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        LncRNA在胃癌早期診斷中的研究進(jìn)展

        2019-01-19 03:57:30頡晚林綜述孫軼華審校
        國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志 2019年1期
        關(guān)鍵詞:外泌體標(biāo)志物編碼

        鄒 磊,頡晚林,張 鑫 綜述,孫軼華△ 審校

        (1.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院檢驗科,黑龍江哈爾濱 150086;2.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院檢驗科,黑龍江哈爾濱 150086)

        胃癌是惡性腫瘤最常見的類型之一,是全球第二大癌癥相關(guān)死亡原因。由于早期胃癌具有非特異度癥狀,患者往往晚期才能確診。臨床數(shù)據(jù)表明,晚期胃癌患者術(shù)后5年生存率僅為30%~40%,而早期胃癌則為70%~90%[1]。因此,早期診治是提高患者5年生存率和改善患者預(yù)后的重要途徑。目前,胃癌的診斷依賴于內(nèi)鏡、病理檢查和腫瘤標(biāo)志物的測定[包括癌胚抗原(CEA)、糖鏈抗原19-9(CA19-9)、癌抗原72-4(CA72-4)和癌抗原50(CA50)等]。然而,內(nèi)窺鏡和病理檢查雖然是確診胃癌的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但因其費用較高、取材困難和患者痛苦大,并不能用于早期癌癥的篩查。腫瘤標(biāo)記物也因缺乏高特異度和靈敏度[2],效用有限。因此,為優(yōu)化治療策略、預(yù)測療效并延長患者生存期,必須盡快確定早期新型診斷標(biāo)志物。循環(huán)長非編碼RNA(lncRNA)由于可直接從患者血漿和血清中檢測,具有檢測方便快捷、無創(chuàng)傷性、高靈敏度和特異度等優(yōu)點被視為胃癌潛在的腫瘤標(biāo)志物。

        1 lncRNA簡介

        lncRNA是長度超過200個核苷酸的功能性RNA。在各種生理過程中l(wèi)ncRNA在控制基因表達(dá)方面具有關(guān)鍵作用。lncRNA的異常表達(dá)是發(fā)生腫瘤的重要因素,并參與了血管的發(fā)生和細(xì)胞增殖、遷移和凋亡[3-4]。lncRNAs表現(xiàn)出廣泛的生物學(xué)功能,且可與mRNA和微小RNA(miRNA)結(jié)合具有以下功能:(1)作為miRNA或翻譯因子調(diào)節(jié)基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)因子[5];(2)作為miRNA的內(nèi)源性抑制劑[5];(3)作為增強子RNA與mRNA競爭負(fù)伸長因子復(fù)合物結(jié)合靶向啟動子進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)控[6];(4)作為表觀遺傳或染色質(zhì)修飾復(fù)合物的配體[7];(5)與其相應(yīng)的剪接的mRNA雜交以形成雙鏈RNA(dsRNA),其由Dicer酶切割以產(chǎn)生內(nèi)源性小干擾RNA以調(diào)節(jié)基因表達(dá)[8];(6)通過腫瘤抑制基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控或腫瘤抑制因子靶基因的激活直接調(diào)控腫瘤抑制信號的傳導(dǎo)[9];(7)通過直接lncRNA-mRNA相互作用的基因表達(dá)調(diào)控[10]。越來越多的證據(jù)表明,lncRNA異常表達(dá)與胃癌的發(fā)生、轉(zhuǎn)移和患者預(yù)后相關(guān)。

        2 LncRNA在胃癌發(fā)生、發(fā)展中的作用研究

        2.1通過調(diào)控細(xì)胞周期進(jìn)程,促使上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT),促進(jìn)胃癌進(jìn)展 有研究表明,LINC00978、lncRNA-分化拮抗非蛋白質(zhì)編碼RNA(DANCR)、lncRNA-癌癥易感性候選者15(CASC15)和 lncRNA-鋅指結(jié)構(gòu)反義轉(zhuǎn)錄本1(ZFAS1)等在胃癌組織、血清樣品和細(xì)胞系中的表達(dá)水平升高[11-14]。這些lncRNAs可通過誘導(dǎo)細(xì)胞周期停滯和抑制細(xì)胞凋亡促進(jìn)細(xì)胞增殖,且通過影響EMT進(jìn)展抑制或加速細(xì)胞遷移和侵入,促進(jìn)胃癌進(jìn)展。在胃癌發(fā)生時lncRNA-DANCR可被人婆羅雙樹樣基因4(SALL4)激活,并通過激活β-連環(huán)蛋白途徑發(fā)揮其致癌活性。LINC00978升高可促使胃癌細(xì)胞中轉(zhuǎn)化生長因子β(TGF-β)/SMAD信號傳導(dǎo)途徑的活化。此外,PAN等[14]還發(fā)現(xiàn),lncRNA-ZFAS1可通過外泌體遞送的方式,介導(dǎo)胃癌細(xì)胞-細(xì)胞間的信息交流,促進(jìn)胃癌的發(fā)生、發(fā)展。

        2.2通過競爭性內(nèi)源RNA(ceRNA)機制影響下游信號通路,促進(jìn)胃癌進(jìn)展 2011年SALMENA等[15]提出了ceRNA假說,假設(shè)任何含有miRNA應(yīng)答元件(MREs)的RNA分子均可隔離來自共享相同MRE的其他靶標(biāo)的miRNA,從而調(diào)節(jié)其功能。已有研究表明,在胃癌中,lncRNAs可作為競爭miRNA結(jié)合的ceRNAs,從而抑制miRNA靶向的mRNA的表達(dá)[16-17]。目前,在胃癌中,已發(fā)現(xiàn)頗多l(xiāng)ncRNA的ceRNA機制[18-20]。ZHENG等[21]發(fā)現(xiàn),lncRNA-LINC01410通過抑制miR-532-5p表達(dá),導(dǎo)致中性粒細(xì)胞胞漿因子2(NCF2)表達(dá)增多和核因子κB (NF-κB)通路的持續(xù)激活,促進(jìn)胃癌轉(zhuǎn)移和血管生成。且NCF2反過來可通過NF-κB增加啟動子活性和LINC01410的表達(dá),從而形成正向反饋回路,驅(qū)動胃癌的惡性行為。lncRNA-尿路上皮癌相關(guān)基因1(UCA1)可調(diào)節(jié)磷酸肌醇-3激酶-蛋白激酶B-哺乳動物雷帕霉素蛋白(PI3K-Akt-mTOR)信號蛋白及其下游介質(zhì),促進(jìn)體外和體內(nèi)胃癌進(jìn)展[22]。lncRNA-溶質(zhì)載體家族7成員11(SLC7A11)-反義RNA1(AS1)在胃癌中顯著下調(diào),且可通過ASK1-p38-MAPK/c-Jun N端激酶途徑(JNK)信號通路調(diào)控SLC7A11的表達(dá),促進(jìn)體外和體內(nèi)腫瘤的生長[23]。此外,YUAN等[24]還發(fā)現(xiàn),lncRNA-CAT104通過抑制鋅指E盒結(jié)合同源框1調(diào)控miR-381的表達(dá),進(jìn)而誘導(dǎo)JNK和NCIN87細(xì)胞Wnt/β-連環(huán)蛋白信號通路的激活,促進(jìn)胃癌的發(fā)生、發(fā)展。

        2.3其他 除以上的機制外,在胃癌中,也發(fā)現(xiàn)了LncRNAs可通過影響自噬、代謝應(yīng)激和缺氧3個方面促進(jìn)胃癌的惡性進(jìn)展。一方面,CHEN等[25]發(fā)現(xiàn),lncRNA-HOXD反義生長相關(guān)長非編碼RNA(HAGLROS)表達(dá)的外源性下調(diào)顯著抑制了細(xì)胞增殖、侵襲和遷移。lncRNA-HAGLROS以2種方式調(diào)節(jié)mTOR信號:(1)HAGLROS通過拮抗miR-100-5p介導(dǎo)的mTOR mRNA抑制競爭性地吸引miR-100-5p以增加mTOR表達(dá);(2)HAGLROS與哺乳動物雷帕霉素靶蛋白復(fù)合物1(mTORC1)組分相互作用以激活mTORC1信號通路,抑制自噬,從而促進(jìn)過度增殖并維持胃癌細(xì)胞的惡性表型。另一方面,ZHAO等[26]發(fā)現(xiàn),lncRNA-結(jié)腸癌轉(zhuǎn)移相關(guān)基因1(MACC1)-AS1在胃癌組織中表達(dá)顯著升高。在代謝應(yīng)激狀態(tài)下,LncRNA-MACC1-AS1升高,并穩(wěn)定了MACC1 mRNA,使MACC1轉(zhuǎn)錄增強,通過AMPK/Lin28途徑協(xié)調(diào),促進(jìn)代謝可塑性,促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖并抑制細(xì)胞凋亡。再者,LIU等[27]發(fā)現(xiàn),lncRNA-BC005927在胃癌樣品中表達(dá)上調(diào)。在缺氧條件下,缺氧誘導(dǎo)因子-1α(HIF-1α)能調(diào)控lncRNA-BC005927表達(dá)升高,導(dǎo)致轉(zhuǎn)移相關(guān)基因表達(dá)升高,促進(jìn)胃癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移。

        3 LncRNA對胃癌的診治和預(yù)后評估價值

        目前,通過高通量測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)大量LncRNAs的表達(dá)水平與胃癌組織學(xué)分級、腫瘤直徑、TNM分期、淋巴轉(zhuǎn)移、神經(jīng)周圍浸潤、靜脈入侵等密切相關(guān)。已證實胃癌患者血漿lncRNA-H19、lncRNA-AK001058、lncRNA-INHBA-AS1、lncRNA-MIR4435-2HG、lncRNA-轉(zhuǎn)錄因子ccAAT-增強子結(jié)合蛋白α(CEBPA-AS1)、lncRNA-組織分化誘導(dǎo)非蛋白編碼RNA(TINCR)和lncRNA-LINC00857等表達(dá)均明顯升高[28-30],血清lncRNA-肝癌高表達(dá)長鏈非編碼RNA(HULC)、lncRNA尿路上皮癌相關(guān)基因1-α(CUDR)、lncRNA-應(yīng)激誘導(dǎo)長鏈非編碼轉(zhuǎn)錄體5(LSINCT-5)和lncRNA-PTEN同源假基因1(PTENP1)對胃癌具有診斷(表1)和預(yù)后評估價值[31-32]。且相較于單一腫瘤標(biāo)志物——CEA檢測,無論是lncRNA-H19和CEA的聯(lián)合檢測,還是5種血漿lncRNAs[TINCR、結(jié)腸癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄體2(CCAT2)、AOC4P、BRAF激活的長鏈非編碼RNA(BANCR)和LINC00857]的聯(lián)合檢測均顯示出了更高的診斷價值,增強了診斷胃癌的靈敏度。有研究表明,在胃癌患者的外泌體中,LINC00152顯著增加[33]。

        LINC00152主要存在于胃癌患者血漿和外泌體中,但血漿和外泌體LINC00152水平比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。表明外泌體可能在體內(nèi)循環(huán)過程中保護(hù)了lncRNA免于降解[33]。同時,ZHAO等[34]發(fā)現(xiàn),胃癌患者血清外泌體lncRNA-HOXA遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)錄體(HOTTIP)和lncRNA-ZFAS1的表達(dá)水平高于健康個體。且胃癌患者血清外泌體LncRNA-HOTTIP的受試者工作特征曲線的曲線下面積(AUC)為0.827,顯示出比CEA、CA19-9和CA72-4(AUC分別為0.653、0.685和0.639)更高的診斷能力,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001)。體現(xiàn)了lncRNAs作為腫瘤標(biāo)志物用于胃癌診斷的優(yōu)越性,且胃癌患者外泌體型lncRNAs對胃癌的早期診斷更加敏感。

        表1 作為胃癌診斷標(biāo)記物的lncRNA的最新研究進(jìn)展

        lncRNA除對胃癌具有診斷價值外,lncRNAs還可作為胃癌治療的新靶標(biāo)。一方面,通過對胃癌相關(guān)lncRNAs發(fā)揮基因調(diào)控功能的機制研究,找出lncRNA和下游靶蛋白,采用RNA干擾技術(shù)和開發(fā)相關(guān)蛋白的小分子抑制劑治療胃癌[35]。另一方面,可借由lncRNA干預(yù)化療藥物多重耐藥(MDR),增強化療藥物的敏感性,提高化療的療效。一些研究已證明,部分胃癌相關(guān)lncRNA與藥物抗性有關(guān)。LIU等[36]發(fā)現(xiàn),lncRNA-CDKN1A反義鏈啟動子DNA損傷激動RNA(PANDAR)水平是判斷早期腫瘤組與健康組,轉(zhuǎn)移灶組和非化療敏感組胃癌患者化療耐藥的標(biāo)志物。PANDAR可通過競爭性結(jié)合p53蛋白控制CDKN1A基因轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)體內(nèi)胃癌的生長,與其他化療藥物聯(lián)用會具有不同的抗腫瘤作用。ZHOU等[37]研究表明,人漿細(xì)胞瘤轉(zhuǎn)化遷移基因1(PVT-1)在順鉑耐藥患者、BGC823/DDP和SGC7901/DDP細(xì)胞的胃癌組織中高度表達(dá)。PVT-1過度表達(dá)具有抗凋亡活性,且在順鉑耐藥性胃癌細(xì)胞中改善MDR相關(guān)基因,如MDR1、mTOR、MRP和HIF-1α的表達(dá)。

        UCA1可通過UCA1-miR-27b軸參與胃癌細(xì)胞化療靈敏度的調(diào)控。UCA1過表達(dá)和miR-27b抑制來增加了阿霉素(ADR)、DDP和5-氟脲嘧啶(5-FU)在SGC7901細(xì)胞中的半抑制濃度(IC50),減少SGC7901/ADR細(xì)胞凋亡,下調(diào)多聚腺苷二磷酸核糖聚合酶蛋白表達(dá),增加抗凋亡蛋白的表達(dá)[38]。在BGC823/ADR和SGC7901/ADR細(xì)胞中,敲低lncRNA-CASC9可恢復(fù)其對紫杉醇和阿霉素的敏感性[39]。表明lncRNAs是治療胃癌的潛在靶點。

        此外,lncRNA也可作為評估胃癌患者預(yù)后的重要指標(biāo)。通過收集臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)后統(tǒng)計分析的研究已證明lncRNA-HOTTIP、lncRNA-SLC7A11-AS1和lncRNA-CASC15等與胃癌患者的預(yù)后不良密切相關(guān)[23,34,40]。同時,Liu等發(fā)現(xiàn),觀察術(shù)前胃癌患者與健康個體血漿lncRNA-FER-1樣蛋白4(FER1L4)的表達(dá)水平比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。然而,術(shù)后2周在胃癌患者中觀察到表達(dá)水平急劇下降[41],表明了lncRNA-FER1L4作為評估胃癌患者預(yù)后的生物標(biāo)志物的潛力。因此,lncRNA可能是評價胃癌患者預(yù)后的潛在標(biāo)志物,具有研究價值。

        4 LncRNA可作為胃癌的早期診斷標(biāo)志物

        許多血清標(biāo)志物[包括CEA、CA19-9、CA72-4、CA125、癌抗原242(CA242)和CA50]被廣泛用于胃癌的檢測。然而,低靈敏度或低特異度降低了其對胃癌的臨床診斷價值。大量非蛋白質(zhì)編碼的轉(zhuǎn)錄物以前被認(rèn)為是基因組內(nèi)的“垃圾”。

        隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,多種非編碼RNA的功能發(fā)現(xiàn)引起了許多研究人員的關(guān)注,并促使其在發(fā)病機制中尋找與疾病密切相關(guān)的非編碼RNAs。有證據(jù)表明,lncRNAs在癌癥中的失調(diào)表達(dá)會改變疾病的進(jìn)展,并可能作為多種類型癌癥的獨立生物標(biāo)志物[8]。

        本文強調(diào)了胃癌檢測、診治中的lncRNA的重要性。首先,檢測循環(huán)lncRNA,相較于胃鏡等有創(chuàng)檢查手段,只需采集體液,具有非侵入性的檢測特點,大大減輕了患者痛苦和檢測的繁瑣。其次,盡管lncRNA的使用具有許多限制,如lncRNA檢測的不同方法及研究中驗證步驟的小群組大小。前瞻性研究驗證了使用lncRNA作為不同人群胃癌檢測診斷生物標(biāo)志物的可行性。同時,相較于常規(guī)腫瘤標(biāo)志物(如CA19-9、CA125、CA72-4、CA242、CA50、CEA和胃蛋白酶原),lncRNA具有更高的靈敏度和特異度,尤其是血漿外泌體型lncRNA。此外,lncRNA組合檢測及其與常規(guī)腫瘤標(biāo)志物的聯(lián)合檢測還可大大提高診斷胃癌的準(zhǔn)確度。因此,lncRNA可作為胃癌早期診斷的標(biāo)志物。

        5 小 結(jié)

        人類血液除有大量miRNA外,還含有豐富的lncRNA。lncRNA可通過高通量測序技術(shù)或微陣列檢測,并通過逆轉(zhuǎn)錄PCR驗證,體現(xiàn)了lncRNA在胃癌檢測中的潛在應(yīng)用價值。這些小核酸(lncRNA、miRNA和其他)能將胃癌患者與健康個體區(qū)分開來,具有實用性、非侵入性和成本效益等優(yōu)點,是早期篩查胃癌的有效手段。同時,lncRNA與常規(guī)腫瘤標(biāo)志物(如CA19-9、CA125、CA72-4、CA242、CA50、CEA和胃蛋白酶原)的聯(lián)合檢測能優(yōu)化診斷胃癌的準(zhǔn)確度。隨著lncRNA在胃癌中研究的逐漸深入,lncRNA也被視為評估預(yù)后的標(biāo)志物和靶向治療的新靶點。遺憾的是,盡管現(xiàn)有的研究已發(fā)現(xiàn)了大量與胃癌相關(guān)的lncRNA,且可作為胃癌生物標(biāo)志物。但由于驗證樣本量較少,仍需更大規(guī)模的臨床驗證,才能用于臨床。因此,胃癌相關(guān)lncRNA的研究具有很大的發(fā)展?jié)摿?,lncRNA作為早期診斷胃癌的腫瘤標(biāo)志物,也有待于進(jìn)一步的用基礎(chǔ)與臨床試驗證實。

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