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        河南省豬源大腸桿菌ESBLs基因型檢測及耐藥性分析

        2018-12-11 03:45:24張青嫻徐引弟王治方朱文豪焦文強李海利方劍玉郎利敏張立憲鄭萬錄王克領(lǐng)
        山西農(nóng)業(yè)科學 2018年12期
        關(guān)鍵詞:頭孢類內(nèi)酰胺耐藥性

        張青嫻 ,徐引弟 ,王治方 ,朱文豪 ,焦文強 ,李海利 ,方劍玉 ,郎利敏 ,張立憲 ,游 一 ,許 峰 ,鄭萬錄 ,王克領(lǐng)

        (1.河南省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所,河南鄭州450002;2.河南省畜禽繁育與營養(yǎng)調(diào)控重點實驗室,河南鄭州450002)

        β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物是化學結(jié)構(gòu)中含有β-內(nèi)酰胺環(huán)的一大類抗生素,包括青霉素類、頭孢菌素類和其他β-內(nèi)酰胺類,此類抗生素具有殺菌活性強、毒性低、適應癥廣及臨床療效好等優(yōu)點。其主要作用機制是產(chǎn)生能抑制細菌細胞壁的黏肽合成酶(又叫青霉素結(jié)合蛋白,PBPs),從而阻礙細胞壁黏肽的合成。產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases,ESBLs) 是腸桿菌科細菌對 β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥的最主要機制,其中,大腸桿菌是ESBLs最主要的產(chǎn)生菌。ESBLs基因型眾多,根據(jù)質(zhì)粒編碼基因和ESBLs優(yōu)先水解底物的不同主要分為CTX-M型、TEM型、SHV型、OXA型和其他型等[1-6]。

        為了解河南省豬源ESBLs大腸桿菌對β-內(nèi)酰胺酶的耐藥性流行情況,本試驗對河南省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所傳染病研究室2018年1—4月所分離的70株大腸桿菌進行藥敏試驗和耐藥基因的相關(guān)檢測,采用CLSI推薦的表型篩選和確證試驗檢測大腸桿菌攜帶ESBLs情況,用PCR方法檢測ESBLs 基 因(blaCTX-M,blaTEM,blaSHV,blaOXA)的流行分布情況,旨在為獸醫(yī)臨床ESBLs大腸桿菌耐藥性的評估與治療提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 病料來源 2018年1—4月,從河南省規(guī)?;i場采集有腹瀉癥狀的豬肺臟、氣管等組織,通過細菌培養(yǎng)、純化和PCR檢測等方法共獲得70株大腸桿菌。

        1.1.2 試劑和培養(yǎng)基 胰蛋白胨大豆瓊脂培養(yǎng)基(tryptic soy agar,TSA)、胰蛋白胨大豆肉湯培養(yǎng)基(tryptic soybroth,TSB)購自 Difco公司。麥康凱(MC)瓊脂、普通營養(yǎng)瓊脂、苗勒-欣頓(MHA)瓊脂、革蘭氏染色液等購自北京奧博星生物公司。藥敏紙片購自杭州濱和微生物試劑有限公司。Taq PCR master mix,DL2000 DNA Marker等PCR試劑購自寶生物(大連)有限公司。DNA提取試劑盒、膠回收試劑盒等購自上海生工生物有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 ESBLs大腸桿菌耐藥表型菌株測定 參照2017年美國臨床和實驗室標準化協(xié)會(Clinical and LaboratoryStandards Institute,CLSI)推薦的雙紙片法進行[7]。

        1.2.2 藥敏試驗 采用K-B法測定ESBLs分離菌株對18種常用抗菌藥物的敏感性。所用藥敏紙片包括:阿米卡星(AK)、四環(huán)素(TE)、氨芐西林(AMP)、阿莫西林(AMX)、卡那霉素(K)、氧氟沙星(OFX)、頭孢噻呋(EFT)、恩諾沙星(ENR)、頭孢唑林(CZ)、復方新諾明(STX)、新霉素(N)、頭孢哌酮(CFP)、氟苯尼考(FFC)、鏈霉素(S)、慶大霉素(GM)、環(huán)丙沙星(CIP)等。

        1.2.3 PCR方法檢測ESBLs大腸桿菌基因型 參照GenBank已發(fā)表的基因序列,設計5對特異性引物,由上海生工生物工程有限公司合成。引物序列為:CTX-M,F(xiàn) 5′-AAAAATCACTGCGCCAGTTC-3′,R5′-AGCTTATTCATCGCCACGTT-3′;OXA,F(xiàn)5′-AT GAAAAACACAATACATATCAACTTCGC-3′,R5′-G TGTGTTTAGAATGGTGATCGCATT-3′;TEM,F(xiàn)5′-C ATTTCCGTGTCGCCCTTATTC-3′,R5′-CGTTCATCC ATAGTTGCCTGAC-3′;SHV,F(xiàn)5′-AGCCGCTTGAGC AAATTAAAC-3′,R5′-ATCCCGCAGATAAATCACC AC-3';DHA,F(xiàn)5'-TGATGGCACAGCAGGATATTC-3′,R5'-GCTTTGACTCTTTCGGTATTCG-3'。

        將經(jīng)ESBLs確證試驗的30株ESBLs大腸桿菌菌株分別接種TSA平皿,37℃溫箱內(nèi)培養(yǎng)18 h后,挑取單個菌落,置于100 μL滅菌超純水中,旋渦混勻,100℃煮沸10min后12000r/min離心10min,取上清提取DNA作為PCR模板備用。

        PCR 體系為:13 μL Taq PCR master mix,1 μL上游引物,1 μ 下游引物 2,5 μL 菌液,5 μL ddH2O,進行PCR反應,取PCR產(chǎn)物于1%瓊脂糖凝膠電泳。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 ESBLs大腸桿菌耐藥表型測定結(jié)果

        70株大腸桿菌雙紙片法一共鑒定出30株ESBLs菌,其中,肺臟20株,脾臟1株,氣管5株,關(guān)節(jié)1株,有3株分離自心臟。區(qū)域分布基本覆蓋全省較多地市,無明顯地域性差異。

        2.2 藥物敏感性試驗結(jié)果

        藥敏試驗結(jié)果按2017年CLSI[7]的標準判斷,結(jié)果如表1、圖1和表2所示。

        表1 大腸桿菌分離株的藥敏結(jié)果 mm

        續(xù)表1 mm

        由表1可知,30株 ESBLs菌有6株(36,45,48,67,69,70號菌株)對CAZ耐藥,并非 100%敏感,而對CTX耐藥的則有 11 株(菌株32,36,38,42,45,48,50,51,60,61,64 號),說明用 CTX檢測 ESBLs菌的敏感性高于CAZ,且紙片法測定的ESBLs菌不一定對CAZ和CTX耐藥。

        從圖1和表2可以看出,大腸桿菌ESBLs菌對常用藥物的耐藥率均超過70%,全部為14種耐藥以上,且17種和18種耐藥共20株,占ESBLs菌的66.7%。對常用藥物尤其是頭孢類藥物耐藥,其耐藥譜平均耐16.8種藥,要高于非ESBLs菌。ESBLs菌和非ESBLs菌耐藥率差異最大的為頭孢類藥物,即EFT,CZ,CFP,CAZ和 CTX。

        表2 大腸桿菌分離株的耐藥譜

        續(xù)表2

        大腸桿菌非ESBLs菌耐藥譜均為7種以上,13種及以上耐藥菌株有23株,占總數(shù)的57.5%。所分離的非ESBLs菌平均耐13.1種藥,對常用18種藥物除頭孢類外,對其他氨基糖苷類、喹諾酮類、四環(huán)素類、青霉素類、磺胺類和氯霉素類等均表現(xiàn)出高于60%的耐藥率,說明大腸桿菌的耐藥性較高,且均為多重耐藥。

        2.3 大腸桿菌ESBLs耐藥基因PCR擴增結(jié)果

        分別擴增30株ESBLs菌的CTX-M基因、TEM基因、OXA基因、SHV基因和DHA基因,陽性基因型片段均與預期設計相符合,PCR擴增結(jié)果如圖2~4和表3所示。CTX-M基因型擴增結(jié)果表明,預期條帶大小為415 bp(圖2);TEM基因型擴增結(jié)果表明,預期條帶大小為800 bp(圖3);SHV基因型擴增結(jié)果表明,預期條帶大小為713 bp(圖4)。擴增出與預期設計相符合者為陽性,其中,陽性率分別為CTX-M53.3%,TEM66.7%,SHV3.3%,未擴增出OXA,DHA基因。

        表3 耐藥基因的PCR擴增結(jié)果統(tǒng)計

        從表3可以看出,30株ESBLs菌株除3株未擴增出ESBLs耐藥基因外,同時攜帶有CTX-M和TEM基因型的為9株,占30%,同時攜帶CTX-M和SHV基因型的有1株,其余菌株均含有1個耐藥基因,含CTX-M基因型菌株檢出率為53.3%,含TEM基因型菌株檢出率為66.7%,為本試驗分離株的優(yōu)勢基因型。

        3 討論

        病料分離結(jié)果證明,來自于肺臟、脾臟、關(guān)節(jié)和氣管的ESBLs大腸桿菌藥敏試驗和耐藥基因檢測無明顯規(guī)律性。

        藥敏試驗證明,所分離的30株ESBLs菌對頭孢類的耐藥率并非是100%,部分菌株表現(xiàn)出對該類藥物敏感,但是ESBLs菌具有體外敏感而體內(nèi)耐藥的特點,故不能僅通過體外藥敏試驗結(jié)果來指導臨床用藥[8]。大腸桿菌ESBLs株分離率為42.8%,低于苑麗等[8]的76.7%,而高于大多數(shù)研究者的分離率[7-11],可能說明近年來大腸桿菌ESBLs菌的分離率呈增長趨勢,也說明頭孢類藥物在臨床上的應用和耐藥率越來越高。而非ESBLs菌對各類抗生素的耐藥率也在60%以上,且耐藥譜13種以上的居多,說明河南省大腸桿菌的耐藥性很高,且均為多重耐藥。

        我國分離的ESBLs大腸桿菌基因型主要以CTX-M型為主,河南省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)所傳染病研究室所分離的ESBLs大腸桿菌則以CTX-M型和TEM型為主,這與國內(nèi)大多數(shù)學者的研究結(jié)果一致[5-6,7-12],但未擴增出同時存在2種以上基因型的菌株。而歐美國家以TEM型和SHV型為主,葡萄牙動物源性ESBLs大腸桿菌基因型則以TEM-1,OXA和SHV為主;西班牙動物源性ESBLs大腸桿菌基因型流行TEM-1,SHV-1和OXA型,不同國家和地區(qū)流行的ESBLs大腸桿菌耐藥基因不同與本地區(qū)抗生素的使用方法、種類和數(shù)量等因素有關(guān)[13-16]。

        ESBLs大腸桿菌不僅含有ESBLs耐藥基因,還同時攜帶有其他耐藥基因[16-17]。BATCHELOR等[17]研究表明,介導β-內(nèi)酰胺類藥物的耐藥基因常常與介導氨基糖苷類、氯霉素類和磺胺類藥物的耐藥基因在同一質(zhì)粒上,導致耐藥性的共選擇(Co-selection)和共同播散,即其他藥物(如氨基糖苷類、氯霉素類或磺胺類藥物)的使用,可能會使β-內(nèi)酰胺類藥物的耐藥性選擇出來。河南省ESBLs大腸桿菌耐藥基因以CTX-M和TEM為主,且分離率逐漸增高,說明養(yǎng)殖企業(yè)使用頭孢噻肟和頭孢他啶類藥物的頻率正在逐年增加,會導致今后養(yǎng)殖業(yè)用藥越來越困難。由于耐藥基因的宿主可轉(zhuǎn)移性,隨之會產(chǎn)生人類公共衛(wèi)生安全隱患,應研制出中藥等其他替代藥物,減少第3代抗生素的大規(guī)模使用,以免給人和動物的健康帶來重大影響[18-22]。

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