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        ERCC-2基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌患者預(yù)后相關(guān)性的meta分析

        2018-09-11 02:09:48武亞運(yùn)王勇攀董曉強(qiáng)毛德利何宋兵
        健康研究 2018年4期
        關(guān)鍵詞:多態(tài)性基因型位點(diǎn)

        武亞運(yùn),王勇攀,董曉強(qiáng),毛德利,何宋兵

        (1.嘉善縣第一人民醫(yī)院 普外科,浙江 嘉善 314000;2.蘇州大學(xué)附屬第一醫(yī)院 普外科,江蘇 蘇州 215006)

        胃癌(gastric cancer)是消化系統(tǒng)比較常見(jiàn)的惡性腫瘤,有統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)表明,在2012年,全世界有72.31萬(wàn)的胃癌患者死亡,而且有95.16萬(wàn)的新增病例[1]。亞洲地區(qū)尤其是亞洲東部地區(qū)的胃癌發(fā)病率相對(duì)全球而言,處于較高的水平,就最新的流行病學(xué)數(shù)據(jù)表明,2015年度,我國(guó)新增67.91萬(wàn)胃癌患者,同年又有49.80萬(wàn)胃癌患者死亡,對(duì)于我國(guó)國(guó)民而言,其危害性僅次于肺癌[2]。ERCC-2基因,又稱XPD基因,即著色性干皮病基因 D(xeroderma pigmentosum group D,XPD),是NER(nucleotide excision repair)通路中的重要基因,該基因中751、312 位密碼子的突變頻率較高。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),該基因的rs1799793(XPD312)、rs13181(XPD751)位點(diǎn)單核苷酸突變與胃癌患者預(yù)后相關(guān)[3-4]。本文擬應(yīng)用meta分析的方法系統(tǒng)評(píng)價(jià)ERCC2基因多態(tài)性與胃癌患者預(yù)后的相關(guān)性。

        1 資料和方法

        1.1 檢索數(shù)據(jù)庫(kù) 檢索Pubmed, Embase, Web of science等數(shù)據(jù)庫(kù)中2017年9月8日前公開(kāi)發(fā)表的有關(guān)ERCC2多態(tài)性與胃癌相關(guān)的文獻(xiàn)。對(duì)檢索到的文獻(xiàn)無(wú)時(shí)間限制,未檢索灰色文獻(xiàn),語(yǔ)種為英文。檢索關(guān)鍵詞為(“ERCC-2”,“ERCC2”,“XPD”, “Stomach Neoplasm*”, “Gastric Neoplasm*”, “Stomach Cancer*”, “Gastric Cancer*”,“Polymorphism*”,“snp”, “snps”, “varia*”, “mutation*”),括號(hào)內(nèi)“*”代表“截詞檢索”。

        1.2 文獻(xiàn)的納入和排除 納入標(biāo)準(zhǔn):英文類公開(kāi)發(fā)表的隊(duì)列研究文獻(xiàn),所有研究對(duì)象均為病理確診的胃癌,對(duì)于預(yù)后的相關(guān)性研究,結(jié)局指標(biāo)必須為OS(Overall Survival即總體生存時(shí)間),文中可以直接獲取HR(hazard ratio)及95%CI(confidengce interval),或應(yīng)用Tierney 等人的方法從Kaplan-meier生存曲線上間接獲取HR及95%CI[5];排除會(huì)議論文或摘要,綜述,系統(tǒng)評(píng)價(jià)類文獻(xiàn),動(dòng)物試驗(yàn),質(zhì)量評(píng)價(jià)分?jǐn)?shù)較低,數(shù)據(jù)不全且無(wú)法獲得完整數(shù)據(jù)的文獻(xiàn)。

        1.3 文獻(xiàn)質(zhì)量及風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià) 此次meta分析,由于納入的所有研究類型均為隊(duì)列研究,應(yīng)用的是NOS量表(Newcastle-OttawaScale量表)對(duì)研究進(jìn)行評(píng)價(jià),以其下包含的8個(gè)分支小條目作為評(píng)分點(diǎn),單個(gè)小條目代表1分,高于6分(含6分)的研究才可進(jìn)行meta分析。經(jīng)評(píng)價(jià)后所有入選文獻(xiàn)評(píng)分均在6分及6分以上。

        1.4 篩選和資料提取 研究的篩選由多名人員完成(n≥3)。主要提取的信息包括:作者、胃癌患者腫瘤分期、樣本量、SNP位點(diǎn)、終末指標(biāo)、基因型測(cè)序方法、研究所在地區(qū)。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 Stata 14.0處理數(shù)據(jù),對(duì)包含的研究應(yīng)用χ2檢驗(yàn)進(jìn)行異質(zhì)性評(píng)價(jià),只有當(dāng)I2值低于50%且P>0.05,采用固定效應(yīng)模型。對(duì)于生存資料,以HR值(對(duì)于文獻(xiàn)中同時(shí)存在CrudeHR和AjustedHR情況,選擇AdjustedHR)及95%CI作為效應(yīng)量對(duì)各個(gè)納入的文獻(xiàn)結(jié)果進(jìn)行合并,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,繪制森林圖,并繪制漏斗圖檢測(cè)發(fā)表偏倚(Egger檢驗(yàn)結(jié)果,P<0.1認(rèn)為存在發(fā)表偏倚),最后進(jìn)行敏感性分析。

        2 結(jié)果

        2.1 文獻(xiàn)檢索與篩選結(jié)果 共檢索到239篇胃癌與ERCC-2基因多態(tài)性相關(guān)的文獻(xiàn)。根據(jù)上述的文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià)原則及被研究文獻(xiàn)的納入和排除標(biāo)準(zhǔn),最終11篇研究納入meta分析,共計(jì)3282例經(jīng)病理確診的胃癌患者,研究的年限區(qū)間為2008—2016年。具體見(jiàn)表1。

        表1 納入文獻(xiàn)基本情況

        *AGC advanced gastri cancer;OS Overall survival;HR Hazard ratio

        2.3 ERCC-2基因單核苷酸多態(tài)性與胃癌患者預(yù)后相關(guān)的meta分析結(jié)果

        2.3.1 rs13181單核苷酸多態(tài)性與胃癌患者預(yù)后相關(guān)的meta分析 結(jié)果顯示,rs13181單核苷酸多態(tài)性與胃癌患者預(yù)后無(wú)明顯相關(guān)性,森林圖結(jié)果顯示,GT/TT(HR=0.94,95%CI=0.80~1.10,P=0.408)(圖1),GG/TT(HR=0.97,95%CI=0.75~1.25,P=0.820)(圖2);發(fā)表偏倚的數(shù)字化結(jié)果見(jiàn)圖3、4,Egger檢驗(yàn)結(jié)果提示,GT基因型vs. TT基因型P=0.179;GG基因型vs. TT基因型P=0.746(均P>0.1),結(jié)合圖示及數(shù)字化結(jié)果,沒(méi)有明顯發(fā)表偏倚;為分析單項(xiàng)研究對(duì)總的合并結(jié)果的影響力,應(yīng)用Stata軟件繪制的敏感性分析圖顯示,剔除單項(xiàng)研究后結(jié)果沒(méi)有明顯變化(圖5和圖6)。

        圖1 GT基因型 vs. TT基因型森林圖

        圖2 GG基因型 vs. TT基因型森林圖

        圖3 GT基因型 vs. TT基因型漏斗圖

        圖4 GG基因型 vs. TT基因型漏斗圖

        圖5 GT基因型 vs. TT基因型敏感性分析

        圖6 GG基因型 vs. TT基因型敏感性分析

        2.3.2 rs1799793單核苷酸多態(tài)性與胃癌患者預(yù)后相關(guān)的meta分析 結(jié)果顯示,對(duì)于rs1799793位點(diǎn), 森林圖結(jié)果顯示GA/GG(HR=1.09,95%CI=0.93~1.27,P=0.280)(圖7),AA/GG(HR=1.58,95%CI=1.20~2.08,P=0.001)(圖8);發(fā)表偏倚的數(shù)字化結(jié)果見(jiàn)圖9、10。Egger檢驗(yàn)結(jié)果提示,GA基因型vs. GG基因型P=0.200;AA基因型vs. GG基因型P=0.751(P均>0.1),結(jié)合圖示及數(shù)字化結(jié)果,沒(méi)有明顯發(fā)表偏倚;為分析單項(xiàng)研究對(duì)總的合并結(jié)果的影響力,應(yīng)用Stata軟件繪制的敏感性分析圖顯示,剔除單項(xiàng)研究后結(jié)果沒(méi)有明顯變化,結(jié)論可靠(見(jiàn)圖11、12)。

        圖7 GA基因型vs. GG基因型森林圖

        圖8 AA基因型 vs. GG基因型森林圖

        圖9 GA基因型 vs. GG 基因型漏斗圖

        圖10 AA基因型vs. GG基因型漏斗圖

        圖11 GA基因型 vs. GG基因型敏感性分析

        圖12 AA基因型 vs. GG基因型敏感性分析

        3 討論

        胃癌的全球發(fā)病率位于第五位,死亡率位居第三位[1]。切除修復(fù)交聯(lián)互補(bǔ)基因2(ERCC2/XPD)是一種進(jìn)化保守的DNA解旋酶基因,研究發(fā)現(xiàn)該基因與多種人類惡性腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[15-16],尤其是該基因多態(tài)性與胃癌發(fā)病的關(guān)聯(lián),在研究中已經(jīng)得到證實(shí)[17]。rs13181和rs1799793位點(diǎn)是目前研究較多的位點(diǎn),rs13181位點(diǎn),屬于A/G/T三等位基因突變,其中G/T突變較為常見(jiàn),而A突變報(bào)道較少,MAF(G)=0.2366;rs1799793位點(diǎn),屬于A/G/T三等位基因突變,其中G/A突變較為常見(jiàn),而T突變報(bào)道較少,MAF(A)=0.1945。近年來(lái)有研究開(kāi)始著重于胃癌患者ERCC-2基因多態(tài)性與預(yù)后相關(guān)的研究,但是學(xué)者們的研究結(jié)果存在爭(zhēng)議,例如Ding等[18]認(rèn)為ERCC-2基因rs1799793位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與胃癌患者生存期有關(guān),Mo等[8]卻認(rèn)為他們無(wú)明顯相關(guān)性。

        對(duì)于預(yù)后的相關(guān)研究合并,由于多數(shù)研究采用的是單基因型的對(duì)比,為了盡可能地避免選擇偏倚,本次meta分析選擇對(duì)單基因型的生存資料進(jìn)行合并。結(jié)果顯示,所有的合并結(jié)果異質(zhì)性均低于50%且P值均大于0.05,因此選用固定效應(yīng)模型進(jìn)行比較。對(duì)于rs13181位點(diǎn)而言,其突變型雜合子及純合子相對(duì)于野生型均沒(méi)有顯示出預(yù)后方面的明顯差異;對(duì)于rs1799793位點(diǎn),其突變型純合子相對(duì)于野生型純合子預(yù)后存在顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.001),為考察結(jié)果的穩(wěn)定性,應(yīng)用STATA軟件繪制敏感性分析圖,如圖12結(jié)果顯示:排除Li 2013這篇權(quán)重較大的研究后對(duì)結(jié)果有較大的影響,但差異仍具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,結(jié)論可靠;另一方面其突變雜合子相對(duì)于野生型卻沒(méi)有顯示出明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。筆者認(rèn)為這是一個(gè)有意義的發(fā)現(xiàn),對(duì)于以后有意向研究ERCC-2基因多態(tài)性與胃癌患者預(yù)后相關(guān)性的學(xué)者而言可以是一個(gè)參考;而且,對(duì)于胃癌患者預(yù)后評(píng)估,風(fēng)險(xiǎn)性因子的篩查也可以提供幫助,ERCC-2基因rs1799793位點(diǎn)的突變檢測(cè)或可成為胃癌患者的預(yù)后評(píng)估及風(fēng)險(xiǎn)因子篩查的新途徑。

        一篇發(fā)表于Tumor Biology上的meta分析[19],作者從胃癌患者ERCC-2單核苷酸多態(tài)性與含奧沙利鉑化療療效及預(yù)后的關(guān)聯(lián)性著手進(jìn)行整合,進(jìn)而得出rs13181位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性與預(yù)后無(wú)關(guān)的結(jié)論,但該篇meta分析的納入研究數(shù)量較少,結(jié)論的獲取可能不太可靠。本次研究納入文獻(xiàn)均為英文文獻(xiàn),影響資料的全面性,部分合并結(jié)果顯示出不容忽視的異質(zhì)性等,希望更多的學(xué)者提供更大樣本量、多區(qū)域的研究,用以進(jìn)一步明確其相關(guān)性。

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