宮俐 韓中波
(吉林市結(jié)核病防治研究所 吉林 吉林 132011)
Xpert Mtb/RIF技術(shù)使用半定量巢氏熒光PCR,該技術(shù)針對(duì)結(jié)核桿菌利福平耐藥基因rpoB基因區(qū)設(shè)定引物、探針,擴(kuò)增熒光檢測(cè),其是否發(fā)生基因突變,檢測(cè)標(biāo)本中是否含有結(jié)核桿菌及是否對(duì)利福平耐藥,整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程需3小時(shí)左右。線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)技術(shù)直接從臨床收集的病人肺部涂片陽(yáng)性痰標(biāo)本中提取核酸DNA、用生物素標(biāo)記的引物進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增和反向雜交。通過(guò)檢測(cè)rpoB基因突變(編碼RNA聚合酶β-亞單位)確定對(duì)利福平的耐藥性;通過(guò)檢測(cè)katG基因(編碼過(guò)氧化氫酶)和inhA基因的啟動(dòng)子區(qū)(編碼NADH烯酰酸性磷酸酶還原酶)確定對(duì)異煙肼的耐藥性。從而,對(duì)來(lái)自培養(yǎng)物或病人肺部涂片陽(yáng)性痰標(biāo)本的結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群及其耐利福平和/或異煙肼耐藥基因進(jìn)行分子生物學(xué)檢測(cè)。
1.1 標(biāo)本來(lái)源
2015年10月至2018年6月期間吉林市結(jié)核病防治研究所及所轄各縣區(qū)結(jié)防所收治的疑似結(jié)核病患者共1345份痰標(biāo)本。
1.2 檢測(cè)方法
對(duì)1345份痰標(biāo)本進(jìn)行熒光染色涂片鏡檢檢測(cè)、結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)、結(jié)核桿菌比例法藥敏,相關(guān)操作及結(jié)果判定。其操作均按《結(jié)核病診斷細(xì)菌學(xué)檢驗(yàn)規(guī)程》進(jìn)行。
臨床確診肺結(jié)核病442例,對(duì)442例患者痰標(biāo)本進(jìn)行Xpert Mtb/RIF檢測(cè)和線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè),其操作均按試劑說(shuō)明書進(jìn)行。
2.1 1345例初診肺結(jié)核可疑患者,經(jīng)X線、CT、實(shí)驗(yàn)室檢查,臨床最終確診肺結(jié)核病442例,確診率為32.9%。
2.2 Xpert Mtb/RIF檢測(cè)及線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)結(jié)核桿菌應(yīng)用價(jià)值的評(píng)價(jià)
對(duì)442例肺結(jié)核患者痰標(biāo)本進(jìn)行涂片鏡檢,改良羅氏培養(yǎng)陽(yáng)性率分別為24.4%(108/442)、42.3%(187/442),對(duì)442例肺結(jié)核病人痰標(biāo)本進(jìn)行Xpert Mtb/RIF檢測(cè)、線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)陽(yáng)性率分別為49.5%(219/442)、44.8%(198/442)。Xpert Mtb/RIF檢測(cè)陽(yáng)性率略高線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè),兩種分子生物學(xué)方法檢測(cè)陽(yáng)性率明顯高于涂片鏡檢,改良羅氏培養(yǎng)法。
2.3 Xpert Mtb/RIF檢測(cè)利福平耐藥
Xpert Mtb/RIF檢測(cè)結(jié)果報(bào)告時(shí)間只需2~3小時(shí),遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于培養(yǎng)(2個(gè)月)、培養(yǎng)藥敏(3個(gè)月)的報(bào)告時(shí)間。Xpert Mtb/RIF檢測(cè)利福平耐藥與傳統(tǒng)方法比較,敏感度為90.2%、特異性為97.0%。見表1。
表1 Xpert Mtb/RIF檢測(cè)利福平耐藥與傳統(tǒng)方法比較
2.4 線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)利福平、異煙肼耐藥
檢測(cè)結(jié)果報(bào)告時(shí)間需2~3天,遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于培養(yǎng)(2個(gè)月)、培養(yǎng)藥敏(3個(gè)月)的報(bào)告時(shí)間。線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)利福平耐藥與傳統(tǒng)方法比較,敏感度為88.0%、特異性為95.4%。檢測(cè)異煙肼耐藥與傳統(tǒng)方法比較,敏感度為73.7%、特異性為90.3%。見表2。
表2 線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)利福平耐藥與傳統(tǒng)方法比較
近年來(lái),Xpert Mtb/RIF檢測(cè)系統(tǒng)逐漸在基層推廣使用、線性探針雜交技術(shù)(Hain)在具有條件地市級(jí)實(shí)驗(yàn)室推廣,本文對(duì)Xpert Mtb/RIF檢測(cè)技術(shù)、線性探針雜交技術(shù)(Hain)在檢測(cè)臨床標(biāo)本診斷結(jié)核病及利福平、異煙肼耐藥檢測(cè)中的應(yīng)用價(jià)值進(jìn)行評(píng)價(jià)。
Xpert Mtb/RIF核酸檢測(cè)采用美國(guó)公司GeneXpert檢測(cè)系統(tǒng),是一種半巢式實(shí)時(shí)定量熒光PCR體外擴(kuò)增技術(shù),針對(duì)利福平耐藥rpoB基因81bp核心區(qū)間(RRDR)設(shè)計(jì)相關(guān)引物、核酸探針,檢測(cè)相關(guān)基因是否發(fā)生突變,進(jìn)而診斷是否結(jié)核桿菌感染以及是否對(duì)利福平耐藥。本研究Xpert Mtb/RIF檢測(cè)陽(yáng)性率為49.5%,高于涂片鏡檢、結(jié)核桿菌培養(yǎng)法的陽(yáng)性檢出率,且時(shí)間遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于培養(yǎng)(6~8周)。Xpert Mtb/RIF檢測(cè)利福平耐藥與傳統(tǒng)方法比較,敏感度為90.2%、特異性為97.0%。表明Xpert Mtb/RIF技術(shù)檢測(cè)結(jié)核桿菌具較高有的臨床應(yīng)用價(jià)值,可以對(duì)肺結(jié)核的診斷及合理規(guī)范治療起到重要作用。線性探針雜交技術(shù)(Hain),從培養(yǎng)物或直接從臨床收集的病人痰標(biāo)本中提取核酸DNA、用生物素標(biāo)記的引物進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增和反向雜交。雜交包括下列步驟:擴(kuò)增產(chǎn)物的變性,單鏈雜交、生物素標(biāo)記的擴(kuò)增產(chǎn)物與膜上的探針雜結(jié)合、嚴(yán)格漂洗、與鏈霉親和素/堿性磷酸酶(AP)標(biāo)記物孵育、堿性磷酸酶介導(dǎo)的顯色反應(yīng),判讀模板,便于對(duì)所獲帶型簡(jiǎn)易、快速做出解釋。實(shí)驗(yàn)只需3天時(shí)間,即可檢測(cè)出結(jié)核桿菌及利福平和異煙肼是否耐藥。線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)結(jié)核分支桿菌陽(yáng)性率為44.8%,線性探針雜交技術(shù)(Hain)檢測(cè)利福平耐藥與傳統(tǒng)方法比較,敏感度為88.0%、特異性為95.4%。檢測(cè)異煙肼耐藥與傳統(tǒng)方法比較,敏感度為73.7%、特異性為90.3%。
Xpert Mtb/RIF檢測(cè)技術(shù)、線性探針雜交技術(shù)(Hain)均是世衛(wèi)組織認(rèn)可的結(jié)核病快速檢測(cè)新方法,Xpert Mtb/RIF檢測(cè)技術(shù)具有簡(jiǎn)單、快捷,只需3小時(shí)左右即可得到報(bào)告;生物安全要求低,具備生物安全柜就可操作,具有較高的陽(yáng)性檢出率,Xpert Mtb/RIF檢測(cè)利福平耐藥與傳統(tǒng)比例法藥敏進(jìn)行比較,敏感性和特異性均較高,在基層結(jié)核病防治機(jī)構(gòu)具有較高的應(yīng)用價(jià)值。研究表明,線性探針雜交技術(shù)(Hain)可快速、準(zhǔn)確鑒定結(jié)核分枝桿菌并對(duì)利福平、異煙肼耐藥基因進(jìn)行檢測(cè),適用于檢測(cè)結(jié)核菌株和痰標(biāo)本,可大幅縮短藥物敏感試驗(yàn)時(shí)間,有利于指導(dǎo)臨床用藥治療。但該技術(shù)對(duì)實(shí)驗(yàn)室有嚴(yán)格要求,需要在通過(guò)認(rèn)證的PCR實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行試驗(yàn),更適合在市級(jí)結(jié)核病PCR實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行推廣。