亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        26份海州常山種質(zhì)資源遺傳多樣性的AFLP分析

        2018-06-29 05:06:44謝福春曾現(xiàn)艷張艷君王華田
        江蘇農(nóng)業(yè)科學 2018年11期
        關(guān)鍵詞:海州標記技術(shù)常山

        謝福春, 曾現(xiàn)艷, 程 瑤, 張艷君, 秦 棟, 王華田

        (1.東北農(nóng)業(yè)大學園藝園林學院,黑龍江哈爾濱 150030; 2.煙臺新海建筑設(shè)計有限責任公司,山東煙臺 264000;3.哈爾濱理工大學榮成學院,山東榮成 264300; 4.山東農(nóng)業(yè)大學林學院,山東泰安 271018)

        海州常山(ClerodendrumtrichotomumThunb.)是馬鞭草科(Verbenaceae)大青屬(Clerodendrum)落葉小喬木或灌木,在我國華北、華東、中南和西南各省(區(qū)、市)均有分布,常見于山丘陵、荒坡溝谷等地[1]。海州常山具有花形別致,花、果觀賞價值高且觀賞期長的特點,被廣泛應(yīng)用于城市園林綠化中,同時由于該樹種具有較強的抗鹽、抗旱、耐澇等特性,是干旱瘠薄荒山及礦區(qū)廢棄地植被恢復(fù)與重建、城市廢棄地綠化、鹽堿地綠化的優(yōu)良樹種。目前對于海州常山的研究多集中在繁育技術(shù)、抗逆性機制、花粉活力的測定及植物化學成分分析等方面[2-6],而對其遺傳多樣性的研究相對較少。

        擴增片段長度多態(tài)性(amplified fragment length polymorphism,簡稱AFLP)分子標記技術(shù)是一項以PCR反應(yīng)為基礎(chǔ)的分子標記技術(shù),具有DNA用量少、多態(tài)性水平高、檢測位點多、分子識別率高等特點[7-9],近年來被廣泛應(yīng)用于雞冠花、銀杏、珙桐和海棠等觀賞植物的遺傳多樣性研究[10-13]。本研究采用DNA-AFLP分子標記技術(shù),對來自我國15個省(區(qū)、市)26份種源的海州常山進行遺傳多樣性研究,從分子水平揭示我國海州常山種質(zhì)資源的遺傳多樣性水平和遺傳進化關(guān)系,為海州常山的良種選育和遺傳變異性研究提供理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        根據(jù)中國數(shù)字植物標本館、《中國植物志》及其他相關(guān)文獻記載確定海州常山標本采集地點,結(jié)合標本采樣地點的地理位置和主要氣象因子(年均溫、日照時數(shù)、無霜期、降水量),對海州常山種源分布進行區(qū)域劃分,根據(jù)種源區(qū)劃確定15個省(區(qū)、市),根據(jù)每個省(區(qū)、市)資源的分布情況,確定采集地點,共選取26個采集地點(表1),所選采集地點基本覆蓋了海州常山在國內(nèi)的分布區(qū)域。采集的不同地區(qū)的海州常山種源種植于山東農(nóng)業(yè)大學種質(zhì)資源圃,本試驗采集的幼嫩葉片均是來自不同地區(qū)的海州常山3年生萌蘗苗。

        1.2 DNA提取

        每個種源從5個單株中各取2張幼嫩葉片混合取樣 50 mg,利用改良的十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法[14]提取海州常山葉片基因組總DNA,采用紫外分光光度計和0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測提取DNA的質(zhì)量和濃度,將樣品稀釋到50 μg/mL,于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 AFLP分析

        參照Vos等的方法[15],用EcoRⅠ+MseⅠ內(nèi)切酶組合對基因組DNA進行酶切,從64對AFLP引物中篩選出條帶清晰、多態(tài)性高的8對引物組合(表2)。預(yù)擴增總反應(yīng)體系:酶切連接產(chǎn)物2 μL,Pre-AMPmix 1 μL,dNTPs 1 μL,10×PCR buffer 2.5 μL,2.5 U/μLTaq0.5 μL,ddH2O 18 μL,共 25 μL。預(yù)擴增PCR程序:94 ℃預(yù)變性2 min;94 ℃變性 30 s,56 ℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸1 min,循環(huán)30次;72 ℃延伸 5 min。將PCR產(chǎn)物稀釋20倍后作為選擇性擴增模板,選擇性擴增體系同上。PCR擴增程序:94 ℃ 30 s,65 ℃ 30 s,72 ℃ 80 s,1個循環(huán),然后以每次循環(huán)復(fù)性溫度逐級降低0.7 ℃的梯度繼續(xù)進行12個循環(huán),變性和延伸條件同上,最后以94 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 60 s,23個循環(huán)結(jié)束。PCR產(chǎn)物經(jīng) 95 ℃變性 10 min 后用4%變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,銀染法檢測。

        表1 海州常山采樣地概況

        表2 海州常山熒光AFLP引物篩選中供試的64對引物組合

        1.4 數(shù)據(jù)分析

        用377DNA自動檢測儀掃描電泳膠圖,用Gene Scan3.1軟件對電泳膠圖進行數(shù)據(jù)提取,通過Binthere軟件分析各片段大小。利用Excel 2007將原始數(shù)據(jù)中有帶的換成“1”,無帶的換成“0”,構(gòu)建“01”矩陣。利用POPGENE version1.31軟件計算遺傳多樣性參數(shù):多態(tài)帶數(shù)(AP)和多態(tài)帶百分率(P);觀測等位基因數(shù)(Na)、觀測的有效等位基因數(shù)(Ne)、香農(nóng)信息指數(shù)(I)、Nei’s基因多樣性(H)。用NTSYSpc-2.11F軟件進行數(shù)據(jù)分析。對原始矩陣用Sim Qual程序求DICE相似系數(shù)矩陣,并獲得相似系數(shù)矩陣。用SHAN程序中的非加權(quán)組平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,簡稱UPGMA)方法進行聚類分析,并通過Treeplot模塊生成聚類圖(圖1)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 AFLP擴增結(jié)果

        從64對引物組合中篩選出8對譜帶清晰、多態(tài)性高且穩(wěn)定的引物組合,這8對引物擴增圖譜顯示電泳帶數(shù)目豐富,分帶清晰(圖2)。擴增片段的大小在70~500 bp之間,且分布相對均勻。8對引物組合共擴增出1 042條條帶,其中多態(tài)性條帶1 030條,占比為的98.85%。不同引物組合擴增出的多態(tài)性條帶總數(shù)范圍在115~148條之間,平均為128.75條;不同引物組合平均多態(tài)性條帶比例為98.87%(表3)。不同引物產(chǎn)生的條帶數(shù)存在一定的差異,其中E-ACA/M-CAG引物產(chǎn)生的條帶最多,為151條,而E-AGC/M-CAG引物產(chǎn)生的條帶最少,為116條。引物組合E-AGC/M-CAG和E-AGG/M-CAA擴增出的位點全部具有多態(tài)性,而引物組合 E-ACA/M-CAG的多態(tài)性位點的比例最低,為98.01%。以上分析表明,所選擇的引物在海州常山種源間表現(xiàn)了較高的多態(tài)性。

        表3 AFLP選擇性擴增引物產(chǎn)生的條帶多態(tài)性

        采用POPGENE軟件對不同引物組合對海州常山的遺傳多樣性進行分析。由表4可知:26份海州常山種質(zhì)資源平均觀測等位基因數(shù)為1.562 5個,平均有效等位基因數(shù)為 1.226 0個,平均Nei’s基因多樣性、平均香農(nóng)信息指數(shù)分別為0.142 0、0.225 5,以上數(shù)據(jù)顯示,我國海州常山的多態(tài)性豐富,種源間的遺傳多樣性較高,存在豐富的變異。

        2.2 不同海州常山種質(zhì)資源的遺傳相似性系數(shù)分析

        采用NTSYSpc 2.10軟件計算種質(zhì)間遺傳相似系數(shù)(表5),結(jié)果顯示,來自不同地區(qū)的26份海州常山的遺傳相似系數(shù)在0.285 1~0.690 9之間,平均為0.518 0。其中山東泰安馬套村和泰安夏張鎮(zhèn)2個種源間的相似系數(shù)最大(0.690 9),甘肅天水和云南昭通間的相似系數(shù)最低(0.285 1)。據(jù)統(tǒng)計,遺傳相似系數(shù)在0.400 0~0.600 0之間的占種源總數(shù)的81.58%;遺傳相似系數(shù)小于0.400 0的占7.69%;遺傳相似系數(shù)大于0.600 0的占10.46%。另外從相似系數(shù)矩陣可知:來自同一省份或者相近地域的種源之間相似系數(shù)較大,例如來自山東省、河南省、江蘇省的種源之間相似系數(shù)偏高。由遺傳相似系數(shù)分析可知,供試材料之間的遺傳相似性與地理距離存在顯著的相關(guān)性,地理距離越遠,遺傳相似性越小,遺傳距離越大,基因間的交流越少。反之,遺傳相似性越大,材料間的遺傳距離越小,基因交流越頻繁。

        表4 基于不同引物組合的海州常山遺傳多樣性水平

        注:同列數(shù)據(jù)后標有不同大寫字母表示在0.01水平上差異顯著。

        2.3 不同海州常山種質(zhì)資源的聚類分析

        根據(jù)相似性系數(shù)進行UPGMA聚類分析,在相似系數(shù)為0.534處可以將所有種源海州常山劃分為7類(圖1):第一類包括2個種源,分別為山西太原和甘肅天水,第二類陜西楊凌單獨為一類,第三類包括19份種質(zhì)資源,在相似性系數(shù)0.57處切割??蓪⒌谌惾簞澐譃?個亞群(A、B、C、D),A亞群包括11個種源,其中在11份種源中,山東的占有8份,其他3份分別為山東省周邊省份;B亞區(qū)包括1份種源,為遼寧大連;C亞區(qū)包括3份種源,分別為安徽舒城、江蘇連云港、江蘇南京;D亞區(qū)包括4份種源,分別為湖北神農(nóng)架、河南新縣、河南西峽、浙江天目山。廣西臨桂縣、云南昭通、重慶金佛山、貴州望謨這4個種源可能由于分別地處熱帶和亞熱帶的交界、熱帶、亞熱帶、亞熱帶,加上地理位置相差較大,在聚類圖上分別單獨聚為一類。

        3 討論

        3.1 AFLP標記的檢測有效性及海州常山的遺傳多樣性分析

        在植物遺傳多樣性研究中AFLP標記技術(shù)已在農(nóng)作物、花卉、樹木等植物中廣泛應(yīng)用[16-18]。例如野生扁蓿豆[19]、雞冠花[10]、枸杞[20]、紫椴[21]等植物遺傳多樣性的研究都采用AFLP標記技術(shù)。本研究篩選出8對AFLP引物對26份來自不同地理區(qū)域的海州常山進行擴增,共檢測出1 042條帶,其中多態(tài)性條帶1 030條,多態(tài)性位點比例98.85%。另由多樣性參數(shù)可知:Na為1.562 5個,Ne為1.226 0個,H、I分別為 0.142 0、0.225 5,這與紫椴、甘蔗[21-22]等作物的研究類似,表明26份海州常山種質(zhì)間有豐富的遺傳多樣性,這為海州常山的資源開發(fā)利用奠定了基礎(chǔ)。植物的遺傳多樣性水平與其生物學特性、環(huán)境、分布范圍、花粉和種子傳播方式等因素有關(guān)[23],本試驗中的26份種源遺傳多樣性豐富,可能是由于種源采自全國不同地區(qū),這充分表明我國海州常山種質(zhì)資源具有豐富的遺傳基礎(chǔ)。

        3.2 國內(nèi)主要分布區(qū)的海州常山親緣關(guān)系分析

        在來自不同地區(qū)的26份海州常山種質(zhì)資源中,其相似系數(shù)在0.285 1~0.690 9之間,來自不同省份的海州常山種質(zhì)資源間相似系數(shù)相對較小,這一趨勢與對紫花苜蓿[24]、白花泡桐[25]、甘蔗[22]種質(zhì)資源間遺傳相似系數(shù)的分析相似,可知來自不同省(區(qū)、市)的海州常山種質(zhì)資源間的親緣關(guān)系相對較遠,基因交流較少。聚類分析表明,劃分類群與地理起源明顯相關(guān),例如來自山東、河南、江蘇各地區(qū)的種源多數(shù)聚為一類或者聚為一亞類,而來自地理距離較大的廣西臨桂縣、云南昭通、重慶金佛山、貴州望謨這4個種源各自單獨聚為一類,表明這4個種源與其他材料間的親緣關(guān)系相對較遠,具有相對獨立的遺傳特性。親本間的親緣關(guān)系在很大程度上決定著后代群體的選擇范圍,通常認為2個親本遺傳差異越大,后代分離范圍就越廣泛,獲得優(yōu)良個體的機會也就越多。從聚類分析可知,地理位置分布差異較大的幾個海州常山種源可考慮作為雜交親本,為海州常山今后育種提供科學依據(jù)。

        由于對海州常山種質(zhì)資源的多樣性研究剛剛開始,本研究在海州常山種質(zhì)資源多樣性研究中存在一些不足,例如不同地區(qū)采樣的數(shù)量不均,而且本試驗只用了AFLP技術(shù),簡單重復(fù)序列標記(simple sequence repeats,簡稱SSR)、相關(guān)序列擴增多態(tài)性(sequence-related amplified polymorphism,簡稱SRAP)等分子標記技術(shù)還未用于海州常山種質(zhì)資源的遺傳多樣性的分析。下一步將采集樣品較少地區(qū)的種質(zhì)資源,并采用其他分子標記技術(shù)對其遺傳多樣性進行分析,尋找適宜該樹種遺傳多樣性分析的分子標記技術(shù),進一步確定海州常山不同地區(qū)種質(zhì)資源的親緣關(guān)系。

        參考文獻:

        [1]鄭萬鈞. 中國樹木志[M]. 北京:中國林業(yè)出版社,2004:4796.

        [2]林燕青,楊秀蓮,王良桂. 海州常山花粉活力測定及其萌發(fā)條件[J]. 東北林業(yè)大學學報,2015,43(5):94-99.

        [3]劉 軍,曾德靜,王 鋮,等. 植物生長調(diào)節(jié)劑對海州常山硬枝扦插生根的影響[J]. 東北林業(yè)大學學報,2012,40(8):10-15.

        [4]張 穎,楊 舸. 微波提取法優(yōu)選海州常山葉總黃酮的提取工藝[J]. 北方園藝,2016(10):118-122.

        [5]謝福春,陳才業(yè),劉富強,等. 土壤鹽脅迫對海州常山形態(tài)與氣體交換特性的影響[J]. 浙江林學院學報,2009,26(2):176-181.

        [6]謝福春,張文婷,王華田,等. 土壤鹽脅迫對海州常山生理生化特性的影響[J]. 江西農(nóng)業(yè)大學學報,2008,30(5):839-844.

        [7]Nei M,Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics[M]. New York:Oxford University Press,2000:87-88.

        [8]王玉山,邢世巖,唐海霞,等. 側(cè)柏種源遺傳多樣性分析[J]. 林業(yè)科學,2011,47(7):91-96.

        [9]周延清. DNA分子標記技術(shù)在植物研究中的應(yīng)用[M]. 北京:化學工業(yè)出版社,2005:164.

        [10]張西西,李 俊,趙正楠,等. 26份雞冠花遺傳資源親緣關(guān)系的AFLP分析[J]. 中國農(nóng)業(yè)大學學報,2016,21(3):67-74.

        [11]王 萱,劉曉靜,邢世巖,等. 中國部分古銀杏資源遺傳多樣性的AFLP分析及核心種質(zhì)的構(gòu)建[J]. 園藝學報,2016,43(2):249-260.

        [12]李雪萍,李在留,賀春玲. 珙桐遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 園藝學報,2012,39(5):992-998.

        [13]沈紅香,趙天田,宋婷婷,等. 觀賞海棠‘王族’自然雜交后代的遺傳多樣性分析[J]. 園藝學報,2011,38(11):2157-2168.

        [14]Doyle J J,Doule J L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue[J]. Phytochem Bull,1987,19(1):11-15.

        [15]Vos P,Hogers R,Bleeker M,et al. AFLP:a new technique for DNA fingerprinting[J]. Nucleic Acids Research,1995,23(21):4407-4414.

        [16]王曉醒,李淑娟,謝永麗,等. 梭羅草AFLP體系優(yōu)化及指紋圖譜構(gòu)建[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學,2017,45(16):37-41.

        [17]高金秋,周建朝,王孝純,等. 部分高抗低磷脅迫基因型甜菜AFLP指紋圖譜的構(gòu)建[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學,2017,45(6):36-38.

        [18]李建武,李灝德,文國宏,等. 馬鈴薯EcoRⅠ/MseⅠ內(nèi)酶切組合AFLP反應(yīng)體系的優(yōu)化與引物篩選[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學,2017,45(15):25-29.

        [19]李鴻雁,李志勇,辛 霞,等. 野生扁蓿豆種質(zhì)資源AFLP遺傳多樣性的分析[J]. 植物遺傳資源學報,2016,17(1):78-83.

        [20]王錦楠,陳進福,陳武生,等. 柴達木地區(qū)野生黑果枸杞種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 植物生態(tài)學報,2015,39(10):1003-1011.

        [21]王東升,辛 紅,邢世巖,等. 山東省紫鍛遺傳多樣性AFLP分析[J]. 福建農(nóng)林大學學報(自然科學版),2014,43(1):45-48.

        [22]咎逢剛,應(yīng)雄美,吳才文,等. 98份甘蔗種質(zhì)資源遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學,2015,48(5):1002-1010.

        [23]王洪新,胡志昂. 植物的繁育系統(tǒng)、遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性保護[J]. 生物多樣性,1996,4(2):92-96.

        [24]劉青松,陳立波,李志勇,等. 基因組DNA分子標記在紫花苜蓿遺傳多樣性研究中的應(yīng)用[J]. 華北農(nóng)學報,2013,28(增刊1):36-40.

        [25]李海英,茹廣欣,侯 婷,等. 12個白花泡桐種源的遺傳多樣性分析[J]. 河南農(nóng)業(yè)大學學報,2015,49(6):764-768.

        猜你喜歡
        海州標記技術(shù)常山
        近代海州城市中心的轉(zhuǎn)移與發(fā)展困境
        江蘇地方志(2023年6期)2024-01-18 07:07:48
        江蘇省海州現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)示范園
        拔野蔥
        常山和常山堿的藥理作用及減毒研究進展△
        《海州繡——十二生肖兒童吉祥玩具》
        海州刺綉
        讓評論在縣級紙媒有效落地響亮發(fā)聲——以《今日常山》為例
        傳媒評論(2019年4期)2019-07-13 05:49:24
        DNA分子標記技術(shù)在柑橘研究中的應(yīng)用
        浙江柑橘(2016年3期)2016-03-11 20:12:48
        RAPD分子標記技術(shù)和ITS同源性分析比較不同生態(tài)環(huán)境來源的鈍頂螺旋藻的遺傳多樣性
        三種不同分子標記技術(shù)對靈芝單核體多態(tài)性的研究
        亚洲无线一二三四区手机| 黑人一区二区三区啪啪网站| 国产手机在线αⅴ片无码| 国产精品98福利小视频| 国内揄拍国内精品久久| 中国国产不卡视频在线观看| 老司机亚洲精品影院| 日本高清www午色夜高清视频| 91手机视频在线| 久久久久无码中文字幕| 女同恋性吃奶舌吻完整版| 免费无码一区二区三区a片百度| 国产69精品久久久久9999| 国产自在自线午夜精品视频在| 日本成人中文字幕亚洲一区| 内射中出日韩无国产剧情| 国产呦系列呦交| 九九久久国产精品大片| 国产又湿又爽又猛的视频| 国产三级a三级三级| 亚洲国产成人久久综合电影| 亚洲韩国在线| 久久精品国产黄片一区| 国产一区二区三区四区三区| 内射中出无码护士在线| 无码8090精品久久一区| 国产精品视频白浆免费视频| 在线看无码的免费网站| 亚洲中文无码成人影院在线播放| 中文熟女av一区二区| 中文字幕免费人成在线网站| 亚洲人成网站色www| 96精品在线| 天堂精品人妻一卡二卡| 亚洲另类无码专区首页| 曰本极品少妇videossexhd | 无码午夜成人1000部免费视频 | 伊伊人成亚洲综合人网香| 亚色中文字幕| 男女做那个视频网站国产| 丰满人妻一区二区三区视频53|