王 康,吳志革,趙偉睿,3,胡 升,麻菊美,王進波,姚善涇,梅樂和
(1.浙江大學(xué) 寧波理工學(xué)院 生物與化學(xué)工程學(xué)院,浙江 寧波 315100;2.浙江大學(xué) 化學(xué)工程與生物工程學(xué)院,浙江 杭州 310027;3.浙江大學(xué) 生物系統(tǒng)工程與食品科學(xué)學(xué)院,浙江 杭州 310058)
9α-羥基雄甾-4-烯-3,17-二酮(9α-OH-AD)是甾體類藥物合成的重要前體物質(zhì),常用于抗雌性激素、抗雄性激素和避孕功能藥物以及皮質(zhì)藥物的合成[1-2]。目前,由于甾體的9α-羥基化很難用化學(xué)法進行,一般使用微生物轉(zhuǎn)化法實現(xiàn)[3-5]。
隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,已從微生物中鑒定了甾體9α-羥基化的關(guān)鍵酶即3-甾酮-9α-羥基化酶(KSH)[6-9]。KSH屬于IA家族末端單加氧酶,由末端加氧酶(KshA)和鐵氧還原酶(KshB)組成。其中,KshA是主反應(yīng)進行的活性中心,其與甾體物質(zhì)的特異性結(jié)合是KSH進行9α-羥基化反應(yīng)的關(guān)鍵。對于不同的甾體底物,選擇合適的KshA酶至關(guān)重要[10-11]。雖然目前關(guān)于KSH的研究多集中于分枝桿菌和紅球菌屬[6,8-9],但甾體物質(zhì)關(guān)鍵代謝途徑的發(fā)現(xiàn)為利用大腸桿菌等工程菌構(gòu)建高催化9α-羥基化能力的工程菌株提供了可能,有利于縮短9α-OH-AD的生產(chǎn)周期、降低生產(chǎn)成本。但由于受合適的kshA基因篩選難度大且穩(wěn)定性較差、涉及NADH輔酶系統(tǒng)等因素影響,目前仍處于初步嘗試階段,產(chǎn)率較低。最早在2006年,來源于Mycobacteriumsmegmatismc2155的kshA基因被證實在大腸桿菌表達系統(tǒng)中具有催化活性,但是產(chǎn)物濃度較低,僅能在色譜中檢測到[2];2007年,在大腸桿菌BL21中表達的分枝桿菌Mycobacteriumsmegmatis的甾體9α-羥基化基因,在以黃體酮(PS)為底物時,經(jīng)過7 d的反應(yīng),有43.6 mg/L的9α-羥基化產(chǎn)物生成[7];2009年,來源于RhodococcusrhodochrousDSM 43269中的kshA基因在大腸桿菌表達系統(tǒng)中進行了研究,但單獨表達kshA的菌株并沒有表現(xiàn)出催化活性[12];2010年,在大腸桿菌中表達的分支桿菌MycobaterriumneoaurumMwIB-01的kshA基因,在底物投料濃度為1.5 μmol/L時,反應(yīng)體系經(jīng)萃取濃縮后,經(jīng)液質(zhì)連用檢測到9α-OH-AD的產(chǎn)生[13]。截至目前,在大腸桿菌中單獨表達kshA研究的催化效率仍然較低,這限制了大腸桿菌系統(tǒng)在制備9α-OH-AD中的應(yīng)用。
本文中,筆者對2種可進行甾醇9α位羥基化的RhodococcuserythropolisSQ1的rekshA和M-y-c-o-b-a-c-t-e-r-i-u-mtuberculosisH37Rv的mtkshA基因表達進行比較研究,通過基因序列優(yōu)化以提升蛋白質(zhì)的可溶性表達水平,并基于RekshA的工程表達菌株,以雄甾-4-烯-3,17-二酮(AD)為底物,對制備9α-OH-AD的催化反應(yīng)進行初步探索,以期開發(fā)新型9α-OH-AD生物轉(zhuǎn)化工藝,為9α-OH-AD的高效、低成本生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。
AD、9α-OH-AD(純度大于98%),寧波旋光醫(yī)藥有限公司;其他試劑均為市售國產(chǎn)分析純。
pET-28a(+)質(zhì)粒保存于浙江大學(xué)寧波理工學(xué)院酶工程實驗室;E.coliDH5α感受態(tài)細胞、核酸內(nèi)切酶NheⅠ和XhoⅠ,TaKaRa公司;E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細胞、T4DNA連接酶及DNA聚合酶,Transgen公司。
基因序列的測定由上海生工生物工程有限公司完成。
應(yīng)用Jcat軟件[14](http://www.jcat.de)對rekshA與mtkshA基因序列進行優(yōu)化,得到rekshA-yh與mtkshA-yh基因序列。將獲得的rekshA、mtkshA、rekshA-yh和mtkshA-yh基因序列送至上海捷瑞公司合成,并在基因的5′端和3′端分別加入NheⅠ和XhoⅠ酶切位點。
用NheI、XhoI對上述kshA基因和pET28a(+)分別進行雙酶切,T4DNA連接酶連接,再將重組質(zhì)粒導(dǎo)入大腸桿菌BL21(DE3)中,得到工程菌株BL21(DE3)-pET28a-mtkshA、BL21(DE3)-pET28a-rekshA、BL21(DE3)-pET28a-mtkshA-yh與BL21(DE3)-pET28a-rekshA-yh。
挑取BL21(DE3)-pET28a-mtkshA、BL21(DE3)-pET28a-rekshA、BL21(DE3)-pET28a-mtkshA-yh與BL21(DE3)-pET28a-rekshA-yh單菌落進行活化;然后以體積分數(shù)2%的接種量接種于50 mL含50 μg/mL卡那霉素的LB培養(yǎng)基中,待菌液生長到OD600為0.5~1.0時,加入終濃度為0.5 mmol/L的IPTG,于28 ℃、150 r/min誘導(dǎo)表達6 h。離心收集菌體,使用磷酸鹽緩沖液(PBS)重懸菌體,超聲破胞,離心取上清液,SDS-PAGE電泳檢測蛋白表達情況。
將重組菌株BL21(DE3)-pET28a-rekshA-yh與BL21(DE3)-pET28a-mtkshA-yh活化后,以2%的接種量接種于TB培養(yǎng)基中。在37 ℃培養(yǎng)至OD600為0.5~1.0時,加入IPTG至終濃度為0.5 mmol/L,同時加入溶解于二甲基亞砜(DMSO)的底物AD至終濃度為300 μmol/L。于搖床中30 ℃振蕩反應(yīng),24 h后取樣,使用高效液相色譜(HPLC)進行定量檢測。
取適量的反應(yīng)液樣品,12 000 r/min離心2 min去除菌體,取上清液,使用水相濾膜過濾后進行高效液相色譜分析成分。HPLC檢測條件為:液相柱采用Hypersil ODS2 C18(4.6 mm×250 mm,5 μm),流動相為V(甲醇)∶V(水)=5∶ 5,流速為1 mL/min,柱溫40 ℃,紫外檢測波長254 nm,進樣體積20 μL。
1)培養(yǎng)基對反應(yīng)的影響分析 將菌種分別接種到LB和TB培養(yǎng)基中,OD600為0.5~1.0時,同時加入0.5 mmmol/L的IPTG和300 μmol/L AD(溶解于DMSO),于30 ℃搖床中反應(yīng),在12、24、36、48、60和72 h分別取樣,測量菌體生物量和反應(yīng)得率。
2)IPTG濃度對反應(yīng)的影響分析 菌液培養(yǎng)至OD600為0.5~1.0時,分別加入0、0.01、0.05、0.10、0.25、0.50和1.00 mmol/L的IPTG和200 μmol/L AD(溶解于DMSO),于30 ℃搖床中反應(yīng),24 h后取樣進行HPLC分析,計算得率。
3)助溶劑選擇對反應(yīng)的影響分析 菌液培養(yǎng)至OD600為0.5~1.0時,加入0.1 mmol/L的IPTG和200 μmol/L AD,并使反應(yīng)液中分別含有0.8%乙醇、甲醇、丙酮和DMSO作為助溶劑,于30 ℃搖床中反應(yīng),24 h后取樣進行HPLC分析,計算得率。
4)底物添加時間對反應(yīng)的影響分析 菌液培養(yǎng)至OD600為0.5~1.0時,加入0.1 mmol/L的IPTG,并分別在加入IPTG后的0、6、12、18和24 h,加入500 μmol/L溶解于乙醇中的底物AD,于30 ℃搖床中反應(yīng),在反應(yīng)的12、24、36、48、60和72 h分別取樣,測量菌體生物量和反應(yīng)得率。
經(jīng)過優(yōu)化的基因序列往往能提高mRNA二級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,有利于新生肽段的正確折疊,提高外源活性蛋白的表達。通過與大腸桿菌E.coliK12菌系的密碼子偏好性及最適GC百分比進行比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn):基因rekshA和mtkshA序列中的GC百分比分別為62.33%和60.7%,遠高于大腸桿菌的最適GC百分比(如EscherichiacoliK12中為52.35%),同時含有GUC(Val)和CCC(Pro)等低頻密碼子。通過同義轉(zhuǎn)換,rekshA-yh基因共替換了224個堿基,GC百分比降為52.33%,與原序列的相似度為81.24%,mtkshA-yh共替換了221個堿基,GC百分比降為51.55%,與原序列相似度為80.92%。
對上述重組工程菌株進行誘導(dǎo)表達分析,結(jié)果見圖1。由圖1可知:與陰性對照相比,BL21(DE3)-pET28a-mtkshA、BL21(DE3)-pET28a-rekshA、BL21(DE3)-pET28a-mtkshA-yh與BL21(DE3)-pET28a-rekshA-yh的粗酶液樣品在4.0×104與5.0×104條帶中間均多出1條明顯的條帶,與MtkshA和RekshA的理論大小4.427×104、4.45×104相符合。
對比圖1(a)與圖1(b)可見,優(yōu)化后的rekshA-yh較rekshA的可溶性表達有非常明顯的提高;對比圖1(c)與圖1(d)可見,優(yōu)化后的mtkshA-yh比mtkshA的可溶性表達也有一定的提升,達到了通過基因序列的優(yōu)化提高外源活性蛋白表達的預(yù)期目的,進一步證明了基因序列的優(yōu)化是提高蛋白可溶性表達的重要途徑之一。
樣品經(jīng)離心、微濾處理后,經(jīng)液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)分析及與標準品比對以確認9α-OH-AD產(chǎn)物峰和AD底物峰的位置,結(jié)果見圖2。
通過建立標準曲線換算及圖2結(jié)果可知:MtKshA表達菌株轉(zhuǎn)化AD產(chǎn)生9α-OH-AD的得率較低,在TB培養(yǎng)基中經(jīng)24 h的反應(yīng),9α-OH-AD的得率僅為2.7%,而ReKshA表達菌株卻可以較好地轉(zhuǎn)化AD產(chǎn)生9α-OH-AD,得率為63.86%,是MtKshA的23.57倍。以上結(jié)果表明,ReKshA是催化AD合成9α-OH-AD較為理想的催化劑。
以AD為底物,研究不同培養(yǎng)基對9α-OH-AD轉(zhuǎn)化效率的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn):重組菌株BL21(DE3)-pET28a-rekshA-yh在LB培養(yǎng)基中菌體生物量處于較低水平,OD600為2.075時,9α-OH-AD的得率僅為2.85%。而在TB培養(yǎng)基中,工程菌菌體濃度處于較高水平,OD600為11.25時,9α-OH-AD的得率達85.7%。由此說明,高生物量對于9α-OH-AD的制備較為關(guān)鍵。
考察IPTG濃度對得率的影響,結(jié)果見圖3(a)。由圖3(a)可知:當IPTG濃度為0.1 mmol/L時,200 μmol/L底物經(jīng)過24 h反應(yīng),9α-OH-AD得率最高,達72.54%。
因為底物AD的水溶性較差,筆者選取了甲醇、乙醇、丙酮和DMSO 4種不同的助溶劑進行催化實驗研究,結(jié)果見圖3(b)。由圖3(b)可知:乙醇的助溶效果最好,200 μmol/L底物經(jīng)過24 h反應(yīng),9α-OH-AD得率為90.62%,比DMSO的提高了14.85%。
在催化反應(yīng)過程中,底物可能會對菌體生長及蛋白表達產(chǎn)生不利影響。筆者進一步考察在添加IPTG進行蛋白誘導(dǎo)后,不同底物添加時間對菌體濃度和反應(yīng)得率的影響,結(jié)果見圖4。由圖4可知:底物的添加時間對菌體的生物量影響較小,說明AD并不抑制菌體的生長(圖4(a));但底物的添加時間對底物轉(zhuǎn)化率有著顯著影響,表現(xiàn)為隨著底物添加時間的推遲,9α-OH-AD得率逐步降低(圖4(b))。推測其原因可能與反應(yīng)的時間有關(guān),越早加入的實驗組相較于較晚加入的反應(yīng)時間更長,所以得率更高。
圖2 AD、9α-OH-AD的液質(zhì)分析圖譜Fig.2 LC-MS analysis of AD,9α-OH-AD and HPLC analysis of the relationship between peak area and the concentration of 9α-OH-AD
圖3 IPTG濃度和助溶劑對反應(yīng)得率的影響Fig.3 Effects of IPTG concentration and cosolvent on reaction yield
圖4 底物添加時間對菌體生物量和反應(yīng)得率的影響Fig.4 Effects of time-points of substrate addition on cell growth and productive yield
在上述研究基礎(chǔ)上,筆者在反應(yīng)體系中加入500 μmol/L底物,以0.8%(體積分數(shù))乙醇為助溶劑,在150 r/min攪拌條件下,底物與IPTG同時加入,30 ℃反應(yīng)48 h,9α-OH-AD得率達到了97.09%。
基于大腸桿菌開發(fā)高效、低成本的雄甾-4-烯-3,17-二酮9α位羥基生物合成方法,具有廣闊的工業(yè)應(yīng)用前景。筆者對來自分枝桿菌M-y-c-o-b-a-c-t-e-r-i-u-mtuberculosisH37Rv 與紅平紅球菌RhodococcuserythropolisSQ1的kshA基因進行了序列優(yōu)化,提高了其在大腸桿菌中的可溶性表達水平。在此基礎(chǔ)上發(fā)現(xiàn),在以AD為底物,對來源于紅平紅球菌RhodococcuserythropolisSQ1的kshA基因進行優(yōu)化后構(gòu)建的工程菌BL21(DE3)-pET28a-kshA-reyh表現(xiàn)出更好的9α-羥基化活性。進一步對基于工程菌BL21(DE3)-pET28a-kshA-reyh制備9α-OH-AD的生物催化工藝進行了初步探索,在底物濃度為500 μmol/L的條件下,經(jīng)48 h的反應(yīng),產(chǎn)物9α-OH-AD的得率可達97.09%,反應(yīng)效率較以往的體系得到了極大的提升,實現(xiàn)了9α-OH-AD的高效轉(zhuǎn)化,為將來9α-OH-AD的高效生產(chǎn)奠定基礎(chǔ)。
與此同時,本研究進一步證明了kshA在大腸桿菌中可獨立于kshB發(fā)揮作用,為后續(xù)基于單獨kshA的高效催化劑開發(fā)提供了新的思路。