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        穩(wěn)定過表達(dá)人源SAMHD1基因細(xì)胞株的建立及其抗病毒活性的研究

        2019-02-27 04:49:14武晉英張洲李子威王昊然操孫潤李宇恒宋曉宇曹流
        關(guān)鍵詞:結(jié)腸癌

        武晉英,張洲,李子威,王昊然,操孫潤,李宇恒,宋曉宇,曹流

        (中國醫(yī)科大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院,遼寧省協(xié)同創(chuàng)新中心,沈陽 110122)

        SAMHD1 (sterile α motif domain and HD domaincontaining protein 1) 蛋白是真核細(xì)胞內(nèi)的一種天然免疫抑制因子[1-2],HD蛋白結(jié)構(gòu)域具有脫氧核苷三磷酸 (deoxyribonucleoside triphosphate, dNTP) 水解酶活性,可水解病毒RNA、DNA轉(zhuǎn)錄和復(fù)制所必需的原料物質(zhì),從而阻斷病毒侵襲宿主細(xì)胞、發(fā)揮抑制病毒感染的功能[3-8]。SAMHD1基因突變可誘發(fā)類似先天性病毒感染的遺傳性自身免疫性疾病、Aicardi-Goutières 綜合征 (Aicardi-Goutières syndrome,AGS)[9-10]。近期研究發(fā)現(xiàn)SAMHD1蛋白dNTP水解酶活性可被細(xì)胞周期檢驗(yàn)點(diǎn)激酶磷酸化修飾調(diào)節(jié)[11],進(jìn)而參與細(xì)胞周期調(diào)控、維系細(xì)胞穩(wěn)態(tài)[12]、調(diào)節(jié)DNA損傷修復(fù)進(jìn)程[13-14],從而影響腫瘤等疾病的發(fā)生與治療[15-16]。為了深入研究SAMHD1蛋白的功能與相關(guān)分子機(jī)制,急需建立穩(wěn)定表達(dá)SAMHD1蛋白的細(xì)胞系。本研究利用慢病毒過表達(dá)質(zhì)粒載體pCDH-EF1- MCS-T2A-copGFP,進(jìn)行穩(wěn)定過表達(dá)人源SAMHD1基因的結(jié)腸癌細(xì)胞系構(gòu)建,并進(jìn)行1型單純皰疹病毒 (herpes simplex virus type 1,HSV-1) 病毒感染實(shí)驗(yàn)加以驗(yàn)證,為進(jìn)一步探索SAMHD1的生物學(xué)功能奠定實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 質(zhì)粒、細(xì)胞及主要試劑

        pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP質(zhì)粒、慢病毒包裝質(zhì)粒 (PCMV-dr8.9dvpr418 和 PCMV-VSV-G419)、人結(jié)腸癌細(xì)胞 (HCT116) 為本實(shí)驗(yàn)室保存;HSV-1購自遼寧佰昊生物科技有限公司;RNAiso PLus、M-MLV反轉(zhuǎn)錄合成cDNA試劑盒、 PrimerSTAR、 EcoR1、 BamH1、T4 Ligase、E.coli.DH5a購自日本TaKaRa公司;瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自美國Axygen公司;轉(zhuǎn)染試劑Tubofect transfection購自美國Thermo Scientific公司;Anti-SAMHD1、β-actin 抗體購自英國Abcam公司;其余分子生物學(xué)試劑購自美國Sigma公司。

        1.2 細(xì)胞培養(yǎng)

        人結(jié)腸癌細(xì)胞HCT116用含10%胎牛血清及青霉素 (100 U/mL) 和鏈霉素 (100 U/mL) 的RPMI 1640培養(yǎng)基,置于37 ℃、5% CO2孵箱培養(yǎng),根據(jù)細(xì)胞的生長情況進(jìn)行傳代,調(diào)整好細(xì)胞狀態(tài)備用。

        1.3 總RNA的提取及cDNA合成

        運(yùn)用Trizol法提取HCT116細(xì)胞中的總RNA,在ThermoNanodrop濃度分析儀上測定總RNA濃度,然后利用cDNA合成試劑盒,逆轉(zhuǎn)綠合成cDNA,將其暫存于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 PCR擴(kuò)增與重組質(zhì)粒構(gòu)建

        根據(jù)GENBANK中的人源SAMHD1基因序列,設(shè)計(jì)SAMHD1引物:F,CCGGAATTCATGCAGCGAGC CGATTC; R,CGGGATCCTCACATTGGGTCATCT。以1.3中合成的cDNA為模板擴(kuò)增SAMHD1全長編碼區(qū)序列。純化PCR產(chǎn)物,并將其與pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP質(zhì)粒分別用EcoRⅠ和BamHⅠ限制性核酸內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,最后利用T4 Ligase將SAMHD1片段與pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP載體連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒PCDH-EF1-MCS-SAMHD1-T2A-GFP。重組質(zhì)粒經(jīng)EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切初步鑒定,送測序驗(yàn)證。

        1.5 穩(wěn)定表達(dá)人源SAMHD1細(xì)胞株構(gòu)建

        1.5.1 表達(dá)人源SAMHD1的慢病毒制備:分別將4.4 μ g PCMV-dr8.9dvpr418、2.2 μ g PCMV-VSV-G419、3.4 μ g pCDH-EF1-MCS-SAMHD1-T2A-GFP或pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP 質(zhì)粒稀釋于1 mL無血清DMEM,加入20 μ L Tubofect轉(zhuǎn)染試劑,立即混勻并低速離心,室溫放置15~20 min,將上述混合液加入準(zhǔn)備好的293T細(xì)胞,6 h后更換細(xì)胞培養(yǎng)液,24、48、72 h分別收集上清,2 000 r/min離心10 min去除細(xì)胞碎片,上清即為含有 pCDH-EF1-MCS-SAMHD1-T2A-GFP或pCDHEF1-MCS-T2A-copGFP 的病毒液。收集上清并加入適量PEG-it于4 ℃混轉(zhuǎn)過夜,4 000 r/min離心30 min,500 μ L PBS重懸沉淀,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.5.2 穩(wěn)定表達(dá)人源SAMHD1細(xì)胞株建立:用1.5.1中制備的病毒 (100 μ L) 感染細(xì)胞 (培養(yǎng)皿直徑=35 mm) ,密度約40% (1×105/皿) 的HCT116細(xì)胞,24 h后重復(fù)感染,48 h后正常培養(yǎng)。

        1.5.3 穩(wěn)定表達(dá)人源SAMHD1細(xì)胞株鑒定:冰上制備穩(wěn)定表達(dá)SAMHD1的116細(xì)胞總蛋白樣。Western blotting檢測目的蛋白表達(dá)。

        1.6 穩(wěn)定表達(dá)SAMHD1細(xì)胞株的抗HSV-1病毒作用檢測

        首先進(jìn)行HSV-1病毒擴(kuò)大培養(yǎng),用10 cm直徑培養(yǎng)皿培養(yǎng)Hela細(xì)胞,密度達(dá)到100% (約1×107/皿) 后更換培液,加入新鮮培養(yǎng)基9 mL,再加入1 mL HSV-1病毒液。48~72 h收取上清,1 000 r/min離心 5 min,取上清,4 ℃冰箱短期保存。然后培養(yǎng)HCT116細(xì)胞,密度50%~70% (約7×106/皿) 時(shí)感染病毒 (培養(yǎng)基∶病毒液=9∶1) ,病毒感染12 h后換液。HSV-1病毒用綠色熒光蛋白 (green fluorescent protein,GFP) 標(biāo)記。在熒光顯微鏡下觀察并記錄HSV-1感染0、12、24、36、48 h后情況,收集感染后細(xì)胞進(jìn)行蛋白印記實(shí)驗(yàn),檢測病毒感染的標(biāo)志性蛋白 (HSV-GD) 來評價(jià)過表達(dá)細(xì)胞株的抗病毒作用。

        2 結(jié)果

        2.1 重組質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定結(jié)果

        結(jié)果顯示,以合成的cDNA為模板采用特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,把PCR產(chǎn)物連接到慢病毒表達(dá)載體pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP上,構(gòu)建出重組質(zhì)粒pCDH-EF1-MCS-SAMHD1- T2A-GFP。將重組質(zhì)粒經(jīng)EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切鑒定,片段大小約為1 800 bp,與SAMHD1片段長度相符,見圖 1。DNA測序結(jié)果證明SAMHD1基因插入方向及讀碼框正確,表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功,見圖2。

        2.2 穩(wěn)定表達(dá)SAMHD1的細(xì)胞株建立及鑒定

        圖1 重組質(zhì)粒酶切鑒定的瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.1 Restriction enzyme digestion results of the recombinant plasmid identified by agarose gel electrophoresis

        圖2 重組質(zhì)粒測序結(jié)果圖Fig.2 Sequencing chromatogram of the recombinant plasmid

        將pCDH-EF1-MCS-SAMHD1-T2A-GFP和pCDHEF1-MCS-T2A-copGFP的假病毒感染HCT116細(xì)胞,感染2次后更換為正常培養(yǎng)基培養(yǎng)。細(xì)胞裂解液裂解感染后的細(xì)胞。Western blotting檢測結(jié)果顯示,感染pCDH-EF1-MCS- SAMHD1-T2A-GFP病毒細(xì)胞在72×103位置條帶亮度明顯增強(qiáng),SAMHD1蛋白的相對表達(dá)量為1.108±0.066; 而空白對照HCT116細(xì)胞和感染pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP病毒液細(xì)胞在72×103位置未見條帶亮度明顯改變,SAMHD1蛋白相對表達(dá)量分別為0.708±0.043和0.719±0.011,見圖3。表明穩(wěn)定過表達(dá)SAMHD1的HCT116細(xì)胞株構(gòu)建成功。

        2.3 穩(wěn)定表達(dá) SAMHD1 細(xì)胞株抗病毒功能評價(jià)

        圖3 Western blotting 檢測HCT116細(xì)胞中SAMHD1 蛋白表達(dá)Fig.3 Western blotting results of SAMHD1 protein expression in HCT116 cells

        利用HSV-1 GFP病毒對目的細(xì)胞進(jìn)行0、12、24、36、48 h感染,觀察目的細(xì)胞中GFP熒光強(qiáng)度的高低變化確定感染時(shí)間,結(jié)果發(fā)現(xiàn),36 h病毒感染效率最高。pCDH+HSV-1與未感染病毒pCDH組比較,感染組GFP熒光亮度明顯增高,說明感染成功。但是同樣都進(jìn)行病毒感染的pCDH+ SAMHD1+ HSV-1組與pCDH+ HSV-1組細(xì)胞比較,GFP熒光亮度卻未見明顯增高,見圖4A。結(jié)果顯示,與pCDH-EF1-MCS-T2A-copGFP的HCT116細(xì)胞 (相對表達(dá)量為11.509±0.607 )比較,穩(wěn)定表達(dá)pCDH-EF1-MCS-SAMHD1-T2A-GFP細(xì)胞 (相對表達(dá)量為1.234±0.072 ) GFP表達(dá)明顯較少。同時(shí)收集感染后細(xì)胞進(jìn)行蛋白印記實(shí)驗(yàn),檢測病毒感染的標(biāo)志性蛋白 (HSV-GD) 表達(dá)來評價(jià)過表達(dá)細(xì)胞株的抗病毒作用。蛋白印記實(shí)驗(yàn)結(jié)果也證明過表達(dá)SAMHD1細(xì)胞中病毒感染的標(biāo)志性蛋白HSV-GD表達(dá)較低,見圖4B。以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果均表明慢病毒介導(dǎo)的過表達(dá)SAMHD1基因的結(jié)腸癌細(xì)胞株能夠有效抑制HSV-1復(fù)制。

        3 討論

        2011年,研究[17]證實(shí)SAMHD1是一種有效的人類免疫缺陷病毒Ⅰ型(human immunodeficiency virus-1,HIV-1)限制因子。作為目前發(fā)現(xiàn)唯一的dNTP水解酶,SAMHD1通過調(diào)控脫氧核糖核苷三磷酸的含量來限制非循環(huán)細(xì)胞中的HIV-1感染,并且能夠阻斷細(xì)胞中逆轉(zhuǎn)錄病毒的轉(zhuǎn)錄過程和DNA病毒的復(fù)制[5-6,18]。隨后人們對其抗病毒功能進(jìn)行了大量研究,dNTP是細(xì)胞、寄生蟲和病毒DNA聚合酶的通用底物[19],因此細(xì)胞dNTP含量幾乎影響所有dsDNA病毒的基因組復(fù)制,目前認(rèn)為SAMHD1維系核苷酸含量的動(dòng)態(tài)平衡可能是細(xì)胞限制各種病毒復(fù)制的一般機(jī)制。

        圖4 過表達(dá) SAMHD1 細(xì)胞系的抗病毒功能評價(jià)Fig.4 Evaluation of the antiviral function of the cell line overexpressing SAMHD1 gene

        瞬時(shí)轉(zhuǎn)染存在表達(dá)效率不一致且外源基因表達(dá)會(huì)隨細(xì)胞生長繁殖而逐漸降低,無法傳到子代,臨床研究[20]證明單純皰疹病毒 (herpes simplex virus,HSV) 是人類最常見的病原體,人是唯一的自然宿主,本研究選擇人結(jié)腸癌細(xì)胞作為工具細(xì)胞,通過瓊脂糖凝膠實(shí)驗(yàn)及測序結(jié)果證明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。利用慢病毒包裝系統(tǒng)建立SAMHD1的穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株,Western blotting檢測結(jié)果表明穩(wěn)定過表達(dá)SAMHD1的細(xì)胞株構(gòu)建成功。免疫熒光和Western blotting結(jié)果證明穩(wěn)定過表達(dá)SAMHD1可以有效抑制HSV-1在結(jié)腸癌細(xì)胞系中的復(fù)制,且證實(shí)本實(shí)驗(yàn)所構(gòu)建的穩(wěn)定過表達(dá)SAMHD1細(xì)胞株具有SAMHD1的生物學(xué)功能。

        SAMHD1具有廣泛的抗病毒功能,能夠有效抑制DNA病毒HSV-1在結(jié)腸癌細(xì)胞中的復(fù)制。但是SAMHD1是否對其他類型病毒及在其他細(xì)胞中有同樣的生物學(xué)功能,還需進(jìn)一步探討。本研究為深入研究SAMHD1蛋白的生物學(xué)功能提供實(shí)驗(yàn)保障。

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