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        基于高光譜信息特征選擇的玉米霉變程度Fisher鑒別方法

        2018-05-31 03:56:08戴松松DAISongsong
        食品與機(jī)械 2018年3期
        關(guān)鍵詞:波長預(yù)處理光譜

        戴松松DAI Song-song 殷 勇

        (河南科技大學(xué)食品與生物工程學(xué)院,河南 洛陽 471023)

        玉米極易被霉菌感染,發(fā)生霉變,人畜食用發(fā)霉的玉米,毒素會在體內(nèi)蓄積,產(chǎn)生嚴(yán)重危害。目前,檢測霉變玉米的方法主要有感官評定[1]、高效液相色譜法(HPLC)[2]、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)[3]、氣質(zhì)聯(lián)用法(GC-MS)[4]及DNA探針法[5]、酶聯(lián)免疫(ELISA)法[6-7]等,這些方法雖然比較準(zhǔn)確,但缺點(diǎn)是存在主觀性強(qiáng)、結(jié)果可靠性差,而且破壞物料、操作復(fù)雜、成本高等,不能滿足玉米貯藏和運(yùn)輸過程中快速檢測霉變的需要。相比之下,高光譜技術(shù)具有高效、無損、低成本和可重復(fù)等優(yōu)勢[8],已廣泛應(yīng)用于煙葉[9]、干果[10-11]、水果[12-13]、油[14]、肉[15-16]等農(nóng)副產(chǎn)品檢測中,并且取得了較好的分析結(jié)果。近年來,高光譜技術(shù)在玉米霉變檢測中也有報(bào)道。袁瑩等[17]利用傅里葉變換近紅外光譜對不同霉變程度的玉米顆粒進(jìn)行檢測區(qū)分,以支持向量機(jī)作為判別模型,其分類模型得出的訓(xùn)練集和預(yù)測集的預(yù)測準(zhǔn)確率分別為93.3%,91.7%。張楠楠等[18]利用高光譜圖像技術(shù)對霉變玉米進(jìn)行檢測,其正確檢出率為93.75%。

        已有的研究成果表明,高光譜技術(shù)有能力對霉變玉米進(jìn)行鑒別,但正確率不高,而且檢測時均需往新鮮玉米中注射不等量的真菌毒素,來培育不同等級的霉變玉米,不具有隨機(jī)性。本研究以5種發(fā)霉程度不同的玉米(霉變玉米是實(shí)驗(yàn)室模擬毒素最適宜生長時的溫度和濕度來培育的霉變玉米,并由商丘市質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心測出毒素值)為研究對象,利用高光譜圖像采集系統(tǒng)采集這些霉變玉米的高光譜圖像,提取各個樣本的平均光譜反射值,用標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量變換和多元散射校正2種預(yù)處理方法對原始平均光譜進(jìn)行預(yù)處理,再對預(yù)處理后的數(shù)據(jù)和未預(yù)處理的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行FDA判別,并比較三者的FDA結(jié)果;為了降低光譜維度,采用偏最小二乘回歸系數(shù)法選取特征波長,建立特征波長下的Fisher判別模型,并考察全波長與特征波長的判別效果,以期為高光譜成像技術(shù)應(yīng)用于玉米霉變的在線分級提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        玉米樣品:中單909,形狀和大小基本一致,購于洛陽市中原農(nóng)貿(mào)城。由于玉米本身自帶芽孢和孢子,芽孢是細(xì)菌的休眠體,孢子由霉菌產(chǎn)生,它們在適宜的生長環(huán)境下可使玉米產(chǎn)生霉變[1],在實(shí)際試驗(yàn)中,發(fā)現(xiàn)玉米樣品的發(fā)霉程度隨著培養(yǎng)時間的延長而相應(yīng)發(fā)生變化(表1),因此采用不同的培養(yǎng)時間來表征玉米樣品的不同發(fā)霉等級。方法為:將新鮮玉米放入相對濕度為 90%,溫度為30 ℃的恒溫恒濕培養(yǎng)箱(LHS-HC-100型,上海資一儀器設(shè)備有限公司)中培育。采用不同培育天數(shù)的玉米來表征不同的霉變程度。試驗(yàn)選用培育0,2,4,6,8 d的霉變玉米,每個等級的樣品各取50個樣本(35個訓(xùn)練集,15個測試集),每個樣本量為(60.0±0.5) g。這些霉變等級樣本委托商丘市質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督檢驗(yàn)測試中心測定(每個霉變等級測試5個平行樣本),結(jié)果見表1。

        表1 發(fā)霉玉米中3種霉菌測量結(jié)果Table 1 Moldy maize three kinds of mold measurement results

        1.2 高光譜采集系統(tǒng)

        高光譜圖像采集系統(tǒng),是由成像光譜儀(IST 50-3810型,德國Inno-spec公司)、計(jì)算機(jī)、4個500 W的光纖鹵素?zé)?RK90000420108型,德國ESYLUX公司)和傳送裝置等組成??刹杉降姆瓷涔庾V范圍為371.05~1 023.82 nm,光譜分辨率2.8 nm,共得到1 288個不同的波段。高光譜掃描設(shè)定范圍為Width760、Heigh550。得到的高光譜圖像分辨率為760×550。因此,最終得到的每個樣本大小為760×550×1 288的高光譜圖像。

        1.3 高光譜數(shù)據(jù)采集與校正

        采集樣本高光譜數(shù)據(jù)時,將樣本均勻地平鋪在規(guī)格為8 cm×8 cm的培養(yǎng)皿中,然后將盛有樣品的培養(yǎng)皿放在搭建的傳送帶上,由SICap-STVR V1.0.x軟件平臺驅(qū)動控制成像儀,采集樣本光譜大小在371.05~1 023.82 nm的反射光譜。然后對采集的高光譜圖像信息進(jìn)行黑白校正,校正方法詳見文獻(xiàn)[19]。

        針對所采集的高光譜圖像,用ENVI 4.8提取每個樣本的所有像素點(diǎn)在各波長下的平均反射值,以此得到250個樣本的平均反射光譜數(shù)據(jù),然后通過MATLAB R2014a軟件對光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。

        1.4 光譜預(yù)處理

        高光譜圖像采集時,受到電路噪聲以及隨機(jī)誤差等因素的影響,噪音是光譜信號探測時無法避免的現(xiàn)象[20]。因此,需對高光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理;采用標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量變換和多元散射校正2種預(yù)處理方法對原始光譜進(jìn)行預(yù)處理,并將不預(yù)處理的原始數(shù)據(jù)與2種預(yù)處理后的數(shù)據(jù)作為Fisher判別模型的輸入,進(jìn)行初步的判別。

        1.4.1 標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量變換處理 高光譜在采集圖像過程中,由于霉變玉米的顆粒度、表面散射等原因,會在采集過程中產(chǎn)生噪聲,因此,選用標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量變換預(yù)處理方法來減弱這種噪聲。SNV的方程式為:

        (1)

        式中:

        Xa——第a個樣本的光譜向量;

        p——波長變量數(shù)。

        1.4.2 多元散射校正處理 多元散射校正法可以增強(qiáng)與成分含量相關(guān)的光譜吸收信息,消除了光譜數(shù)據(jù)中散射帶來的影響。使用這種方法的前提是要先建立一個樣品的“理想光譜”,即樣品中待測成分的含量與光譜變化滿足直接線性關(guān)系,以該光譜為標(biāo)準(zhǔn)對其他樣品光譜通過基線平移和偏移校正進(jìn)行修正,首先計(jì)算樣品高光譜的平均值,然后以平均值作為標(biāo)準(zhǔn)光譜,將樣品光譜與標(biāo)準(zhǔn)光譜進(jìn)行一元線性回歸運(yùn)算,最后進(jìn)行多元散射校正[21],公式如下:

        (2)

        (3)

        (4)

        式中:

        A——n×p維光譜數(shù)據(jù)矩陣;

        n——樣品數(shù);

        p——光譜采集所用的波長點(diǎn)數(shù);

        Ai——1×p維矩陣;

        1.5 光譜特征波長提取

        由于采集到的高光譜信息是高達(dá)1 288個波段的數(shù)據(jù),再加上光譜數(shù)據(jù)中相鄰光譜值存在極高的相關(guān)性,含有大量的冗余信息,使得特征吸收峰不明顯。所以特征波長的提取對減少計(jì)算量、提高檢測精度至關(guān)重要。因此,通過偏最小二乘回歸系數(shù)法對1 288個波段上樣本的平均光譜反射值進(jìn)行分析,借助于回歸系數(shù)的大小來提取特征波長。

        由于表達(dá)式中每個波段的回歸系數(shù)表征了各波段的貢獻(xiàn)比重,系數(shù)絕對值越大對回歸模型的影響越大。因此,通過比較回歸系數(shù)絕對值的大小可以選取出光譜的特征波長。

        1.6 Fisher判別分析

        為了有效地鑒別發(fā)霉玉米的霉變程度,選用Fisher判別分析作為模式識別的工具,其基本的思想是投影,即將k組m元數(shù)據(jù)投影到某一方向,投影后組和組之間盡可能地區(qū)分開,借助方差分析思想來導(dǎo)出判別函數(shù),這個判別函數(shù)可以是線性的,也可以是比較一般的函數(shù)。在實(shí)際應(yīng)用中,因?yàn)榫€性判別函數(shù)是最為方便的,所以選用線性判別函數(shù)。為探究采用FDA分析全波長和特征波長下不同等級霉變玉米的有效性,采用本實(shí)驗(yàn)室在MATLAB R2014a平臺上自行研制的FDA分析程序,分別對全波長和特征波長下的5種玉米訓(xùn)練集及其對應(yīng)的測試集進(jìn)行分析。其FDA的相關(guān)應(yīng)用參見文獻(xiàn)[1]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 霉變玉米的光譜特征

        由圖1可知,培育0,2,4 d的發(fā)霉玉米,隨著培育時間的延長,平均光譜反射值逐漸降低;培育6,8 d時,平均光譜反射值沒有降低反而變的更高了,可能是與霉變玉米中的某些霉變產(chǎn)物有關(guān)??傮w來看,不同等級霉變玉米的平均光譜曲線總體變化規(guī)律具有相似性和可分性,這為建立Fisher判別模型提供了一定的基礎(chǔ)。

        2.2 原始光譜預(yù)處理

        隨機(jī)選取175個玉米樣本為訓(xùn)練集,75個樣本為測試集,把原始光譜數(shù)據(jù)和不同預(yù)處理后的光譜數(shù)據(jù),分別作為建立Fisher判別模型的輸入,結(jié)果見表2。由表2可知,經(jīng)過MSC預(yù)處理的光譜FDA判別模型的正確識別率最高,其訓(xùn)練集和測試集的識別率分別為0.977 1,0.973 3;經(jīng)MSC、SNV預(yù)處理后的訓(xùn)練集和測試集識別率均高于原始光譜,因此,選用MSC為原始光譜預(yù)處理方法。

        2.3 特征波長的選取

        由圖2可知,可選出9個特征波長(538.5,583,624.5,649.6,699.1,767.3,759.2,842.7,932.6 nm),這些特征波長能較好地體現(xiàn)出大部分原光譜信息。因此,在建立特征波長下的Fisher判別模型時,選擇這9個波長作為模型的輸入。

        圖1 5種玉米樣本平均光譜反射值曲線Figure 1 The average spectral reflectance curve of five kinds of maize samples

        表2 原始光譜與預(yù)處理光譜的FDA模型比較Table 2 Comparison of FDA model between raw and pretreated spectra

        圖2 偏最小二乘回歸系數(shù)圖Figure 2 Coefficient map of partial least squares regression

        2.4 玉米霉變等級FDA鑒別分析

        2.4.1 全波長下的FDA分析 隨機(jī)選取175個玉米樣本為訓(xùn)練集,75個樣本為測試集,以MSC預(yù)處理后的全波長光譜信息作為Fisher判別模型的輸入,其FDA鑒別結(jié)果見圖3,F(xiàn)DA的鑒別正確率見表3。由圖3(a)可知,全波長下的不同程度霉變玉米大部分能夠區(qū)分開來,但培育2,4 d與培育6,8 d的仍有小部分重疊,F(xiàn)DA測試結(jié)果比較分散。由表3可知,培育2 d的35個玉米樣本,有1個樣本錯分為培育4 d,判別準(zhǔn)確率為97.14%;培育6 d的35個玉米樣本,有1個樣本錯分為培育8 d,判別準(zhǔn)確率為97.14%;而培育8 d有2個樣本錯分為培育6 d,判別準(zhǔn)確率為94.29%。由圖3(b)可知,不同程度霉變玉米大部分也能夠區(qū)分開來,培育2,4 d與培育6,8 d的也有小部分重疊。由表3可知,培育2 d的15個玉米樣本,有1個樣本錯分為培育4 d,判別準(zhǔn)確率為93.33%,培育6 d的15個玉米樣本有1個樣本錯分為培育8 d,判別準(zhǔn)確率為93.33%。全波長下的FDA判別模型訓(xùn)練集和測試集的整體判別準(zhǔn)確率分別為97.71%,97.33%,因此,在鑒別分析中運(yùn)用全波長能較好地鑒別不同等級的霉變玉米。

        2.4.2 特征波長下的FDA分析 為了減少計(jì)算量、提高檢測精度,從1 288個全波長中提取了9個特征波長(538.5,583,624.5,649.6,699.1,767.3,759.2,842.7,932.6 nm)作為Fisher判別模型的輸入,其FDA鑒別結(jié)果見圖4,F(xiàn)DA的鑒別正確率見表4。由圖4可知,特征波長下的不同程度霉變玉米都能夠區(qū)分開來,F(xiàn)DA測試結(jié)果中每個等級也比較聚集。從表4中的訓(xùn)練集和測試集的總體判別結(jié)果分別為100.00%,98.67%??梢缘贸?,建立的特征波長下的判別模型能夠有效地鑒別玉米的霉變程度,與全波長下的FDA鑒別結(jié)果相比,特征波長下的鑒別能力明顯提高,而且特征波長判別模型的變量降到9個,遠(yuǎn)低于全波長下的1 288 個變量,提高了計(jì)算速度。

        3 結(jié)論

        為了提高高光譜鑒別玉米霉變程度的正確率,在提取特征波長的基礎(chǔ)上,分別研究了全波長和特征波長下的Fisher判別模型的判別效果。結(jié)果顯示,在全波長和特征波長下均能有效地鑒別玉米霉變程度,而特征波長的鑒別效果優(yōu)于全波長的,鑒別正確率可以達(dá)到98.67%。表明基于特征選擇及Fisher判別的高光譜鑒別玉米霉變程度是可行、有效的;而且進(jìn)行特征波長的提取也是必要的,可減少計(jì)算量、提高檢測精度及減少信息的冗余現(xiàn)象。該研究也為高光譜鑒別其他物品提供重要的理論依據(jù)。

        圖3 基于全波長下的FDA結(jié)果Figure 3 FDA results based on the full wavelengths

        表3 全波長下的Fisher判別模型判別準(zhǔn)確率Table 3 accuracy of Fisher discriminant model under full wavelength

        圖4 基于特征波長下的FDA結(jié)果Figure 4 FDA results based on the characteristic wavelengths

        表4 特征波長下的Fisher判別模型判別準(zhǔn)確率Table 4 The accuracy of Fisher discriminant model under characteristic wavelength

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