劉 韜,吳麗軍,甘曉龍,張 波,劉寶龍,陳文杰,張連全,劉登才,張懷剛,4
(1.中國(guó)科學(xué)院 西北高原生物研究所,西寧 810008; 2.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 小麥研究所,成都 611130;3.中國(guó)科學(xué)院大學(xué),北京 100049;4.青海省作物分子育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,西寧 810008)
小麥葉銹病(Wheat leaf rust)作為小麥的三大銹病之一,是由小麥葉銹菌(Pucciniatirticina)引起的真菌病害,影響小麥的產(chǎn)量和品質(zhì),對(duì)小麥生產(chǎn)具有極大威脅,嚴(yán)重爆發(fā)時(shí)減產(chǎn)50%[1-4]。研究培育小麥葉銹病抗病品種是小麥生產(chǎn)上最為經(jīng)濟(jì)和安全有效的方法。全面了解目前生產(chǎn)小麥品種的抗葉銹性及其所含有的抗葉銹基因、發(fā)掘新的葉銹病抗源已經(jīng)成為有效控制小麥葉銹病害的一個(gè)重要環(huán)節(jié)。
至今,國(guó)際上已發(fā)現(xiàn)抗小麥葉銹病基因超過(guò)100個(gè),其中正式命名的有72個(gè)[5]。大部分已分子作圖并獲得緊密連鎖或共分離的分子標(biāo)記。Temam等[6]利用RILs定位14個(gè)小麥抗葉銹基因 Lr1、Lr9、Lr10、Lr19、Lr20、Lr24、Lr27、Lr31、Lr32、Lr34、Lr35、Lr40、Lr46、Lr47,其中, Lr34、Lr35和 Lr46為成株抗性位點(diǎn)。Baszczyk等[7]對(duì) Lr9、Lr19、Lr20、Lr21、Lr24、Lr25、Lr26、Lr28、Lr29和 Lr37的分子標(biāo)記在小麥抗葉銹病育種中進(jìn)行有效驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)除 Lr21和 Lr25的分子標(biāo)記以外都具有高度特異性;Vida等[8]對(duì) Lr9、Lr24、Lr25、Lr29、Lr35和 Lr37的分子標(biāo)記進(jìn)行鑒定,認(rèn)為這些分子標(biāo)記可以有效地檢測(cè)到未知背景的小麥品種所含有的抗葉銹病基因。 Lr9來(lái)源于小傘山羊草,對(duì)中國(guó)葉銹病優(yōu)勢(shì)小種表現(xiàn)極高的抗性,在生產(chǎn)上有很大利用價(jià)值[9]。
近年來(lái),隨著全球氣候變化,青海也變得濕潤(rùn)多雨,成為小麥銹病的繁育地。而葉銹菌孢子對(duì)環(huán)境的適應(yīng)能力強(qiáng)于條銹菌和稈銹菌孢子,既耐低溫也耐高溫。因此,葉銹病入侵青海并爆發(fā)將成為可能。2017年6月,中科院西北高原生物研究所張懷剛課題組在青海西寧周邊考察時(shí)發(fā)現(xiàn),西寧大通縣長(zhǎng)寧鎮(zhèn)(N36°49′,E101°45′)種植的部分小麥感染葉銹病(圖1),不過(guò)未大規(guī)模爆發(fā)。所以了解青海當(dāng)?shù)貙彾ㄐ←溒贩N抗葉銹基因的分布狀況,通過(guò)基因聚合培育抗葉銹病品種非常迫切。
圖1 發(fā)現(xiàn)于青海西寧的葉銹病感病株葉片F(xiàn)ig.1 Wheat leaf rust detected in Xining,Qinghai province
本研究利用與6個(gè)抗葉銹基因緊密連鎖的分子標(biāo)記,對(duì)青海省審定的66個(gè)小麥品種進(jìn)行抗葉銹基因檢測(cè),調(diào)查青海省當(dāng)?shù)仄胀ㄐ←溒贩N葉銹病抗性基因的分布情況,以期為小麥葉銹病抗病育種提供材料和理論基礎(chǔ)。
青海省審定的小麥品種66份(表1)。
1.2.1 DNA提取 采集小麥新鮮葉片,在液氮中冷凍研磨后,用CTAB法[10]提取基因組DNA,用微量紫外檢測(cè)儀NANODROP2000C(Thermo)測(cè)量DNA質(zhì)量濃度。將DNA均稀釋到200 mg/L,用10 g/L的瓊脂糖膠在110 V電壓下電泳30 min,檢測(cè)DNA的質(zhì)量。
1.2.2 特異性引物的選擇 小麥抗葉銹病基因 Lr1[11]、 Lr9[12]、 Lr24[13]、 Lr29[14]、 Lr34[15]、 Lr42[16]是目前發(fā)現(xiàn)的能夠有效抵抗小麥葉銹病的抗性基因。上述基因已經(jīng)被分別定位到小麥染色體上: Lr1 定位到5DL[17], Lr9 定位到6BL[17], Lr24 定位到3DL[17], Lr29 定位到7DS[17], Lr34 定位到7DS[17], Lr42 定位到1D[16]。根據(jù)查閱相關(guān)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)、GrainGenes2.0(https://wheat.pw.usda.gov)、參考文獻(xiàn)得到與抗性基因相應(yīng)的引物序列22對(duì),通過(guò)試驗(yàn)對(duì)比,選取穩(wěn)定性比較高的6對(duì)引物(表2)進(jìn)行相應(yīng)的抗性基因擴(kuò)增,各引物目的片段大小見(jiàn)表2。引物均由北京奧科鼎盛生物科技有限公司合成。
1.2.3 PCR擴(kuò)增以及電泳檢測(cè) 用6對(duì)引物對(duì)66份小麥品種的基因組進(jìn)行PCR擴(kuò)增分析。PCR擴(kuò)增體系(20 μL)為:10×Taqbuffer(200 mmol/L Tris-HCl,200 mmol/L KCl,15 mmol/L MgCl2) 2 μL,2.5 mmol/L dNTPs 1.6 μL,2.5 U/μLTaqDNA polymerase 0.4 μL,各引物正反序列均為5 pmol,DNA 200 ng。PCR程序?yàn)椋?5 ℃變性4 min,然后35個(gè)循環(huán)95 ℃變性30 s,55 ℃~68 ℃復(fù)性(各引物根據(jù)試驗(yàn)前期摸索的最適退火溫度確定)30 s,72 ℃延伸30 s~1 min(根據(jù)目的片段大小確定),最后72 ℃延伸10 min。不同的PCR產(chǎn)物根據(jù)各基因目的條帶大小,制作各自的瓊脂糖分離膠或PAGE膠;然后瓊脂糖膠在TAE緩沖液中,110 V電壓下,電泳30 min;取出后在凝膠成像儀中拍照保存。而PAGE膠在TBE緩沖液中,160 V電壓下,電泳2 h,將膠在置于含EB的TBE溶液(10 μL∶100 mL)中浸泡10 min,取出后在凝膠成像儀中拍照保存。
表1 66份青海省審定小麥品種Table 1 66 wheat cultivars released in Qinghai province
表2 微衛(wèi)星引物Table 2 SSR markers
由于參考文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫(kù)中給出的引物有多對(duì),最終篩選到最適合的6對(duì)引物和其最適退火溫度(表2): Lr1的引物WR003,63 ℃; Lr9的引物J13,68 ℃; Lr24的引物S1302-609,55 ℃; Lr29的引物OPY10,60 ℃; Lr34的引物CSLV34,55 ℃; Lr42的引物Wmc432,55 ℃。
分別用確定的6對(duì)引物及最適退火溫度對(duì)66份青海審定小麥品種分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增檢測(cè),部分電泳圖如圖2,結(jié)果發(fā)現(xiàn)(表3),在66份小麥品種中,有16份含有 Lr1,占24.24%;有18份含有 Lr24,占27.27%;有31份含有 Lr29,占46.97%;有5份含有 Lr34,占7.58%;有23份含有 Lr42,占34.85%。
在66份青海青海審定小麥品種中均未檢測(cè)出 Lr9抗性基因(表3)。結(jié)果還發(fā)現(xiàn),在檢測(cè)的小麥品種中同時(shí)含有2個(gè)抗性基因的品種有17份(表3),占25.76%;同時(shí)含有3個(gè)或3個(gè)以上的品種有9份,占13.64%(表3)。綜上可以看出,同時(shí)含有多個(gè)抗葉銹病基因的品種很少,每個(gè)品種的抗葉銹病基因過(guò)于單一。
M1.1 kb plus DNA ladder;M2.50 bp DNA ladder;1-18.部分檢測(cè)樣品 Some detected samples
表3 66份青海審定小麥品種抗葉銹基因檢測(cè)結(jié)果統(tǒng)計(jì)Table 3 Molecular detection results of leaf rust resistance genes in 66 wheat cultivars released in Qinghai province
(續(xù)表3 Continued table 3)
在中國(guó),葉銹病發(fā)病地主要為長(zhǎng)江流域,多為西南和華東地區(qū)。但近年來(lái),隨著全球氣候變暖,青海也變得濕潤(rùn)多雨,逐年成為小麥銹病的繁育地。葉銹病對(duì)環(huán)境的適應(yīng)能力強(qiáng)于條銹病和稈銹病,既耐低溫也耐高溫。因此,葉銹病入侵青海并突然爆發(fā)將成為可能。2017年7月對(duì)西寧周邊區(qū)縣進(jìn)行調(diào)查時(shí)發(fā)現(xiàn),在西寧大通縣長(zhǎng)寧鎮(zhèn)發(fā)現(xiàn)小麥葉銹病感病株(圖1)。雖后期未見(jiàn)該病在西寧周邊爆發(fā),但這一現(xiàn)象足以說(shuō)明青海部分地區(qū)已逐漸滿足小麥葉銹病的發(fā)病條件。本研究以66份青海省審定的小麥品種為試驗(yàn)材料,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有10份材料不含有以上6種任何一種抗性基因,32份供試材料只含有其中1種抗性基因,研究結(jié)果表明:對(duì)青海省春小麥主栽品種‘阿勃’和‘高原448’[18]而言,‘高原448’不含以上6個(gè)抗葉銹病基因的任何一個(gè),而‘阿勃’也只含有1個(gè)(表5)。這是一個(gè)危險(xiǎn)信號(hào),一旦小麥葉銹病孢子的某小種適應(yīng)青海氣候環(huán)境,極有可能引起葉銹病在青海爆發(fā),導(dǎo)致小麥減產(chǎn)和品質(zhì)下降。本研究也有不足之處,結(jié)論有可能不準(zhǔn)確,因?yàn)槟壳翱谷~銹病的基因還未完全發(fā)現(xiàn),這些小麥品種中可能存在未曾檢測(cè)到的其他抗葉銹病基因。
本研究的另一結(jié)果表明,供試材料中含有的抗性基因極其單一,42份不含有或只含有1個(gè)抗性基因,占供試材料的63.64%。因此,引進(jìn)、發(fā)掘和合理利用優(yōu)良種質(zhì)資源,使一個(gè)品種同時(shí)聚合多個(gè)抗性基因,提高小麥抗性基因的多樣化,是防治小麥葉銹病的有效措施。
本研究明確了青海審定66份小麥品種的抗葉銹性及其抗葉銹基因的單一性等問(wèn)題,為小麥種質(zhì)的抗葉銹性評(píng)價(jià)提供基礎(chǔ)信息;同時(shí),也為青海省的小麥抗病育種提供依據(jù)和材料。