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        四川小麥品種籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性相關(guān)基因的分子標記鑒定

        2018-06-05 05:56:42李式昭鄭建敏萬洪深楊漫宇羅江陶劉廷輝楊開俊蒲宗君
        西南農(nóng)業(yè)學報 2018年4期

        李式昭,鄭建敏,伍 玲,李 俊,萬洪深,楊漫宇,羅江陶,劉廷輝,楊開俊,蒲宗君*

        (1. 四川省農(nóng)業(yè)科學院作物研究所/農(nóng)業(yè)部西南地區(qū)小麥生物學與遺傳育種重點實驗室, 四川 成都 610066; 2. 四川省甘孜州農(nóng)科所, 四川 康定 626000)

        【研究意義】籽粒硬度是決定小麥品質(zhì)的關(guān)鍵性狀之一,對面粉顆粒大小、出粉率、潤麥加水量、破損淀粉含量和最終食品加工品質(zhì)都有重要影響。而穗發(fā)芽(Pre-harvest sprouting,PHS)則指小麥收獲前遇到陰雨天氣時籽粒在穗上發(fā)芽的現(xiàn)象,不僅降低產(chǎn)量,而且嚴重劣化品質(zhì)。穗發(fā)芽后的小麥α-淀粉酶活性提高,導致淀粉水解,面粉的降落值降低,烘烤品質(zhì)變差[1]。分析四川小麥籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性相關(guān)基因分布,對四川小麥的品質(zhì)改良具有重要意義。【前人研究進展】小麥籽粒硬度主要受位于5D染色體短臂上的1對主效基因Ha調(diào)控,由puroindoline蛋白控制,該蛋白的2種組分puroindoline a(PINA)和puroindoline b(PINB)是形成籽粒硬度的基礎(chǔ),分別由基因Pina和Pinb編碼[2-3]。小麥籽粒硬度的差異主要源于Pina和Pinb基因的不同變異類型,當Pina和Pinb基因都處于野生(功能)狀態(tài)時,籽粒表現(xiàn)為軟質(zhì);但當其中任一基因缺失或發(fā)生突變時,籽粒表現(xiàn)為硬質(zhì),但也有例外[4]。軟質(zhì)麥適宜制作餅干和糕點等甜食,而硬質(zhì)麥則更適合制作面包和面條等食品。不同puroindoline等位變異類型對磨粉和加工品質(zhì)的影響也不盡相同,目前已命名17個Pina位點和25個Pinb位點的等位變異[5]。相較于Pina位點,對Pinb-D1b基因的研究則更為深入,該基因的氨基酸序列中第46位點的甘氨酸(Glycine,Gly)突變?yōu)榻z氨酸(Serine,Ser),造成小麥質(zhì)地變硬。相關(guān)研究[6-8]表明,Pinb-D1b較Pina-D1b出粉率高、灰份低,磨粉品質(zhì)更好,此外,前者的饅頭、面包和面條加工品質(zhì)也略優(yōu)于PINA蛋白缺失和野生類型。小麥穗發(fā)芽則與種子的休眠期長短顯著相關(guān),休眠期越長,穗發(fā)芽抗性越強;休眠期短或無休眠期的品種更易發(fā)生穗發(fā)芽[9]。Vp-1基因是種子成熟、干燥及休眠的主要轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,能促進胚成熟,加速休眠并抑制其萌發(fā)[10],該基因位于小麥第3同源群染色體的長臂上[11]。研究[12-14]表明,等位基因類型Vp-1Bb和Vp-1Bc與抗穗發(fā)芽相關(guān),而Vp-1Ba則與感穗發(fā)芽相關(guān)?!颈狙芯壳腥朦c】目前,針對上述品質(zhì)性狀,國內(nèi)、外已開發(fā)出多種鑒定上述基因內(nèi)部等位變異的功能標記[15-16],方便進行快速檢測?!緮M解決的關(guān)鍵問題】本研究利用2個籽粒硬度相關(guān)分子標記Pinb-D1a、Pinb-D1b和1個穗發(fā)芽抗性等位基因分子標記Vp1B3,對2000年以來四川育成的105份小麥品種進行鑒定,旨在深入了解四川小麥品種籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性相關(guān)等位基因的變異類型和分布規(guī)律,為選配有價值的品質(zhì)育種親本,加速四川小麥品質(zhì)育種進程提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        試驗選用自2000年以來四川育成的105份優(yōu)良小麥新品種,其中包括:川麥系列32份、綿麥系列(含綿陽、綿麥、國豪麥)19份、川農(nóng)系列(含川農(nóng)、良麥、蜀麥)18份、川育系列(含川育、科成麥)10份、西科麥系列(含綿農(nóng)、西科麥)8份和其他單位品種18份。2個籽粒硬度和1個穗發(fā)芽抗性等位基因分子標記的引物序列信息見表1。

        1.2 基因組DNA提取

        每份品種采用5株幼苗混合取樣,參照Murray等[17]的微量CTAB法提取小麥基因組DNA,用于基因位點檢測,并確定105份品種的基因型。

        1.3 PCR擴增及電泳檢測

        全部3對引物均由生工(上海)生物工程股份有限公司(http://www.sangon.com)合成。PCR反應在AB Veriti型PCR擴增儀中進行,各分子標記的PCR反應體系、程序及擴增產(chǎn)物的檢測均采用表1參考文獻方法進行。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 籽粒硬度相關(guān)基因的分子標記檢測

        在Pinb-D1位點,105份四川小麥品種中,有95份品種擴增出標記Pinb-D1a顯示非Pinb-D1b等位基因類型的250 bp特征帶(圖1A),頻率為89.5 %;11份品種擴增出標記Pinb-D1b顯示Pinb-D1b等位基因類型(Pinb突變)的250 bp特征帶(圖1B),頻率為10.5 %。

        2.2 穗發(fā)芽抗性相關(guān)基因的分子標記檢測

        在Vp-1B位點,105份四川小麥品種中,有88份品種擴增出共顯性標記Vp1B3顯示Vp-1Bc(抗穗發(fā)芽)的569 bp特征帶,頻率為83.8 %;17份品種擴增出顯示Vp-1Ba(感穗發(fā)芽)的652 bp特征帶,頻率為16.2 %(圖2);未能擴增出含有Vp-1Bb(抗穗發(fā)芽)等位基因類型的品種。

        表1 分子標記PCR引物及其相關(guān)信息

        M:DL2000;1:川麥39;2:川麥44;3:川麥50;4:川麥56;5:川麥65;6:川麥107;7:川農(nóng)23;8:綿陽35;9:綿麥46;10:川育20;11:西科麥4號;12:杏麥2號M: DL2000; 1: Chuanmai 39; 2: Chuanmai 44; 3: Chuanmai 50; 4: Chuanmai 56; 5: Chuanmai 65; 6: Chuanmai 107; 7: Chuannong 23; 8: Mianyang 35; 9: Mianmai 46; 10: Chuanyu 20; 11: Xikemai 4; 12: Xingmai 2圖1 特異性籽粒硬度標記Pinb-D1a(A)、Pinb-D1b(B)對部分供試品種的PCR擴增結(jié)果Fig.1 PCR products amplified by specific grain hardness markers Pinb-D1a (A) and Pinb-D1b (B) in several tested cultivars

        M:Trans2K plus DNA marker;1:川麥32;2:川麥37;3:川麥39;4:川麥42;5:川麥44;6:川麥48;7:川麥51;8:川麥55;9:川麥58;10:川麥62;11:川麥64;12:川麥104;13:川麥65;14:川麥107;15:川農(nóng)23;16:川農(nóng)27;17:綿陽30;18:綿麥37;19:綿麥51;20:川育20;21:西科麥4號;22:蜀麥482M: Trans2K plus DNA marker; 1: Chuanmai 32; 2: Chuanmai 37; 3: Chuanmai 39; 4: Chuanmai 42; 5: Chuanmai 44; 6: Chuanmai 48; 7: Chuanmai 51; 8: Chuanmai 55; 9: Chuanmai 58; 10: Chuanmai 62; 11: Chuanmai 64; 12: Chuanmai 104; 13: Chuanmai 65; 14: Chuanmai 107; 15: Chuannong 23; 16: Chuannong 27; 17: Mianyang 30; 18: Mianmai 37; 19: Mianmai 51; 20: Chuanyu 20; 21: Xikemai 4; 22: Shumai 482 圖2 特異性穗發(fā)芽抗性標記Vp1B3對部分供試材料的PCR擴增結(jié)果Fig.2 PCR products amplified by specific resistance to PHS markers Vp1B3 in several tested cultivars

        2.3 四川小麥籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性基因的分布

        105份四川小麥品種籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性相關(guān)基因的分布如表2所示,聚合2項優(yōu)質(zhì)基因(同時含有Pinb-D1b和Vp-1Bc)的四川小麥品種有11份,分別為川麥55、川農(nóng)12、川農(nóng)18、綿陽35、綿麥43、國豪麥15、蓉麥2號、良麥4號、蜀麥375、渝麥7號和南麥302,頻率占全部品種的10.5 %。

        3 討 論

        3.1 優(yōu)質(zhì)籽粒硬度基因在四川小麥中的分布與組成形式

        Giroux等[15]研究表明,硬質(zhì)小麥Cheyenne的質(zhì)地變化是由于其Pinb基因的第46位氨基酸由甘氨酸(G)突變?yōu)榻z氨酸(S)造成的。本研究顯示,四川小麥品種含Pinb-D1b(Pinb突變)的頻率較低,僅占10.5 %。其中,32份川麥、19份綿麥、18份川農(nóng)、10份川育、8份西科麥系列品種中含Pinb-D1b的材料分別僅有1、3、4、0、0份,頻率為3.1 %、15.8 %、22.2 %、0.0 %和0.0 %。陳鋒等[7]研究認為,中國小麥品種Pinb-D1b變異類型較多,占54.5 %,但西南區(qū)頻率較低,僅占19.2 %。不同地區(qū)的Pinb-D1b分布也不盡相同,陜西占57.4 %[18],青海占15.2 %[19]。本研究中所采用的105份小麥品種基本涵蓋了2000年以來四川省的育成品種,能夠代表該省小麥的遺傳特征,檢測表明四川小麥品種Pinb-D1b頻率較低,與陳鋒等[7]結(jié)論一致,這不僅與自然地理環(huán)境和當?shù)氐娘嬍沉晳T有關(guān),也與選育品種所選用的親本資源相關(guān)。在實際育種過程中,籽粒硬度已可通過硬度儀(單籽粒谷物特性測試儀,Single Kernel Characterization System,SKCS)等儀器快速進行表型選擇,今后四川小麥的籽粒硬度品質(zhì)育種,可多考慮引入含Pinb-D1b類型的材料,改善Puroindoline基因的遺傳多樣性,適度提升硬質(zhì)麥的比例。

        表2 105份四川小麥籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性的分子標記檢測結(jié)果

        注:下劃線表示正向品質(zhì)效應基因。

        Note: The gene names underlined mean genes with positive effect to noodle quality.

        3.2 優(yōu)質(zhì)穗發(fā)芽抗性基因在四川小麥中的分布與組成形式

        四川因小麥收獲期與雨季相接,近年來已成為小麥穗發(fā)芽的重災區(qū),從本研究結(jié)果來看,抗穗發(fā)芽基因資源已經(jīng)在四川得到良好應用,含Vp-1Bc(抗穗發(fā)芽)的品種頻率占83.8 %,高于中國推廣小麥品種抗穗發(fā)芽的平均頻率(71.7 %)[14],接近優(yōu)質(zhì)面條商品小麥澳白麥的水平(88.9 %)[20]。川麥、綿麥、川農(nóng)、川育、西科麥系列品種含Vp-1Bc的材料分別有23、17、17、10、7份,頻率為71.9 %、89.5 %、94.4 %、100.0 %和87.5 %。究其原因,可能是四川陰雨潮濕氣候較多,生產(chǎn)上種植的小麥品種在較大的選擇壓力下得以保留豐富的抗穗發(fā)芽基因資源,但也應看到,四川還缺少含Vp-1Bb(高抗穗發(fā)芽)基因資源的材料;同時,現(xiàn)有的抗穗發(fā)芽品種若遭遇連續(xù)遇雨的自然環(huán)境,其抗性表現(xiàn)也會出現(xiàn)很大差異,部分含Vp-1Bc(抗穗發(fā)芽)的品種依然大量出現(xiàn)穗發(fā)芽現(xiàn)象,這就要求育種家盡早開拓出新的穗發(fā)芽抗源。另一方面,紅粒[12]、白粒[13]小麥的抗穗發(fā)芽能力也不盡相同,一般來說,紅粒小麥較白粒休眠期更長,更抗穗發(fā)芽,但白粒小麥更受農(nóng)民親睞,充分挖掘現(xiàn)有的白??顾氚l(fā)芽小麥材料就顯得更為重要。

        3.3 聚合優(yōu)質(zhì)籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性基因品種在四川小麥中的分布

        聚合優(yōu)質(zhì)籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性基因的四川小麥品種有川麥55等11份,頻率為10.5 %;但其中白粒品種僅有4份,分別為川麥55、綿陽35、國豪麥15和渝麥7號,僅占全部品種的3.8 %。上述品種可成為改良籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性的寶貴資源材料,直接利用它們作為優(yōu)質(zhì)基因?qū)氲挠H本,可能是改良四川小麥品質(zhì)的捷徑。同時,也應看到,部分品種的實際磨粉品質(zhì)與基因檢測結(jié)果并不十分吻合,如川麥36和川麥39,是四川省審定的為數(shù)不多的強筋小麥品種,硬度值較高,但檢測結(jié)果是非Pinb-D1b類型的;在穗發(fā)芽抗性上,含抗穗發(fā)芽Vp-1Bc基因的綿麥367在實際生產(chǎn)中反而較感穗發(fā)芽。這充分說明籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性均是由多基因位點控制的,實際品質(zhì)表現(xiàn)是多種基因共同作用的結(jié)果,繼續(xù)發(fā)掘其他相關(guān)基因位點的功能,才能更好地為分子標記輔助育種工作服務。

        4 結(jié) 論

        本研究檢測的105份四川小麥品種的籽粒硬度和穗發(fā)芽抗性基因組成具有豐富的多態(tài)性,在四川小麥品質(zhì)育種中逐步導入優(yōu)質(zhì)基因Pinb-D1b和Vp-1Bc,是綜合提高四川小麥品質(zhì)的有效途徑。

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