陸文斌,宮雪超, 金建華,胡文蔚,王月,張華
近年,腫瘤免疫療法發(fā)展迅速,尤其以嵌合抗原受體(CAR)-T為代表的過繼性T細(xì)胞療法。其中,CD19-CAR T更以令人驚嘆的臨床治療效果獲得了FDA批準(zhǔn)[1]。在CAR改造T細(xì)胞所涉及的諸多重要環(huán)節(jié)中,選擇腫瘤細(xì)胞表面特異性靶點(diǎn)和獲取具有合適親和力的單鏈抗體基因是最重要的基礎(chǔ)要素[2]。癌胚抗原(carcinoembryonic antigen, CEA)是大腸癌組織產(chǎn)生的一種糖蛋白,常作為胃癌、胰腺癌、結(jié)直腸癌、乳腺癌、甲狀腺髓樣癌等腫瘤的標(biāo)志物,是多種免疫療法的消化道腫瘤特異性靶點(diǎn)[3-4]。CA19-9是唾液酸化lewis-a血型抗原,在胃腸道等多種癌癥診斷中都有一定價(jià)值。目前,已有較多靶向CA19-9以提高診斷靈敏度和特異性的研究,但以此為靶點(diǎn)構(gòu)建CAR-T細(xì)胞用于臨床治療的報(bào)道[5-6]不多。本研究擬利用基因工程技術(shù),構(gòu)建帶有人IgG1 Fc標(biāo)簽的抗CEA scFv和抗CA19-9 scFv真核表達(dá)載體。另外,為提高抗體表達(dá)效率,在anti-CEA scFv上游加入人IL-2信號(hào)肽,形成三個(gè)不同單鏈抗體融合基因;脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染后,在HEK293細(xì)胞中表達(dá)三個(gè)抗體-Fc融合蛋白,并進(jìn)行表達(dá)檢測和親和力鑒定。以此獲得anti-CEA scFv和anti-CA19-9 scFv基因并驗(yàn)證兩種單鏈抗體親和力,為后續(xù)開展以CEA和CA19-9為靶點(diǎn)的腫瘤免疫治療提供理論和物質(zhì)基礎(chǔ)。
菌種E.coliBL21(DE3)和質(zhì)粒pET-32a(+)購自Novagen公司(美國);Fc/pTT5為含有人IgG1 Fc段基因的pTT5載體,由本實(shí)驗(yàn)室保存。HEK293、SW480、CFPAC-1等細(xì)胞株均購自中科院上海細(xì)胞庫(中國);EcoRⅠ、BamHⅠ、XhoⅠ、NcoⅠ等限制性內(nèi)切酶和Taq酶、T4連接酶等工具酶均購自NEB公司(美國);rProtein-A FF親和層析柱購自GE公司(美國);鼠抗人IgG Fc單克隆抗體、鼠抗人CEA單克隆抗體、鼠抗人CA19-9單克隆抗體、HRP標(biāo)記山羊抗鼠IgG H&L多克隆抗體均購自Abcam公司(英國);基因及引物合成由金唯智公司(中國)完成;合成后測序驗(yàn)證由生工生物工程(上海)股份有限公司(中國)完成。以下為anti-CEA scFv上下游引物(P1和P2)和anti-CA19-9 scFv上下游引物(P3和P4),兩端均引入酶切位點(diǎn)(5’-EcoRⅠ,3’-NcoⅠ);hIL-2信號(hào)肽上游引物(P5);hIL-2信號(hào)肽基因合成序列(5’端整合EcoRⅠ酶切位點(diǎn),3’端引入anti-CEA scFv 5’端重復(fù)序列)。P1:5’-AAGAATTCATGTCCTGGGTCAAAC-3’;P2:5’-AACCATGGGGCGGCCCTGGGCTCCA-3’;P3: 5’-AAGAATTCATGGCCCAGGTGAAGCT-3’;P4: 5’-AACCATGGTCTTTTAATCTCCAGCT-3’;P5: 5’-AAGAATTCATGAGTGGTTTTGGAGT-3’;hIL-2信號(hào)肽:5’-AGAATTCATG AGTGGTTTTT GGAGTCAGTA CATTCTCTTT TCAAATCCTT CTCTGCCCCT TACTGGCAAT TCCTGGGTCA AACAGGCT-3’。
1.2.1 基因合成和pET32a(+)表達(dá)載體構(gòu)建 從GenBank獲取兩種單鏈抗體基因序列:抗CEA scFv(AB001737.1)和抗CA19-9 scFv(BD455083.1);其中,AB001737.1為完整讀碼框;CA19-9 scFv(BD455083.1)需要?jiǎng)h除兩端多余密碼子,并在3’段加入終止子。對(duì)兩基因序列進(jìn)行密碼子優(yōu)化,加入酶切位點(diǎn)(5’-BamHⅠ和3’-XhoⅠ)并送基因公司做全基因合成?;蚝铣珊螅瑢⒑衋nti-CEA scFv/pET32a(+)和anti-CA19-9 scFv/pET32a(+)的兩種E.coliDH5α在肉湯培養(yǎng)基(LB)抗性平板(50 μg/ml氨芐西林)上進(jìn)行劃線接種,37℃培養(yǎng)過夜。挑取抗性平板上的陽性單菌落,進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng);提取質(zhì)粒,并經(jīng)雙酶切鑒定后,送基因公司進(jìn)行測序驗(yàn)證。
1.2.2 scFv/pET32a(+)轉(zhuǎn)化BL21和表達(dá) 經(jīng)測序驗(yàn)證,將純化后的陽性重組質(zhì)粒導(dǎo)入感受態(tài)E.coliBL21(DE3)中。LB抗性平板篩選后,挑選生長狀態(tài)良好的單菌落,接種于5 ml LB液體培養(yǎng)基(50 μg/ml氨芐西林)中,37℃振蕩,培養(yǎng)過夜。次日,取對(duì)數(shù)生長期菌液轉(zhuǎn)接于大瓶培養(yǎng)液中,進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng);加入誘導(dǎo)劑IPTG(0、0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4 mmol/L),30℃誘導(dǎo)表達(dá)3 h。10 000 r/min離心10 min,棄上清液,收集菌體,直接煮沸,上樣,SDS-PAGE電泳分析;以未誘導(dǎo)的菌體(0 mmol/L IPTG)作陰性對(duì)照,以未插入外源基因的空質(zhì)粒菌體為空白對(duì)照。
1.2.3 融合基因合成及pTT5表達(dá)載體構(gòu)建 以anti-CEA scFv/pET32a(+)為模板,以P1和P2為引物,使用PCR擴(kuò)增法刪除anti-CEA scFv基因末端終止子,并在基因兩端引入酶切位點(diǎn),獲得anti-CEA scFv(-t);循環(huán)參數(shù):94℃預(yù)變性5 min,94℃變性1 min,55℃退火1 min,72℃延伸1 min,循環(huán)30次后72℃延伸10 min。利用同樣方法,以P3和P4為引物,以anti-CA19-9 scFv/pET32a(+)為模板,獲得anti-CA19-9 scFv(-t)。為進(jìn)一步探索提高抗體產(chǎn)量可能,使用重疊區(qū)基因擴(kuò)增法,在anti-CEA scFv(-t)基因5’端加入hIL-2信號(hào)肽基因;以P5和P2為引物,以IL-2信號(hào)肽(含重復(fù)區(qū))和anti-CEA scFv(-t)為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,構(gòu)建IL-2信號(hào)肽與anti-CEA scFv(-t)融合基因—IL2s-anti-CEA scFv(-t);循環(huán)參數(shù):94℃預(yù)變性5 min ,94℃變性1 min,55℃退火1 min,72℃延伸90 s,循環(huán)30次后72℃延伸10 min。anti-CEA scFv(-t)、anti-CA19-9 scFv(-t)和IL2s-anti-CEA scFv(-t)三種基因擴(kuò)增產(chǎn)物使用EcoRⅠ和NcoⅠ雙酶切,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。利用膠回收試劑盒純化抗體基因片段;并與同樣雙酶切的Fc/pTT5載體片段進(jìn)行連接(反應(yīng)體系T4Ligase和T4Ligase Buffer),16℃過夜。次日,將連接有抗體基因的載體分別導(dǎo)入感受態(tài)DH5α中,并將菌液涂布于LB抗性平板上(含有50 μg/ml氨芐西林),37℃培養(yǎng)過夜。16~24 h后,挑取陽性單菌落,擴(kuò)大培養(yǎng),進(jìn)行酶切和測序鑒定。
1.2.4 不同scFv-Fc/pTT5在HEK293細(xì)胞中表達(dá) 在DMEM培養(yǎng)基(含10%FBS)中接種HEK293細(xì)胞,37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。測G418篩選濃度和維持濃度。待細(xì)胞融合度達(dá)到80%時(shí),將HEK293細(xì)胞以4×105個(gè)/孔密度接種于6孔培養(yǎng)板中;細(xì)胞再生長至約70%~80%時(shí),按說明書方法進(jìn)行脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染,并以未轉(zhuǎn)染的HEK293細(xì)胞作為陰性對(duì)照。載體和脂質(zhì)體混合后,室溫孵育20 min,加入HEK293細(xì)胞中,37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。轉(zhuǎn)染24 h后,G418(1 μg/ml)加壓篩選;48 h后,每天取5 ml培養(yǎng)物,離心收集細(xì)胞。超聲法破碎細(xì)胞,鏡檢破碎率,提取上清液和沉淀中的蛋白,SDS-PAGE電泳分析。
1.2.5 rProtein-A FF親和層析純化抗體融合蛋白 A液:20 mmol/L PBS(pH7.0),B液:0.1 mol/L甘氨酸(pH3.0),C液:1 mol/L Tris(pH8.0)。A液平衡rProtein-A FF層析柱,將含有anti-CEA scFv-Fc/pTT5和anti-CA19-9 scFv-Fc/pTT5的兩種細(xì)胞總蛋白粗提液分別上樣,用A液以相同流速洗脫至讀數(shù)穩(wěn)定,再用B液緩慢洗脫;同時(shí),用C液以1/10接樣(以內(nèi)含0.5 ml C液的離心管接收流穿液);最后,用甘氨酸(pH2.5)和C液交替洗脫層析柱,NaN3封柱。
1.2.6 Western blot法檢測抗體融合蛋白表達(dá) 取三個(gè)單鏈抗體融合基因轉(zhuǎn)染HEK293細(xì)胞后的培養(yǎng)液濃縮液、細(xì)胞破碎后上清液和沉淀中蛋白提取液、純化產(chǎn)物等各20 μl上樣,10%十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠(SDS-PAGE)電泳,100 mA電流半干轉(zhuǎn)2 h;2% BSA室溫封閉2 h,棄掉封閉液,將硝酸纖維素膜置于干凈培養(yǎng)皿中,加入5 μg/ml鼠抗人IgG Fc單克隆抗體(anti-Human IgG Fc mAb),4℃保濕過夜;TBST洗3次,每次5~10 min,加入1:2 500稀釋的HRP標(biāo)記山羊抗鼠IgG H&L多克隆抗體,室溫放置1.5 h;TBST洗滌3次,每次5~10 min;DAB顯色。
1.2.7 基于細(xì)胞的競爭性ELISA檢測scFv親和力 收獲CEA陽性細(xì)胞(SW480)和CEA/CA19-9雙陽性細(xì)胞(CFPAC-1),計(jì)數(shù);鋪裝于96孔板中(50 000個(gè)/孔),培養(yǎng)過夜。次日,移除培養(yǎng)基;用150 μl PBS和2% FBS洗滌。棄上清液,每孔加入150 μl 1nmol/L鼠抗人CA19-9 mAb稀釋液和鼠抗人CEA mAb稀釋液,室溫孵育1 h。棄上清液,洗滌(方法同前);每孔加入150 μl不同濃度(濃度梯度:1~100 nmol/L)的anti-CEA scFv-Fc和anti-CA19-9 scFv-Fc(待測抗體),室溫孵育1 h。棄上清液,洗滌;每孔加150 μl HRP 標(biāo)記山羊抗鼠IgG H&L多克隆抗體(1:10 000倍稀釋),室溫孵育1 h。棄上清液,洗滌;每孔加150 μl DAB顯色液,15 min后終止反應(yīng),利用酶標(biāo)儀測定450 nm處吸光度值。每個(gè)樣品重復(fù)3孔。根據(jù)吸光率制作飽和結(jié)合圖;評(píng)估解離常數(shù)(KD),確定能夠抵消50% CEA和CA19-9親本抗體的anti-CEA scFv-Fc和anti-CA19-9 scFv-Fc用量。
抗CEA scFv和抗CA19-9 scFv兩段基因經(jīng)編輯和基因合成后,被克隆到pET32a(+),并轉(zhuǎn)入DH5α中。在抗性平板中,隨機(jī)挑取5個(gè)單菌落,提取質(zhì)粒并進(jìn)行雙酶切(BamHⅠ和XhoⅠ)鑒定;鑒定結(jié)果符合兩個(gè)單鏈抗體基因大小(anti-CEA scFv,708 bp;anti-CA19-9 scFv,735 bp)。將鑒定后的單鏈抗體-pET32a(+)重組質(zhì)粒送上海生工測序鑒定,測序結(jié)果與設(shè)計(jì)序列完全吻合(圖略)。
測序驗(yàn)證后,將anti-CEA scFv/pET32a(+)和anti-CA19-9 scFv/pET32a(+)表達(dá)載體導(dǎo)入感受態(tài)E.coliBL21(DE3),IPTG誘導(dǎo)表達(dá)3 h后進(jìn)行SDS-PAGE分析。結(jié)果見圖1~2,在40 kDa上方都有過表達(dá)條帶,與anti-CEA scFv(42.55 kDa)和anti-CA19-9 scFv(43.97 kDa)預(yù)測蛋白質(zhì)量相近;其中,anti-CEA scFv/pET32a(+)在1.0 mmol/L IPTG濃度下表達(dá)量最高。而anti-CA19-9 scFv/pET32a(+)則在0.4~0.6 mmol/L IPTG濃度下有較高表達(dá)。相反,陰性對(duì)照(0 mmol/L IPTG)在40 kDa上方并沒有過表達(dá);而空白對(duì)照(pET32a)不僅在該處沒有過表達(dá),18 kDa處還形成過表達(dá)(空載體表達(dá)蛋白)。據(jù)此判斷,在E.coliBL21(DE3)中,anti-CEA scFv和anti-CA19-9 scFv都存在過表達(dá)可能。
圖1 Anti-CEA scFv/pET32a(+)在E.coli BL21( DE3) 中IPTG誘導(dǎo)表達(dá)Figure1 Anti-CEA scFv/pET32a (+) expressed in E.coli BL21 (DE3) with IPTG
圖2 Anti-CA19-9 scFv/pET32a(+)在E.coli BL21( DE3) 中IPTG誘導(dǎo)表達(dá)Figure2 Anti-CA19-9 scFv/pET32a (+) expressed in E.coli BL21 (DE3) with IPTG
anti-CEA scFv(-t)、anti-CA19-9 scFv(-t)和IL2s-anti-CEA scFv(-t)三種基因擴(kuò)增產(chǎn)物分別與同樣經(jīng)EcoRⅠ和NcoⅠ雙酶切的Fc/pTT5質(zhì)粒連接后,分別導(dǎo)入DH5α中;經(jīng)酶切鑒定和測序鑒定,證明三個(gè)單鏈抗體基因與Fc/pTT5正確連接,見圖3~5。
圖3 Anti-CA19-9 scFv-Fc/pTT5表達(dá)載體構(gòu)建及酶切鑒定Figure3 Construction of anti-CA19-9 scFv-Fc/pTT5 and identification of restriction enzyme
圖4 Anti-CEA scFv-Fc/pTT5表達(dá)載體構(gòu)建及酶切鑒定Figure4 Construction of anti-CEA scFv-Fc/pTT5 and identification of restriction enzyme
圖5 IL2s-anti-CEA scFv-Fc/pTT5表達(dá)載體構(gòu)建及酶切鑒定Figure5 Construction of IL2s-anti-CEA scFv-Fc/pTT5 and identification of restriction enzyme
anti-CEA scFv(-t)-Fc/pTT5、anti-CA19-9 scFv(-t)-Fc/pTT5和IL2s-anti-CEA scFv(-t)-Fc/pTT5轉(zhuǎn)染HEK293細(xì)胞,G418加壓篩選。轉(zhuǎn)染48 h后,取細(xì)胞培養(yǎng)物上清液、細(xì)胞破碎后上清液和沉淀、純化和鑒定。Western blot檢測結(jié)果顯示,anti-CEA scFv-Fc和anti-CA19-9 scFv-Fc在細(xì)胞沉淀中有表達(dá)條帶,在細(xì)胞上清液中沒有表達(dá)條帶;無論是培養(yǎng)液中還是細(xì)胞上清液和沉淀中都未見帶有IL-2信號(hào)肽基因的IL2s-anti-CEA scFv-Fc表達(dá)條帶。在轉(zhuǎn)染72 h后,除能看到anti-CEA scFv-Fc和anti-CA19-9 scFv-Fc在細(xì)胞沉淀中的表達(dá)條帶,IL2s-anti-CEA scFv-Fc在細(xì)胞上清液和沉淀中也出現(xiàn)表達(dá)條帶;其中,anti-CEA scFv-Fc經(jīng)rProtein-A FF柱子純化后能在Western blot檢測中顯示清晰條帶。所有條帶大小與三種抗體融合蛋白預(yù)測分子質(zhì)量相當(dāng)(anti-CEA scFv-Fc,50.5 kDa;anti-CA19-9 scFv-Fc,51.9 kDa;IL2s-anti-CEA scFv-Fc,52.6 kDa),見圖6~7。
圖6 Western blot法檢測轉(zhuǎn)染scFv-Fc/pTT5 48h后HEK293細(xì)胞Figure6 HEK293 cells detected by Western blot after transfection of scFv-Fc/pTT5 for 48h
圖7 Western blot法檢測轉(zhuǎn)染scFv-Fc/pTT5 72h后的HEK293細(xì)胞Figure7 HEK293 cells detected by Western blot after transfection of scFv-Fc/pTT5 for 72h
通過競爭結(jié)合實(shí)驗(yàn),與完整單克隆抗體相比較,確定兩種單鏈抗體anti-CEA scFv-Fc和anti-CA19-9 scFv-Fc相對(duì)親和力。對(duì)每個(gè)樣品吸光度值進(jìn)行平均,并繪制飽和結(jié)合圖。經(jīng)過ELISA測定和飽和結(jié)合曲線圖分析,anti-CA19-9 scFv-Fc相對(duì)親和力約為6 nmol/L,anti-CEA scFv-Fc相對(duì)親和力約為8.2 nmol/L,見圖8~9。
圖8 Anti-CA19-9 scFv-Fc相對(duì)親和力(與鼠抗人CA19-9單克隆抗體對(duì)比)Figure8 Relative binding affinity of anti-CA19-9 scFv-Fc,compared with anti-human CA19-9 mAb
圖9 Anti-CEA scFv-Fc相對(duì)親和力(與鼠抗人CEA單克隆抗體對(duì)比)Figure9 Relative binding affinity of the anti-CEA scFv-Fc,compared with anti-human CEA mAb
雖然CAR-T在急性淋巴細(xì)胞白血?。ˋML)等癌癥治療方面取得巨大突破,但治療實(shí)體瘤(如胃腸癌、胰腺癌等)還面臨諸多挑戰(zhàn)[7-8]。主要困難之一就是實(shí)體瘤沒有像B細(xì)胞血液腫瘤CD19那樣的特異性標(biāo)志物[9]。CEA是目前研究最深入的腫瘤標(biāo)志物之一;在多種內(nèi)胚層組織、上皮性組織起源細(xì)胞及相關(guān)疾病中均有表達(dá),在腫瘤細(xì)胞免疫逃避及擴(kuò)散/轉(zhuǎn)移中都具有重要作用;在結(jié)直腸癌中表達(dá)最高(60%~90%)[10],已被廣泛應(yīng)用于結(jié)直腸癌的診斷及靶向治療。人CEA基因家族位于19號(hào)染色體q13.2區(qū),共29個(gè)基因,其中CEACAM5(CEA, CD66e)通過糖基磷脂酰肌醇(glycosyl phosphatidylinositol, GPI)連接于細(xì)胞膜[11]。CA19-9是一種類黏膜蛋白形式的糖蛋白,也是多種癌癥檢測的重要參考指標(biāo)之一。CA19-9對(duì)于胰腺癌的特異性為90%,敏感度為81%;被認(rèn)為是胰腺癌中最具價(jià)值的腫瘤標(biāo)志物[12]。CEA和CA19-9都是位于腫瘤細(xì)胞表面的抗原物質(zhì),在腫瘤細(xì)胞中高表達(dá),可與單克隆抗體結(jié)合,非常適合作為腫瘤免疫治療靶標(biāo)[13-15]。通過基因工程技術(shù),我們構(gòu)建了靶向CEACAM5和CA19-9的單鏈抗體融合蛋白(scFv-Fc)真核表達(dá)載體。為提高抗體表達(dá)效率和便于檢測其表達(dá),通過重疊區(qū)基因擴(kuò)增法[16-18]和亞克隆技術(shù)向抗CEA scFv和抗CA19-9 scFv下游引入hIgG1 Fc基因,并在抗CEA scFv上游增加人IL-2信號(hào)肽,獲得3個(gè)單鏈抗體融合蛋白的表達(dá)載體anti-CEA scFv-Fc、IL2s-anti-CEA scFv-Fc和anti-CA19-9 scFv-Fc;將表達(dá)載體轉(zhuǎn)入HEK293細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá)。通過Western blot等證明,三個(gè)抗體均可以通過Fc段抗體融合技術(shù)在HEK293細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行表達(dá);但培養(yǎng)基中未檢測到IL2s-anti-CEA scFv-Fc,表明沒有產(chǎn)生分泌型anti-CEA scFv??紤]到IL2s-anti-CEA scFv-Fc在細(xì)胞上清和沉淀中均有表達(dá),可以確定IL2信號(hào)肽沒有發(fā)揮作用,具體原因有待下一步研究確定。從結(jié)果分析來看,三個(gè)抗體在細(xì)胞中表達(dá)效率仍然不高。為明確抗CEA scFv和抗CA19-9 scFv的親和力及識(shí)別腫瘤細(xì)胞的陽性結(jié)合率,通過競爭性細(xì)胞ELISA檢測兩種抗體對(duì)CEA陽性細(xì)胞(SW480)和CEA/CA19-9雙陽性細(xì)胞(CFPAC-1)進(jìn)行競爭性結(jié)合實(shí)驗(yàn),證實(shí)兩種抗體可以與腫瘤細(xì)胞表面抗原CEA和CA19-9特異性結(jié)合。通過抗CEA單鏈抗體和抗CA19-9單鏈抗體在HEK293細(xì)胞中表達(dá),我們獲取了抗體基因的優(yōu)化序列,并對(duì)抗體識(shí)別抗原的能力進(jìn)行了研究,證實(shí)兩種單鏈抗體能夠較好的識(shí)別結(jié)直腸癌等消化道腫瘤細(xì)胞表面抗原,為后續(xù)研究腫瘤特異性抗體藥物和改造T細(xì)胞進(jìn)行過繼性免疫治療奠定了基礎(chǔ)。