文/曲鳴明
“你需要哪些材料,哪些數(shù)據(jù)?”面對筆者的采訪,伯曉晨研究員習(xí)慣性地用材料、數(shù)據(jù)等一系列實實在在的證據(jù)闡述事實,或許就是他自2003年以來,孜孜不倦地從事生物信息學(xué)研究而養(yǎng)成的專業(yè)習(xí)慣。
幾乎每一位在同一領(lǐng)域鉆研多年、有著較高造詣的科研人員,身上都會顯現(xiàn)與其職業(yè)相符的某種氣質(zhì),伯曉晨研究員也不例外。這位榮獲第21屆求是杰出青年實用工程獎,并受邀參加頒獎盛典,獲得了由中國科協(xié)領(lǐng)導(dǎo)頒獎榮譽的科研人員,舉止言談中,都流露著嚴(yán)肅而淡然的穩(wěn)重氣度。
“我之所以要從事生物信息學(xué)研究,做生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)這個方向,是出于國家軍隊需要和技術(shù)發(fā)展的必然趨勢?!辈畷猿空J(rèn)真地說:“一方面,新一代生物安全技術(shù)體系需要大數(shù)據(jù)支撐;另一方面,生物大數(shù)據(jù)正在深刻變革生物醫(yī)學(xué)研究范式,實驗加計算的研究模式逐漸成為主流。”近年來,本著這樣的理念,伯曉晨率領(lǐng)團隊在大數(shù)據(jù)支撐的生物安全、基因組注釋和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)等方面努力開拓。
生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的研究,需要面對海量數(shù)據(jù),進行耐心細(xì)致的分析,在旁人眼中頗為枯燥乏味,但對于伯曉晨而言,他熱愛這個專業(yè)——熱愛,既是出于興趣,也是出于責(zé)任。
“我是國防科技大學(xué)控制科學(xué)專業(yè)畢業(yè)的,原本學(xué)的是自動化技術(shù),碩士和博士期間的研究方向與生物醫(yī)學(xué)完全不沾邊。一直到博士畢業(yè),將近30歲才到原軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院從事生物信息學(xué)研究?!辈畷猿扛嬖V筆者,最開始,他只負(fù)責(zé)簡單的實驗設(shè)計、數(shù)據(jù)分析、儀器維護等工作:“這對于我來說沒有什么難度?!弊鳛橐粋€希望體現(xiàn)更多人生價值,為國家、部隊真正做出貢獻的青年,伯曉晨從一開始就不希望自己的工作停留在輕松簡單的范疇內(nèi),他看到了自己與生物醫(yī)學(xué)研究之間存在的專業(yè)差距,并希望盡快彌補。
“高中畢業(yè)后就沒有再接觸過化學(xué)和生物的知識,我只能從別人眼里最基本的常識開始學(xué)習(xí)。為了自學(xué)好生物,甚至從中學(xué)化學(xué)開始補課。”通過兩年多的勤奮學(xué)習(xí),伯曉晨迅速掌握了科研所必需的相關(guān)生物學(xué)知識,快速完成了由自動化專業(yè)向生物信息專業(yè)的過渡。與此同時,他結(jié)合自身的專業(yè)優(yōu)勢,大膽開展了交叉科學(xué)研究:“用信息技術(shù)解決生命科學(xué)的問題,這是我們生物信息方向發(fā)展的一條途徑?!辈畷猿咳缡钦f。
有想法就要大膽實施,堅持心中的方向,孜孜以求,讓歲月累積經(jīng)驗與成果。十幾年來,伯曉晨始終朝著交叉學(xué)科的研究方向前行,并陸續(xù)取得一系列有特色的研究成果。其個人也因此獲得諸多榮譽:他先后入選北京市科技新星、原總后勤部科技新星、國家科技部創(chuàng)新人才推進計劃“中青年科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才”、第三批國家“萬人計劃”領(lǐng)軍人才,并兩次榮立三等功。
科研的腳步并未因榮譽的取得而稍停。近年來,伯曉晨研究員帶領(lǐng)一支以青年人為主的交叉研究團隊,緊密結(jié)合我軍后勤現(xiàn)代化建設(shè)的需求和生命科學(xué)發(fā)展前沿,面向傳染病防控、精準(zhǔn)醫(yī)療等重大需求開展生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析關(guān)鍵技術(shù)研究。作為負(fù)責(zé)人和主要研究者,他先后承擔(dān)自然基金重大研究計劃、國家重點研發(fā)專項等國家和軍隊課題10余項,發(fā)表第一和通訊作者SCI期刊論文50余篇。
“新一代的生物安全技術(shù)研究,要求具有針對新發(fā)病原體的檢測能力?!闭劶皹?gòu)筑新一代生物防控技術(shù)體系,伯曉晨研究員表達了上述觀點。他還認(rèn)為,擁有針對生物威脅的快速應(yīng)對能力,是未來生物安全體系所要追求的另外一個重要能力。無論是解決“新發(fā)”還是“快速反應(yīng)”的問題,大數(shù)據(jù)的處理和分析都是重要的支撐技術(shù)之一。
在大數(shù)據(jù)技術(shù)的推動下,新一代生物防控技術(shù)體系正在形成,其中多個關(guān)鍵數(shù)據(jù)分析工作有待突破。“他山之石可以攻玉?!辈畷猿空f。“我們團隊的特色就在于充分利用海量的公開數(shù)據(jù)資源,把各種不同側(cè)面的數(shù)據(jù)聯(lián)系起來?!眻F隊在基因組高效并行分析、大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組比較等技術(shù)方向上建立了系列關(guān)鍵算法和軟件,并在相關(guān)的基礎(chǔ)研究方面取得了重要進展。
“生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)一方面服務(wù)于國防和國家安全,一方面服務(wù)于人類健康?!辈畷猿考皥F隊還將目光瞄準(zhǔn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)相關(guān)的多組學(xué)整合分析中的系列瓶頸問題。“解碼人類基因間的調(diào)控關(guān)系不僅是后基因組時代生物學(xué)的挑戰(zhàn),更是發(fā)展針對腫瘤等復(fù)雜疾病診斷治療手段的重要基礎(chǔ)。囿于目前生物學(xué)的研究手段,基因組、轉(zhuǎn)錄組等各種組學(xué)技術(shù)只能提供某一層次的觀測數(shù)據(jù)?!辈畷猿空f:“我們發(fā)展了一系列挖掘和建模方法,這就能夠為揭示復(fù)雜的基因調(diào)控模式提供分析工具和線索?!贝送?,該團隊還針對分子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、表征、比較等環(huán)節(jié),發(fā)展了關(guān)鍵算法和軟件,為疾病機理解析、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)診斷等提供了關(guān)鍵的技術(shù)支撐。
在科技強軍以及新軍科組建的大背景下,伯曉晨對未來的研究方向有著更加深遠的規(guī)劃。他認(rèn)為,自己和自己的團隊之所以能夠取得今天的成就,一方面來自于國家、軍隊人才政策的支持;另一方面則來自于學(xué)科交叉帶來的創(chuàng)新與突破。
“生物醫(yī)學(xué)研究需要各種專業(yè)的配合。”伯曉晨說,“這是由于生命科學(xué)本身就具有強大的包容性,數(shù)學(xué)、物理、計算機等等專業(yè)的人才都可以進入生命科學(xué)領(lǐng)域,從自己專業(yè)的角度來解析生命的奧秘。當(dāng)然,交叉研究對人的要求還是挺高的,你需要掌握兩個或者更多個專業(yè)的基礎(chǔ)知識和價值觀。”在他的團隊中,多數(shù)人才并非生物專業(yè)出身,而是來自數(shù)學(xué)、物理、計算機、自動化、電子等各行各業(yè)。他要求大家發(fā)揮專業(yè)交叉的優(yōu)勢,獨立思考,大膽用自己的專業(yè)特長解決問題。
在未來的科研道路上,伯曉晨將繼續(xù)帶領(lǐng)這支獨具特色、兼包并容的生物信息學(xué)團隊,利用學(xué)科交叉的優(yōu)勢,為國家生物科研事業(yè)做出卓越貢獻?!?/p>