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        基于前列腺影像報告和數(shù)據(jù)系統(tǒng)第2版的機器學(xué)習(xí)模型診斷高級別前列腺癌

        2018-12-21 07:25:08曾小輝高月琴牛翔科陳雪卉張仕慧陳志凡
        關(guān)鍵詞:高級別前列腺癌前列腺

        曾小輝,彭 濤,高月琴,牛翔科,陳雪卉,張仕慧,陳志凡

        (成都大學(xué)附屬醫(yī)院放射科,四川 成都 610081)

        前列腺癌居惡性腫瘤導(dǎo)致男性死亡的第2位[1]。隨著人民生活質(zhì)量提高和人口老齡化,我國前列腺癌發(fā)病率呈上升趨勢[2]。前列腺多參數(shù)MRI是目前診斷前列腺癌的主要無創(chuàng)檢查方法。為提高前列腺癌診斷率和報告的規(guī)范化,2012年歐洲泌尿生殖放射協(xié)會提出前列腺影像報告和數(shù)據(jù)系統(tǒng)第1版(prostate imaging reporting and data system version 1, PI-RADS v1),但存在諸多不足,2014年底由美國放射學(xué)會、歐洲泌尿生殖放射學(xué)會及AdMeTech基金會共同對PI-RADS v1進行修訂,在線頒布了前列腺影像報告和數(shù)據(jù)系統(tǒng)第2版(prostate imaging reporting and data system version 2, PI-RADS v2)[3-4]。隨著對前列腺癌的深入研究,有學(xué)者[5-6]發(fā)現(xiàn)高級別前列腺癌(Gleason評分≥7分)和非高級別癌患者預(yù)后明顯不同,但通過多種模型結(jié)合影像學(xué)表現(xiàn)及臨床相關(guān)指標診斷高級別前列腺癌的報道較少見。本研究探討支持向量機(support vector machine, SVM)、決策樹(decision tree, DT)和Logistic回歸3種機器學(xué)習(xí)模型在診斷高級別前列腺癌中的價值。

        1 資料與方法

        1.1一般資料 回顧性分析2013年1月—2018年2月于我院接受前列腺多參數(shù)MR掃描并取得病理結(jié)果的194例患者的資料,年齡50~90歲,平均(74.7±8.9)歲。MRI顯示中位前列腺體積為55.16(35.47,77.77)cm3;中位總前列腺特異抗原(total prostate specific antigen, tPSA)為16.30(8.32,46.52)ng/ml,中位游離前列腺特異抗原(free prostate specific antigen, fPSA)為2.08(1.23,4.65)ng/ml,前列腺特異性抗原密度(adjusted-prostate-specific antigen density, adjusted-PSAD)為0.28(0.14,1.16)ng/(ml·cm3)。根據(jù)Gleason評分[7]將患者分為2組,高級別癌組63例(Gleason評分≥7分),Gleason評分分別為:3+4=7分10例、4+3=7分5例、4+4=8分13例、3+5=8分1例、5+4=9分8例、4+5=9分14例、5+5=10分12例;非高級別癌組131例,Gleason評分<7分。納入標準:①臨床資料及相關(guān)檢查完整;②MR檢查前3個月內(nèi)未接受前列腺穿刺、手術(shù)及前列腺癌內(nèi)分泌治療;③MR檢查后1個月內(nèi)經(jīng)直腸超聲引導(dǎo)下穿刺或前列腺全切術(shù),并取得病理結(jié)果。排除標準:①圖像質(zhì)量不佳;②MR序列不完整;③既往有前列腺相關(guān)手術(shù)或治療病史。

        1.2儀器與方法 采用Siemens Avanto 1.5T超導(dǎo)型MR掃描儀,相控陣體線圈,掃描前囑患者排空膀胱。仰臥位掃描,先行常規(guī)T2WI及DWI,后行動態(tài)增強掃描。T2WI參數(shù):FOV 200 mm×200 mm,掃描層數(shù)20層,層厚3 mm,層間距0.6 mm,采用自旋回波-回波平面成像序列,TR 4 300 ms,TE 101 ms,矩陣256×205;DWI:b值取800 s/mm2,F(xiàn)OV 260 mm×220 mm,掃描層數(shù)20層,層厚3.6 mm,層間距0,TR 3 700 ms,TE 80 ms,矩陣160×100,NEX 6次。動態(tài)增強掃描時,采用高壓注射器經(jīng)肘前靜脈注射Gd-DTPA 0.2 mmol/kg體質(zhì)量,流率2.5 ml/s;3D-Flash-T1WI,F(xiàn)OV 260 mm×260 mm,掃描層數(shù)20層,層厚3.6 mm,體塊(slab)為1,TR 5 ms,TE 1.69 ms,矩陣192×138,掃描次數(shù)36次。

        1.3相關(guān)指標收集及處理 通過臨床信息系統(tǒng)(clinical information system, CIS)查閱獲得臨床指標,包括年齡、fPSA、前列腺抗原比值(fPSA/tPSA)和adjusted-PSAD。由2名具有5年工作經(jīng)驗的、泌尿系統(tǒng)影像學(xué)診斷醫(yī)師利用盲法對患者進行PI-RADS v2評分[7],如有分歧經(jīng)協(xié)商達成一致。在T2WI上結(jié)合軸位、冠狀位和矢狀位圖像測量前列腺左右徑、前后徑及上下徑,根據(jù)公式計算前列腺體積(V)及adjusted-PSAD:V=左右徑(cm)×前后徑(cm)×上下徑(cm)×0.52,adjusted-PSAD=tPSA/V。

        1.4模型建立 采用IBM SPSS Modeler軟件中的SVM、DT和Logistic回歸分別對高級別前列腺癌建立預(yù)測模型,數(shù)據(jù)流示意圖見圖1。對各評價因素和相關(guān)診斷數(shù)據(jù)建立數(shù)據(jù)庫,錄入后建立SVM、DT和Logistic回歸3種模型:對5個評價因素(年齡、PI-RADS v2評分、fPSA、fPSA/tPSA及adjusted-PSAD)建立SVM流、DT流和Logistic回歸數(shù)據(jù)流,并分析3種學(xué)習(xí)模型診斷高級別前列腺癌的準確率。采用IBM SPSS Modeler軟件隨機抽樣選出173例(高級別前列腺癌組55例、非高級別前列腺癌組118例)作為訓(xùn)練集,用于篩選變量和建立預(yù)測模型;21例(高級別前列腺癌組8例、非高級別前列腺癌組13例)作為測試集,用于評價模型預(yù)測效果。

        表1 測試集3種機器學(xué)習(xí)模型及PI-RADS v2評分診斷高級別前列腺癌的比較分析(%)

        圖1 3種機器學(xué)習(xí)模型數(shù)據(jù)流示意圖

        1.5統(tǒng)計學(xué)分析 采用SPSS 20.0統(tǒng)計分析軟件。對數(shù)據(jù)進行正態(tài)分析(Kolmogorov-Smirnov檢驗)和方差齊性(Levene檢驗)檢驗,計量資料符合正態(tài)分布以±s表示,非正態(tài)分布以中位數(shù)(上下四分位數(shù))表示。繪制ROC曲線評價PI-RADS v2評分和3種機器學(xué)習(xí)模型診斷高級別前列腺癌的效能;并以DeLong方法比較AUC;以病理Gleason評分結(jié)果為金標準,采用χ2檢驗比較PI-RADS v2評分及3種模型診斷高級別前列腺癌的敏感度、特異度及準確率的差異。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1模型評價及數(shù)據(jù) 以PI-RADS v2評分預(yù)測高級別前列腺癌的準確率為82.66%。訓(xùn)練集SVM、DT和Logistic回歸3種機器學(xué)習(xí)模型經(jīng)學(xué)習(xí)后診斷高級別前列腺癌的準確率、敏感度及特異度見表1,PI-RADS v2評分及3種機器學(xué)習(xí)模型診斷高級別前列腺癌的敏感度、特異度、準確率差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P均>0.05)。測試集SVM、DT和Logistic回歸3種機器學(xué)習(xí)模型經(jīng)學(xué)習(xí)后診斷高級別前列腺癌準確率分別為76.19%、80.95%及76.19%。通過IBM SPSS Modeler軟件經(jīng)訓(xùn)練集學(xué)習(xí)后,自動獲得3種學(xué)習(xí)模型診斷高級別前列腺癌變量的重要性,并按所占比例進行排序:SVM模型前3位預(yù)測變量為PI-RADS v2、adjusted-PSAD及年齡,所占比例分別為50.00%、15.00%及13.00%;DT模型前3位預(yù)測變量為adjusted-PSAD、PI-RADS v2及fPSA,所占比例分別為49.00%、23.00%及14.00%;Logistic回歸模型前3位預(yù)測變量為PI-RADS v2、fPSA/tPSA及adjusted-PSAD,所占比例分別為36.00%、27.00%及21.00%。

        2.2ROC曲線分析 173例訓(xùn)練集PI-RADS v2評分和SVM、DT和Logistic回歸3種機器學(xué)習(xí)模型診斷高級別前列腺癌的AUC分別為0.83、0.81、0.90及0.83(P均<0.01),其中DT模型的AUC最大(圖2),且與PI-RADS v2評分(Z=1.96,P=0.049)、SVM(Z=2.87,P=0.004)和Logistic回歸(Z=2.31,P=0.021)差異均有統(tǒng)計學(xué)意義,其模型樹狀圖見圖3;而SVM與Logistic回歸(Z=1.25,P=0.21)及PI-RADS v2評分(Z=0.98,P=0.32)、Logistic回歸與PI-RADS v2評分(Z=0.04,P=0.96)的AUC差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。

        圖2 PI-RADS v2評分及3種機器學(xué)習(xí)預(yù)測高級別前列腺癌的ROC曲線

        3 討論

        多參數(shù)MRI[8]是目前診斷前列腺癌的主要影像學(xué)檢查方法,有助于提高診斷前列腺癌的準確率,但影像學(xué)報告不規(guī)范等問題限制了其廣泛應(yīng)用。與PI-RADS v1相比,PI-RADS v2評分系統(tǒng)主要針對臨床顯著性癌或高級別腫瘤[9],其將臨床顯著性高級別腫瘤前列腺癌定義為符合以下條件之一者:①前列腺穿刺活檢任何一針Gleason評分>6分;②前列腺穿刺活檢任何一針癌組織長度大于5 mm。Albertsen等[10]回顧性分析發(fā)現(xiàn)高級別前列腺癌患者10年死亡率高于非高級別前列腺癌,并提出應(yīng)著重診斷高級別前列腺癌,以便臨床減少不必要的前列腺穿刺活檢及降低對非高級別前列腺癌的過度治療。De Visschere等[11]研究報道,應(yīng)用單一評分系統(tǒng)對前列腺癌進行預(yù)測具有一定風(fēng)險。本研究聯(lián)合應(yīng)用3種機器學(xué)習(xí)模型對前列腺癌影像學(xué)表現(xiàn)和臨床指標進行分析。

        圖3 DT模型樹狀圖

        機器學(xué)習(xí)模型能根據(jù)疾病與相關(guān)危險因素的內(nèi)在規(guī)律近似地以數(shù)學(xué)方式表達,已成為預(yù)測疾病的主流方法。本研究采用SVM、DT和Logistic回歸建立對高級別前列癌的預(yù)測模型。SVM的優(yōu)點為解決小樣本、非線性及高維模式識別問題,追求現(xiàn)有信息情況下的最優(yōu)解,可提高學(xué)習(xí)方法的推廣能力;DT具備對未來新數(shù)據(jù)的分類預(yù)測能力,可將大量數(shù)據(jù)有目的地分類,從中找到潛在的、有價值的信息,且準確性良好,同時還可揭示重要預(yù)測因子之間的復(fù)雜關(guān)系;Logistic回歸的優(yōu)點是能較好地表現(xiàn)評價因素與因變量之間的依存關(guān)系。

        本研究中,DT模型診斷高級別前列腺癌的AUC最大,且與PI-RADS v2評分、SVM和Logistic回歸的AUC差異均有統(tǒng)計學(xué)意義,而SVM與Logistic回歸及PI-RADS v2評分、Logistic回歸與PI-RADS v2評分的AUC差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。DT模型預(yù)測高級別前列腺癌診斷準確率、敏感度及特異度均較高,但與其他模型相比差異無統(tǒng)計學(xué)意義,可能與陽性樣本量較少有關(guān)。IBM SPSS Modeler軟件建立的3種預(yù)測高級別前列腺癌模型前3位變量中均有PI-RADS v2評分,且單純采用PI-RADS v2評分的診斷價值也較高,與模型預(yù)測變量重要性基本相符。van Leeuwen等[12]發(fā)現(xiàn)運用前列腺癌相關(guān)臨床指標聯(lián)合PI-RADS v1評分建立Logistic模型預(yù)測前列腺高級別癌的AUC為0.88。Bermejo等[13]認為基于前列腺特異性抗原等單獨生物指標不能很好地診斷前列腺癌,故聯(lián)合年齡、PSA、直腸指檢、多參數(shù)MR等指標建立DT和Logistic回歸模型,發(fā)現(xiàn)2種模型診斷前列腺癌的準確率均較好(AUC=0.72,0.80)。Nhung等[14]采用SVM模型預(yù)測前列腺癌的敏感度為95.1%、特異度為84.6%。上述研究[12-14]的目的均在于鑒別診斷前列腺癌與良性前列腺病變,而對高級別與非高級別前列腺癌的分類研究較為缺乏,且上述研究均未對各模型進行對比分析。Lee等[15]基于經(jīng)直腸超聲,聯(lián)合臨床相關(guān)指標,建立了診斷前列腺癌的Logistic回歸、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和SVM模型,發(fā)現(xiàn)SVM模型的AUC最大(AUC=0.847),且與其他2種模型比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義。本研究結(jié)果與其不符,分析原因:①研究納入的決策因素不同;②Lee等[15]的研究基于超聲,而本研究是基于多參數(shù)MR分析建立的模型;③本研究樣本量較小,SVM比人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)更為適用。

        本研究的不足:①為回顧性研究,前列腺大切片病理標本及穿刺點不能完全與影像學(xué)直接對照,結(jié)果可能存在偏倚;②樣本量小,對于樣本選擇有一定局限性;③僅為3種機器學(xué)習(xí)模型的訓(xùn)練集和較少測試集分析,有待樣本量擴大后進一步驗證。

        綜上所述,基于PI-RADS v2評分的3種算法模型預(yù)測高級別前列腺癌的價值均較好,DT模型可作為預(yù)測前列腺高級別癌的較優(yōu)模型。

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