趙杰 岳華 茍學(xué)磊 周金燕 譚紅
(1. 中國科學(xué)院成都生物研究所 中國科學(xué)院環(huán)境與微生物重點實驗室,成都 610041;2. 中國科學(xué)院大學(xué),北京 100039)
伊枯草菌素A(Iturin A)最初是從枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)發(fā)酵液中分離得到的一種環(huán)脂肽類抗生素,其結(jié)構(gòu)由一個β-脂肪酸側(cè)鏈和7個α-氨基酸殘基(L-Asn-D-Tyr-D-Asn-L-Gln-LPro-D-Asn-L-Ser-)構(gòu)成[1,2]。具有強烈的抗真菌活性[3],并且低毒、低致敏性,能抑制西瓜枯萎病菌(Fusarium oxysporum)[4]、南部玉米葉斑病原菌(South corn leaf blight)[5]、禾谷鐮孢菌(Fusarium graminearum)[6]等多種植物病原真菌的生長,還可用于人和動物皮膚真菌病的治療[7]。因而,在農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥方面具有較好的應(yīng)用前景及潛在的研究價值。
近年來,國內(nèi)外對iturin A的發(fā)酵工藝進(jìn)行了大量研究,Hbid等[8]認(rèn)為較高溶氧量有利于iturin A的產(chǎn)生。Shih等[9]利用響應(yīng)面法優(yōu)化枯草芽孢桿菌 S3的發(fā)酵條件,使iturin A的產(chǎn)量達(dá)11.44702 mg/g固體濕重。金虎等[10]利用未經(jīng)處理的菜籽粉作為氮源,并以一種新型兩步葡萄糖補料方法生產(chǎn)iturin A,使iturin A產(chǎn)量達(dá)到1.12 g/L。彭文璟等[11]基于均勻設(shè)計的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,優(yōu)化iturin A的補料分批發(fā)酵條件,將iturin A效價優(yōu)化至13364.5±271.3 U/mL。這些研究雖然使iturin A產(chǎn)量得到一定的提高,但依舊未能實現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn)。另有研究表明,iturin A是經(jīng)非核糖體途徑合成的環(huán)脂肽抗生素,其合成過程需要結(jié)合氨基酸以完成結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化[12]。在iturin A合成代謝途徑中,Asn、Val可作為iturin A的重要合成前體,對iturin A的合成具有促進(jìn)作用[13-14],并且培養(yǎng)基中氨基酸的種類和含量對iturin A同系物的組成比例有影響[15]。氨基酸既可作為iturin A的結(jié)構(gòu)組分,又可作為iturin A合成酶的誘導(dǎo)物,在iturin A生物合成過程中起著關(guān)鍵性作用。因此,分析檢測iturin A發(fā)酵過程中各種游離氨基酸,可以明確培養(yǎng)基中氨基酸的種類、含量以及被利用的時間和速度,對人工有效調(diào)控發(fā)酵過程中氨基酸濃度來提高iturin A產(chǎn)量具有重要意義。
為快速、精確研究iturin A發(fā)酵過程中游離氨基酸含量的變化,建立一種適合此樣品中游離氨基酸的測定方法至關(guān)重要。目前測定氨基酸的方法主要有氨基酸分析儀法[16]、毛細(xì)管電泳法[17]和高效液相色譜法[18]等。氨基酸分析儀因設(shè)備昂貴、用途單一導(dǎo)致其使用受限。任艷麗等[19]報道用毛細(xì)管電泳法測定枯草芽孢桿菌發(fā)酵液中游離氨基酸含量,但此方法穩(wěn)定性及重現(xiàn)性差,無法對His、Arg、Ile和Leu進(jìn)行準(zhǔn)確的定性和定量分析。而高效液相色譜(HPLC)結(jié)合柱前衍生的方法具有靈敏度高、適用性廣、且能同時準(zhǔn)確測定多種氨基酸等特點[20],并且液相色譜儀帶有自動進(jìn)樣系統(tǒng),是一種較為理想的氨基酸檢測方法。柱前衍生HPLC法使用的關(guān)鍵在于衍生試劑和液相色譜條件的選擇。本研究擬通過采用在室溫下能和氨基酸發(fā)生反應(yīng),且衍生產(chǎn)物PTC-AA成分單一穩(wěn)定,衍生副產(chǎn)物對測定無干擾的異硫氰酸苯酯(PITC)[21]為柱前衍生劑,優(yōu)化HPLC檢測條件,以建立一種iturin A發(fā)酵液中游離氨基酸的快速檢測方法,提高各氨基酸的分離度,為研究iturin A發(fā)酵過程中游離氨基酸的代謝規(guī)律及調(diào)控發(fā)酵過程中氨基酸濃度提供技術(shù)支持。
1.1.1 菌種 枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)ZK8,由本實驗室從產(chǎn)自新疆阿克蘇的棉花植株上分離純化、誘變而得。
1.1.2 試劑 混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)溶液:天門冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)、絲氨酸(Ser)、甘氨酸(Gly)、組氨酸(His)、精氨酸(Arg)、蘇氨酸(Thr)、丙氨酸(Ala)、脯氨酸(Pro)、酪氨酸(Tyr)、纈氨酸(Val)、蛋氨酸(Met)、異亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、苯丙氨酸(Phe)、賴氨酸(Lys)。除半胱氨酸(Cys)濃度為1.25 μmol/mL外,其余16種氨基酸濃度均為2.5 μmol/mL,內(nèi)標(biāo)物質(zhì)為正亮氨酸(Nle)、異硫氰酸苯酯(PITC)以及三乙胺(TEA),以上試劑均購自天津博納艾杰爾科技有限公司;色譜級乙腈,美國霍尼韋爾公司;無水乙酸鈉,天津市科密歐化學(xué)試劑有限公司;冰醋酸、甲醇,天津市博迪化工股份有限公司;水為超純水。
1.1.3 儀器 Agilent 1260高效液相色譜儀,美國Agilent公司;5415R高速冷凍離心機(jī),德國Eppendorf公司;BUCHI旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀R-300,瑞士步琦有限公司;電子分析天平,上海梅特勒—托利多儀器有限公司;pH計,賽多利斯科學(xué)儀器有限公司;旋渦混合器購自上海青浦滬西儀器廠。
1.2.1 溶液配制 系列混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)溶液:取氨基酸混合標(biāo)準(zhǔn)溶液,用超純水將其稀釋為0.1、0.5、0.9、1.3、1.7、2.1、2.5 μmol/mL 7個濃度梯度標(biāo)準(zhǔn)溶液;三乙胺乙腈溶液:取三乙胺1.4 mL,加乙腈8.6 mL,混勻;異硫氰酸苯酯乙腈溶液:取異硫氰酸苯酯25 μL,加乙腈2 mL,混勻(密閉,4℃保存);正亮氨酸內(nèi)標(biāo)溶液:精密稱取正亮氨酸10 mg,加0.1 mol/L 鹽酸溶液10 mL溶解,混勻。
1.2.2 衍生方法 氨基酸衍生參照文獻(xiàn)[22]方法,略作修改。準(zhǔn)確量取混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)溶液及樣品溶液200 μL,分別置于1.5 mL 的EP管中,依次加入20 μL正亮氨酸內(nèi)標(biāo)溶液、100 μL三乙胺乙腈溶液及100 μL異硫氰酸苯酯乙腈溶液,搖勻,室溫靜置衍生1 h。衍生結(jié)束后加入400 μL正己烷,震蕩搖勻,靜置10 min,取下層溶液(PITC-AA)200 μL,用600 μL超純水稀釋,混合均勻后用0.45 μm針式過濾器過濾。
1.2.3 氨基酸色譜分析條件優(yōu)化 色譜柱:Venusil AA氨基酸分析專用柱(4.6 mm ×250 mm,5 μm);流動相A:0.1 mol/L無水乙酸鈉-乙腈溶液(66:5);流動相B:80%乙腈水溶液;流速:1 mL/min;檢測波長:254 nm;進(jìn)樣量:10 μL;優(yōu)化其余3個色譜條件。
1.2.3.1 流動相梯度洗脫程序的優(yōu)化 以文獻(xiàn)[23-24]中的梯度洗脫程序為基礎(chǔ),并結(jié)合所測定各氨基酸的極性特性,多次調(diào)節(jié)流動相A、B的比例,使其隨洗脫時間連續(xù)發(fā)生改變以此連續(xù)改變流動相的極性,考察不同梯度洗脫程序?qū)旌习被岱蛛x效果的影響,以確定能在最短時間內(nèi)實現(xiàn)氨基酸最佳分離的梯度洗脫程序。
1.2.3.2 流動相pH值的優(yōu)化 配制0.1 mol/L無水乙酸鈉溶液4份,用冰醋酸調(diào)節(jié)pH值分別為4.0、5.0、6.0、7.0,加入一定體積乙腈,使無水乙酸鈉與乙腈的體積比為66∶5,過0.45 μm 濾膜,得到不同pH值的流動相A。其余色譜條件不變,混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)溶液經(jīng)HPLC在不同pH值的流動相中洗脫測定,考察流動相pH值對各氨基酸分離效果的影響,以確定最佳的流動相pH值。
1.2.3.3 色譜柱溫的優(yōu)化 分別設(shè)置色譜柱溫度為25℃、30℃、35℃、40℃,其余色譜條件不變,混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)溶液經(jīng)HPLC在所設(shè)定的色譜柱溫度下測定分析,考察色譜柱溫對各氨基酸分離效果的影響,以確定最佳的色譜柱溫度。
1.2.4 方法驗證
1.2.4.1 線性關(guān)系 將“1.2.1”所配制的系列混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)溶液按“1.2.2”項方法衍生處理后,在優(yōu)化后的色譜條件下經(jīng)HPLC檢測分析,以氨基酸峰面積與內(nèi)標(biāo)Nle峰面積之比為縱坐標(biāo),以氨基酸濃度(mg/L)為橫坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,進(jìn)行線性回歸分析,并計算相關(guān)系數(shù)(R2)。
1.2.4.2 精密度及穩(wěn)定性 取濃度為2.1 μmol/mL氨基酸混合標(biāo)準(zhǔn)溶液,按“1.2.2”項中的衍生方法衍生處理,在優(yōu)化后的色譜條件下連續(xù)進(jìn)樣6次,計算氨基酸峰面積與內(nèi)標(biāo)峰面積之比以及保留時間的相對標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD),考察方法精密度;另對同一濃度氨基酸混合標(biāo)準(zhǔn)溶液衍生處理,并于衍生處理后0、2、4、6、8、12、18、24 h依次進(jìn)樣測定,計算氨基酸峰面積與內(nèi)標(biāo)峰面積之比以及保留時間的RSD值,考察方法穩(wěn)定性。
1.2.4.3 重復(fù)性 精確量取發(fā)酵0 h的iturin A發(fā)酵液6份,經(jīng)預(yù)處理及衍生后,分別進(jìn)樣測定,計算每種氨基酸濃度和RSD值。
1.2.4.4 加標(biāo)回收率 精確量取已知濃度的iturin A發(fā)酵液6份,分別加入一定濃度混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)品,經(jīng)樣品預(yù)處理及衍生后,進(jìn)行HPLC測定分析,計算回收率。
1.2.5 發(fā)酵液制備
1.2.5.1 發(fā)酵培養(yǎng)基 葡萄糖 42.6 g/L,大豆蛋白胨總氮 2.0 g/L,酵母膏 0.12 g/L,MgSO4·7H2O 3.14 g/L,KH2PO43.62 g/L,pH 8.0,121℃滅菌 30 min。
1.2.5.2 搖瓶分批發(fā)酵 取一支生產(chǎn)良好的枯草芽孢桿菌ZK8斜面,轉(zhuǎn)接于種子培養(yǎng)基中(裝樣量為100 mL/500 mL三角瓶),150 r/min、30℃條件下震蕩培養(yǎng)20 h。然后將種子液按10%轉(zhuǎn)種量轉(zhuǎn)種至發(fā)酵培養(yǎng)基中,150 r/min、30℃條件下震蕩培養(yǎng),并于發(fā)酵開始后不同時間點取樣,取樣時間點為0、3、6、9、12、15、18、24、28、32、36、42、48、54、60 h。樣品于12 000 r/min離心10 min,取上清液,冷凍保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.6 樣品預(yù)處理 取250 μL發(fā)酵上清液,加入1 mL無水甲醇,搖勻,靜置1 h,12 000 r/min離心10 min,吸取1 mL上清液用旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀于50℃水浴蒸干,最后加200 μL超純水溶解備用。
2.1.1 梯度洗脫程序優(yōu)化 HPLC 色譜圖結(jié)果(圖1)顯示,不同梯度洗脫程序?qū)旌习被岱蛛x時間、分離效果有顯著影響。當(dāng)流動相B(80%乙腈)初始比例為0%,在2-15 min增加至10%、15-25 min增加至30%、25-33 min增加至45%、33-33.1 min增加至100% 時,可在35 min內(nèi)將所有氨基酸完全分離(圖1-c),與條件a(圖1-a)相比,氨基酸在色譜柱中的保留時間縮短了20 min,且Pro與雜質(zhì)峰得到有效分離,故最優(yōu)梯度洗脫程序見表1。
圖1 不同梯度洗脫程序下混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)品色譜圖
表1 梯度洗脫程序
2.1.2 流動相pH值優(yōu)化 HPLC在不同pH值的流動相中分離混合氨基酸的結(jié)果(圖2)顯示,當(dāng)流動相pH值為4.0、5.0時,氨基酸色譜峰重疊現(xiàn)象嚴(yán)重,分離效果較差;當(dāng)流動相pH值為6.0、7.0時,所有氨基酸完全分離,并且分離度均大于1,僅Ser、Gly、His、Arg、Thr、Ala和Pro色譜峰有前延現(xiàn)象。在pH值6.0-7.0之間進(jìn)一步實驗后確定流動相pH值為6.4±0.1。
圖2 不同流動相pH值下氨基酸標(biāo)準(zhǔn)品色譜圖
2.1.3 色譜柱溫優(yōu)化 HPLC在不同色譜柱溫度下分離混合氨基酸的結(jié)果(圖3)顯示,升高色譜柱溫有利于目標(biāo)物的分離,當(dāng)色譜柱溫上升至40℃時,各氨基酸色譜峰無明顯前延、重疊現(xiàn)象,峰型較好,且分離度均大于1.5,因此選擇40℃為最終柱溫。
圖3 不同色譜柱溫下氨基酸標(biāo)準(zhǔn)品色譜圖
2.2.1 線性關(guān)系 將系列濃度混合氨基酸標(biāo)準(zhǔn)溶液衍生處理后,在優(yōu)化后的色譜條件下經(jīng)HPLC檢測,計算分析得到各氨基酸線性回歸方程、相關(guān)系數(shù)、線性范圍,結(jié)果見表2。16種氨基酸在一定濃度范圍內(nèi)具有良好的線性關(guān)系,但半胱氨酸衍生物不穩(wěn)定易分解,因而只對其進(jìn)行了定性分析。
2.2.2 精密度及穩(wěn)定性 按照實驗方法測定并計算,結(jié)果見表3,各氨基酸峰面積與內(nèi)標(biāo)峰面積之比以及保留時間的RSD值均在2%以內(nèi),表明該方法波動小、精密度高,且16種氨基酸衍生物在24 h內(nèi)均具有較好穩(wěn)定性。
表2 16種氨基酸的線性關(guān)系
表3 精密度和穩(wěn)定性驗證結(jié)果
2.2.3 重復(fù)性 取0 h的iturin A發(fā)酵液6份,經(jīng)預(yù)處理及衍生后分別進(jìn)樣1次,結(jié)果見表4,各氨基酸濃度的RSD值均小于5%,表明該方法的重復(fù)性良好。
2.2.4 加標(biāo)回收率 16種氨基酸的加標(biāo)回收率在83.84%-108.02%之間,且RSD值均小于2.77%,見表4,表明該測定方法準(zhǔn)確性高,滿足分析要求。
表4 重復(fù)性和加標(biāo)回收率結(jié)果
Iturin A發(fā)酵液樣品在優(yōu)化后的色譜條件下經(jīng)HPLC測定分析,得到樣品中各游離氨基酸的分離圖譜,見圖4。用內(nèi)標(biāo)曲線法計算各時間點樣品中16種氨基酸濃度,得到iturin A發(fā)酵過程中16種游離氨基酸濃度隨發(fā)酵時間的變化規(guī)律,見圖5。
由圖5-A知,游離氨基酸總含量呈一個游離氨基酸被消耗與釋放的動態(tài)變化過程。在發(fā)酵0-15 h期間,發(fā)酵液中游離氨基酸的總含量隨著時間增加而降低,可能原因為此階段菌體生長較快,游離氨基酸被枯草芽孢桿菌大量消耗用于菌體生長,18 h后其總含量呈較明顯的上升趨勢,推測可能與培養(yǎng)基中多肽、蛋白質(zhì)不斷被分解為氨基酸有關(guān)。Iturin A于發(fā)酵3 h開始合成,隨后產(chǎn)量逐漸增加直至發(fā)酵結(jié)束。
16種游離氨基酸初始濃度各不相同,且在發(fā)酵過程中呈現(xiàn)出不同的變化趨勢。其濃度變化趨勢大致可分為三類:第一類為游離Tyr,其濃度在整個發(fā)酵過程中變化不大,見圖5-B。第二類為游離Asp、Glu、Ser、Arg、Ala、Leu、Gly、Thr、Met, 在 發(fā)酵過程中其濃度均呈下降趨勢。其中,Asp、Leu、Glu、Gly這4種氨基酸濃度在發(fā)酵0-24 h期間逐漸下降,Ser、Ala則于0-15 h間處于下降階段,之后其濃度均無明顯變化,Arg、Thr濃度在整個發(fā)酵過程中緩慢下降,Met在發(fā)酵0-28 h期間濃度迅速下降,之后其濃度小幅升高,見圖5-C。第三類是游離 His、Pro、Val、Ile、Phe、Lys,發(fā)酵過程中其濃度呈上升趨勢,其中Val的上升速率最大,見圖5-D。
圖4 氨基酸標(biāo)準(zhǔn)品及樣品色譜圖
圖5 枯草芽孢桿菌發(fā)酵過程中游離氨基酸及iturin A合成代謝曲線
在微生物發(fā)酵產(chǎn)生抗生素過程中,氨基酸與抗生素合成密切相關(guān),且在發(fā)酵過程中添加氨基酸能促進(jìn)抗生素合成[25-27]。Iturin A作為環(huán)脂肽類抗生素,已有研究表明氨基酸對其生物合成存在影響。Besson等[28,13]考察了14種氨基酸分別作為發(fā)酵培養(yǎng)基中唯一氮源對iturin A合成的影響,發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)骨架中的L-Asn是合成iturin A的最佳底物,而在L-Pro和D-Tyr中不能合成iturin A,后期采用同位素標(biāo)記α-氨基酸(Asn、Gln、Ser、Pro和Tyr)進(jìn)一步研究iturin A的生物合成,表明L-Asn可能是iturin A合成的最好前體。Hourdou等[14]研究發(fā)現(xiàn)Val是iturin A側(cè)鏈脂肪酸部分合成的前體。Iwase等[15]通過向以脫脂豆粉為氮源的培養(yǎng)基中添加不同種類氨基酸研究發(fā)現(xiàn)氨基酸種類對iturin A同系物的組成比例有影響。許錟等[29]和彭文璟等[11]研究表明在枯草芽孢桿菌發(fā)酵過程中添加Asp、Glu、Pro能促進(jìn)iturin A的合成,并采用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)方法優(yōu)化這三種氨基酸在分批發(fā)酵中的補料濃度,使iturin A的效價達(dá)13364.5 ± 271.3 U/mL,較對照提高了34.6%。由此可見,氨基酸對iturin A的生物合成具有重要影響。采用高效、便捷的檢測手段監(jiān)測分析發(fā)酵過程中各種游離氨基酸含量的動態(tài)變化有助于深入了解iturin A的合成代謝,并可為調(diào)控iturin A發(fā)酵過程中氨基酸的濃度,提高iturin A的產(chǎn)量奠定基礎(chǔ)。
由于iturin A發(fā)酵液中含有多種游離氨基酸,這些氨基酸不含有芳香環(huán)等生色團(tuán)無法直接用紫外檢測器檢測[30],并且各氨基酸的保留性質(zhì)強弱不一[31],以及氨基和羧基的解離情況受到pH值及溫度的影響[32]。因此,需要選用一種合適的衍生劑衍生氨基酸,在最佳的條件下實現(xiàn)各氨基酸的有效分離。本研究采用高效液相色譜,以異硫氰酸苯酯(PITC)為衍生劑衍生氨基酸,對梯度洗脫程序、流動相pH和色譜柱溫3個色譜條件進(jìn)行優(yōu)化選擇,使得各氨基酸在35 mim內(nèi)被完全分離,縮短了分析時間,提高了分析效率。所使用的PITC衍生劑衍生得到的氨基酸衍生物除半胱氨酸衍生物外,其余均非常穩(wěn)定,而且衍生步驟簡單,對環(huán)境要求低。與毛細(xì)管電泳法[19]相比,PITC柱前衍生高效液相色譜法可顯著改善部分氨基酸的分離度,能有效分離出的氨基酸種類(16種)比毛細(xì)管電泳(14種)法多,且準(zhǔn)確性更高,尤其更能準(zhǔn)確定性和定量分析His、Arg、Ile和Leu。該方法具有良好的線性關(guān)系(R2>0.996),靈敏度高、衍生產(chǎn)物穩(wěn)定、精密度和重現(xiàn)性好,適合用于iturin A發(fā)酵液中多種游離氨基酸成分和含量的測定。
本研究采用PITC將氨基酸在柱前轉(zhuǎn)化為適于高效液相色譜分離及檢測的衍生物,并優(yōu)化了色譜條件,建立了柱前衍生高效液相色譜測定伊枯草菌素A發(fā)酵液中游離氨基酸含量的方法。該方法線性關(guān)系良好,衍生產(chǎn)物穩(wěn)定、分析時間短、精密度高、重復(fù)性好。同時,研究分析了伊枯草菌素A發(fā)酵過程中16種游離氨基酸濃度變化規(guī)律,為發(fā)酵過程中調(diào)控氨基酸濃度提高iturin A產(chǎn)量提供了科學(xué)依據(jù)。