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        胰腺癌分子分型的研究進展

        2019-01-04 17:44:38孫晨蔣慧鄭建明
        中華胰腺病雜志 2019年4期
        關(guān)鍵詞:樣型亞型基底

        孫晨 蔣慧 鄭建明

        海軍軍醫(yī)大學附屬長海醫(yī)院病理科,上海 200433

        【提要】 胰腺導管腺癌(PDAC)是世界上惡性程度最高的腫瘤之一,近年來發(fā)病率逐步升高,但其生存率并未有明顯提高。PDAC表現(xiàn)為顯著的異質(zhì)性,而這為其分子分型提供了依據(jù)。隨著二代測序技術(shù)的發(fā)展,PDAC的DNA、RNA、蛋白質(zhì)等的突變模式也越來越清楚。本文旨在總結(jié)近年來PDAC的分子分型的研究進展。

        胰腺導管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)是惡性程度最高的腫瘤之一,預后極差,5年生存率<10%[1]。手術(shù)切除輔以化療是唯一的治愈性方案,然而只有15%~20%的患者在診斷時可以進行手術(shù)并且即使在成功切除后,預期的5年生存率也<20%[2]。1999年,美國國家癌癥研究所提出通過分子分析技術(shù),以腫瘤的分子特征為依據(jù)進行分類,首次提出了腫瘤分型這個概念。而后二代測序技術(shù)提供了腫瘤DNA、RNA、蛋白質(zhì)和表觀遺傳等突變資料,這些資料增加了對腫瘤異質(zhì)性的理解,也為腫瘤分類提供了新方法[3]。胰腺癌分子分型的提出對靶向療法、預后評估、個體化治療的發(fā)展起到了至關(guān)重要的作用,本文旨在對近年來國際上提出的胰腺癌分子分型進行綜述。

        一、以基因和染色體突變?yōu)榛A(chǔ)的分型

        早期研究證明,在PDAC中最常見的突變基因是KRAS、SMAD4、TP53以及CDKN2A/B,后通過大量基因測序、相對基因組雜交等技術(shù),ARID1A、GATA6、SF3B1以及TGFBR2等基因的突變也陸續(xù)被發(fā)現(xiàn)[4-6]。Shindo等[7]對854例PDAC患者進行了分析,發(fā)現(xiàn)有3.9%的患者發(fā)生了生殖系突變,而其中最常見的突變基因是BRCA1/2、PALB2、CDKN2A、TP53、MLH1、ATM。

        Waddell等[8]通過對100例PDAC樣本進行全基因組測序和拷貝數(shù)變異分析,以染色體結(jié)構(gòu)改變和涉及的分子機制為基礎(chǔ)將其分為4種亞型,分別為:(1)穩(wěn)定型(20%)。腫瘤基因組有<50個結(jié)構(gòu)突變事件,表現(xiàn)出廣泛的非整倍性,提示在細胞周期或有絲分裂中存在缺陷。其KRAS和SMAD4的點突變率與其他亞型相似,TP53突變率略低于樣本的平均水平(61%比70%)。另外同其他亞型相比,該亞型的端粒的長度無明顯不同。(2)局部重排型(30%)。其在一條或兩條染色體上表現(xiàn)出明顯的局部結(jié)構(gòu)改變,表現(xiàn)為局部基因的擴增或放大和復雜基因的重排。大約有1/3的局部重排型的基因組包含著原癌基因拷貝數(shù)目的增加如KRAS、SOX、GATA6的局部擴增,有時會包括靶向基因如ERBB2、MET、CDK6、PIK3CA及PIK3R3,但發(fā)生率很低。剩余2/3的局部重排型存在著復雜的基因組事件,例如斷裂-融合-橋或染色體碎裂形成環(huán)狀染色體。(3)分散型(36%)。表現(xiàn)出中等程度的非隨機染色體損傷,以及<200個結(jié)構(gòu)改變事件。(4)不穩(wěn)定型(14%)。腫瘤表現(xiàn)出大量的染色體結(jié)構(gòu)改變事件(>200個,最多達558個),這體現(xiàn)了DNA維護的缺陷,提示這種亞型對DNA損傷藥物的敏感性較高。

        二、以基因表達為基礎(chǔ)的分子分型

        Collisson等[9]在2011年首次對PDAC進行了分型。其通過對27個顯微切割的手術(shù)樣本進行分析,將PDAC分為3種亞型:經(jīng)典型、類間充質(zhì)型、外分泌型。(1)經(jīng)典型:其黏附相關(guān)基因和上皮細胞相關(guān)基因的表達增高,且癌細胞內(nèi)GATA6及KRAS mRNA含量較高,預后較其他兩型好。(2)類間充質(zhì)型:間充質(zhì)相關(guān)基因(TWIST1、HK2、CAV1)表達增多,對吉西他濱更敏感,但預后最差。(3)外分泌型:通過免疫組織化學染色,可發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞來源的消化酶基因表達增高。但他們認為外分泌型可能是被腫瘤周圍正常組織污染所致。隨后Janky等[10]通過對118例PDAC和13例正常胰腺組織標本進行分析表明,兩者間共有6 873個基因的表達存在差異,而其中有1 325個基因在PDAC中下調(diào)。其中肝細胞核因子1同源框A/B(hepatocyte nuclear factor 1 homeobox A/B,HNF1A/B)下調(diào)程度最強,其在分化較好的PDAC中表達較低,而在分化較差的PDAC中不表達。該研究同樣證明,經(jīng)典型的預后最好。但與Collisson等的結(jié)果不同的是,他們發(fā)現(xiàn)外分泌型和類間充質(zhì)型的預后相似。

        Moffitt等[11]通過對145例原發(fā)性PDAC、61例轉(zhuǎn)移性PDAC、17個細胞系、46個胰腺和88個遠端部位相鄰的正常樣本進行基因芯片測序,對腫瘤的實質(zhì)和間質(zhì)分別進行了分型:(1)腫瘤實質(zhì)細胞分為經(jīng)典型和基底細胞樣型,并認為這是獨立的預后因子。基底細胞樣型中層粘連蛋白和角蛋白基因表達增高,這與先前在膽囊癌[12-14]和乳腺癌[15]中描述的一致?;准毎麡有偷念A后較經(jīng)典型差,其中位生存時間短(11個月比19個月),生存率低(44%比70%)。(2)間質(zhì)分為激活型間質(zhì)和正常型間質(zhì)。在正常型間質(zhì)中,胰腺星狀細胞的標志物如平滑肌肌動蛋白、波形蛋白和結(jié)蛋白表達相對增高。激活型間質(zhì)的特征是存在一系列與巨噬細胞相關(guān)的基因如整合素ITGAM以及趨化因子配體CCL13/18的表達。激活型間質(zhì)中表達促進腫瘤發(fā)展的相關(guān)基因,包括分泌蛋白SPARC、WNT家族成員WNT2和WNT5A、明膠酶B和間充質(zhì)溶解素3。由于成纖維細胞活化蛋白的出現(xiàn)已被證明與較差預后有關(guān)[16],因此認為激活型間質(zhì)的預后較正常型間質(zhì)較差。另外間質(zhì)和實質(zhì)的預后效應是疊加性的,經(jīng)典型腫瘤+正常型間質(zhì)的危害性最低(HR=0.39),而基底細胞樣型+激活型間質(zhì)的危害性最高(HR=2.28)。

        Bailey等[17]以轉(zhuǎn)錄因子及其下游靶點的表達差異為基礎(chǔ)將PDAC分為4種亞型,分別為鱗狀型、胰腺祖細胞型、免疫型和內(nèi)外分泌分化異常型(aberrantly-differentiated endocrine exocrine, ADEX)。(1)鱗狀型:TP53和KDM6A突變率較高,與炎癥反應、缺氧反應、代謝重編程、TGF-β信號轉(zhuǎn)導、MYC途徑激活、自噬和TP63delN及其靶基因的上調(diào)表達的基因相關(guān)。(2)胰腺祖細胞型:主要表達參與胰腺早期發(fā)育的基因(如PDX1、MNX1、HNF4G HNF4A、HNF1B、HNF1A、FOXA2、FOXA3和HES1)。特征是具有和內(nèi)胚層細胞命運相關(guān)的基因與無融合蛋白的共表達。(3)ADEX型:主要表達參與胰腺發(fā)育和分化的后期階段的基因(NR5A2、MIST1、RBPJL、INS、NEUROD1和MAFA)。(4)免疫型:其特征是存在與T和B細胞信號通路相關(guān)的免疫浸潤及Toll樣受體信號通路,預后極差。而Collisson分類中的類間充質(zhì)型、經(jīng)典型和外分泌型可分別被鱗狀型、胰腺祖細胞型和ADEX型所取代,其基因表達和臨床病理有著共同特征[11,16]。

        最近癌癥基因組圖譜聯(lián)盟重現(xiàn)了二元經(jīng)典型、基底細胞樣型分類,并顯示ADEX亞型和免疫型是由于取材時樣本被瘤周正常組織污染所致。同時鱗狀型、類間充質(zhì)型、基底細胞樣型有著相同的特征;經(jīng)典型、胰腺祖細胞型有著相同的特征[18]。

        三、以腫瘤細胞和腫瘤微環(huán)境的特征為基礎(chǔ)的分子分型

        腫瘤微環(huán)境對患者的預后有顯著的影響。Puleo等[19]對309例PDAC樣本進行了基因表達、靶向DNA測序和免疫組織化學分析,根據(jù)腫瘤細胞和腫瘤微環(huán)境的特征將其分為5種亞型。(1)完全經(jīng)典型:其間質(zhì)特征不明顯,細胞浸潤水平較低,KRAS突變和Gly12Arg較豐富。(2)免疫經(jīng)典型:間質(zhì)特征尤其是結(jié)構(gòu)血管化和免疫間質(zhì)較明顯,存在低蛋白酶體或凋亡信號,伴隨著NK、T、B細胞等免疫細胞的浸潤,且KRAS突變和Gly12Arg較豐富。(3)完全基底細胞樣:由基底樣細胞組成,間質(zhì)信號較低。Gly12Val是主要的突變類型,有MET和Hedgehog通路的激活,與轉(zhuǎn)移擴散顯著相關(guān)。(4)間質(zhì)激活型:間質(zhì)中存在大量α平滑肌肌動蛋白,富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白、成纖維細胞活化蛋白等激活型間質(zhì)的成分。有MET和Hedgehog通路的激活,伴隨著大量的成纖維細胞和內(nèi)皮細胞浸潤且其炎癥成分較多。(5)結(jié)締組織增生型:存在著低腫瘤成分和大量間質(zhì)轉(zhuǎn)錄組信號,包括免疫和炎性間質(zhì)組分特別是結(jié)構(gòu)和血管化間質(zhì)組分的高表達,伴隨著大量免疫細胞、內(nèi)皮細胞及成纖維細胞的浸潤。不同的是,間質(zhì)對預后的影響取決于腫瘤實質(zhì)的亞型。對于經(jīng)典型腫瘤來說,間質(zhì)對預后產(chǎn)生負性影響;而對于基底細胞樣型腫瘤來說則是正性影響。預后最差的是完全基底細胞樣型,其存活時間中位數(shù)為10.3個月;完全經(jīng)典型為43.1個月,免疫經(jīng)典型為37.4個月;間質(zhì)激活型的預后較完全基底型稍好。

        四、以miRNA表達為基礎(chǔ)的分子分型

        miRNA是一類非編碼的、17~25 bp的短RNA分子,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因表達[20-21]。其可以通過結(jié)合mRNA3`非編碼區(qū)導致基因的降解或抑制翻譯來控制基因表達水平[22-23]。其失調(diào)涉及到腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)移,因此miRNA可以作為新型的診斷、預后和治療標志物[24-27]。到目前為止,已有多種miRNA被證明和胰腺癌的預后相關(guān)。miR-142-5p和miR-320c可預測腫瘤對吉西他濱的反應[28-29]。據(jù)報道,miR-200c、miR-142-5p和miR-204的高表達與切除后更好的存活率相關(guān),而miR-155、miR-203、miR-210、miR-222、miR-21和miR-196a-2的高表達與切除后的不良預后相關(guān)[30-32]。Namkung等[33]通過對104例胰腺PDAC樣本進行基因芯片分析得到了1 733種miRNA的表達圖譜。根據(jù)miRNA表達水平的不同,其將PDAC分為高風險、中等風險、低風險3種與預后相關(guān)的亞型。3種亞型的中位生存時間分別是17.2、26.5、32.4個月。又因為低風險型和中等風險型的miRNA基因表達譜相似度較高,所以將其歸為一組,與高風險型相比較,其分類標志為19個miRNA分子(miR-106b-star、miR-324-3p、miR-943、miR-1292、miR-4474-5p、miR-935、miR-668、miR-574-5p、miR-1244、miR-4763-5p、miR-145-star、miR-328、miR-26b-star、miR-615-5p、miR-1914-star、miR-564、miR-3194-5p、miR-4746-3p、miR-4321)。 在高風險組中,miR-574-5p、miR-1244和miR-4474-5p表達上調(diào);而其他16個miRNA則下調(diào)。在效應程度方面,miRNA-54-5p和miR3-243-3p的效應最強。這19種miRNA中的6種(miR-574-5p、miR-1244、miR-145-star、miR-328、miR-26b-star和miR-4321)與總體生存率和無病生存率顯著相關(guān)[33]。

        五、以免疫反應為基礎(chǔ)的分子分型

        Wartenberg等[34]根據(jù)微環(huán)境的免疫細胞組成將PDAC分為3種亞型。(1)免疫逃逸型(54%):其微環(huán)境中CD3、CD4、CD8型T細胞和CD20B細胞較少,但FOXP3+Treg細胞較多;存在局灶性p63表達且KRAS、TP53、CDKN2A、SMAD4及PIK3CA的突變率較高。形態(tài)學上腫瘤出芽程度較高,臨床病理特征不良。以上特征與預后較差(中位生存期10個月)相關(guān)。(2)免疫豐富型(35%):在微環(huán)境中有大量的CD3、CD4、CD8型T細胞和CD20型B細胞,但FOXP3+Treg細胞少。其出芽程度較低,臨床病理特征較好。與免疫逃逸型相比,CDKN2A、SMAD4和PIK3CA突變率較低。在研究隊列中,很少有GNAS和IDH2突變。這些特征使其預后較好(中位生存期19個月)。(3)免疫枯竭型:有兩種亞群,而這兩種亞群在微環(huán)境特點上有很大相似點。第一種有PD-L1高表達,腫瘤出芽程度較高,PIK3CA突變率較大,伴隨著CD8/FOXP3比值高以及較差的預后(中位生存時間為10個月);第二種為微衛(wèi)星不穩(wěn)定亞群,其DNA錯配修復蛋白缺失,有著最高的CD8/FOX3比值,高JAK3/PIK3CA突變率的抗腫瘤微環(huán)境,伴隨著透明質(zhì)酸介導的運動受體表達的腫瘤芽[34]。

        目前胰腺癌的分子分型還沒有一個統(tǒng)一的標準,分型方法也不盡完善,某些亞型之間存在交叉重合性。應綜合眾多分子分型方法的優(yōu)點,總結(jié)各種胰腺癌亞群的異同,朝著形成統(tǒng)一的分子分型方法的方向努力。相信隨著分子診斷技術(shù)的不斷進步,會使胰腺癌的臨床分類診斷、個體化治療、反應預測、預后評估達到新的高度。

        利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

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