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        LncRNA-ATB在非小細胞肺癌細胞中的作用及其機制探討*

        2019-01-24 05:27:46李柏森姜鶴群文敏易紅梅李濤
        關(guān)鍵詞:小室結(jié)果顯示距離

        李柏森,姜鶴群,文敏,易紅梅,李濤

        [1.西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院 腫瘤科,四川 瀘州 646099;2.成都醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院 腫瘤科,四川 成都 610500;3.電子科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院(四川省癌癥防治中心),四川成都 610041;4.成都醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院 胸心外科,四川 成都 610500]

        約80%肺癌為非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)[1],其預(yù)后差,總體生存率<20%[2]。遠處轉(zhuǎn)移是NSCLC死亡的主要原因[3]。因此,深入闡明其發(fā)生、發(fā)展中的分子機制有巨大的現(xiàn)實意義。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA activated by transforming growth factor β, LncRNA-ATB)是一類轉(zhuǎn)錄本>200 nt的幾乎不具有蛋白編碼能力的RNA[4]。近年來,許多LncRNA被證實在NSCLC侵襲和轉(zhuǎn)移過程中發(fā)揮重要作用[5-6]。然而,LncRNA-ATB在NSCLC中的表達及功能尚未充分闡明。本研究擬探索LncRNA-ATB在NSCLC中的表達及其功能。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        NSCLC和正常支氣管上皮細胞(human bronchial epithelial cells, HBEC)選取2012年3月7日—2015年5月8日在四川省腫瘤醫(yī)院就診的患者。NSCLC分為A549和HCI-H23細胞。用Trizol(美國Sigma公司)提取RNA,RNA逆轉(zhuǎn)錄和實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)試劑盒購自日本TaKaRa公司,qRT-PCR引物由上海生工生物工程股份有限公司合成,Transwell小室(美國Millipore公司),基質(zhì)膠(美國BD公司),螢光素酶報告基因檢測試劑盒(上海碧云天生物技術(shù)有限公司)。

        1.2 方法

        1.2.1 RNA的提取及逆轉(zhuǎn)錄 將細胞鋪6孔板培養(yǎng)過夜至匯合度為80%,每孔加入1 ml Trizol裂解30 min,4℃、12 000 r/min離心5 min,上清轉(zhuǎn)移至一新離心管中。加入裂解液1/5體積的氯仿,用力振蕩至充分乳化。4℃、12 000 r/min離心15 min,吸取上清液至一新的離心管中,加入等體積異丙醇,上下顛倒15次,靜置10 min。4℃、12 000 r/min離心15 min,棄上清,加入75%乙醇1 ml,14℃、12 000 r/min離心5 min。所得沉淀加入20μl去離子水,即為所需RNA。

        1.2.2 逆轉(zhuǎn)錄 將 1μl RNA,2μl 5× PrimeScript RT Master,7μl去離子水輕柔混勻后,進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。反應(yīng)條件為:37℃15 min,85℃5 s,4℃儲存。

        1.2.3 qRT-PCR 總反應(yīng)體系25μl,具體如下:SYBR premix Ex TaqⅡ 12.5μl,正義鏈反義鏈引物各1μl,實時定量產(chǎn)物2μl,去離子水8.5μl。PCR反應(yīng)條件為: 95℃預(yù)變性30 s,95℃變性15 s,60℃退火30 s,共30個循環(huán)。反應(yīng)結(jié)束后樣品保存于4℃。采用 2-ΔΔCt法計算,LncRNA-ATB/microRNA-141(miR-141)相對表達量=2-(CTLncRNA-ATB/miR-141-CTU6)待測樣本-(CTLncRNA-ATB/miR-141-CTU6)校準(zhǔn)樣本。

        1.2.4 Transwell實驗 在 Transwell下室中加入600μl含10%胎牛血清的1640培養(yǎng)基(細胞侵襲實驗采用預(yù)先鋪好基質(zhì)膠的Milipore小室,細胞轉(zhuǎn)移實驗采用Milipore小室),上室中加入200μl約2×105個細胞,置于細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48 h。棄上室液體,小心取出小室,濕棉簽去除未穿過膜的細胞。甲醇固定2 min,結(jié)晶紫染色5 min,PBS洗滌,切下小室膜,封片。顯微鏡200倍視野下統(tǒng)計隨機10個視野的細胞數(shù),拍照并繪制統(tǒng)計圖。

        1.2.5 細胞劃痕實驗 將NSCLC細胞鋪板,孵育過夜至細胞融合率達100%。用1 ml槍頭均勻地在細胞培養(yǎng)孔中劃痕,劃痕后用PBS洗滌細胞3次,加入不含血清的培養(yǎng)基,拍照,此時細胞間距離為0 h距離。置于細胞培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24 h,再次拍照,此時細胞間距離為24 h距離。細胞遷移距離為2次細胞間距離之差再除以2。

        1.2.6 熒光素酶報告基因?qū)嶒?細胞培養(yǎng)過夜至匯合度達70%后,共轉(zhuǎn)染miR-141 mimics/miR-141 NC和pmiR-GLO-WT質(zhì)粒。裂解細胞后,取10μl樣品加入100μl熒光素酶檢測試劑,上機測定熒光值。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法

        數(shù)據(jù)分析采用SPSS 22.0統(tǒng)計軟件,計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,比較用t檢驗或方差分析,方差分析后的兩兩比較用LSD-t檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 LncRNA-ATB在NSCLC和HBEC細胞中的表達

        qRT-PCR結(jié)果顯示,LncRNA-ATB在HBEC細胞中的相對表達量為(1.000±0.050),在NSCLC的A549細胞中相對表達量為(4.319±0.158),在NSCLC的NCI-H23細胞中相對表達量為(4.753±0.031)。經(jīng)方差分析,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=25.417,P=0.011)。進一步兩兩比較經(jīng)LSD-t檢驗,NSCLC的A549和NCI-H23細胞中LncRNA-ATB表達水平高于HBEC細胞(t=5.435和6.416,P=0.016和0.014)。見圖1。

        圖1 NSCLC和HBEC細胞中LncRNA-ATB的表達水平比較 (±s)

        本研究合成特異性沉默LncRNA-ATB表達的shRNA,qRT-PCR結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC的A549和NCI-H23細胞中LncRNA-ATB的相對表達量均為(1.000±0.050);轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB shRNA的A549和NCI-H23細胞中LncRNA-ATB的相對表達量分別為(0.228±0.027)和(0.332±0.019),經(jīng)t檢驗,兩組間LncRNA-ATB表達差異有統(tǒng)計學(xué)意義(A549:t=5.731,P=0.021;NCI-H23:t=4.135,P=0.029)。LncRNA-ATB shRNA 可有效地沉默NSCLC細胞中LncRNA-ATB的表達(見圖2)。

        2.2 LncRNA-ATB與NSCLC細胞轉(zhuǎn)移能力的關(guān)系

        轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC的A549和NCI-H23細胞的相對轉(zhuǎn)移細胞率為(100.0±5.0)%;轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB shRNA的A549和NCI-H23細胞的相對轉(zhuǎn)移細胞率為(25.3±3.2)%和(30.9±3.8)%,經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(A549:t=4.332,P=0.033;NCI-H23:t=3.451,P=0.037),沉默 Lnc-ATB可抑制NSCLC細胞的轉(zhuǎn)移能力。見圖3、4。

        圖2 轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC和LncRNA-ATB shRNA的A549、NCI-H23細胞中LncRNA-ATB的表達水平比較 (±s)

        圖3 LncRNA-ATB促進NSCLC細胞轉(zhuǎn)移 (×200)

        圖4 轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC和LncRNA-ATB shRNA的A549、NCI-H23細胞的相對轉(zhuǎn)移細胞率比較 (±s)

        2.3 LncRNA-ATB與NSCLC細胞侵襲能力的關(guān)系

        轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC的A549和NCI-H23細胞的相對侵襲細胞率為(100.0±5.0)%;轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB shRNA的A549和NCI-H23細胞的相對侵襲細胞率為(20.8±2.2)%和(24.9±1.7)%,經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(A549:t=5.482,P=0.017;NCI-H23:t=4.513,P=0.021),沉默 Lnc-ATB可抑制NSCLC細胞的侵襲能力。見圖5、6。

        圖5 LncRNA-ATB促進NSCLC細胞侵襲 (×200)

        圖6 轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC和LncRNA-ATB shRNA的A549、NCI-H23細胞的相對侵襲細胞率比較 (±s)

        2.4 LncRNA-ATB與NSCLC細胞轉(zhuǎn)移距離的關(guān)系

        轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC的A549和NCI-H23細胞的相對轉(zhuǎn)移距離均為(1.000±0.050)μm;轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB shRNA的A549和NCI-H23細胞的相對轉(zhuǎn)移距離為(0.423±0.024)和(0.381±0.029)μm,經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(A549:t=2.317,P=0.042,NCI-H23:t=2.726,P=0.039),沉默 Lnc-ATB可縮短NSCLC細胞的轉(zhuǎn)移距離。見圖7、8。

        2.5 LncRNA-ATB在NSCLC細胞中吸附miR-141

        生物信息學(xué)預(yù)測結(jié)果顯示,LncRNA-ATB存在miR-141結(jié)合位點。熒光素酶報告基因結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染miR-141 NC和miR-141 mimics的pmirGLOLncRNA-ATB相對熒光強度分別為(1.000±0.050)和(0.346±0.029),經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=2.817,P=0.037),miR-141 mimics可特異性地與pmirGLO-LncRNA-ATB結(jié)合,并降低其熒光強度。見圖9。

        圖7 LncRNA-ATB延長NSCLC細胞轉(zhuǎn)移距離 (×100)

        圖8 轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC和LncRNA-ATB shRNA的A549、NCI-H23細胞的相對轉(zhuǎn)移距離比較 (±s)

        圖9 兩組相對熒光強度比較 (±s)

        2.6 LncRNA-ATB在NSCLC細胞中下調(diào)miR-141的表達

        轉(zhuǎn)染miR-141 NC的A549和NCI-H23細胞中LncRNA-ATB的相對表達量均為(1.000±0.050);轉(zhuǎn)染miR-141 mimics的A549和NCI-H23細胞中LncRNA-ATB的相對表達量分別為(1.032±0.019)和(0.983±0.029),經(jīng)t檢驗,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(A549:t=0.618,P=0.295;NCI-H23:t=0.561,P=0.332),轉(zhuǎn)染miR-141 mimics不能降低NSCLC細胞中LncRNA-ATB的表達水平(見圖10)。轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC的A549和NCI-H23細胞中miR-141的相對表達水平均為(1.000±0.050);轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB shRNA的A549和NCI-H23細胞中miR-141的相對表達水平為(3.517±0.132)和(2.771±0.216),經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(A549:t=5.321,P=0.009;NCI-H23:t=4.316,P=0.015),沉默NSCLC細胞中LnRNA-ATB的表達可促進miR-141的表達(見圖11)。

        圖10 轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC和LncRNA-ATB shRNA的A549、NCI-H23細胞中LncRNA-ATB的表達水平比較 (±s)

        圖11 轉(zhuǎn)染LncRNA-ATB NC和LncRNA-ATB shRNA的A549、NCI-H23細胞中miR-141的表達水平比較 (±s)

        3 討論

        LncRNA在多種腫瘤中異常表達,并與腫瘤細胞的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),是近年來研究的熱點之一。LncRNA-ATB位于14號染色體(ENST00000493038),在肝細胞癌中表達上調(diào),與肝細胞癌患者不良預(yù)后密切相關(guān)[7]。更為重要的是,多項研究表明lncRNAATB在胃癌[8]、結(jié)腸癌[9]、乳腺癌[10]及甲狀腺乳頭狀癌[11]等多種腫瘤中異常高表達,并與腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。最新研究顯示,LncRNA-ATB在NSCLC組織中的表達異常升高,并與NSCLC患者不良預(yù)后密切相關(guān)[12]。本研究結(jié)果顯示,LncRNA-ATB在NSCLC細胞中的表達水平高于HBEC細胞。沉默NSCLC細胞中l(wèi)ncRNA-ATB的表達后,NSCLC的侵襲和轉(zhuǎn)移能力受抑制,提示lncRNA-ATB可能在NSCLC細胞中扮演抑癌基因的角色。

        值得注意的是,一些IncRNAs可以作為競爭性內(nèi)源性RNA(competing endogenous RNAs, ceRNA),通過與miRNA特異性地結(jié)合而調(diào)控其靶基因。研究顯示,LncRNA-HOTAIR可通過與miR-331-3p結(jié)合而調(diào)控HER2的表達,從而促進乳腺癌的進展[13]。LncRNAARSR可作為miR-34和miR-449的ceRNA,促進AXL和c-MET的表達,從而促進腎細胞癌細胞對舒尼替尼耐藥[14]。在肝細胞癌中,LncRNA-ATB可作為miR-200家族的ceRNA,調(diào)控ZEB1和ZEB2的表達[7]。本研究結(jié)果顯示,LncRNA-ATB可與miR-141特異性結(jié)合并調(diào)控其表達,提示LncRNA-ATB在NSCLC細胞中可能作為miR-141的ceRNA,調(diào)控NSCLC細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。

        miR-141屬于miR-200家族。研究顯示,miR-200家族與腫瘤干細胞形成、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化關(guān)系密切[15]。在miR-200家族中,miR-200bc/429和miR-200a/141簇在序列上有高度同源性[16]。多項研究顯示,miR-200/141可抑制頭頸部鱗狀細胞癌、NSCLC、女性生殖系統(tǒng)腫瘤和腎細胞癌等多種腫瘤細胞的侵襲、轉(zhuǎn)移、增殖及耐藥[17-19]。更為重要的是研究顯示,在胃癌中LncRNA-ATB可與miR-141特異性結(jié)合,并降低其表達水平[20]。本研究結(jié)果顯示,LncRNA-ATB在NSCLC細胞中可特異性結(jié)合miR-141,并降低其表達水平,與既往研究結(jié)果一致。此外,本研究結(jié)果顯示,LncRNA-ATB可促進NSCLC細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。結(jié)合既往文獻,筆者推測LncRNA-ATB可能通過競爭性地與miR-141結(jié)合并促進其降解,而解除miR-141對下游靶基因的抑制,從而促進NSCLC細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。值得注意的是LncRNA-ATB在乳腺癌[10]、腎癌[14]、肝癌[7]等多種腫瘤細胞中高表達,并可通過上調(diào)ZEB1、c-MET等,促進腫瘤細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移,因此LncRNA-ATB吸附miR-141僅為其促進NSCLC細胞侵襲和轉(zhuǎn)移的機制之一,更為復(fù)雜的作用機制仍需進一步研究證實。

        綜上所述,本研究通過qRT-PCR檢測NSCLC和HBEC細胞中LncRNA-ATB的表達差異,發(fā)現(xiàn)LncRNA-ATB在NSCLC細胞中的表達水平高于HBEC細胞。沉默NSCLC細胞中LncRNA-ATB的表達后,NSCLC細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移能力降低。研究結(jié)果顯示,LncRNA-ATB在NSCLC細胞中可吸附并下調(diào)miR-141的表達。本研究進一步明確NSCLC細胞侵襲和轉(zhuǎn)移的分子機制,有助于發(fā)現(xiàn)新的NSCLC靶向治療靶點。

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