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        1 株攜帶mcr-1的食品動(dòng)物源多藥耐藥奇異變形桿菌耐藥性狀分析

        2018-07-24 08:45:04張德福趙禹宗劉雪飛楊立娜白鳳翎周冬生李鈺金勵(lì)建榮
        食品科學(xué) 2018年14期
        關(guān)鍵詞:菌素質(zhì)粒耐藥

        張德福,安 慧,張 健,趙禹宗,張 蕊,劉雪飛,楊立娜,白鳳翎,李 春,周冬生,李鈺金,殷 喆,勵(lì)建榮,*

        (1.渤海大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,生鮮農(nóng)產(chǎn)品貯藏加工及安全控制技術(shù)國(guó)家地方聯(lián)合工程研究中心,遼寧省食品安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,遼寧省高等學(xué)校生鮮食品產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究院,遼寧 錦州 121013;2.軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100071;3.渤海大學(xué)數(shù)理學(xué)院,遼寧 錦州 121013;4.榮成泰祥食品股份有限公司,山東 榮成 264309)

        耐藥細(xì)菌的出現(xiàn)是21世紀(jì)人類健康面臨的最嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)之一,而食物鏈在人接觸耐藥細(xì)菌的途徑中居重要地位[1-3],如人類大多數(shù)耐藥沙門菌感染就是因?yàn)槭秤昧宋廴镜膭?dòng)物性食品而引起的[3-7]。在美國(guó),每年可能有一百萬(wàn)起食源性沙門菌喹諾酮耐藥性病例,其中有上千起死亡病例,幾乎都源于動(dòng)物性食品[8]。人和動(dòng)物的腸道是耐藥菌的儲(chǔ)存庫(kù),而且由于畜禽集約化養(yǎng)殖的迅猛發(fā)展,畜禽糞便經(jīng)常沒(méi)有任何凈化處理任意排放,污染了土壤和水源[3,7,9-10];糞便經(jīng)雨水沖刷、地表徑流等最終進(jìn)入湖泊和海洋[11-12],造成蔬菜[13-14]、水產(chǎn)品[13,15-18]、畜禽等動(dòng)物性食品[6,9,19]及地下水[7,10-11]等出現(xiàn)耐藥菌。耐藥菌最終通過(guò)被污染的作物、耐藥菌感染的畜禽肉和蔬菜、暴露在耐藥菌污染的水中的水產(chǎn)品等途徑進(jìn)入人體,從而引起人類的感染及耐藥菌株的傳播[3]。

        奇異變形桿菌(Proteus mirabilis)是腸桿菌科、變形桿菌屬的一種革蘭氏陰性條件致病菌,廣泛存在于水、土壤、腐敗的有機(jī)物以及人和動(dòng)物的腸道中,與臨床關(guān)系較密切,能夠引起慢性中耳炎、創(chuàng)傷感染等繼發(fā)感染,也可引起膀胱炎、嬰兒腹瀉、食物中毒等,是僅次于大腸埃希菌的可引起泌尿系統(tǒng)感染的主要病原菌[20]。奇異變形桿菌主要污染動(dòng)物性食品,特別是肉類,受污染的食品在一定條件下會(huì)引起人的感染。我國(guó)公布的細(xì)菌性食物中毒病原中,奇異變形桿菌僅次于副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、沙門菌(Salmonella)和金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),是引起食物中毒的第四大主要病原菌[21]。

        多黏菌素是從多黏桿菌培養(yǎng)液中提取的一種多肽類抗菌藥物,主要為多黏菌素B和多黏菌素E(黏菌素)兩種。由于多黏菌素具有腎毒性和神經(jīng)毒性及廣譜抗菌藥物的研發(fā)與使用,在臨床上已較少使用;但是由于20世紀(jì)90年代末多藥耐藥革蘭氏陰性菌的出現(xiàn),尤其是耐碳青霉烯類腸桿菌的出現(xiàn),多黏菌素又被重新應(yīng)用于這類細(xì)菌的治療,并被視為對(duì)抗多藥耐藥革蘭氏陰性細(xì)菌感染的最后一道防線[22]。因此,多黏菌素耐藥問(wèn)題受到了國(guó)際上的廣泛關(guān)注。2015年11月,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)劉健華教授和中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)沈建忠院士的團(tuán)隊(duì)首次從豬體內(nèi)分離得到一株對(duì)黏菌素耐藥的大腸桿菌SHP45,進(jìn)而報(bào)道了腸桿菌科細(xì)菌質(zhì)粒介導(dǎo)的多黏菌素耐藥基因mcr-1對(duì)多黏菌素的耐藥機(jī)理,該基因是國(guó)際上首次發(fā)現(xiàn)的質(zhì)粒介導(dǎo)的黏菌素耐藥基因[23]。mcr-1耐藥基因多出現(xiàn)在大腸埃希菌中,此外,肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)、產(chǎn)氣腸桿菌(Enterobacter aerogenes)、陰溝腸桿菌(E. cloacae)、沙門菌(Salmonella)、克呂沃菌(Kluyvera ascorbata)、阪崎克羅諾桿菌(Cronobacter sakazakii)等腸桿菌科細(xì)菌也有關(guān)于mcr-1耐藥基因的報(bào)道[22],但尚鮮有研究表明奇異變形桿菌攜帶mcr-1耐藥基因的研究報(bào)道。本課題組在對(duì)遼寧錦州附近的養(yǎng)雞場(chǎng)、養(yǎng)豬場(chǎng)、屠宰場(chǎng)等地的食品動(dòng)物源性多藥耐藥菌的調(diào)查中,在某養(yǎng)雞場(chǎng)分離得到一株攜帶mcr-1等耐藥基因的廣泛耐藥分離株F160211,經(jīng)鑒定為奇異變形桿菌,并對(duì)該菌的耐藥譜、耐藥基因、攜帶耐藥基因的質(zhì)粒復(fù)制類型等進(jìn)行了進(jìn)一步的研究。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        麥康凱(MacConkey,MAC)瓊脂培養(yǎng)基、伊紅美藍(lán)(eosin methylene blue,EMB)瓊脂培養(yǎng)基、牛腦心浸液(bovine brain heart infusion,BHI)培養(yǎng)基、Mueller-Hinton肉湯(MH)瓊脂培養(yǎng)基 美國(guó)BD公司;革蘭氏陰性需氧菌藥敏檢測(cè)板 上海星佰生物技術(shù)有限公司;Taq-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)Master Mix、細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒 生工生物工程(上海)股份有限公司;瓊脂糖 美國(guó)Sigma公司;Goldview核酸染料 北京博邁德公司;2000 DNA Marker 北京鴻躍公司;甘油 美國(guó)MP Biomedicals公司;所有引物全部由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

        藥敏紙片:頭孢唑啉(30 μg/片)、頭孢他啶(10 μg/片)、亞胺培南(10 μg/片)、環(huán)丙沙星(5 μg/片)、阿米卡星(30 μg/片)、阿奇霉素(15 μ g/片)、四環(huán)素(1 0 μ g/片)、磷霉素(200 μg/片)、氯霉素(30 μg/片)、復(fù)方新諾明(25 μg/片)、替加環(huán)素(15 μg/片)和多黏菌素E(10 μg/片) 英國(guó)Oxoid公司。

        1.2 儀器與設(shè)備

        DYY-8C型電泳儀 北京市六一儀器廠;LRH系列生化培養(yǎng)箱 上海一恒科學(xué)儀器有限公司;Mastercycler pro梯度PCR儀、5424R冷凍離心機(jī) 德國(guó)Eppendorf公司;Cheimd Doc XRS型凝膠成像儀 美國(guó)Bio-Rad公司;NanoDrop 2000微量分光光度計(jì)、II級(jí)生物安全柜、紙片分配器 美國(guó)Thermo公司;比濁儀 法國(guó)梅里埃公司;HWS恒溫恒濕培養(yǎng)箱 寧波市科技園區(qū)新江南儀器有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1 細(xì)菌的分離與純化

        自養(yǎng)雞場(chǎng)采集病雞、自屠宰場(chǎng)采集血液樣品、自養(yǎng)豬場(chǎng)用棉簽蘸取糞便(或者肛門拭子)和鼻拭樣品,樣品放入采樣管或采樣袋中,編號(hào)后放入冰盒內(nèi)帶回實(shí)驗(yàn)室。將病雞解剖后取發(fā)病部位組織約50 g,勻漿后取20 μL涂布MAC瓊脂平板,豬糞便直接涂板,抗凝血取100 μL涂板。平板37 ℃培養(yǎng)過(guò)夜后挑取單克隆劃線接種至EMB瓊脂平板上37 ℃培養(yǎng)24 h,再挑單克隆菌落涂布BHI瓊脂平板上37 ℃培養(yǎng)12 h左右,刮下菌苔,置于含30%甘油的BHI肉湯中-80℃保存?zhèn)溆?。上述培養(yǎng)基均添加200 μg/mL氨芐西林。

        1.3.2 細(xì)菌DNA模板的制備

        根據(jù)細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書提取細(xì)菌基因組DNA,稀釋至質(zhì)量濃度為10 ng/μL備用。

        1.3.3 16S rRNA基因擴(kuò)增

        以保存的細(xì)菌基因組DNA為模板,以參考文獻(xiàn)[24]中的27F/1492R引物和反應(yīng)條件擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA基因。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳觀察條帶大小無(wú)誤后送到生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。

        1.3.4 紙片擴(kuò)散法鑒定耐藥譜

        參照美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)推薦方法[25]及SN/T 1944—2016 《動(dòng)物及其制品中細(xì)菌耐藥性的測(cè)定 紙片擴(kuò)散法》鑒定細(xì)菌的耐藥譜。

        1.3.5 最小抑菌濃度(minimum inhibitory concentration,MIC)的測(cè)定

        采用肉湯稀釋法,根據(jù)試劑盒說(shuō)明書,挑取單克隆菌落用0.45%滅菌的生理鹽水2~3 mL配制成0.5麥?zhǔn)蠞岫鹊木鷳乙汉笕?0 μL加入12 mL BHI培養(yǎng)基搖勻,加入至革蘭氏陰性需氧菌藥敏檢測(cè)板中,放置37 ℃恒溫培養(yǎng)16~20 h觀察結(jié)果。

        1.3.6 耐藥基因篩查

        以實(shí)驗(yàn)室建立的方法,用PCR篩查超廣譜β-內(nèi)酰胺酶、碳青霉烯酶和喹諾酮類、大環(huán)內(nèi)酯類、多黏菌素類等常見(jiàn)抗菌藥物的耐藥基因。超廣譜β-內(nèi)酰胺酶、碳青霉烯酶擴(kuò)增引物等見(jiàn)參考文獻(xiàn)[26],其他引物序列與退火溫度等見(jiàn)表1。

        表1 耐藥基因篩查用引物Table1 Primers used for drug-resistant gene screening

        續(xù)表1

        1.3.7 質(zhì)粒復(fù)制類型分析

        根據(jù)p H N S H P4 5序列(G e n B a n k登錄號(hào):KP347127)的復(fù)制起始蛋白基因repA和質(zhì)粒分離蛋白parA基因設(shè)計(jì)引物進(jìn)行擴(kuò)增,檢測(cè)攜帶mcr-1的質(zhì)粒復(fù)制類型。PCR程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性40 s,58 ℃退火40 s,72 ℃延伸1 min,30 個(gè)循環(huán);最終72 ℃延伸5 min。引物序列見(jiàn)表2。

        表2 質(zhì)粒復(fù)制類型PCR檢測(cè)用引物Table2 Primers used for detection of plasmid replicon type

        2 結(jié)果與分析

        2.1 細(xì)菌的分離與純化

        課題組在遼寧省內(nèi)多家養(yǎng)雞場(chǎng)、養(yǎng)豬場(chǎng)、屠宰場(chǎng)等共采集樣品500余份,分離到多藥耐藥菌361 株,其中一株編號(hào)為F160211的菌株初步鑒定為對(duì)多黏菌素等藥物耐藥,因此進(jìn)行了進(jìn)一步的研究。

        2.2 16S rRNA菌種擴(kuò)增結(jié)果

        以細(xì)菌F160211的基因組DNA為模板,以27F/1492R引物擴(kuò)增16S rRNA基因后的測(cè)序結(jié)果進(jìn)行BLAST分析表明,分離株F160211為奇異變形桿菌。

        2.3 紙片擴(kuò)散法鑒定耐藥譜

        紙片擴(kuò)散法對(duì)奇異變形桿菌F160211的耐藥譜鑒定表明(表3),該菌對(duì)頭孢唑啉、頭孢他啶、環(huán)丙沙星、阿米卡星、阿奇霉素、四環(huán)素、磷霉素、氯霉素、復(fù)方新諾明和多黏菌素耐藥,對(duì)亞胺培南和替加環(huán)素敏感。

        表3 紙片擴(kuò)散法鑒定奇異變形桿菌F160211耐藥譜Table3 Drug-resistance pro fi le of P. mirabilis F160211 using disk-based test

        2.4 肉湯稀釋法測(cè)MIC結(jié)果

        表4 奇異變形桿菌F160211的MICTable4 MIC of P. mirabilis F160211

        利用肉湯稀釋法對(duì)奇異變形桿菌F160211的耐藥情況進(jìn)一步詳細(xì)分析(表4),結(jié)果表明,該菌對(duì)青霉素類、第1代和第2代頭孢菌素類、大環(huán)內(nèi)酯類、氨基糖苷類、酰胺醇類、四環(huán)素類、磺胺類、利福霉素類和黏菌素類等耐藥,對(duì)呋喃類、多肽類、喹諾酮類中介耐藥,對(duì)第3代和第4代頭孢菌素類、單環(huán)β-內(nèi)酰胺類、碳青霉烯類、甘氨酰環(huán)素類敏感。

        2.5 耐藥基因篩查結(jié)果

        以文獻(xiàn)報(bào)道的、實(shí)驗(yàn)室已合成的多種耐藥基因引物對(duì)奇異變形桿菌F160211的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果表明,F(xiàn)160211攜帶blaCTX-M-1、blaCTX-M-9、blaTEM、blaOXA-1、mph(A)、qnrS和mcr-1等多種耐藥基因(圖1)。

        圖1 奇異變形桿菌F160211耐藥基因PCR篩查Fig.1 PCR screening of drug-resistance genes from P. mirabilis F160211

        2.6 質(zhì)粒復(fù)制類型分析

        通過(guò)對(duì)奇異變形桿菌F160211攜帶mcr-1基因的質(zhì)粒repA和parA基因進(jìn)行PCR驗(yàn)證結(jié)果表明,養(yǎng)殖場(chǎng)分離得到的分離株奇異變形桿菌F160211的mcr-1基因存在于pHNSHP45類似的IncI2型質(zhì)粒上(圖2)。

        圖2 質(zhì)粒復(fù)制類型PCR檢測(cè)結(jié)果Fig.2 PCR detection of plasmid replicon type

        3 討 論

        MIC和耐藥基因PCR擴(kuò)增結(jié)果表明,分離自病雞肉中的奇異變形桿菌F160211為多藥耐藥株,攜帶有多種耐藥基因,耐藥性非常嚴(yán)重,除了對(duì)第3代和第4代頭孢菌素類、單環(huán)β-內(nèi)酰胺類、碳青霉烯類、甘氨酰環(huán)素類敏感外,對(duì)其他藥物均為耐藥或中介耐藥;且其耐藥基因位于質(zhì)粒上,具有水平轉(zhuǎn)移給其他細(xì)菌并播散開來(lái)的風(fēng)險(xiǎn),給消費(fèi)者的食品安全和身體健康帶來(lái)隱患。

        多黏菌素對(duì)大多數(shù)革蘭氏陰性菌具有較好的殺菌作用,一直被養(yǎng)殖業(yè)者廣泛應(yīng)用于促進(jìn)動(dòng)物生長(zhǎng)和疾病的預(yù)治等;在臨床上用作對(duì)碳青霉烯類耐藥的肺炎克雷伯菌、鮑曼不動(dòng)桿菌和銅綠假單胞菌等革蘭氏陰性多藥耐藥菌治療的最后一道防線;雖然也有耐藥菌出現(xiàn),但一般都是染色體介導(dǎo)的,其耐藥基因的傳播也是通過(guò)病人之間的克隆株的傳播,耐藥率較低,危害較小[35]。但Liu Yiyun等[23]在雞、豬、零售的肉類和病人體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了質(zhì)粒攜帶的、可在細(xì)菌間接合轉(zhuǎn)移的多黏菌素耐藥基因mcr-1,且該質(zhì)粒在雞肉中存在的比例高達(dá)28%,引起世界范圍的震驚。

        本研究中,奇異變形桿菌F160211攜帶有mcr-1耐藥基因,但其耐藥性為敏感,這也與Liu Yiyun[23]、易靈嫻[22]、Skov[36]等報(bào)道m(xù)cr-1介導(dǎo)宿主菌低水平的黏菌素耐藥相符;攜帶mcr-1的奇異變形桿菌質(zhì)粒與Liu Yiyun等[23]報(bào)道的屬于同一類型不相容性質(zhì)粒,宿主范圍也由報(bào)道的大腸桿菌、沙門菌等進(jìn)一步擴(kuò)大至奇異變形桿菌,這說(shuō)明該質(zhì)粒已在不同菌種間發(fā)生了水平轉(zhuǎn)移,形勢(shì)更加嚴(yán)峻。隨著時(shí)間的推移,如果沒(méi)有合理的應(yīng)對(duì)措施,將可能有更多的菌種產(chǎn)生mcr-1耐藥基因,這無(wú)論對(duì)食品安全還是臨床感染的治療都將是嚴(yán)峻的挑戰(zhàn),同時(shí)也對(duì)人類濫用抗菌藥物的行為敲響了警鐘。

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