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        一株產(chǎn)抗菌脂肽芽孢桿菌篩選鑒定、產(chǎn)酶特性及其脂肽初步鑒定

        2018-11-09 05:40:04胡美忠鄔小蘭郁建生
        中國飼料 2018年19期

        胡美忠, 鄔小蘭, 郁建生

        (銅仁職業(yè)技術(shù)學(xué)院,貴州銅仁 554300)

        畜牧業(yè)中抗生素的濫用嚴(yán)重威脅到食品安全和人類健康,帶來了藥物殘留、耐藥致病菌、環(huán)境污染等弊端。鑒于抗生素濫用的危害,已有多個國家在養(yǎng)殖業(yè)中限制甚至禁止使用抗生素,如1992年瑞士立法禁止使用飼用抗生素,歐盟于1999年立法禁止使用抗生素作為促生長劑,我國近幾年針對抗生素在畜牧業(yè)中濫用問題,提出禁止或者逐步禁止飼用抗生素的使用,并提出鼓勵和支持抗菌肽、微生物制劑、中藥提取物等新獸藥研發(fā)。

        枯草芽孢桿菌(B.subtilis)是一類產(chǎn)芽孢,好氧或兼性好氧的革蘭陽性桿狀細(xì)菌,是我國農(nóng)業(yè)部允許直接喂養(yǎng)動物的菌種??莶菅挎邨U菌分布廣泛,抗逆性強(qiáng),一些菌株能產(chǎn)生蛋白酶、脂肪酶等消化酶、合成多種生理活性物質(zhì)、產(chǎn)生抗菌脂肽、在腸道中奪氧能力強(qiáng)(鄒艷,2017;馬樹瑞等,2016)。 這些優(yōu)良特性在畜牧養(yǎng)殖業(yè)中有利于提高飼料轉(zhuǎn)化率,促進(jìn)動物生長發(fā)育和提高免疫力,且具無毒副作用、無殘留、原生態(tài)等特性??莶菅挎邨U菌及其代謝產(chǎn)物,是理想的抗生素替代物之一 (王宗偉等,2015;鐘蔚,2013),本研究旨在篩選尋找優(yōu)良的枯草芽孢桿菌,以期將來應(yīng)用于動物生產(chǎn)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣品、培養(yǎng)基及指示菌 樣品來源:貴州銅仁、貴州赤水、貴州遵義等地土壤、枯葉、動物糞便。

        Landy培養(yǎng)基:酵母粉 1 g,L-苯丙氨酸0.002 g,葡萄糖20 g,磷酸二氫鉀1 g,5水硫酸銅 0.0016 g,7水硫酸鎂 0.5 g,7水硫酸亞鐵0.0015 g,L-谷氨酸 0.5 g, 硫酸錳 0.005 g, 氯化鉀 0.5 g,水 1 L,pH 7。

        LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,氯化鈉 10 g,蒸餾水 1 L,pH 7.2。

        纖維素酶檢測培養(yǎng)基:羧甲基纖維素鈉10 g,氯化鈉10 g,蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,水1 L。

        PDA培養(yǎng)基:馬鈴薯 200 g(洗凈去皮,稱取200 g馬鈴薯切成小塊,加水煮爛,用八層紗布過濾取濾液),葡萄糖 20 g,瓊脂 15~20 g,水 1 L,自然pH(不加瓊脂則為PD培養(yǎng)基)。

        YPD培養(yǎng)基:酵母提取物10 g,蛋白胨20 g,葡萄糖20 g,水 1 L,自然pH。

        MRS培養(yǎng)基:蛋白胨10 g,牛肉膏10 g,酵母膏5 g,葡萄糖20 g,吐溫80 1 mL,磷酸氫二鉀2 g,乙酸鈉 5 g,檸檬酸銨 2 g,硫酸鎂 0.1 g,硫酸錳0.05 g,蒸餾水 1 L,pH 6.2±0.2。

        指示菌:金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)(ATCC 25923),大腸桿菌(Escherichia coli)(ATCC 25922),黑曲霉(Aspergillus niger),產(chǎn)朊假單絲酵母(Candida utilis),植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)為本實驗室(民族中獸藥分離純化技術(shù)國家地方聯(lián)合工程研究中心中獸藥微生物發(fā)酵技術(shù)研究室)分離純化鑒定保藏。

        1.1.2 主要儀器 垂直流超凈工作臺 (ZHJHC1214C),上海智城;pH 計(DELTA 320),上海閔勝;臺式高速冷凍離心機(jī)(EXPERT 16K-R),湖南吉爾森;恒溫培養(yǎng)箱(BPH-9042),上海一恒;全自動高壓滅菌鍋(HVE-50),華粵;恒溫震蕩培養(yǎng)箱(DHP260),金壇市國旺試驗儀器廠;安捷倫1100型液相色譜儀;安捷倫G6400三重四極桿質(zhì)譜聯(lián)用儀。

        1.2 方法

        1.2.1 樣品采集 選取農(nóng)田、菜園等熟地,取距離泥土表面5~20 cm土壤,或采集枯葉、新鮮動物糞便,裝置于無菌采樣袋中,置于4℃下保藏待用。

        1.2.2 菌種分離純化 無菌條件下取采集的樣品,置于滅菌的離心管,加入適量無菌蒸餾水,混勻,置于85~90℃水浴鍋中水浴20 min(或水浴煮沸10 min),冷卻,吸取50μL樣品液涂布于LB固體培養(yǎng)基,37℃下培養(yǎng)24 h,挑取大小、形態(tài)不一致的菌落分別繼續(xù)劃線培養(yǎng)2次,得純培養(yǎng)菌落,采用25%甘油 -70℃保藏待用。

        1.2.3 產(chǎn)抗菌脂肽芽孢桿菌篩選 保藏的菌株,使用適量LB液體培養(yǎng)基活化,活化的菌株劃線培養(yǎng)于LB固態(tài)培養(yǎng)基,待長出菌落后,挑取菌落接種于LB液體培養(yǎng)基,37℃下180 r/min振蕩培養(yǎng)15 h作為種子液,種子液按1%比例接種于Landy培養(yǎng)基,37℃下180 r/min振蕩培養(yǎng)24 h,8000 g離心去除菌體,以金黃色葡萄球菌及大腸桿菌為指示菌,采用瓊脂擴(kuò)散法測試上清液抑菌活性(制備指示菌平板,無菌打孔器打孔后,孔加入80μL上清液,37°C培養(yǎng)18~24 h后測量抑菌圈大?。?/p>

        1.2.4 產(chǎn)抗菌脂肽芽孢桿菌分子生物學(xué)鑒定 前期篩選得到數(shù)株對金黃色葡萄球菌和大腸桿菌都有抑制效果的菌株,選擇抑菌效果最好的菌株,編號為S21,菌株S21總DNA提取,16SrDNA擴(kuò)增和測序由蘇州泓迅生物科技有限公司完成,測序所得的16SrDNA序列校對后,與NCBI的Gen-Bank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)數(shù)據(jù)庫和http://www.ezbiocloud.net數(shù)據(jù)庫分析,根據(jù)序列同源性,確定菌株的種屬關(guān)系。

        1.2.5 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)酶特性

        1.2.5.1 蛋白酶 菌株S21使用LB培養(yǎng)基活化,點接種于添加了10%脫脂奶粉的LB培養(yǎng)基,37℃下培養(yǎng)60 h,觀察菌落周圍是否出現(xiàn)蛋白水解圈。

        1.2.5.2 脂肪酶 菌株S21活化,點接種于添加了1%三丁酸甘油酯的LB培養(yǎng)基,37℃下培養(yǎng)72 h后觀察菌落周圍是否出現(xiàn)脂肪水解圈。

        1.2.5.3 纖維素酶 菌株S21活化,點接種于纖維素酶檢測培養(yǎng)基,37℃下培養(yǎng)48 h后,往平板表面傾入0.1%的剛果紅溶液(蓋住菌落即可),靜置30 min,倒出0.1%的剛果紅溶液,再往平板傾入5%氯化鈉溶液,輕輕搖晃10 min,倒出5%氯化鈉溶液,觀察菌落周圍是否出現(xiàn)透明水解圈。

        1.2.5.4 淀粉酶 菌株S21活化,點接種于添加了1%淀粉的LB培養(yǎng)基,37℃下培養(yǎng)48 h后,往平板倒入碘液,觀察菌落周圍是否非藍(lán)色圈。

        1.2.6 枯草芽孢桿菌21產(chǎn)抗菌脂肽分離純化及鑒定 菌株S21活化,接種于LB培養(yǎng)基作為種子液,種子液按1%比例接種于Landy培養(yǎng)基,37℃下180 r/min振蕩培養(yǎng)30 h,8000 g離心去除菌體得上清液,上清液鹽酸調(diào)節(jié)pH至2后,4℃靜置過夜,7000 r/min離心得沉淀,沉淀用適量甲醇抽提(調(diào)節(jié)pH至7),蒸干得殘留物,殘留物加入適量蒸餾水溶解,得粗脂肽提取物。粗脂肽提取物使用半制備液相色譜進(jìn)行純化,流動相:乙腈(含0.1%三氟乙酸),水(含0.1%三氟乙酸),色譜柱:agilent XDB-C18,波長:214 nm,流速:0.8 mL/min,時間:0~35 min,90%乙腈—90%乙腈。利用安捷倫G6400三重四極桿質(zhì)譜聯(lián)用儀分析半制備色譜純化得到的活性抑菌峰。

        1.2.7 抗菌脂肽性質(zhì)研究

        1.2.7.1 抑菌譜 根據(jù)1.2.5方法制備得粗脂肽提取物,采用瓊脂擴(kuò)散法測試其對金黃色葡萄球菌,大腸桿菌,植物乳桿菌,產(chǎn)朊假單絲酵母,黑曲霉抑制活性(Jagadeeswari等,2010)。具體步驟為:指示菌使用LB培養(yǎng)基 (乳酸菌MRS培養(yǎng)基,霉菌PD培養(yǎng)基,酵母YPD培養(yǎng)基)活化,制備出約107cfu/mL指示菌菌液,相應(yīng)指示菌固體培養(yǎng)基融化待其溫度降至40℃左右后,按1%比例加入指示菌菌液,混勻倒平板,待平板凝固,打孔器打孔,孔中加入70μL粗抗菌脂肽,37℃下培養(yǎng)24 h后測量抑菌圈直徑。

        1.2.7.2 穩(wěn)定性 熱穩(wěn)定性,根據(jù)1.2.5方法制備得粗脂肽提取物,分別60℃(水浴)、80℃(水?。?、100 ℃(煮沸)、121 ℃(滅菌鍋) 處理 20 min,以金黃色葡萄球菌為指示菌,采用瓊脂擴(kuò)散法測試處理后的抗菌脂肽殘留抗菌活性。

        酸堿穩(wěn)定性,根據(jù)1.2.5方法制備得粗脂肽提取物,取粗脂肽提取物,采用HCl和NaOH分別調(diào)節(jié)其 pH 為 2、3、4、5、6、7、8、9、10, 以相應(yīng) pH相同的蒸餾水為對照,金黃色葡萄球菌為指示菌,采用瓊脂擴(kuò)散法測試不同pH下抗菌脂肽的抑菌活性。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 產(chǎn)抗菌脂肽芽孢桿菌篩選 利用芽孢桿菌可產(chǎn)生耐高溫芽孢的特性,水浴加熱采集的樣品除去非芽孢類細(xì)菌,從銅仁、遵義等地的土壤、枯葉、動物糞便中共篩選到芽孢桿菌200余株,通過是否產(chǎn)抗菌物質(zhì)篩選,從200余株芽孢桿菌中篩選得到產(chǎn)抗菌物質(zhì)的芽孢桿菌4株,編號分別為 B1、Y4、S21、20。 其中 S21 對金黃色葡萄球菌和大腸桿菌都有抑制效果,其他三株根據(jù)篩選的操作方法,其發(fā)酵上清液僅僅對金黃色葡萄球菌有抑制效果。故選定編號S21的菌株為進(jìn)一步研究菌株。

        2.2 菌株S21分子生物學(xué)鑒定 原核生物的16SrDNA基因含有高度保守序列、中度保守和高度變異序列,可以很好區(qū)分種屬關(guān)系,且序列長度1500 bp左右,測序方便。故16SrDNA鑒定是目前被最常用來作為細(xì)菌鑒定的方法 (楊霞等,2008;劉文強(qiáng)等,2007;焦振泉等,2001)。蘇州泓迅生物科技有限公司對菌株S21總DNA提取,16SrDNA 擴(kuò)增和測序,使用 seqman(7.1.0)軟件分析,得到1428 bp堿基,在www.ncbi.nlm.nlh.gov網(wǎng)站中使用BLAST在基因庫中進(jìn)行同源性搜索,所得結(jié)果中表明菌株S21與枯草芽孢桿菌Bacillus subtilis subsp.subtilis str.168(complete genome) (accession number:AL009126.3),Bacillus subtilis strain NCIB 3610 (complete genome)(accession number:CP020102.1) 等 Bacillus subtilis相似度達(dá)99%,http://www.ezbiocloud.net進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)與 Bacillus subtilis subsp.Subtilis(NCIB 3610(T))相似度為 99.79%,結(jié)合比較結(jié)果,鑒定菌株S21為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)。

        2.3 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)酶特性 枯草芽孢桿菌在代謝過程中能產(chǎn)生多種酶 (劉斯斯等,2017;劉秀俠等,2017;周平等,2016)。 對枯草芽孢桿菌S21的產(chǎn)酶特性定性檢測見圖1。從圖1可以發(fā)現(xiàn),蛋白酶、脂肪酶、纖維素酶和淀粉酶定性檢測試驗中,枯草芽孢桿菌S21菌落周圍均出現(xiàn)水解圈,說明其產(chǎn)蛋白酶、纖維素酶、脂肪酶和淀粉酶。

        圖1 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)酶特性

        2.4 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽分離純化及鑒定 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽分離純化及鑒定見圖2。粗抗菌脂肽經(jīng)過半制備色譜純化和抑菌試驗檢測,發(fā)現(xiàn)保留時間為15.163 s的峰為活性峰,此活性峰經(jīng)過ESI-TOF_MS質(zhì)譜鑒定,可得 到 <M+H >=1008,<M-CH2+H >=1022,<M-CH2++H>=1036 三個加氫離子峰,<M+Na>=1030,<M-CH2++Na>=1044加鈉離子峰,他們之間的分子量相差 14(即 CH2-),結(jié)合文獻(xiàn)資料(李寶慶等,2010;Xiaohong,2008;陳華等,2008),可以推斷出此抗菌脂肽為surfactin族系列物,具體屬于surfactin A系列、surfactin B系列還是surfactin C系列有待進(jìn)一步分析。

        圖2 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽分離鑒定圖

        2.5 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽性質(zhì)研究枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽的抑菌性、熱穩(wěn)定性和酸堿穩(wěn)定性見表1。從表1可知,枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽對金黃色葡萄球菌,大腸桿菌,植物乳桿菌,黑曲霉表現(xiàn)出不同強(qiáng)弱的抑菌活性,但是對產(chǎn)朊假單絲酵母無抑制活性??莶菅挎邨U菌S21產(chǎn)抗菌脂肽能承受一定的溫度,在80°C及以下溫度處理,其活性損失不大,但是對高溫抵抗力比較弱,100°C其活性可損失約達(dá)40%。酸堿方面,枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽在堿性環(huán)境下其抑菌活性不受影響,在酸性環(huán)境下,其抑菌活性受到一定抑制,但仍然能保留較大活性,總體來說,枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽熱穩(wěn)定性和酸堿穩(wěn)定性較好。

        3 討論

        Surfactin是芽孢桿菌屬部分菌株代謝產(chǎn)生的一種由七個氨基酸和13~15個碳原子的β羥基脂肪酸鏈組成的環(huán)狀抗菌脂肽(莊國宏,2014),研究表明surfactin具有抗菌、抗病毒、抗腫瘤、抗支原體和原蟲等活性 (翟少偉等,2015;任鵬舉等,2014),在醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)、食品、環(huán)境治理等領(lǐng)域具有巨大的應(yīng)用前景,特別是在畜牧業(yè)中替代抗生素,具有非常好的潛力。

        動物飼料中添加各種酶有利于動物生產(chǎn),因為酶可以幫助消化飼料,提升飼料報酬,故酶制劑在動物生產(chǎn)中應(yīng)用廣泛 (高研等,2017;高研等,2016a; 高研等,2016b;孫玉明等,2016),利用飼用益生菌本身產(chǎn)酶特性,制備微生態(tài)制劑,在動物消化也可起到重要作用。

        本研究篩選到一株能產(chǎn)對金黃色葡萄球菌和大腸桿菌都有抑制效果抗菌脂肽的芽孢桿菌,經(jīng)過分子生物學(xué)鑒定為枯草芽孢桿菌,進(jìn)一步研究表明枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)surfactin,且產(chǎn)蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶和纖維素酶,其產(chǎn)生的抗菌脂肽抑菌譜廣、熱穩(wěn)定性和酸堿穩(wěn)定性較好,說明枯草芽孢桿菌S21是一株性能優(yōu)良的菌株,能夠用于動物養(yǎng)殖,比如作為微生態(tài)制劑、發(fā)酵飼料和飼用抗菌脂肽生產(chǎn)菌種。

        表1 枯草芽孢桿菌S21產(chǎn)抗菌脂肽性能

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