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        一株巨菌草內(nèi)生細(xì)菌的鑒定及其促生特性初步分析

        2018-05-28 06:09:47劉玉珍鄧振山李征霆陳凱凱魏婷婷
        廣東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年3期
        關(guān)鍵詞:鐵載體溶磷菌草

        劉玉珍,鄧振山,高 飛,李 靜,李征霆,陳凱凱,魏婷婷

        (延安大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,陜西 延安 716000)

        植物內(nèi)生菌是細(xì)菌或真菌定植在健康植物組織,屬于植物細(xì)胞或植物組織之間無明顯癥狀的疾病組織[1-2]。這些內(nèi)生菌可以用它們的生命周期或其一部分入侵寄主植物的活組織而對(duì)被剝奪的植物不產(chǎn)生任何傷害,有時(shí)造成隱性感染和無癥狀[3]。值得一提的是,現(xiàn)存的大量植物物種是多數(shù)內(nèi)生菌的宿主,但對(duì)這些植物的內(nèi)生微生物尚未深入研究[4-5]。在與植物共生中,這些細(xì)菌是通過不同的途徑包括激素的產(chǎn)生、磷酸鹽等無機(jī)礦物的溶磷作用、大氣中氮的固定和鐵載體的產(chǎn)生來刺激植物生長[6-7]。植物內(nèi)生菌的生物學(xué)特性,可發(fā)揮定殖于植物體內(nèi)生細(xì)菌的促生和防病作用,為植物提供有效營養(yǎng),促進(jìn)植物生長[8-9]。近年來關(guān)于有多種生物學(xué)特性內(nèi)生菌的報(bào)道陸續(xù)出現(xiàn)。姚玉玲等[10]從矮生嵩草體內(nèi)分離到1株具有多種生物學(xué)特性的植物內(nèi)生菌;姜云[11]等研究了1株人參內(nèi)生菌的多種生物學(xué)特性。目前關(guān)于促生細(xì)菌的報(bào)道較多,但因其在實(shí)際應(yīng)用中存在諸多問題如應(yīng)用效果不穩(wěn)定、易受土著微生物的影響、難以在土壤中成功定殖等,分離篩選植物內(nèi)生促生細(xì)菌并加以應(yīng)用已成為新的研究方向。

        巨菌草(Pennisetumsp.)是指營養(yǎng)適合食用菌、藥用菌等微生物生長需要,太陽能利用率高,適應(yīng)性強(qiáng),具有某些優(yōu)良特性,可作為食用菌、藥用菌等微生物培養(yǎng)基并有綜合開發(fā)利用價(jià)值的草本植物[12-13]。目前對(duì)于巨菌草內(nèi)生促生細(xì)菌的研究鮮見報(bào)道。本試驗(yàn)以巨菌草為研究對(duì)象,從中篩選具有促生作用的內(nèi)生菌,研究測(cè)定其抑菌效果、固氮、溶磷、產(chǎn)鐵載體和分泌IAA的能力,通過16S rDNA鑒定該菌株的分類地位,以期為植物內(nèi)生促生菌的開發(fā)和利用提供依據(jù),也為巨菌草微生物菌肥的開發(fā)與應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 樣品采集 2016年5月在陜西延安溫家溝巨菌草基地(35°31′55″N,109°31′22″E)采集完整巨菌草植株體,用無菌袋包裝帶回實(shí)驗(yàn)室。延安屬高原大陸性季風(fēng)氣候,平均海拔1000 m左右,年日照2818 h,年均無霜期170 d,平均氣溫9.2℃,年均降水量500 mm,土壤的物質(zhì)組成主要以黃土為主。

        1.1.2 主要試劑和儀器 PCR所用試劑均購自上海生工生物工程有限公司,其他化學(xué)試劑均為國產(chǎn)分析純。所用儀器包括UV-1780紫外可見分光光度計(jì)(蘇州島津儀器有限公司),HC-3614R高速冷凍離心機(jī)(安徽中科中佳科學(xué)儀器有限公司),HNZ-2-2F垂直流形超凈工作臺(tái)(南通滬南科學(xué)儀器有限公司),LS-75L型立式壓力蒸汽滅菌器(江陰濱江醫(yī)療設(shè)備廠),電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱(上海躍進(jìn)醫(yī)療器械廠),LRH-250F生化培養(yǎng)箱(上海一恒科學(xué)儀器有限公司),F(xiàn)LY-2102恒溫振蕩器(上海風(fēng)棱實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司)。

        1.1.3 培養(yǎng)基與染液 PDA培養(yǎng)基、牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基、察氏培養(yǎng)基、水瓊脂培養(yǎng)基(瓊脂15~20 g,蒸餾水1000 mL,pH自然)、高氏I號(hào)培養(yǎng)基、NBRIP培養(yǎng)基、Ashby培養(yǎng)基。

        100 mL CAS檢測(cè)固體培養(yǎng)基:20%蔗糖溶液1 mL,10%酸水解酪蛋白3 mL,1 mmol/L CaCl2100 μL,0.1 mol/L 磷酸鹽緩沖液(pH 6.8)0.5 mL,CAS染液5 mL,瓊脂粉1.8 g;CAS染液:稱取0.012 g CAS溶解于10 mL去離子水中,并與2 mL 1 mmol/L FeCl3混合,得a液;取0.015 g CTAB溶于8 mL去離子水中,得b液;a液與b液混合即得CAS染液。0.1 mol/L 磷酸鹽緩沖液(pH=6.8)100 mL:NaH2PO4·2H2O 0.5905 g,Na2HPO4·12H2O 2.427 g,NH4Cl 0.250 g,KH2PO4·3H2O 0.075 g,NaCl 0.125 g。

        Salkowski’s試劑:1 mL 0.5 mol/L FeCl3溶解于49 mL 35% HClO4中。鉬銻抗試劑:將125 ml 2.5 mol/L硫酸與37.5 mL鉬酸銨溶液混合,加入75 mL抗壞血酸溶液和12.5 mL酒石酸梯鉀溶液,充分混勾(現(xiàn)用現(xiàn)混)。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 巨菌草內(nèi)生菌的分離、純化 采用組織塊分離法和劃線分離法對(duì)巨菌草植株體中的內(nèi)生菌進(jìn)行篩選,在超凈工作臺(tái)對(duì)材料表面進(jìn)行消毒。選擇新鮮、健康巨菌草根、莖、葉,首先去掉表面的泥土等附著物,然后用自來水沖洗干凈,再用無菌水沖洗1次;于95%酒精中浸泡3~5 min后用無菌水沖洗3~4次,然后轉(zhuǎn)入含有效氯為5%的次氯酸鈉溶液中浸泡3~8 min,無菌水沖洗4~5次,最后用70%乙醇浸泡30 s,無菌水沖洗4~5次,在無菌條件下晾干備用;在無菌狀態(tài)下將材料切成0.2 cm×0.2 cm的小塊,每平板接2~4個(gè)組織,于28℃恒溫靜置培養(yǎng)3~5 d。待培養(yǎng)基中有可見菌落時(shí),挑取周圍菌落移入相應(yīng)培養(yǎng)基純化,并進(jìn)行菌落形態(tài)描述,編號(hào),置于4℃冰箱中備用。將最后一次沖洗的無菌水涂布于培養(yǎng)基上作為對(duì)照,于恒溫靜置培養(yǎng),檢驗(yàn)消毒效果[14-15]。

        1.2.2 產(chǎn)IAA活性菌株的篩選 定性測(cè)定:將待測(cè)菌株接種于加入了色氨酸(1 g/L)的NA液體培養(yǎng)基,28℃ 180 r/min搖床震蕩培養(yǎng)3 d,于4℃ 12000 r/min離心后取100 μL上清液加入96孔板中,加入100 μL Salkowski’s試劑混勻,室溫下避光顯色30 min,然后進(jìn)行觀察。能夠產(chǎn)生IAA的菌株菌懸液上清與Salkowski’s試劑混合會(huì)呈現(xiàn)紅色或者粉紅色,而色氨酸是黃色或者無顏色反應(yīng)。

        定量測(cè)定:制作標(biāo)準(zhǔn)曲線:配置濃度梯度為 0、5、10、20、40、60 mg/L的吲哚乙酸標(biāo)準(zhǔn)溶液。將1 mL各濃度標(biāo)準(zhǔn)溶液加入試管,再加入等體積Salkowski reagent比色液,避光放置30 min,以0 mg/L作空白對(duì)照,用紫外分光光度計(jì)在540 nm檢測(cè)吸光值,吸光值為縱坐標(biāo),IAA濃度為橫坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,據(jù)其得出的回歸方程為Y= 0.0157608X(R2= 0.9945)。之后,對(duì)能產(chǎn)生IAA的各菌株,在恒溫?fù)u床內(nèi)160 r/min 28℃培養(yǎng)48 h,12000 r/min離心10 min得到上清,取上清液2 mL加入2 mL Salkowski reagent比色液,暗處放置0.5 h后在540 nm下測(cè)定吸光值,并根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算菌液中的IAA濃度[16-17]。

        1.2.3 菌株YA-6其他促生特性分析

        (1)溶磷性的測(cè)定。定性測(cè)定:活化篩選出的內(nèi)生細(xì)菌,培養(yǎng)36 h后,將其分別點(diǎn)接于NBRIP平板中心,每處理重復(fù)3次,28℃恒溫暗培養(yǎng)7~10 d,檢查菌落周圍是否有透明溶磷圈出現(xiàn)。出現(xiàn)透明圈,表示該菌株將難溶的磷轉(zhuǎn)化為可溶性憐,記為有溶磷活性,并測(cè)量記錄其溶磷圈大小。

        定量測(cè)定:配置濃度梯度為0、0.1、0.2、0.4、0.6、0.8、1.2、1.6、2.0 mg/L的標(biāo)準(zhǔn)溶液。將150 μL標(biāo)準(zhǔn)液、2550 μL去離子水和300 μL鉬梯抗試劑分別加入試管,混勻放置15 min,用紫外分光光度計(jì)在700 nm檢測(cè)吸光值,吸光值為縱坐標(biāo),磷酸二氫鉀濃度為橫坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,據(jù)其得出的回歸方程為Y= 0.121333X(R2= 0.98356)。將待測(cè)菌株接種于營養(yǎng)肉湯液體培養(yǎng)基中,置于28℃搖床過夜培養(yǎng),取150 μL接種于15 mL NBRIP液體培養(yǎng)基中,3次重復(fù),于28℃搖床振蕩培養(yǎng)10 d后,將培養(yǎng)液12000 r/min離心5 min,上清液用于磷含量測(cè)定。將150 μL上清液,2550 μL去離子水和300 μL鉬梯抗試劑分別加入24孔板中,混勻,15 min后在700 nm波長下測(cè)定吸光值,并根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算菌液中的磷濃度[18-19]。

        (2)潛在固氮能力檢測(cè)。將待測(cè)菌株接種到NA液體培養(yǎng)基,28℃ 180 r/min搖床震蕩培養(yǎng)36 h 后,以100 μL/5 mL接種到Ashby液體培養(yǎng)基中,對(duì)照接種無菌水,每個(gè)處理3次重復(fù),28℃靜置培養(yǎng),7 d后對(duì)比接菌與對(duì)照的渾濁情況,明顯渾濁為陽性,即為有固氮活性。同時(shí)將培養(yǎng)36 h的菌株在Ashby固體培養(yǎng)基上劃線培養(yǎng),28℃暗培養(yǎng),連續(xù)繼代3次,每次培養(yǎng)7 d,第3次仍有明顯活性的菌株,記為具有固氮活性[20-21]。

        (3)產(chǎn)鐵載體能力的測(cè)定。菌種接種于CAS液體培養(yǎng)基中,28℃、160 r/min恒溫培養(yǎng)2~3 d,觀察培養(yǎng)基顏色變化。顏色由藍(lán)色變?yōu)榉奂t色,說明具有產(chǎn)鐵載體的能力,反之,則無產(chǎn)鐵載體的能力[22-23]。

        (4)抑制病原真菌活性試驗(yàn)。采用平板對(duì)峙法測(cè)定其抑菌活性。選取番茄枯萎病菌、黃瓜枯萎病菌、玉米大斑病菌作為指示菌,并于PDA培養(yǎng)基上活化。用0.5 cm打孔器在菌落邊緣打成菌餅,用接種環(huán)挑取1塊病原菌菌餅置于PDA平板中央,在距離病原菌菌餅2.5 cm處的3個(gè)點(diǎn)對(duì)稱接種待測(cè)內(nèi)生細(xì)菌菌株,以僅接種病原菌的處理為對(duì)照,每個(gè)處理3重復(fù),28℃下培養(yǎng),觀察菌落的生長變化,直至指示菌的菌絲在對(duì)照平板上鋪滿培養(yǎng)基整個(gè)表面,以抑菌圈大小判斷抑菌作用。記錄、測(cè)定抑菌圈大小[24-25]。

        1.2.4 菌株YA-6的鑒定 將純化后的菌株YA-6接種于牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,置28℃恒溫箱中培養(yǎng)2 d后,觀察并描述菌落的形態(tài)特征,對(duì)菌體進(jìn)行革蘭氏染色。

        利用CTAB法提取菌株YA-6的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增引物、反應(yīng)體系及擴(kuò)增程序參見文獻(xiàn)[26-27]。具有特異性條帶的擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海生工公司測(cè)序,將測(cè)得的序列與GenBank中的相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行Blast相似性分析。然后用Mega 5.0的鄰接法(Neighbor-Joining)建立16S rDNA基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析菌株的系統(tǒng)發(fā)育學(xué)特征,獲得GenBank登錄號(hào)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 巨菌草內(nèi)生菌的分離

        采用多種培養(yǎng)基對(duì)巨菌草植株體進(jìn)行內(nèi)生細(xì)菌分離,得到86株內(nèi)生細(xì)菌,其中從葉中分離到34株,占分離總菌數(shù)的39.53%,從根中分離到28株,占分離總菌數(shù)的32.56%,從莖中分離到24株,占分離總菌數(shù)的27.91%。試驗(yàn)表明,巨菌草植株體內(nèi)存在豐富的內(nèi)生細(xì)菌。

        2.2 產(chǎn)IAA菌株的篩選

        從86株內(nèi)生菌中篩選到8株產(chǎn)IAA能力較好的菌株,其中YA-6產(chǎn)IAA能力最強(qiáng),顯色液反應(yīng)后呈現(xiàn)紅色,質(zhì)量濃度達(dá)到11.73 mg/L。

        2.3 菌株YA-6其他促生潛能的分析

        Ashby培養(yǎng)試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),菌株YA-6可以在Ashby培養(yǎng)基上正常生長,說明其具有潛在的固氮能力;溶解無機(jī)磷平板培養(yǎng)試驗(yàn)?zāi)芸吹矫黠@的溶磷圈,說明其具有溶磷能力,鉬銻抗比色法測(cè)得其溶磷活性為7.103 mg/L;鐵載體試驗(yàn)顯色液反應(yīng)為粉紅色,說明菌株具有產(chǎn)生鐵載體的能力;但菌株YA-6不具有抑制病原菌的活性(圖1,封三)。

        2.4 菌株YA-6的鑒定

        2.4.1 形態(tài)特征觀察 菌株YA-6在牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基上形成的菌落呈淡黃色,不透明,不粘稠,邊緣整齊;通過光學(xué)顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)菌體呈桿狀,革蘭氏染色呈陽性。

        2.4.2 分子鑒定 菌株YA-6的16S rDNA序列(登錄號(hào):KY852302)與GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行Blast比對(duì)分析,與其同源性較高的菌株均屬于假單胞菌屬,其中與Pseudomonas hunanensis同源性最高(99.36%),通過構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹也可以看出,菌株YA-6與Pseudomonas hunanensis聚于同一分支(圖2)。

        圖2 菌株YA-616S rRNA基因片段序列系統(tǒng)發(fā)育分析

        3 結(jié)論與討論

        本試驗(yàn)經(jīng)分離、篩選得到86株巨菌草內(nèi)生細(xì)菌,從86株巨菌草內(nèi)生細(xì)菌中,篩選出8株具有產(chǎn)IAA能力的活性菌株,僅占9.30%。其中菌株YA-6產(chǎn)IAA能力最強(qiáng),質(zhì)量濃度達(dá)到11.73 mg/L,與姜云等[11]的報(bào)道基本一致,表現(xiàn)極高的產(chǎn)IAA能力。菌株YA-6在NBRIP固體培養(yǎng)基上能夠形成明顯的溶磷圈,采用定量測(cè)定溶磷能力達(dá)7.103 mg/L,表明其對(duì)無機(jī)磷具有溶解能力,但低于姚玉玲等[10]的研究結(jié)果。測(cè)定菌株YA-6溶磷能力時(shí)發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)液的PH較空白培養(yǎng)液 pH值有所降低,可推測(cè)產(chǎn)生有機(jī)酸是菌株YA-6溶磷的一種方式,但具體的溶磷機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。菌株YA-6能夠使CAS液體培養(yǎng)基由藍(lán)色變?yōu)榉奂t色,說明其具有產(chǎn)生鐵載體的能力。菌株YA-6經(jīng)無氮培養(yǎng)基定性測(cè)定呈陽性,說明其具有固氮能力,對(duì)宿主巨菌草的環(huán)境適應(yīng)性及生長方面具有一定利用價(jià)值。經(jīng)生理生化、分子鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析,初步鑒定YA-6為假單胞菌屬。

        植物內(nèi)生細(xì)菌對(duì)植物生長無害,不僅可以顯示植物生長的潛力,而且有利于植物增強(qiáng)共生環(huán)境,可能通過IAA的產(chǎn)生、固氮、磷酸鹽溶解和鐵載體的產(chǎn)生來影響植物的生長[28-29]。植物內(nèi)生細(xì)菌因其具有多種有益生物學(xué)作用,已成為國內(nèi)外研究的熱點(diǎn)。許多過去的研究表明[30-31],促進(jìn)不同植物生長的細(xì)菌能產(chǎn)生IAA,植物根部含有色氨酸,可被植物內(nèi)生細(xì)菌作為生產(chǎn)IAA的前體,因此,IAA量化被認(rèn)為是描述植物內(nèi)生促生細(xì)菌的共同特征。磷,是一種限制植物生長的營養(yǎng)物質(zhì),但由于固定機(jī)制,植物通常無法獲得。植物通過酸化、螯合、交換反應(yīng)和有機(jī)酸產(chǎn)生的過程中,溶磷菌可以改變不溶性磷酸鹽成可溶性形式;植物內(nèi)生細(xì)菌最重要的一個(gè)磷酸溶解機(jī)制是低分子量有機(jī)酸的產(chǎn)生導(dǎo)致土壤的酸化[32-33]。植物內(nèi)生固氮菌是定殖于植物體內(nèi)與宿主植物進(jìn)行聯(lián)合固氮的一類微生物,不但具有固氮作用還有生物防治促進(jìn)植物生長的作用。20世紀(jì)80年代以來,內(nèi)生固氮菌由于在禾本科作物上具有固氮活性,又能促進(jìn)植物生長,成為國內(nèi)外研究的熱點(diǎn)[34-35]。內(nèi)生菌能產(chǎn)鐵載體對(duì)植物來說是有利的,因?yàn)樗峭ㄟ^抑制植物病原體來促進(jìn)植物生長的機(jī)制之一;鐵載體有能力從染料復(fù)合體中帶走鐵,從而導(dǎo)致顏色由藍(lán)色變?yōu)槌赛S色[36]。

        菌株YA-6經(jīng)16S rDNA測(cè)序,屬于假單胞菌屬,具有多種促生潛能,有望開發(fā)為促生菌株,該試驗(yàn)還需要進(jìn)一步的研究。關(guān)于假單胞菌在促生長方面的研究和報(bào)道已有很多,該屬菌株具有一定溶磷特性,能促進(jìn)植物對(duì)磷元素的利用,還能將硝酸鹽還原為亞硝酸鹽,對(duì)污水和土壤污染治理效果明顯[37]。巨菌草內(nèi)生菌YA-5具有分泌IAA、溶磷、固氮和產(chǎn)鐵載體等生物學(xué)功能,為進(jìn)一步開發(fā)和利用植物的內(nèi)生促生菌提供了依據(jù),也為開發(fā)經(jīng)濟(jì)環(huán)保的生物菌肥提供菌種資源。

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