左若弘 (南京市第十三中學(xué) 江蘇南京 210000)
泡菜以清脆、開胃、滋味爽口著稱,在中國已有大約3000多年的歷史。泡菜是以新鮮蔬菜為原料,利用自身附著的微生物或添加的乳酸菌作為發(fā)酵劑,通過厭氧發(fā)酵所制成的傳統(tǒng)而獨(dú)特的發(fā)酵食品。蔬菜表面通常附生有細(xì)菌、酵母菌和霉菌等多種微生物,在泡菜的制作過程中乳酸菌最終成為優(yōu)勢菌,其代謝產(chǎn)物和低氧分的環(huán)境抑制了食品腐敗菌的生長,從而保障了食品的品質(zhì)和風(fēng)味。
家庭制作泡菜簡單易行,食用方便。但由于泡菜原料未經(jīng)過滅菌處理,因此在后期發(fā)酵過程中一旦環(huán)境溫度升高或者存放條件不利,泡菜中的腐敗微生物就會大量滋生,從而導(dǎo)致產(chǎn)品的腐敗變質(zhì)。在泡菜品質(zhì)劣變的眾多顯現(xiàn)中,“生花”是最常見的現(xiàn)象之一?!吧ā本褪窃谂莶吮砻嫘纬梢粚影啄ぃ莶艘坏┥ㄖ?,菜品風(fēng)味發(fā)生不期待的變化(餿臭味或腐敗味),泡菜壇中鹽水表面形成白色成片或成碎花狀的膜,菜品開始軟爛,泡菜水變渾濁,輕者影響風(fēng)味,重者整壇菜都不能食用。在夏秋季節(jié)由于溫度較高,在家庭制作的泡菜中約90%會出現(xiàn)不同程度的生花現(xiàn)象。
本實(shí)驗(yàn)欲從引起泡菜生花的微生物入手,對其進(jìn)行分離、回接,從而明確引起泡菜腐敗的主要微生物類群,通過生物防控的方式控制這些腐敗微生物的生長,從而開發(fā)出富含活性益生菌的安全、衛(wèi)生的泡菜產(chǎn)品。
材料:從筆者家庭制作的泡菜里收集自然發(fā)酵的、存放時間較長,泡菜汁正在變得渾濁但還沒有明顯“生花”的泡菜汁1份。
牛肉蛋白胨培養(yǎng)基、乳酸細(xì)菌培養(yǎng)基(MRS培養(yǎng)基)、溶菌酶、蛋白酶K、由生物公司合成的細(xì)菌16S rDNA序列擴(kuò)增引物(R1:5′-CGGTTACCTTGTTAC?GACTT-3′、R2:5′-AGAGTTTGATYMTGGCTCAG-3′)。
儀器:光學(xué)顯微鏡、PCR擴(kuò)增儀、凝膠成像系統(tǒng)。
1.2.1 泡菜汁中細(xì)菌的分離
泡菜汁活化→10倍法稀釋涂布含有0.75%質(zhì)量分?jǐn)?shù)為CaCO3的MRS平板→挑起有溶鈣圈的單菌落染色、鏡檢→在37℃固體劃線培養(yǎng),選出溶鈣圈大、生長速度快的純培養(yǎng),液體培養(yǎng)選擇產(chǎn)酸速度較快、產(chǎn)酸量大的菌株。
1.2.2 初步鑒定
(1)載玻片固定。在無菌操作條件下,用接種環(huán)挑取少量細(xì)菌于干凈的載玻片上涂布均勻,在火焰上加熱以殺死菌種并使其粘附固定。
(2)草酸銨結(jié)晶紫染1min,自來水沖洗,去掉浮色。(3)用碘-碘化鉀溶液媒染1 min,傾去多余溶液。(4)用中性脫色劑如乙醇(體積分?jǐn)?shù)為95%)或丙酮酸脫色30 s,革蘭氏陽性菌不被褪色而呈紫色,革蘭氏陰性菌被褪色而呈無色。
(5)用番紅染液或者沙黃復(fù)染30 s,革蘭氏陽性菌仍呈紫色,革蘭氏陰性菌則呈現(xiàn)紅色。革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌即被區(qū)別開。
(6)用光學(xué)顯微鏡觀察。
1.2.3 16S rDNA序列擴(kuò)增
16S rDNA是細(xì)菌染色體上編碼16S rRNA相對應(yīng)的DNA序列,存在于所有細(xì)菌染色體基因中。16S rDNA是細(xì)菌的系統(tǒng)分類研究中最有用的和最常用的分子鐘,其種類少,含量大(約占細(xì)菌RNA含量的80%),分子大小適中,存在于所有的生物中,其進(jìn)化具有良好的時鐘性質(zhì),在結(jié)構(gòu)與功能上具有高度的保守性,素有“細(xì)菌化石”之稱。16S rDNA由于大小適中,約1.5 kb,既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異,又能利用測序技術(shù)較容易地得到其序列,故被細(xì)菌學(xué)家和分類學(xué)家接受。目前,16S rDNA的序列信息已經(jīng)廣泛應(yīng)用于菌種鑒定和系統(tǒng)發(fā)生學(xué)研究。
(1)DNA提取。挑取單菌落接種于5 mL的MRS液體培養(yǎng)基,37℃厭氧培養(yǎng)48 h,取部分獲得純培養(yǎng)物加15%滅菌甘油-70℃保存菌種,其余培養(yǎng)液置于4℃冰箱靜置2 h后,吸取1.5 mL菌體置于離心管中,8 000 r/min離心5 min,去上清液;沉淀用滅菌生理鹽水洗滌2次,加入200 μL溶菌酶( 50 mg/mL)混勻,37℃放置2h,8000r/min離心5min,去上清液;沉淀用滅菌生理鹽水洗滌2次,加入200μL溶菌酶(50mg/mL)混勻,37℃放置2 h;加入400 μL 10%SDS 混勻,再加入 5 μL 蛋白酶K(20 mg/mL),55℃水浴1 h;加入650 μL 酚/氯仿/異戊醇(25∶24∶1)抽提,12 000 r/min離心10 min,吸取上清液至1.5 mL離心管中,加入2倍體積的無水乙醇,12 000 r/min離心10 min,沉淀用70%乙醇洗滌一次,室溫吹干后加入25 μL的TE緩沖液溶解,取8 μL DNA提取物用1%的瓊脂糖電泳檢測,其余樣品-20℃貯存?zhèn)溆谩?/p>
(2)菌株16S核糖體DNA的PCR擴(kuò)增。檢測反應(yīng)體系為:50 ng/μL DNA 模板3 μL,RS上游引物和下游引物(50 pmol/μL)各2 μL,10 × PCR 緩沖液5 μL,10 mmol/L dNTPs 2 μL,Taq酶1 μL,2 mmol/LMgCl22 μL,ddH2O 33 μL;PCR 擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性4 min,94℃變性1 min;52℃退火1 min;72℃延伸2 min,30個循環(huán);72℃補(bǔ)充延伸10 min后反應(yīng)結(jié)束。每個樣品擴(kuò)增2次。取10 μL PCR擴(kuò)增產(chǎn)物和2 μL溴酚藍(lán)混合,以70 V電壓在1.5%瓊脂糖上電泳2 h,溴化乙錠染色20 min,用凝膠成像系統(tǒng)拍照并記錄結(jié)果。
(3)菌株16S rDNA的測序分析。PCR檢測反應(yīng)體系中16S rDNA上游引物和下游引物(50 pmol/μL)各2 μL,其余組分同上;PCR擴(kuò)增程序?yàn)?4℃預(yù)變性4 min,94℃變性1 min;55℃退火45 s;72℃延伸2 min,35個循環(huán);72℃補(bǔ)充延伸10 min后反應(yīng)結(jié)束。取10 μL PCR擴(kuò)增產(chǎn)物在1.0%瓊脂糖上電泳檢測條帶大小,其余產(chǎn)物送上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序分析,序列測定結(jié)果登陸NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/),將所得序列與數(shù)據(jù)庫中已知序列進(jìn)行同源性搜索比對。
細(xì)菌分離培養(yǎng)所得菌落較小,直徑0.2~0.5 mm,在培養(yǎng)基上略突起,圓點(diǎn)狀,顯白色偏黃,略透明,邊緣明顯,生長緩慢。
經(jīng)革蘭氏染色后在40倍油鏡下觀察:菌株經(jīng)革蘭氏染色后呈紅色,可見該菌為革蘭氏陰性菌。形狀為橢圓形,多集中在一起,大小各異,大者比小者大1倍。
采用即用型PCR擴(kuò)增試劑盒對各菌株提取的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,電泳結(jié)果顯示擴(kuò)增的DNA片段大小約為1 500 bp。
得到的各菌株16S rDNA基因序列全長1 508 bp。將該序列在NCBI(美國國家生物技術(shù)信息中心)網(wǎng)站(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)上進(jìn)行同源序列搜索,根據(jù)搜索結(jié)果,該菌株與解鳥氨酸拉烏爾菌(Raoultella ornithinolytica)B6的全基因組序列的16 S rDNA相似度高,相似度為97%。
(1)首次報道了泡菜“花變”初期大量存在解鳥氨酸拉烏爾菌,并首次對其進(jìn)行了形態(tài)觀察。由于對其的繁殖方式未做研究,電鏡觀察到的該細(xì)菌不為二分裂繁殖,L型菌體似出芽繁殖,這有待進(jìn)一步研究。
(2)細(xì)菌的鑒定方法。細(xì)菌的鑒定方法可以依靠直接形態(tài)觀察和生理生化特征分析方法,但這兩種方法不但耗時費(fèi)力而且獲取的信息也比較有限,而挑取代表菌株進(jìn)行16S rDNA測序鑒定,可以快速準(zhǔn)確地鑒定分析菌株。在以后的細(xì)菌鑒定研究中可以優(yōu)先選擇采用。
(3)解鳥氨酸拉烏爾菌為好氧菌,因此在泡菜花變初期,泡菜水開始渾濁之時,注意只要將泡菜水上方的氧氣去掉,那么水體表面的雜菌就很難生存了。如何去氧就要看你的實(shí)際情況了。買一份除氧劑,想辦法將其安置到泡菜壇里即可。民間的辦法是用鐵,鐵易被氧化,將干凈鐵塊直接投入泡菜水可以除氧,將鐵粉或碎鐵包好粘附在泡菜壇蓋內(nèi)頂,能除空氣中的氧。但是,用鐵有個不好就是吸氧后產(chǎn)生鐵銹。因此,將鐵塊投入水內(nèi)的做法只用來清除白花,清除完畢就要取出來。