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        新疆天池放線菌的分離及其抑菌活性

        2018-12-20 09:36:34王秀爽田江麗邵勝楠崔志浩潘崇樂(lè)張國(guó)強(qiáng)
        關(guān)鍵詞:新疆

        王秀爽,田江麗,邵勝楠,崔志浩,潘崇樂(lè),張國(guó)強(qiáng)

        (1.石河子大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,新疆石河子 832003;2.石河子大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,新疆石河子 832003)

        放線菌是一類極具開(kāi)發(fā)價(jià)值的微生物,它不僅能夠產(chǎn)生多種抗生素[1],還能代謝產(chǎn)生極具商用價(jià)值的多糖或蛋白質(zhì)類物質(zhì)[2],其中不乏一些具有農(nóng)用開(kāi)發(fā)價(jià)值的生物活性物質(zhì)。因此,放線菌資源的挖掘一直是各國(guó)學(xué)者關(guān)注的焦點(diǎn)。植物病害嚴(yán)重威脅著中國(guó)農(nóng)業(yè)生產(chǎn),以放線菌為基礎(chǔ)開(kāi)發(fā)微生物源農(nóng)藥既可在一定程度上挽回病害損失,還能降低對(duì)環(huán)境的污染。中國(guó)新疆地域廣闊,擁有多種特殊的自然環(huán)境,蘊(yùn)藏著豐富的微生物資源。因此,深入挖掘新疆微生物資源,開(kāi)發(fā)具有新疆特色的微生物源農(nóng)藥,對(duì)中國(guó)植保領(lǐng)域的發(fā)展具有重要意義。近年來(lái)國(guó)內(nèi)外多家科研單位對(duì)新疆放線菌資源開(kāi)展深入挖掘工作,主要對(duì)羅布泊、艾比湖、于田鹽池、哈密鹽湖等干旱或高鹽環(huán)境中的放線菌進(jìn)行研究[3-8],發(fā)現(xiàn)大量放線菌新種,如Streptomycesluteus、Nocardiopsisakesuensis、Saccharothrixlopnurensis、Glycomycesxinjiangensis等[9-12]。然而,對(duì)于這些新疆特色放線菌的農(nóng)用活性研究相對(duì)較少,加之國(guó)內(nèi)外對(duì)新疆放線菌資源的挖掘主要集中在南疆的荒漠和鹽湖地區(qū),對(duì)天山天池地區(qū)放線菌資源的農(nóng)用活性研究則更為稀少。因此,有必要開(kāi)展新疆天池放線菌資源挖掘及農(nóng)用活性研究。本研究對(duì)天池地區(qū)土壤樣品中的放線菌進(jìn)行選擇性分離,結(jié)合離體和活體試驗(yàn)篩選對(duì)植物病原菌具有抑制作用的放線菌,并進(jìn)行初步分類鑒定,以期獲得具有研究與開(kāi)發(fā)價(jià)值的資源放線菌,為開(kāi)發(fā)新疆特色微生物源農(nóng)藥奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 土壤樣品 采自新疆天池地區(qū)(海拔1 900 m 左右,88.12~88.15°N,43.85~43.92°E,采集時(shí)間為2016年12月)的12份土壤樣品,按照土壤類型混合為4種土樣,分別為砂土、壤土、草甸土以及河底泥土,陰干,備用。

        1.1.2 分離及純化培養(yǎng)基 GA培養(yǎng)基:可溶性淀粉20 g,KNO31 g,K2HPO40.5 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,NaCl 0.05 g,瓊脂20 g,蒸餾水1 L,pH為7.4~7.6。

        PDA培養(yǎng)基:馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂20 g,蒸餾水1 L,pH為7.4~7.6。

        NA培養(yǎng)基:牛肉膏3 g,蛋白胨10 g,NaCl 5 g,瓊脂20 g,蒸餾水1 L,pH為7.4~7.6。

        TPA培養(yǎng)基:海藻糖5 g,脯氨酸1 g,(NH4)2SO41 g,NaCl 1 g,CaCl22 g,K2HPO41 g,ZnSO4·7H2O 1 g,硫胺素50 μg,核黃素50 μg,煙酸50 μg,泛酸鈣50 μg,維生素B650 μg,肌醇50 μg,對(duì)-氨基苯甲酸50 μg,生物素25 μg,瓊脂20 g,蒸餾水1 L,pH為7.2。

        HVA培養(yǎng)基:腐殖酸1 g,CaCO30.02 g,Na2HPO40.5 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g,KCl 1.7 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,硫胺素50 μg,核黃素50 μg,煙酸50 μg,泛酸鈣50 μg,維生素B650 μg,肌醇50 μg,對(duì)-氨基苯甲酸50 μg,生物素25 μg,瓊脂18 g,蒸餾水1 L,pH為7.4。

        CA培養(yǎng)基:幾丁質(zhì)4 g,K2HPO40.5 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 1 mg,瓊脂20 g,硫胺素50 μg,核黃素50 μg,煙酸50 μg,泛酸鈣50 μg,維生素B650 μg,肌醇50 μg,對(duì)-氨基苯甲酸50 μg,生物素25 μg,蒸餾水1 L,pH為7.4。

        GB培養(yǎng)基:可溶性淀粉20 g,KNO31 g,K2HPO40.5 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,NaCl 0.05 g,蒸餾水1 L,pH為7.4~7.6。

        1.1.3 抑制劑 放線菌酮和萘啶酸均為分析純?cè)噭?/p>

        1.1.4 供試病原菌 立枯絲核菌(Rhizoctoniasolani)、番茄灰霉病原菌(Botrytiscinerea),由石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院植物病理實(shí)驗(yàn)室提供。

        1.1.5 供試種子 黃瓜種子(‘荷蘭35’,感病品種),由新疆建設(shè)兵團(tuán)第十師北屯市農(nóng)科所提供。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 土樣采集方法 在每個(gè)采樣地區(qū)選取多個(gè)采樣點(diǎn),采用蛇形采樣法進(jìn)行取樣,土層深度為0~5 cm。取樣品200~500 g采用四分法進(jìn)行混合。將所采土樣裝入布袋或聚乙烯塑料袋,內(nèi)外均應(yīng)附標(biāo)簽,標(biāo)明采樣編號(hào)、名稱、采樣深度、采樣地點(diǎn)、日期、采集人等信息。

        1.2.2 土樣中微生物含量測(cè)定方法 稱取0.5 g風(fēng)干土樣,用無(wú)菌水系列稀釋至10-4,取100 μL分別按照以下方式處理:細(xì)菌在28~30 ℃條件下用NA培養(yǎng)基恒溫培養(yǎng),放線菌用GA培養(yǎng)基培養(yǎng),真菌用PDA培養(yǎng)基培養(yǎng),采用平板計(jì)數(shù)法統(tǒng)計(jì)每克干土中細(xì)菌、放線菌和真菌的個(gè)數(shù)。

        1.2.3 土壤放線菌分離方法 將供試土樣風(fēng)干磨碎過(guò)200目篩后,采用3種方法進(jìn)行處理:(1)稱取0.5 g風(fēng)干土樣,置于10 mmol/L磷酸緩沖液(pH=7.0)中30 ℃處理60 min,1 500 g離心20 min,然后靜置10 min,取上清液系列稀釋至10-4后取100 μL涂于分離培養(yǎng)基平板上分別于4 ℃和22 ℃培養(yǎng)15~30 d,挑出放線菌后于GA培養(yǎng)基中純化培養(yǎng)。(2)稱取0.5 g風(fēng)干土樣,置于1.5%苯酚(5 mmol/L磷酸緩沖液pH=7.0配置)中30 ℃處理20 min 后取上清液系列稀釋至10-4,取100 μL涂于分離培養(yǎng)基平板上培養(yǎng)15~30 d,挑出放線菌后于GA培養(yǎng)基中純化培養(yǎng)。(3)稱取0.5 g風(fēng)干土樣,用無(wú)菌水懸浮后,系列稀釋至10-4,取100 μL涂于分離培養(yǎng)基平板上培養(yǎng)15~30 d,挑出放線菌后于GA培養(yǎng)基中純化培養(yǎng)。所有分離培養(yǎng)基內(nèi)均含有50 mg/L放線菌酮和50 mg/L萘啶酸。

        1.2.4 放線菌發(fā)酵液制備 將放線菌接種于GA培養(yǎng)基平板上,27 ℃培養(yǎng)5~7 d,取8個(gè)6 cm菌餅接種至GB液體培養(yǎng)基(100 mL)中,28 ℃、160 r/min搖床培養(yǎng)5~7 d,取上清過(guò)0.45 μm 無(wú)菌濾膜后備用。

        1.2.5 抑菌活性測(cè)定 對(duì)峙法:在培養(yǎng)皿上穿過(guò)中心作一條線,將放線菌接種于線上1/3處,28 ℃培養(yǎng)2~3 d至完全定殖后,將病原真菌菌塊接種至放線菌菌落對(duì)稱位置,繼續(xù)培養(yǎng)3~5 d 后,測(cè)量放線菌菌落之間的真菌菌落寬度。

        牛津杯法:在GA培養(yǎng)基平板表面直接對(duì)稱放置2個(gè)牛津杯,輕輕加壓,使其與培養(yǎng)基接觸無(wú)空隙。在杯中加入200 μL發(fā)酵液無(wú)菌濾液,在2個(gè)牛津杯中間接種病原真菌,28 ℃培養(yǎng)3 d后測(cè)量抑菌圈直徑。

        盆栽法:取籽粒飽滿的黃瓜種子在φ=75%乙醇中表面消毒3 min,用無(wú)菌水清洗3次,然后放于鋪有濕潤(rùn)濾紙的培養(yǎng)皿中,置于30 ℃條件下催芽48 h。試驗(yàn)使用的土壤中含有立枯病菌1.5 g/kg。試驗(yàn)時(shí)將10粒黃瓜種子淺播于花盆中,并加入20mL放線菌菌株發(fā)酵液。設(shè)無(wú)菌水為對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次。每隔3 d加1次發(fā)酵液,培養(yǎng)9 d時(shí)檢查植株發(fā)病率、株高以及發(fā)芽率。

        1.2.6 放線菌鑒定 形態(tài)學(xué)鑒定:采用插片法[13]在GA培養(yǎng)基平板上培養(yǎng)放線菌3~5 d后,在400倍電子顯微鏡下觀察菌絲及孢子絲形態(tài),然后利用鑒定手冊(cè)進(jìn)行分類鑒定[14]。

        放線菌菌株在GB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)24 h后,用EasyPure Bacteria Genomic DNA Kit(全式金,中國(guó))進(jìn)行放線菌基因組DNA提取;使用通用引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACG- ACTT5-3′),結(jié)合EasyTaqPCR SuperMix(全式金,中國(guó))進(jìn)行16S rDNA進(jìn)行擴(kuò)增;PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,55 ℃退火2 min,72 ℃延伸2 min,循環(huán)30次,72 ℃再延伸10 min。反應(yīng)結(jié)束后進(jìn)行電泳檢測(cè), PCR產(chǎn)物由上海生工生物工程有限公司進(jìn)行純化與測(cè)序。測(cè)序結(jié)果進(jìn)行BLAST,選取相似度較高的菌株序列,利用MEGA7.0進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建(使用NJ法建樹(shù),Bootstrap法進(jìn)行1 000次重復(fù),利用Kimura 2-parameter法計(jì)算進(jìn)化距離)。

        1.2.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析 采用SPSS19軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用Duncun’s新復(fù)極差法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行差異性分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 天池地區(qū)不同類型土壤中的微生物含量差異

        新疆天池地區(qū)的4類土壤樣品中含有大量微生物,包括真菌、細(xì)菌和放線菌。從表1可看出,4種土壤樣品中細(xì)菌含量最高,其次為放線菌,真菌最少。其中草甸土中放線菌數(shù)量最多,為1.58×108CFU/g。而砂土中的放線菌數(shù)量最少,為2.67×107CFU/g。

        表1 天池地區(qū)不同類型土壤微生物含量Table 1 Microbial content in differentsoil types of Tianchi

        2.2 天池放線菌的分離與純化

        采用2種預(yù)處理方法和3種分離培養(yǎng)基對(duì)供試的4類土壤樣品中放線菌進(jìn)行選擇性分離,共分離得到213株放線菌。從表2可以看出,草甸土樣品中分離得到的放線菌數(shù)量最多,壤土次之,兩者得到的放線菌數(shù)量分別為86株和79株,占放線菌分離總數(shù)的40.38%和37.09%。

        表2 各土樣中放線菌的分離情況Table 2 Data of actino mycetei solation from soil samples

        2.3 天池放線菌的抑菌活性

        采用菌株對(duì)峙法測(cè)定213株放線菌對(duì)立枯絲核菌和番茄灰霉病菌的拮抗作用,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有14株放線菌對(duì)立枯絲核菌的拮抗效果在70%以上(表3),8株放線菌對(duì)番茄灰霉病菌的拮抗效果在60%以上(表4)。其中有5株放線菌(TC-33、TC-50、TC-52、TC-95和TC-174)對(duì)立枯絲核菌和番茄灰霉病菌均具有抑制作用。

        表3 14株放線菌對(duì)立枯絲核菌的抑制效果(對(duì)峙法)Table 3 Inhibition of 14 strains against R.solani(Antagonistic method)

        注:數(shù)據(jù)后標(biāo)有不同字母表示差異顯著(P<0.05)。下表同。

        Note:Values followed by the different letters in the same column are significantly different(P<0.05).The same below.

        表4 8株放線菌對(duì)番茄灰霉病菌的抑制效果(對(duì)峙法)Table 4 Inhibition of eight strains against B.cinerea(Antagonistic method)

        利用牛津杯法對(duì)5株放線菌的菌株代謝物的抑菌活性進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果顯示該5株放線菌的代謝物對(duì)立枯絲核菌和番茄灰霉病菌均具有較強(qiáng)的抑制作用(表5),說(shuō)明抑菌活性物質(zhì)主要為胞外代謝產(chǎn)物。

        利用盆栽法測(cè)定5株放線菌對(duì)黃瓜立枯病的防治效果,結(jié)果顯示放線菌TC-33、TC-50和TC-95的菌株代謝物對(duì)黃瓜立枯病均具有較好的防治效果(圖1-A),其中TC-50菌株代謝物的防效最高,為89.98%。在試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)TC-50發(fā)酵液可促進(jìn)黃瓜幼苗生長(zhǎng)(圖1-B),而TC-95發(fā)酵液對(duì)黃瓜幼苗生長(zhǎng)具有一定的抑制作用。3株放線菌的代謝物均可提高黃瓜種子在含菌土壤中的發(fā)芽率,尤其是TC-50,其菌株發(fā)酵液可使種子發(fā)芽率提高90%以上(圖1-C)。

        表5 5株放線菌發(fā)酵液對(duì)2種病原菌的 抑制作用(牛津杯法)Table 5 Inhibition of five strain’s metabolites against two pathogenic fungi (Oxford-cup method)

        2.4 放線菌TC-50初步鑒定

        經(jīng)過(guò)形態(tài)學(xué)觀察,放線菌TC-50菌落為灰白色、干燥、絨狀、無(wú)色素產(chǎn)生(圖2-A),氣生菌絲豐富,孢子絲為直線形,孢子呈橢圓形(圖2-B),屬于灰白色放線菌類群;利用分子手段對(duì)放線菌TC-50進(jìn)行分子鑒定,結(jié)果顯示TC-50與StreptomyceschumphonensisKK1-2(NR_126175)親緣關(guān)系最近(84%),其序列相似達(dá)98%(圖3),結(jié)合形態(tài)學(xué)分析,最終確定放線菌TC-50歸屬于鏈霉菌(Streptomycessp.)。

        A.菌株代謝物對(duì)黃瓜立枯病的防治效果 Effects of strain’s metabolites againstRhizoctoniarot;B.菌株代謝物對(duì)黃瓜幼苗株高的影響 Effects of strain’s metabolites on plant height of cucumber;C.菌株代謝物對(duì)黃瓜種子發(fā)芽及生長(zhǎng)的影響 Effects of strain’s metabolites on germination and growth of cucumber seeds;D.對(duì)照 Control

        圖13株放線菌菌株代謝物對(duì)黃瓜立枯病的防治效果及對(duì)黃瓜幼苗生長(zhǎng)的影響
        Fig.1Effectsofthreestrain’smetabolitesonRhizoctoniarotandseedlinggrowthofcucumber

        圖2 放線菌TC-50菌落(A)及孢子絲形態(tài)(B)Fig.2 Colony (A) and sporotrichial (B) of strain TC-50

        圖3 基于16S rDNA序列分析的放線菌TC-50系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Fig.3 Phylogenetic tree of strain TC-50 based on the sequence analysis of 16S rDNA

        3 討 論

        新疆地域廣闊,擁有多種特殊的自然環(huán)境,造就了該地區(qū)獨(dú)特的微生物資源及其特殊的代謝物。天山天池位于新疆塔里木盆地和準(zhǔn)噶爾盆地天然分界線上,海拔1 928 m,年均氣溫2.5 ℃,冬季長(zhǎng)期處于-15 ℃以下。本研究從該地區(qū)獲得213株放線菌,其中有24株耐4 ℃低溫的放線菌??梢?jiàn),該地區(qū)的耐低溫放線菌較為豐富。另外,本研究發(fā)現(xiàn)草甸土中的放線菌數(shù)量(1.58×108CFU/g)顯著高于其他類型土壤中的放線菌。從王啟蘭等[15]的研究可見(jiàn),青藏高原地區(qū)多種草甸土中平均放線菌數(shù)量顯著低于本研究結(jié)果,僅為5.676×104CFU/g,但是獲得的低溫放線菌數(shù)量占比較高,為32.35%,其原因可能是青藏高原地區(qū)海拔較高,氣溫較低,更適合低溫放線菌的生長(zhǎng)。

        本研究以立枯絲核菌和番茄灰霉病菌為指示菌株,對(duì)213株放線菌進(jìn)行抑菌活性篩選,發(fā)現(xiàn)17株放線菌具有一定抑菌活性,占比8.0%。筆者曾對(duì)青藏高原地區(qū)放線菌進(jìn)行抑菌活性篩選,在279株放線菌中發(fā)現(xiàn)28株具有抑菌活性的放線菌(組織法活性測(cè)定結(jié)果大于60%),占比10%[16],這與本研究結(jié)果有一定差異,主要原因在于土樣來(lái)源的不同、供試病原菌差異及生物活性測(cè)定方法的不同。因此,對(duì)于天池放線菌的生物活性需要深入研究,可針對(duì)抑菌、殺蟲(chóng)、除草、誘抗活性等方面進(jìn)行廣泛篩選。

        分子鑒定結(jié)果顯示,菌株TC-50與S.chumphonensis最近緣。S.chumphonensis最早是在海洋沉積物中分離得到的,它的氣生菌絲為白色至黃白色,能產(chǎn)生長(zhǎng)鏈狀的非移動(dòng)性孢子[17],而且至今仍未有文獻(xiàn)報(bào)道該菌株具有抑菌活性,由此可見(jiàn)菌株TC-50與S.chumphonensis存在較大差異。后期將采用細(xì)胞壁成分分析、DNA雜交等技術(shù)進(jìn)一步探究?jī)烧咧g的關(guān)系,并明確菌株TC-50的準(zhǔn)確分類地位。

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