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        生物檢測技術(shù)PCR及其在獸醫(yī)微生物檢測中的應(yīng)用

        2018-09-10 05:02:57何旭孫代鵬
        畜牧獸醫(yī)科學(xué) 2018年8期
        關(guān)鍵詞:發(fā)展

        何旭 孫代鵬

        摘要:目前,在生物檢測技術(shù)當(dāng)中所采用的PCR技術(shù),是一種基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的技術(shù)手段,也被稱為無細(xì)胞分子克隆系統(tǒng)技術(shù)。首先對現(xiàn)階段PCR生物檢測技術(shù)的基本原理和特征進(jìn)行簡述,并以此為基礎(chǔ),總結(jié)分析了PCR技術(shù)在獸醫(yī)領(lǐng)域微生物檢測當(dāng)中的應(yīng)用方法,從而探究技術(shù)的發(fā)展方向。

        關(guān)鍵詞:微生物檢測;生物檢測技術(shù);PCR;發(fā)展

        中圖分類號:S852.2

        文獻(xiàn)標(biāo)識碼:B doi: 10.3969/j.issn.2096-3637.2018.08.007

        0 前言

        PCR技術(shù)最早出現(xiàn)于1985年的美國getus公司,這種技術(shù)檢測方法在特定的DNA片段當(dāng)中能夠進(jìn)行微量擴(kuò)散,從而達(dá)到檢測目的。在研究領(lǐng)域,PCR技術(shù)較高的靈敏度和特異性特點(diǎn)。隨著技術(shù)發(fā)展與創(chuàng)新,目前PCR技術(shù)應(yīng)用更加廣泛,除了在基因克隆方面得到長足應(yīng)用外,在獸醫(yī)領(lǐng)域的治療診斷中,也得到了充分的運(yùn)用。因此,探究PCR技術(shù),對實(shí)現(xiàn)微生物的精準(zhǔn)檢測意義十分重大。

        1 PCR技術(shù)的原理與應(yīng)用特征

        1.1 PCR技術(shù)原理

        在已知技術(shù)的作用下,各種DNA片段序列會(huì)得到有效擴(kuò)增,再加上人工合成DNA片段的相互作用,可以在兩條鏈的末端進(jìn)行互補(bǔ),從而將核苷酸引物突顯出來,在該種方式的作用之下,待檢DNA序列在酶的作用下會(huì)出現(xiàn)擴(kuò)增,該項(xiàng)技術(shù)也被人們稱之為PCR技術(shù)。通俗意義上來講,PCR就是體外人工選擇性擴(kuò)增DNA的一種方法,它類似于生物體內(nèi)的DNA的復(fù)制。在整個(gè)反應(yīng)過程之中,DNA模板會(huì)經(jīng)歷變性、退火和延伸3個(gè)過程,并由若干個(gè)循環(huán)序列組成。首先,在高溫作用下,DNA模板會(huì)出現(xiàn)變性解鏈,之后在通過降溫,促使寡核苷酸和模板DNA鏈在三端出現(xiàn)退火現(xiàn)象。另外,在聚合酶的作用下,有4種DNTP底物存在,并在模板互補(bǔ)過程中形成新的鏈條。除此之外,在單一拷貝過程中,基因可以將25~ 30作為基數(shù),最終擴(kuò)展到100萬~200萬之間[1]。在擴(kuò)增后期,由于產(chǎn)物積累,使原來呈指數(shù)擴(kuò)增的反應(yīng)變成平坦的曲線,產(chǎn)物不再隨循環(huán)數(shù)而明顯上升,這稱為平臺效應(yīng)。平臺期會(huì)使原先由于錯(cuò)配而產(chǎn)生的低濃度非特異性產(chǎn)物繼續(xù)大量擴(kuò)增,達(dá)到較高水平。因此,應(yīng)適當(dāng)調(diào)節(jié)循環(huán)次數(shù),在平臺期前結(jié)束反應(yīng),減少非特異性產(chǎn)物。到達(dá)平臺期所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝[2]。

        1.2 PCR技術(shù)特征

        在PCR反應(yīng)結(jié)束之后,便會(huì)產(chǎn)生新的引物,這種還包括各種聚合酶及緩沖液,其基本技術(shù)特征主要集中的以下幾方面:首先是引物,在DNA片段擴(kuò)增過程中,主要涉及到寡核苷酸作用下,PCR擴(kuò)展特性中的關(guān)鍵因素得到了有效突顯,在引物設(shè)計(jì)過程中,還能對PCR擴(kuò)展成效進(jìn)行突顯。一般來說,由于堿基在鏈條之中的不斷重復(fù),引物間的Tm將會(huì)與標(biāo)準(zhǔn)值更加接近,避免GC含量出現(xiàn)過高情況。其次是DNA聚合物特點(diǎn),截止到目前,PCR在擴(kuò)展之中可以對DNA聚合酶進(jìn)行充分應(yīng)用,且應(yīng)用類型為TagDNA,該類型主要在水生棲熱菌作用下產(chǎn)生,具有極強(qiáng)的熱穩(wěn)定性。如果PCR的擴(kuò)展能力較高,便會(huì)對具體的DNA特性產(chǎn)生影響。一般來說,在100 uL反應(yīng)體系的作用下,2單位的PCR技術(shù)將會(huì)得到有效應(yīng)用。另外,由于耐熱聚合酶在RNA反轉(zhuǎn)錄過程中大量增加,操作程序出現(xiàn)較大簡化,從而實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄效率的進(jìn)一步提升。最后,為了將檢測效率進(jìn)行提升,相關(guān)研究人員對緩沖液進(jìn)行了積極應(yīng)用,在此過程中,緩沖液的主要類型為10~50 mol的HCI體系,切記不能將Tag酶和緩沖液較差使用[3]。

        2 PCR技術(shù)在曾醫(yī)微生物檢測中的應(yīng)用

        通過對獸醫(yī)微生物檢測工作的分析可知,傳統(tǒng)方法用于微生物監(jiān)測,步驟十分繁瑣,且局限性較強(qiáng),具體表現(xiàn)為:這種檢測方法要求待測樣品經(jīng)被檢測微生物富集培養(yǎng)一段時(shí)間后,直至微生物數(shù)量達(dá)到既定的相應(yīng)水平,方可分離并進(jìn)行檢測。相比之下,PCR技術(shù)則可有效避免上述弊端,在獸醫(yī)微生物檢測中,這種檢測技術(shù)僅需通過特定的核苷酸引物,快速分析并確定樣本中的微生物種類[4]。

        在實(shí)際檢驗(yàn)過程中,具體檢測流程為:提取細(xì)菌靶DNA,采用過濾處理方法或離心處理方法,從待檢樣品中分離出細(xì)菌細(xì)胞;對細(xì)菌細(xì)胞進(jìn)行裂解處理,經(jīng)過核酸純化處理后,為后續(xù)檢驗(yàn)奠定基礎(chǔ)。除了這種方法,出于便捷性目的,還可以通過直接裂解待檢樣品中細(xì)菌細(xì)胞的方式,抽提其中所在的核酸。以大腸桿菌檢測為例,在傳統(tǒng)檢測模式下,需將待檢牲畜樣品、細(xì)菌置于含乳糖的革蘭陰性菌環(huán)境下,持續(xù)培養(yǎng)一段時(shí)間后,再進(jìn)行分離,最后進(jìn)行檢測。整個(gè)大腸桿菌檢測耗時(shí)3~5d,甚至更長,且檢測方法相對繁瑣,一旦其中一個(gè)環(huán)節(jié)出現(xiàn)問題,可能導(dǎo)致最終檢測結(jié)果受到影響。而在獸醫(yī)大腸桿菌檢測中引入PCR技術(shù)后,整個(gè)檢測流程被簡化為:根據(jù)大腸桿菌類,設(shè)計(jì)適宜的PCR反應(yīng)序列,利用PCR、擴(kuò)增樣本中的uidA基因、lacZ基因,此時(shí),即可檢出樣本中的大腸桿菌以及大腸桿菌類[5]。

        雞養(yǎng)殖是我國養(yǎng)殖行業(yè)的主要構(gòu)成。隨著養(yǎng)殖業(yè)的不斷發(fā)展,雞病問題逐漸受到人們的重視。為了保障養(yǎng)殖行業(yè)的良性發(fā)展,可引入PT-PCR技術(shù),具體檢測流程如下:為雞胚接種病毒,制取適量雞胚尿囊液標(biāo)本,從其中提純RNA,按照規(guī)范流程完成CDNA的制備,建立PCR反應(yīng)序列并進(jìn)行反應(yīng),再次進(jìn)行雞胚接種后,可獲取充足的雙股RNA片段,且該RNA片段特征具有可克隆特征,為病雞死亡率的控制提供良好的技術(shù)支持。

        目前,PCR技術(shù)已經(jīng)在各個(gè)生物領(lǐng)域得到初步的應(yīng)用,從而衍生出比較新穎的技術(shù)形式。通過PCR與其他技術(shù)的聯(lián)用還可以解決生產(chǎn)技術(shù)的難題。但在實(shí)際操作與運(yùn)用過程中還存在一些問題。例如:水產(chǎn)動(dòng)物養(yǎng)殖生產(chǎn)者缺乏實(shí)驗(yàn)設(shè)備或?qū)嶒?yàn)設(shè)備不夠先進(jìn)、DNA萃取過程不當(dāng)、實(shí)驗(yàn)試劑上的問題等,這些情況容易使檢測的結(jié)果不夠理想,失去生物檢測原有的意義[6]??焖?、簡便、靈敏的PCR檢測方法為水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物的疾病診斷帶來希望。隨著PCR技術(shù)的不斷完善以及與其他新技術(shù)的聯(lián)合應(yīng)用,將會(huì)極大地推動(dòng)畜牧及水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的有效發(fā)展[7]。

        3 結(jié)束語

        綜上所述,在目前的生物檢測技術(shù)手段當(dāng)中,PCR技術(shù)以其獨(dú)特的精準(zhǔn)度優(yōu)勢在獸醫(yī)微生物檢測領(lǐng)域得到了充分的運(yùn)用。而技術(shù)手段方面,檢測人員中需要將多試劑進(jìn)行試管液相雜交,就可以完成較高靈敏度的快速診斷,最終提升檢測診斷效率。

        參考文獻(xiàn)

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        [2]陳諾,唐善虎,岑璐伽,等.多重PCR技術(shù)在食品微生物檢測中的應(yīng)用進(jìn)展[J]中國畜牧獸醫(yī),2010,37( 10):72-75

        [3]李芳,康懷彬,馬紅燕.食品中農(nóng)獸藥殘留生物傳感檢測技術(shù)的研究進(jìn)展[J].食品工業(yè)科技,2017,38(4):396-400.

        [4]林佳琪,蘇同成,蘇文金,等.數(shù)字PCR技術(shù)及應(yīng)用研究進(jìn)展[J].生物工程學(xué)報(bào),2017,33(2):170-177.

        [5]沈蘭,王銳萍,史海濤,等.PCR技術(shù)在快速檢測沙門氏菌中的應(yīng)用[J].基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué),2012,31 (1):90-94.

        [6]李竹紅,劉德培,梁植權(quán).改進(jìn)的反向PCR技術(shù)克隆轉(zhuǎn)移基因的旁側(cè)序列[J].生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展,1999 (6):600-602+623

        [7]王皓,康現(xiàn)江,王琦.重組PCR技術(shù)研究進(jìn)展和應(yīng)用[J].中國生物工程雜志,2007(5):153-156.

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