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        2016—2018年我國部分豬群塞尼卡病毒回顧性監(jiān)測

        2019-01-18 01:00:14張麗麗董雅琴吳發(fā)興李曉成
        中國動(dòng)物檢疫 2019年1期
        關(guān)鍵詞:檢測

        張 志,張麗麗,2,張 峰,劉 爽,董雅琴,張 慧,崔 進(jìn),吳發(fā)興,李曉成

        (1. 中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心,山東青島 266032;2. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué),山東青島 266019)

        塞尼卡病毒(Senecavirus A,SVA)曾用名塞尼卡谷病毒(Seneca Vally virus,SVV),是最近新發(fā)現(xiàn)的可以感染豬的一種單股RNA病毒,屬于小核糖RNA病毒科[1]。SVA最初從轉(zhuǎn)化的胎兒成視網(wǎng)膜細(xì)胞PER.C6的細(xì)胞培養(yǎng)基中被發(fā)現(xiàn)和分離到,并用于人溶瘤病毒治療[2]。后來發(fā)現(xiàn)豬也可以感染SVA,并且發(fā)現(xiàn)發(fā)病豬的鼻吻部、蹄部冠狀帶等部位可以出現(xiàn)水泡樣病變[3]。這種病變?cè)谂R床上與口蹄疫、豬水泡性口炎、豬水皰病、豬水泡性疹等疾病十分相似,僅靠臨床診斷很難鑒別[4]。近年來,SVA在豬群的感染范圍呈現(xiàn)逐年擴(kuò)大趨勢,美國、加拿大、巴西、中國、泰國、哥倫比亞等養(yǎng)豬業(yè)較發(fā)達(dá)國家先后從出現(xiàn)水泡病的豬病料中檢測到SVA[4-8]。2015年夏天,我國廣東省某豬場發(fā)生了水泡樣疾病,在排除口蹄疫、豬水皰病、豬水泡性口炎等疫病后,證實(shí)感染病原為SVA,且分離到SVA毒株CH-01-2015。該毒株與參考毒株SVV-001的同源性為94.4%~97.1%,這是我國首次報(bào)道豬場感染SVA[6]。隨后,我國學(xué)者又分別從湖北、黑龍江、福建、河南等省份出現(xiàn)水泡病的豬病料中先后檢測到SVA[9-12]。這些研究提示,我國豬群SVA的感染狀況較為嚴(yán)重。但上述研究分離檢測到SVA的樣品均為發(fā)病的水泡樣品,并沒有針對(duì)SVA開展系統(tǒng)的流行病學(xué)調(diào)查和監(jiān)測。一些流行病學(xué)信息,特別是未表現(xiàn)癥狀的外觀健康豬群是否攜帶SVA更是亟待摸清。為此,針對(duì)2016—2018年從部分省市屠宰場和表現(xiàn)非水泡狀豬群采集的樣品,開展了SVA回顧性監(jiān)測,以了解SVA在我國豬群的感染程度和分布規(guī)律。

        1 材料與方法

        1.1 樣品與來源

        458份組織混合樣品和95份血清樣品:2018年采集自廣西、云南、新疆、遼寧、福建、湖南、湖北等7省份的屠宰場;病料樣品164份:2016—2018年采自遼寧、河北、湖北、湖南、江西、四川、山東、上海、貴州、吉林、陜西、云南等12省份,其中2018年84份、2017年32份、2016年48份。采集樣品時(shí),每頭豬采集適量的扁桃體、脾臟、腎臟、淋巴結(jié)、肺臟等混在一起,作為一個(gè)樣品進(jìn)行處理和檢測。

        1.2 主要試劑

        Premix RT-PCR探針法一步法擴(kuò)增試劑盒、pMD-18T vector和DH5α感受態(tài)細(xì)胞:寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;病毒RNA提取試劑盒(TRIzol):Life公司產(chǎn)品。

        1.3 樣品處理與RNA提取

        將樣品稱重后加入4倍體積的PBS(0.01 mol/L,pH7.2)進(jìn)行研磨,待全部乳化后,以8 000 r/min離心5 min,取上清液提取RNA。同時(shí)用本室分離和鑒定的SVA病毒GXT91作為陽性對(duì)照,用PBS作為陰性對(duì)照,同步提取RNA。RNA提取按照TRIzol試劑盒操作說明書進(jìn)行,簡述為:取0.25 mL樣品上清液,加入0.75 mL TRIzol混勻,再加入0.2氯仿混勻;室溫靜置5 min,12 000 r/min離心5 min;取上清液加入等體積異丙醇,12 000 r/min離心5 min,保留沉淀;加入1 mL 70%乙醇洗滌1次,然后加入適量H2O溶解,置-70 ℃?zhèn)溆谩?duì)陽性樣品接種的細(xì)胞上清液,也按照此法提取RNA。

        1.4 樣品檢測

        本研究使用熒光RT-PCR方法,對(duì)樣品中的SVA核酸成分進(jìn)行檢測,根據(jù)GenBank公開的我國SVA毒株序列(KY419132)為靶基因序列設(shè)計(jì)引物。上游引物為SVA-F:ctgcgctgggaccgtatctca;下游引物為:SVA-R:cgccgcgccacctcatt;熒光引物 為SVA-P:5'-FAM-tgccgccaagtttcaatcccatcctgg-3'-BHQ1。反應(yīng)體系為:2×Premix 12.5 μL,SVA- F引物(10 μmol/L)1 μL,SVA- R引物(10 μmol/L)1 μL,SVA- P引物(5 μmol/L)1 μL,樣品RNA模板或陽性標(biāo)準(zhǔn)品2 μL,加水至25 μL。RT-PCR的反應(yīng)程序?yàn)椋?2 ℃ 5 min,95 ℃預(yù)變性3 min,40個(gè)擴(kuò)增循環(huán)(95 ℃ 8 s、60 ℃ 16 s),60 ℃讀取熒光。SVA的判斷標(biāo)準(zhǔn)為:Ct<35為陽性,35≤Ct<37為可疑,Ct≥37為陰性;可疑者重復(fù)檢測1次,如果仍可疑或陰性,則判為陰性,如果為陽性,則判為陽性。

        1.5 結(jié)果分析

        根據(jù)監(jiān)測結(jié)果,使用Excel、ArcGIS等軟件進(jìn)行分析,摸清SVA的三間分布。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 屠宰場樣品檢測情況

        本研究對(duì)7個(gè)省份的35個(gè)屠宰場進(jìn)行了回顧性調(diào)查,對(duì)458份組織混合樣品和95份血清樣品進(jìn)行回顧性檢測。在混合組織樣品中,檢出SVA陽性55份,陽性率為12.0%;在血清樣品中,檢出陽性7份,陽性率為7.4%。在35個(gè)屠宰場中,有17個(gè)檢出SVA陽性樣品,場陽性率為48.6%。雖然7個(gè)省份均有屠宰場檢出SVA陽性,但陽性率并不相同,最高的是福建,5個(gè)屠宰場均檢測到陽性,場陽性率為100%,其次是湖北和新疆,場陽性率分別為66.7%和60.0%,最低的是湖南和云南,場陽性率均為20.0%。7個(gè)省份的SVA樣品陽性率在2.7%~25.0%之間,其中在遼寧的60個(gè)樣品中,檢測到15份陽性,陽性率高達(dá)25.0%(但這些樣品均來自同一個(gè)屠宰場),最低的是湖南和云南,樣品陽性率均為2.7%(表1)。

        2.2 病料SVA檢測情況

        在2016年10個(gè)省份采集的48份病料樣品中,檢出SVA陽性7份,占比為14.6%;2017年5個(gè)省份采集的32份病料樣品中,檢出SVA陽性7份,占比為21.9%。2018年3個(gè)省份采集的84份病料中,檢出SVA陽性19份,占比為22.6%。其中:1—6月份,共檢測病料樣品36份,檢測到SVA陽性5份,占比為13.9%;7—10月份,共檢測病料樣品48份,檢測到SVA陽性14份,占比為29.2%;山東、四川、遼寧等3省份送檢的病料中,均檢測到SVA陽性樣品(表2)。

        2.3 陽性樣品Ct值分布

        從屠宰場62份陽性樣品的SVA熒光RT-PCR擴(kuò)增Ct值分布可以看出(圖1),不同陽性樣品的檢測結(jié)果差異較大。其中:Ct≤20的3個(gè)(占4.8%),20<Ct≤25的1個(gè)(占1.6%),25<Ct≤30的10個(gè)(占16.1%),30<Ct≤35的40個(gè)(占64.5%),35<Ct≤37的8個(gè)(占12.9%)。這一結(jié)果表明,除少數(shù)陽性樣品以外,大部分陽性樣品中含有的SVA病毒數(shù)量并不多。

        圖1 屠宰場樣品中SVA熒光RT-PCR擴(kuò)增Ct值的分布

        從病料樣品SVA熒光RT-PCR擴(kuò)增Ct值分布可以看出,25<Ct≤30的1個(gè)(占2.9%),30<Ct≤35的31個(gè)(占91.2%),35<Ct≤37的2個(gè)(占5.9%),說明未表現(xiàn)水泡樣病變的樣品與屠宰場樣品中含有的SVA病毒數(shù)量分布基本一致(圖2)。

        2.4 時(shí)間分布情況

        2016—2018年的病料樣品SVA監(jiān)測結(jié)果顯示:2016年3個(gè)省份檢出陽性,占比為14.6%,2017年5個(gè)省份檢出陽性,占比為21.9%,2018年3個(gè)省份檢出陽性,占比為22.6%,呈現(xiàn)逐年增加的趨勢,也表明SVA早在2016年就已在我國多個(gè)省份的豬群中流行。

        表1 屠宰場樣品SVA檢測情況

        表2 我國部分省份豬病料中的SVA檢出結(jié)果 單位:份

        圖2 屠宰場樣品和發(fā)病樣品中SVA陽性樣品的比例分布

        3 討論

        本監(jiān)測研究了SVA 時(shí)間、空間分布等流行病學(xué)規(guī)律,通過對(duì)保存的病料進(jìn)行檢測,證實(shí)SVA在我國豬群的流行至少可以追溯到2016年,與Wu等[6]報(bào)道的時(shí)間基本一致。通過對(duì)不同時(shí)間樣品進(jìn)行檢測發(fā)現(xiàn),2016年SVA存在于遼寧、四川和山東等3個(gè)省份,2017年存在于遼寧、四川、山東、上海、貴州等5個(gè)省份,2018年存在于遼寧、上海和山東等3個(gè)省份。2018年對(duì)7個(gè)省份的36個(gè)屠宰場進(jìn)行監(jiān)測發(fā)現(xiàn),調(diào)查的湖南、云南、新疆、遼寧、福建、湖北、廣西等7省份均有不同程度的SVA感染,個(gè)體樣品陽性率為11.2%(2.7%~25.0%),場陽性率為48.6%(20.0%~100%)。因調(diào)查的屠宰場位于不同的縣,所以屠宰場陽性率更能反映出SVA的污染面??紤]到福建、湖北等省份已有檢測到SVA的報(bào)道[9,12],且本次監(jiān)測的福建(100%)和湖北(80.0%)屠宰場陽性率均較高,由此認(rèn)為福建和湖北兩省SVA的污染面較廣。另外,有學(xué)者報(bào)道,我國的黑龍江、河南、福建、湖北、廣東等5省均檢測到SVA感染[9-12]。從以上結(jié)果可以看出,我國感染SVA的省份至少已有14個(gè)(圖3)。

        另外,本次監(jiān)測雖然在部分省份采集的樣品較少,如上海、貴州等地僅3個(gè)樣品,但也能檢測到SVA陽性,還有很多省份沒有采樣監(jiān)測,因此推測我國的SVA實(shí)際感染情況應(yīng)該比上述監(jiān)測結(jié)果更嚴(yán)重。當(dāng)然我國實(shí)際的SVA感染情況和流行面,還需要在后續(xù)工作中進(jìn)一步深入研究。

        根據(jù)Joshi等[13]的試驗(yàn),將SVA毒株SD15-26接種豬以后,第4~5天就可呈現(xiàn)水泡病變,接種后第3天病毒血癥最高,病毒拷貝數(shù)可達(dá)106.5個(gè)/mL,隨后病毒含量逐漸下降,到接種后第10天,血液中已檢測不出病毒RNA,但組織中的RNA直到接種后第28天才檢測不出。另外,不同器官的SVA檢出率也不同,扁桃體中檢測到的病毒含量最高。本實(shí)驗(yàn)室已證明,本次檢測使用的熒光RT-PCR方法的敏感性較高病毒拷貝數(shù)可達(dá)17.4個(gè)/μL。在用該方法對(duì)屠宰場樣品和發(fā)病樣品進(jìn)行檢測時(shí),病毒拷貝數(shù)大于106.5個(gè)/mL的只有來自屠宰場的3個(gè)樣品,而病毒拷貝數(shù)為174~1 740個(gè)/mL的樣品有58份,占陽性樣品總數(shù)的61.1%,病毒拷貝數(shù)為10~174個(gè)/mL的樣品有20份,占陽性樣品總數(shù)的21.1%,二者共計(jì)82.2%。從這一結(jié)果可以看出,病毒含量較低的樣品,在陽性樣品中占主要比例,這可能與病毒的代謝周期較快有關(guān)。

        圖3 我國SVA感染的空間分布

        本調(diào)查是在我國豬群中首次開展的SVA流行病學(xué)監(jiān)測,盡管樣品的數(shù)量分布不十分規(guī)范和平衡,如有的省份收集的發(fā)病樣品只有幾份甚至1份,影響了結(jié)果的可信性,但這些初步的檢測結(jié)果已充分證明,在外觀健康的豬群中仍然可以檢測到SVA陽性,且陽性率高達(dá)11.2%。這一結(jié)果說明我國豬群中SVA感染已比較常見,同時(shí)本監(jiān)測也證實(shí)了許多生豬存在帶毒不發(fā)病的隱性帶毒現(xiàn)象,這種現(xiàn)象更有利于SVA的傳播和擴(kuò)散。進(jìn)一步比較發(fā)病樣品和外觀健康豬樣品中的SVA檢測情況,發(fā)現(xiàn)發(fā)病豬樣品中的SVA陽性占比為20.7%,明顯高于外觀健康豬群。究其原因,可能與發(fā)病豬免疫力下降有利于SVA的感染和增殖有關(guān)??傊?,即使對(duì)于未表現(xiàn)出典型水泡樣病變的生豬,仍存在攜帶和傳播SVA的風(fēng)險(xiǎn)。另外,Joshi等[14]發(fā)現(xiàn),在感染SVA豬舍的蒼蠅、老鼠糞便、老鼠小腸、環(huán)境樣品中均能檢測到SVA,并從老鼠的糞便和小腸中分離到SVA[14],這意味著在豬群生產(chǎn)和管理中必須格外重視對(duì)外觀健康豬群的監(jiān)視和監(jiān)測。

        4 結(jié)論

        本監(jiān)測對(duì)2016—2018年從我國遼寧等12個(gè)省份采集的豬群病料和2018年從我國福建等7個(gè)省份35個(gè)屠宰場采集的組織混合樣品和血清樣品,用熒光實(shí)時(shí)定量RT-PCR方法進(jìn)行SVA回顧性檢測,在所有檢測省份每年的病料樣品或屠宰場樣品中均檢出SAV陽性,表明SVA在我國豬群的流行至少可以追溯到2016年,且流行面較廣,存在隱性感染狀況,今后須需重視對(duì)豬群SVA的監(jiān)視和監(jiān)測。

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