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        重新認(rèn)識(shí)生物圈

        2018-10-31 05:47:50汪品先
        世界科學(xué) 2018年10期
        關(guān)鍵詞:生物圈真核原核

        汪品先

        說(shuō)起生物圈,我們都再熟悉不過(guò):每天吃的、相處的都跳不出生物圈。不過(guò)我們對(duì)生物圈的了解其實(shí)很膚淺,原有的認(rèn)識(shí)也已經(jīng)太陳舊。如果你升到太空回頭看地球,可以把生物圈看作地球系統(tǒng)的一個(gè)圈層;如果你穿越地質(zhì)歷史看今天,在地球演變中看生物圈的發(fā)展,那就會(huì)發(fā)現(xiàn)一個(gè)你很不熟悉的生物圈。自從生命起源,地球上的水循環(huán)和碳循環(huán)都離不開(kāi)生物的作用,所謂碳循環(huán),在很大程度上就是碳的生物地球化學(xué)過(guò)程。從另一方面看,30幾億年來(lái)的生命演化史,也就是地球表層各個(gè)系統(tǒng)相互作用、共同演化的經(jīng)歷。

        地球系統(tǒng)里的生物圈

        地球系統(tǒng)討論的生物圈和人類(lèi)生活里接觸的生物圈,有著不同的含義。人類(lèi)以自己為中心,從生物圈里首先看見(jiàn)的是包括自己在內(nèi)的動(dòng)物,連地質(zhì)學(xué)劃分年代的根據(jù)也是動(dòng)物化石。然而放在地球系統(tǒng)里,動(dòng)物只是生物圈里很小的一部分。地球系統(tǒng)科學(xué)就是自然界的“大歷史”,生物圈的意義不在于生物類(lèi)別的演替,而是生物在地球系統(tǒng)里對(duì)能量和物質(zhì)的轉(zhuǎn)換。因此,進(jìn)行光合作用的植物是生態(tài)系統(tǒng)的基礎(chǔ),相當(dāng)于創(chuàng)造社會(huì)財(cái)富的“勞動(dòng)群眾”。 動(dòng)物當(dāng)然重要,正是脊椎動(dòng)物的長(zhǎng)距離運(yùn)動(dòng)傳播種子,擴(kuò)大了植物的地理分布;正是鉆泥動(dòng)物的攪動(dòng)改造了陸地的土壤層,促進(jìn)了植物的繁榮生長(zhǎng)。但是,地球生態(tài)系統(tǒng)的基礎(chǔ)不是動(dòng)物,而是植物和下面將要介紹的微生物,這才是“真正的英雄”。

        生態(tài)系統(tǒng)是個(gè)金字塔,營(yíng)養(yǎng)層次越高生物量越少。從生物量看,地球上的生物圈主要是樹(shù)木。陸地植物總生物量的92% 屬于森林,海洋的生物量比陸地少幾百倍,陸地動(dòng)物也比植物的生物量少上千倍。人類(lèi)通常注意的是大個(gè)體的生物,但是論生物量反而不如小個(gè)體的生物。上面說(shuō)的是生物量,如果拿生物多樣性來(lái)比較,那么動(dòng)物的種類(lèi)就要比植物多,雖然全球生物多樣性的準(zhǔn)確數(shù)據(jù)很難取得。至于微生物(原核生物),連什么叫“種”都說(shuō)不清楚,因此能說(shuō)種數(shù)的只是真核生物??茖W(xué)家250年來(lái)已經(jīng)描述了一百幾十萬(wàn)個(gè)物種,其中主要是動(dòng)物,光昆蟲(chóng)就有上百萬(wàn)種,植物才二三十萬(wàn)種。

        微生物——地球生態(tài)系統(tǒng)的基礎(chǔ)

        微生物的研究是從病菌開(kāi)始的,后來(lái)人們知道:地球表面微生物幾乎無(wú)所不在,它們?cè)瓉?lái)是地球生態(tài)系統(tǒng)的基礎(chǔ),危害人類(lèi)的只是其中的一小部分。陸地上,微生物活躍在生命活動(dòng)的每個(gè)環(huán)節(jié)里;海洋里,微生物更是生物量的主體,是海洋生物圈物質(zhì)循環(huán)的必要環(huán)節(jié),其中包含著參加制造有機(jī)物的“正能量”;在海底,還發(fā)現(xiàn)了不靠光合作用的黑暗食物鏈和海底下面的深部生物圈。

        微型光合生物我們熟悉的海洋浮游植物本來(lái)都很小,如硅藻等都是幾十微米到毫米級(jí)的個(gè)體,但是在1980年前后發(fā)現(xiàn)海洋里進(jìn)行光合作用的還有更小的生物。這就是屬于藍(lán)細(xì)菌的聚球藻和原綠球藻,它們都屬于微型光合生物(也叫微微型浮游生物)的范疇,這些新發(fā)現(xiàn)沖擊了海洋生態(tài)學(xué)的傳統(tǒng)概念。原來(lái)只知道真核類(lèi)的浮游植物進(jìn)行光合作用,現(xiàn)在知道微小的原核生物不但也能進(jìn)行光合作用,而且還是分布最廣、為數(shù)最多的海洋生物。如果把有核酸顆粒的都作為生物統(tǒng)計(jì),那么海洋里論個(gè)體數(shù)最多的是病毒,占了大洋中有核酸顆粒的94%(每一毫升海水中有上百萬(wàn)個(gè)病毒,估計(jì)全大洋有1030個(gè)病毒,連起來(lái)長(zhǎng)度超過(guò)60個(gè)銀河系),但畢竟個(gè)體小,論生物量在大洋只占5%;相反,原核生物在大洋中占據(jù)有核酸顆??倲?shù)不到10%,生物量卻超過(guò)90%。原生生物的藻類(lèi)在海洋表層可占到生產(chǎn)量的一半,但是在大洋中層、深層只有百分之幾或者更少,所以總的生物量還不如病毒(圖1)。這種新的視野,改變了我們對(duì)海洋生物圈的認(rèn)識(shí):海洋生物量的90%以上屬于原核生物,原來(lái)微生物才是海洋生物圈的主體。

        圖1 海洋里各類(lèi)微生物的大小尺度(上)、生物量和個(gè)體數(shù)(下)的比較

        黑暗食物鏈20 世紀(jì)70 年代末,海洋科學(xué)最大的發(fā)現(xiàn)是深海熱液,而其中最為出人意料的是熱液口密密麻麻的動(dòng)物,如色彩鮮艷的管狀蠕蟲(chóng)群體,數(shù)不清的螺類(lèi)、貝蝦類(lèi)和螃蟹。大洋深處一無(wú)陽(yáng)光、二無(wú)養(yǎng)分,生產(chǎn)力應(yīng)該極其低下,哪里來(lái)的營(yíng)養(yǎng)元素和能量?原來(lái)熱液生物群的基礎(chǔ)是微生物,微生物依靠化學(xué)合成制造有機(jī)物支持各種熱液動(dòng)物,構(gòu)成熱液生物群。熱液生物群的發(fā)現(xiàn)改變了生物圈的基本概念,原來(lái)地球上存在兩大生物圈:一是依靠太陽(yáng)能通過(guò)光合作用在氧化環(huán)境下制造有機(jī)物的生物圈;二是海底熱液區(qū)的“黑暗食物鏈”,以硫細(xì)菌為基礎(chǔ),依靠地球內(nèi)部的地?zé)崮?,通過(guò)微生物化學(xué)合成作用在無(wú)氧還原的環(huán)境下制造有機(jī)物?;\統(tǒng)來(lái)說(shuō),在化學(xué)元素表里,“有光食物鏈”靠的是氧,“黑暗食物鏈”靠的是硫;在能源產(chǎn)生的物理機(jī)制上,“有光食物鏈”靠的是太陽(yáng)內(nèi)部的核聚變,“黑暗食物鏈”靠的是地球內(nèi)部的核裂變。論原理,前者相當(dāng)于氫彈、后者相當(dāng)于原子彈,氫彈產(chǎn)生的能量雖然距離地球遙遠(yuǎn),還是比原子彈強(qiáng)。

        深部生物圈上述發(fā)現(xiàn)說(shuō)明海里生活著巨大數(shù)量的微生物。而同樣驚人的發(fā)現(xiàn),是在海底以下上千米厚的沉積層里,居然還有巨大數(shù)量的微生物生活著,甚至在深海玄武巖里還有細(xì)菌生活,這構(gòu)成了由大量微生物組成的“深部生物圈”。然而它究竟有多大,至今并不清楚。不僅是規(guī)模,“深部生物圈”的組分也有待進(jìn)一步調(diào)查。基因分析表明,海底深處的沉積中,除原核類(lèi)之外也有真核類(lèi)存在。

        極端環(huán)境的微生物“深部生物圈”的發(fā)現(xiàn),挑戰(zhàn)了生命環(huán)境的原有概念,原來(lái)微生物的分布,遠(yuǎn)遠(yuǎn)超越了我們已知的生命極限,于是人們提出了“嗜極生物(extremophile)”的概念,專(zhuān)指在極端環(huán)境下生活的微生物,如極限溫度、酸堿度等。目前看來(lái)最能適應(yīng)高溫的就是古菌,熱液口的嗜熱古菌在113 ℃下還可以生長(zhǎng)。

        生物的重新分類(lèi)

        人類(lèi)對(duì)所接觸的生物進(jìn)行分類(lèi),是根據(jù)看到的形態(tài)和行為來(lái)劃分成最顯著的動(dòng)物和植物。但是微生物根本談不上形態(tài),分類(lèi)依據(jù)靠的是分子生物學(xué)。一旦把微生物和動(dòng)植物放到一起,生物分類(lèi)就只能重新洗牌。生物分類(lèi)在20年前流行的是五個(gè)界的方案:除了動(dòng)物界、植物界和真菌界之外,還有單細(xì)胞動(dòng)物的原生生物界和原核生物界(圖2)。在進(jìn)一步研究的基礎(chǔ)上,Woese等1990年正式提出將生物分為三個(gè)域:真核生物域、真細(xì)菌域和古細(xì)菌域,“域”要比“界”更高。生物三分天下,多細(xì)胞的動(dòng)植物只是真核生物中的一部分。傳統(tǒng)的分類(lèi)方案里多細(xì)胞動(dòng)植物是生物界的主流,而在新方案里只是1/3里的小部分。

        圖2 生物分類(lèi)比較:傳統(tǒng)的系統(tǒng)分類(lèi)(左)和分子生物學(xué)的系統(tǒng)分類(lèi)(右)

        對(duì)持有“人類(lèi)中心觀(guān)”的讀者來(lái)說(shuō),看到這種分類(lèi)可能感覺(jué)不舒服,但其這種分類(lèi)該是非常合理的。本來(lái)微生物是生物圈的主體,不但數(shù)量上(圖1),種類(lèi)上也占據(jù)多數(shù)。從分子生物學(xué)的角度看,原核類(lèi)的基因多樣性遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)真核類(lèi),因?yàn)樵祟?lèi)在地球上已經(jīng)生活、演化了35 億年,比真核類(lèi)的“資歷”高出許多倍。在地球系統(tǒng)生物圈的大千世界里,自封為“萬(wàn)物之靈”的人類(lèi)所處的其實(shí)只是個(gè)非常狹小的角落。

        生物學(xué)從傳統(tǒng)的形態(tài)分類(lèi)發(fā)展到分子生物學(xué)的化學(xué)分類(lèi),是一個(gè)脫胎換骨的深刻變化,絕不可能在短時(shí)間內(nèi)完成,對(duì)于建立在形態(tài)分析基礎(chǔ)上的化石研究,尤其是個(gè)重大的挑戰(zhàn)。

        生物圈的發(fā)展

        生命起源的地點(diǎn)究竟是淺水的“原始湯”還是深海的熱液口并不清楚,但是從生命起源之后,生物圈主要經(jīng)過(guò)了5次大發(fā)展,每次隨著生物的演化拓展了新的生態(tài)空間:① 原核生物細(xì)菌和古菌的分異;② 真核生物的產(chǎn)生;③ 多細(xì)胞生物產(chǎn)生;④ 生物登上陸地;⑤ 智能的產(chǎn)生。這里從地質(zhì)記錄出發(fā),主要對(duì)②~④作進(jìn)一步討論。

        真核生物的產(chǎn)生生命早期演化的一個(gè)重大臺(tái)階是真核生物的形成,即如何從簡(jiǎn)單的原核細(xì)胞演化成具有各種細(xì)胞器的真核細(xì)胞,而其中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)是生物的“內(nèi)共生”理論,認(rèn)為這些細(xì)胞器來(lái)自獨(dú)立的單細(xì)胞生物。具體地說(shuō),一個(gè)被吞噬的原核生物,可以在更大的原核生物里存活下來(lái),經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期共生演變成為細(xì)胞器,藍(lán)細(xì)菌成了葉綠體,好氧細(xì)菌成了線(xiàn)粒體,這就形成了真核細(xì)胞。因此,內(nèi)共生帶來(lái)基因的水平轉(zhuǎn)移是生命演化的重要途徑,最早的內(nèi)共生結(jié)果就是真核生物的起源。真核類(lèi)早期演化產(chǎn)生的綠藻和紅藻兩大系列,構(gòu)成了藻類(lèi)演化的“綠枝”與“紅枝”,它們?cè)谝院蟮难莼蟹值罁P(yáng)鑣:“綠枝”系列登上了陸地,主宰陸地植被;“紅枝”系列在海洋里發(fā)展,產(chǎn)生了紅藻、褐藻等多種色彩的海洋生物,成為海洋的主角。

        真核生物起源的重要性在于比起原核細(xì)胞來(lái),真核細(xì)胞的體積要大出3~4 個(gè)量級(jí),內(nèi)部構(gòu)造更有原則性的區(qū)別,因此兩者新陳代謝的效率不可同日而語(yǔ)。真核生物的光合作用是生產(chǎn)力發(fā)展上極大的創(chuàng)新,其每年全球產(chǎn)生的有機(jī)碳大約是全大洋熱液活動(dòng)區(qū)的微生物產(chǎn)生的有機(jī)碳的一萬(wàn)倍。含氧光合作用和真核生物的出現(xiàn),不但使生物界個(gè)體的體積增大,更為進(jìn)一步演化產(chǎn)生多細(xì)胞動(dòng)植物、加快演化速率準(zhǔn)備了條件。

        多細(xì)胞生物產(chǎn)生從單細(xì)胞到多細(xì)胞的變化過(guò)程,其實(shí)并沒(méi)有想象中的那樣偉大,它們之間也沒(méi)有截然的界限。好些單細(xì)胞生物可以形成群體,這就是最簡(jiǎn)單的多細(xì)胞生物。這里我們討論的還都是依靠化學(xué)合成或光合作用的自養(yǎng)生物。早期地球上的生物也確實(shí)只能有自養(yǎng)生物,因而是個(gè)扁平的生態(tài)系統(tǒng),都是生產(chǎn)者,沒(méi)有競(jìng)爭(zhēng),也很難演化。打破平靜的是大概七八億年前的元古宙末期,先是演化產(chǎn)生了食用單細(xì)胞生物的原生動(dòng)物,接著就是多細(xì)胞動(dòng)物和植物的出現(xiàn)。當(dāng)時(shí)的動(dòng)物化石主要是軟體及其印模,但是動(dòng)物的出現(xiàn)建立了多營(yíng)養(yǎng)級(jí)的生態(tài)系統(tǒng),動(dòng)物發(fā)展出各種復(fù)雜的器官、多樣的身體構(gòu)型和行動(dòng)方式,不但加大了身體體積、動(dòng)作力度和位移長(zhǎng)度,而且加速了生物演化的步伐,激起生物多樣性的急劇增加,增強(qiáng)了生物圈的環(huán)境效應(yīng)。多細(xì)胞動(dòng)植物的產(chǎn)生,極大地拓展了生物圈在地球表面的分布,強(qiáng)化了對(duì)太陽(yáng)能的利用效率,加速了生物自身的演化進(jìn)程,同時(shí)也改造了從陸地到海底的環(huán)境。

        底棲動(dòng)物及其骨骼的出現(xiàn)60 年前澳大利亞南部發(fā)現(xiàn)的埃迪卡拉動(dòng)物群(一批沒(méi)有骨骼的無(wú)脊椎動(dòng)物化石)說(shuō)明6.35億年前多細(xì)胞動(dòng)物門(mén)類(lèi)大量涌現(xiàn)。埃迪卡拉動(dòng)物群是淺海沉積里的底棲動(dòng)物,但它們并沒(méi)有礦物質(zhì)的骨骼,一般都以過(guò)濾浮游生物或者食用海底菌席為生,缺乏積極移動(dòng)的能力。

        動(dòng)物界下一次的重大變革,發(fā)生在5億多年前寒武紀(jì)的開(kāi)始,其中一個(gè)關(guān)鍵在于食肉類(lèi)動(dòng)物的出現(xiàn),不但改變了生態(tài)系統(tǒng)的構(gòu)成,而且激起了生物演化的高潮。食肉動(dòng)物的出現(xiàn),第一次向動(dòng)物界宣告了死亡的威脅,促使各種動(dòng)物尋找躲藏的出路。這當(dāng)然也要有客觀(guān)條件,如寒武紀(jì)澄江動(dòng)物群(大批具有骨骼的無(wú)脊椎和脊索動(dòng)物化石)最大的特點(diǎn)是大量硬體化石的出現(xiàn),具有碳酸鈣、磷酸鈣等礦物成分。前提是海底擴(kuò)張和洋中脊活動(dòng)加強(qiáng)、大陸長(zhǎng)期風(fēng)化使海水中Ca2+等離子增多,為元古宙末的大洋提供了建造骨骼所需的離子。

        生物登上陸地生物圈登陸的變化發(fā)生在4億年前后的志留紀(jì)、泥盆紀(jì),完成在泥盆紀(jì)晚期。陸地上要有動(dòng)物,前提是要有植物;陸地上要有植物,前提是要有土壤。因此猜想打前戰(zhàn)的是菌席和地衣:藍(lán)細(xì)菌的菌席先在潮間帶發(fā)育,然后拓展到陸地;地衣是真菌和光合生物共生的生物體,能夠分泌地衣酸腐蝕巖面,促進(jìn)土壤的形成。泥盆紀(jì)末形成的陸地生物圈主要是構(gòu)造復(fù)雜的植物體。登上陸地是生物史上極大的創(chuàng)新,脫離了海水的生物需要直接面對(duì)太陽(yáng)的曝曬和風(fēng)雨變幻,需要去謀取水分和營(yíng)養(yǎng)。陸地植被的形成提高了地球?qū)μ?yáng)輻射能的利用,改變了地球表面的景觀(guān),對(duì)地球表層從大氣到地貌產(chǎn)生了全方位的影響。也是在三四億年前泥盆紀(jì)的晚期,魚(yú)類(lèi)中演化出具有肺和四肢的類(lèi)型,登上陸地,成為兩棲類(lèi)四足動(dòng)物。到石炭紀(jì),已經(jīng)有大量能飛的節(jié)肢動(dòng)物,生物界開(kāi)始向大氣圈進(jìn)軍。至于脊椎動(dòng)物上天,還得再等上一億年??傊?,三四億年前的陸地已經(jīng)被動(dòng)植物占領(lǐng)。

        生物圈的發(fā)展塑造了當(dāng)今的地球表層系統(tǒng),不僅將還原環(huán)境轉(zhuǎn)化為氧化環(huán)境,而且改造了陸地的地貌景觀(guān)和海底的物理性質(zhì)。生物圈在地球表層造成的變化,通過(guò)俯沖板塊進(jìn)入地球內(nèi)部改變了地幔的性質(zhì)和成分。生物圈的發(fā)展使其本身成為重要的環(huán)境因素,典型的例子是中新世晚期廣大草原形成時(shí),從陸上的有蹄類(lèi)哺乳動(dòng)物到海洋里的硅藻,都與之發(fā)生協(xié)同演化??傊?,30多億年的生命史回味無(wú)窮。生物改造了地球,也改造了自身。生命活動(dòng)主要是在太陽(yáng)能驅(qū)動(dòng)下進(jìn)行的,實(shí)際上為地球提供了長(zhǎng)期儲(chǔ)存太陽(yáng)能的獨(dú)特機(jī)制,這些能量的結(jié)晶就是豐富多彩的當(dāng)代地球。

        本文據(jù)《地球系統(tǒng)與演變》(汪品先,2018年)一書(shū)改寫(xiě)。

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