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        偽狂犬病PCR檢測(cè)方法的建立

        2018-06-05 09:44:33王皓婷紀(jì)愛(ài)英張彥昌趙素杏陳清亮
        畜牧獸醫(yī)科技信息 2018年5期
        關(guān)鍵詞:狂犬病條帶特異性

        王皓婷 ,紀(jì)愛(ài)英,程 龍★,張彥昌 ,袁 英,孫 岐 ,趙素杏,陳清亮

        (1.河北省邯鄲市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,河北 邯鄲 056000;2.河北省邯鄲市飼料工業(yè)辦公室,河北 邯鄲 056000)

        本病是一種可侵害多系統(tǒng)的急性傳染病,由偽狂犬病病毒引起。由于凈化難度較大,給養(yǎng)豬業(yè)帶來(lái)巨大損失。能夠快速區(qū)分野毒和疫苗株對(duì)偽狂犬病凈化有著十分重要的意義。PCR檢測(cè)方法與ELISA檢測(cè)方法相較,有準(zhǔn)確、快速、易于操作等優(yōu)點(diǎn)。本方法可以區(qū)分野毒感染與被動(dòng)免疫,經(jīng)優(yōu)化各項(xiàng)反應(yīng)條件后,測(cè)得本試驗(yàn)最低檢測(cè)模板量為3.75pg/μL,敏感性較高,目的條帶長(zhǎng)度為597bp。

        1 材料

        1.1 參考序列

        Gen Bank數(shù)據(jù)庫(kù)中偽狂犬病病毒標(biāo)準(zhǔn)毒株序列。

        1.2 病毒DNA

        本研究中所使用的偽狂犬病病毒標(biāo)準(zhǔn)毒DNA由河北工程大學(xué)獸醫(yī)實(shí)驗(yàn)室惠贈(zèng)。

        1.3 試劑

        Taq DNA 聚合酶、dNTPs(2.5mM)、10×PCR buffer、瓊脂糖、DL2000 DNA Marker等均購(gòu)自大連寶生物工程公司,設(shè)計(jì)好的引物委托大連寶生物工程有限公司合成。

        1.4 主要儀器

        臺(tái)式離心機(jī)MiniSpin Eppendorf;移液器Eppendorf/大龍醫(yī)療設(shè)備(上海)有限公司;PCR儀GeneAmp 9700Life Technologies(AB&Invitrogen);電泳儀DYY-8C凝膠成像系統(tǒng)/北京六一生物科技有限公司

        1.5 病料采集

        從邯鄲市各縣區(qū)選取豬場(chǎng)采集病料共計(jì)200份。所采豬只均出現(xiàn)有呼吸道癥狀、發(fā)熱等異常情況。病料種類有肺臟,延髓,脾臟,腎臟和淋巴結(jié)等,對(duì)所采集病料按場(chǎng)點(diǎn)分類、編號(hào)。

        2 方法

        2.1 設(shè)計(jì)引物

        偽狂犬病gE基因缺失弱毒疫苗因免疫效果較好而得到廣泛使用。是否包含gE基因是野毒株與疫苗株最大的區(qū)別。本試驗(yàn)針對(duì)偽狂犬病毒gE基因設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增產(chǎn)物片段為597bp。

        PRV:(PRV1)5’-ACACACCGGGGTTGAG-3’

        (PRV2)5’-TGCAGCGTGTAGAGGC-3’

        2.2 病毒DNA的提取

        運(yùn)用世紀(jì)元亨豬偽狂犬病病毒PCR檢測(cè)試劑盒中的DNA提取柱按說(shuō)明書(shū)步驟提取病毒DNA。

        2.3 PCR反應(yīng)體系的構(gòu)建

        以偽狂犬病病毒標(biāo)準(zhǔn)毒DNA作為反應(yīng)模板,構(gòu)建擴(kuò)增體系,總體積為 25μL:(1)PRV DNA 2μL;(2)上下游引物各 0.8μL;2×GC buffe 12.5μL;Taq DNA 聚合酶 0.5μL;dNTPs(2.5mM)3μL;滅菌雙蒸水 5.4μL。

        反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性 5min;循環(huán):94℃變性45s,52℃ 退火 30s,72℃ 延伸 1min,共 35 個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。取10μLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,檢測(cè)擴(kuò)增結(jié)果。

        2.4 反應(yīng)條件的優(yōu)化

        對(duì)退火溫度和引物的加入量進(jìn)行摸索,以確定上述PCR體系的最佳反應(yīng)條件。表1為PRV PCR反應(yīng)體系的各項(xiàng)摸索內(nèi)容。

        2.5 敏感性試驗(yàn)

        用紫外分光光度計(jì)測(cè)定提取出的PRV DNA的濃度并記錄。隨后取5μLDNA進(jìn)行10倍梯度稀釋,直至稀釋到10-6。從稀釋度為 10-2、10-3、10-4、10-5、10-6的稀釋液中各取 2 μL作為模板,在其它反應(yīng)條件相同的情況下分別進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增產(chǎn)物各取10μL,同時(shí)進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,對(duì)比結(jié)果,檢測(cè)本方法的敏感性。

        2.6 特異性試驗(yàn)

        待所有條件均摸索好、確定最佳反應(yīng)體系后,分別以PRV的 DNA、雙蒸水、CSF的 cDNA、PCV2的 DNA、PRRSV的cDNA、JEV的cDNA為模板,同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增,用以驗(yàn)證本方法的特異性。

        2.7 陽(yáng)性檢出率試驗(yàn)

        表1 PRV PCR反應(yīng)條件優(yōu)化

        用本試驗(yàn)建立的PCR方法對(duì)收集的病料進(jìn)行檢測(cè)并記錄陽(yáng)性率,再使用世紀(jì)元亨豬偽狂犬病病毒PCR檢測(cè)試劑盒進(jìn)行檢測(cè),比較兩種檢測(cè)方法的符合率。

        3 結(jié)果

        3.1 PRV PCR方法建立的結(jié)果

        將PRV標(biāo)準(zhǔn)毒的DNA做為模板,運(yùn)用本試驗(yàn)建立的PCR方法進(jìn)行擴(kuò)增,所得條帶大小在500bp~750bp之間(見(jiàn)圖1)。測(cè)序鑒定無(wú)誤,目的條帶為597bp,與預(yù)期結(jié)果相符。

        圖1 PRV PCR擴(kuò)增結(jié)果

        3.2 PRV PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化結(jié)果

        3.2.1 確定最適退火溫度

        在各種選定的退火溫度下都能擴(kuò)增出特異性條帶,但在53℃時(shí),擴(kuò)增出的條帶相比其他溫度最亮(圖2),因此將最適退火溫度定為53℃。

        圖2 PRV PCR退火溫度優(yōu)化結(jié)果

        3.2.2 確定最佳引物量

        加入引物(10μmol/L)量為0.7 μL時(shí),出現(xiàn)的特異性條帶最亮(圖3),擴(kuò)增效果最好,但其它濃度亦可擴(kuò)增出目的條帶。

        圖3 PRV PCR引物量?jī)?yōu)化結(jié)果

        3.3 敏感性試驗(yàn)結(jié)果

        經(jīng)紫外分光光度計(jì)側(cè)得PRV的DNA模板的起始濃度為 37.5ng/μL,結(jié)果如圖 4 所示,稀釋度為 10-2、10-3、10-4、10-5時(shí)均可擴(kuò)增出特異性條帶。經(jīng)計(jì)算得知,最低檢測(cè)量為3.75pg/μL。

        圖4 PRV PCR敏感性試驗(yàn)結(jié)果

        3.4 特異性試驗(yàn)結(jié)果

        分別以雙蒸水、PRV的 DNA、CSF的 cDNA、PRRSV的cDNA、PCV2的DNA、JEV的cDNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增的結(jié)果如圖5所示,僅有PRV的DNA擴(kuò)增出了特異性條帶,說(shuō)明本試驗(yàn)特異性較好。

        圖5 PRV PCR特異性測(cè)定結(jié)果

        3.5 陽(yáng)性符合率檢測(cè)結(jié)果

        分別使用世紀(jì)元亨試劑盒和本試驗(yàn)建立的建立的檢測(cè)方法對(duì)200份樣品進(jìn)行了檢測(cè),其中世紀(jì)元亨的檢出數(shù)為78份,本試驗(yàn)建立的檢測(cè)方法的檢出數(shù)為76份,說(shuō)明本試驗(yàn)建立的PCR檢測(cè)方法與世紀(jì)元亨的檢測(cè)結(jié)果有較高的陽(yáng)性符合率。

        4 討論

        4.1 本試驗(yàn)為偽狂犬病病毒PCR檢測(cè)方法的基礎(chǔ)摸索性試驗(yàn),后續(xù)可考慮加入野毒株與疫苗株都具備的基因,如gB基因、gD基因等其他基因片段,與gE基因同時(shí)擴(kuò)增。雙基因的擴(kuò)增可很好的避免假陰性結(jié)果的出現(xiàn)。

        4.2 可進(jìn)一步探究偽狂犬病病毒基因與其它豬DNA病毒(如豬瘟等)基因一同擴(kuò)增,建立多重PCR檢測(cè)方法,同時(shí)檢測(cè)多種病種,提高檢測(cè)效率。

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