響

        田間測(cè)產(chǎn)結(jié)果如表2,施用DS7菌劑后大蒜的產(chǎn)量比不施用任何產(chǎn)品的對(duì)照組的大蒜產(chǎn)量增加約15.42%。

        表2 田間測(cè)產(chǎn)結(jié)果

        2.5 接種菌株DS7對(duì)田間大蒜根際土壤酶活性的影響

        測(cè)量接種菌株DS7后土壤中的蔗糖酶活性、過(guò)氧化氫酶活性和脲酶活性3種指標(biāo)檢測(cè)土壤酶活性。接種DS7菌液后,土壤蔗糖酶活性相對(duì)于對(duì)照組提高12.95%,可見接種DS7菌液后土壤肥力有所提高并改善。過(guò)氧化氫酶活性并沒有提高,反而降低2.75%,土壤中微生物的生命活動(dòng)速度減慢,可能因?yàn)榻臃NDS7后會(huì)抑制土壤中其他微生物的活動(dòng)。接種DS7可加速氨的生成,與對(duì)照組相比增長(zhǎng)率為6.80%,結(jié)果見表3。

        表3 土壤酶活性結(jié)果

        3 結(jié)論與討論

        植物根際促生菌(PGPR)在植物生長(zhǎng)過(guò)程中對(duì)植物生長(zhǎng)來(lái)說(shuō)是一類有意義的菌群,PGPR在植物的根莖或根表面定殖,通過(guò)吸收礦物質(zhì)的方式來(lái)幫助植物快速生長(zhǎng)[23]。目前常用的根際微生物是具有生物防治功能的促生菌[24],例如:假單胞菌屬(pseudomonas)、芽孢桿菌屬(Bacillus)和農(nóng)桿菌屬(Agrobacterium),這些微生物大多具有防病促生功能,可以有效用于防治植物病害。部分PGPR在對(duì)植物促生時(shí)可對(duì)土壤進(jìn)行修復(fù)[25],所以在肥料開發(fā)的過(guò)程中充分利用PGPR的功能特性是解決田間植物生長(zhǎng)、土壤修復(fù)等問(wèn)題的一種環(huán)保的方法。在實(shí)際生產(chǎn)中已出現(xiàn)商家利用PGPR做成肥料并投入生產(chǎn)的情況[26]。芽孢桿菌屬主要應(yīng)用在田間農(nóng)蔬作物,前期對(duì)種子進(jìn)行處理,可防治各種苗期出現(xiàn)的病害[27]。王娜娜[28]從白皮大蒜中共分離出62株內(nèi)生菌對(duì)4種病原菌都具有拮抗作用,其中芽孢桿菌屬的數(shù)量占到84.2%。解淀粉芽孢桿菌對(duì)果蔬上的病原菌有很好的防治效果,例如:山茶灰斑病,獼猴桃灰霉病等[29-30]。解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens)具有抑制真菌和細(xì)菌的活性的作用,與菌株在生長(zhǎng)過(guò)程中產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物有關(guān)[31]。本研究篩選到的根際細(xì)菌DS7(Bacillus amyloliquefaciens)對(duì)大蒜根腐病病原菌抑制效果:對(duì)H5(Setophoma terrestris)抑制率達(dá)到51.72%,對(duì)H9(Fusarium solani)抑制率達(dá)到42.31%,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,菌株DS7對(duì)大蒜根腐病病害具有較好拮抗效果。

        產(chǎn)鐵載體的PGPR能吸收土壤中的鐵元素提供給植物,還能夠抑制病原菌繁殖[32]。具備固氮能力、溶解磷能力的根際微生物,可以為自身和植物在一定程度上提供可利用的氮和磷,加快植物的生長(zhǎng)速度[33-34]。PGPR菌,例如:枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)、巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium),能促進(jìn)玉米生長(zhǎng),具有溶解無(wú)機(jī)磷、有機(jī)磷,分泌IAA能力[35]。Burkholderia sp.7016具有固氮、溶磷、產(chǎn)ACC脫氨酶,促進(jìn)番茄生長(zhǎng)及拮抗番茄土傳病害等多種功能特性[33]。本實(shí)驗(yàn)研究篩選出的DS7具有多種功能特性:水解蛋白、產(chǎn)鐵載體、固氮、溶解有機(jī)磷、無(wú)機(jī)磷和產(chǎn)IAA的能力。土壤酶活性反映了土壤中營(yíng)養(yǎng)成分的轉(zhuǎn)化以及土壤生物的生命活動(dòng)能力的強(qiáng)弱。土壤中的酶活性與土壤中各種代謝過(guò)程和能量轉(zhuǎn)換息息相關(guān)[36-37],是土壤生物化學(xué)特征的重要組成部分。在評(píng)價(jià)土壤肥力、環(huán)境監(jiān)測(cè)、衡量土地利用等方面有廣泛的作用,可為土壤健康管理提供科學(xué)依據(jù)[38]。土壤中脲酶活性與土壤的微生物數(shù)量、土壤全氮、速效氮等密切相關(guān)[39];蔗糖酶是一種重要水解酶,蔗糖酶斷裂蔗糖分子鍵后產(chǎn)生葡萄糖、果糖,為植物和微生物提供營(yíng)養(yǎng)的碳源[40]。土壤過(guò)氧化氫酶活性與土壤呼吸強(qiáng)度和土壤微生物活動(dòng)相關(guān),能有效防止過(guò)氧化氫的毒害,是重要的土壤微生態(tài)環(huán)境指示因子[40-42]。趙晶等[43]發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)期施用有機(jī)肥能夠增加土壤中有機(jī)質(zhì)含量,并且與土壤脲酶、磷酸酶和轉(zhuǎn)化酶活性呈相關(guān)性。接種類芽孢桿菌(Paenibacillus spp.)后土壤酶活性與植物的生物量呈正相關(guān),能夠提高土壤質(zhì)量,同時(shí)具有促進(jìn)植物產(chǎn)量功能[44]。田間試驗(yàn)結(jié)果可看出,接種DS7(Bacillus amyloliquefaciens)后大蒜產(chǎn)量比對(duì)照組增產(chǎn)15.42%,接種DS7有助于提高產(chǎn)量。收集接種過(guò)DS7菌液的土壤和未做處理的對(duì)照組土壤,測(cè)定土壤中酶的活性,從過(guò)氧化氫酶活性指標(biāo)可看出,DS7可能會(huì)抑制土壤中某些細(xì)菌的生命活動(dòng)。但通過(guò)蔗糖酶活性及脲酶活性可看出,DS7可幫助土壤加快氨的轉(zhuǎn)化速率,改善土壤肥力,起到改良土壤的作用。因此,DS7具備多種功效,對(duì)大蒜根腐病病原真菌有良好的拮抗效果,在增產(chǎn)的同時(shí)可以改善土壤肥力,是一種良好的微生物肥料資源菌種。

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