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        eDNA,搜索瀕危動(dòng)物的大偵探

        2018-05-23 07:13:34陸新
        環(huán)球人物 2018年10期
        關(guān)鍵詞:龜鱉復(fù)性單鏈

        陸新

        前不久,生物學(xué)家的朋友圈被一只龜刷屏了,確切來(lái)說(shuō),是一只鱉。4月,國(guó)際龜鱉生存聯(lián)盟在官網(wǎng)宣布:美國(guó)華盛頓州立大學(xué)的科學(xué)家通過(guò)檢測(cè)eDNA,在越南春慶湖發(fā)現(xiàn)極瀕危的斑鱉。

        這條新聞?dòng)袃蓚€(gè)關(guān)鍵詞:斑鱉和eDNA。讓我們一一來(lái)做名詞解釋?zhuān)葟陌喵M開(kāi)始。斑鱉是渾身布滿(mǎn)黃斑的橢圓形大鱉,背盤(pán)長(zhǎng)度能超過(guò)1米。體重超過(guò)100公斤,是全世界300多種龜鱉里數(shù)量最少、最瀕危的,沒(méi)有之一。目前全世界發(fā)現(xiàn)了4只活著的斑鱉:中國(guó)兩只,都在蘇州動(dòng)物園;越南兩只,分別在同莫湖和春慶湖。

        中國(guó)人很早就認(rèn)識(shí)了斑鱉。最著名的就是“黿鼉?yōu)榱弧钡牡涔省髡f(shuō)周穆王出師東征,到了九江,下令大肆捕殺黿、鼉,用以填河架橋,渡江伐越。這里的黿,就是斑鱉。半個(gè)世紀(jì)前,人們還能在江蘇、云南等地捕到不少斑鱉。但隨著過(guò)度捕捉和環(huán)境惡化,進(jìn)入新世紀(jì)后,國(guó)內(nèi)再也沒(méi)有野生斑鱉的消息,最終只剩下蘇州動(dòng)物園的兩只。

        然而,科學(xué)家并沒(méi)有停下尋找斑鱉的腳步。所以這次,他們運(yùn)用了動(dòng)物保育領(lǐng)域如今最熱門(mén)的技術(shù)——eDNA。eDNA,全名environmental DNA,翻譯過(guò)來(lái)叫作環(huán)境DNA,是指在環(huán)境樣品中所有被發(fā)現(xiàn)的不同生物的基因組DNA的混合。講通俗點(diǎn)。就是科學(xué)家通過(guò)對(duì)土壤、沉積物、排泄物、空氣、水體等樣品進(jìn)行研究。提取樣品中的各種DNA,分析這些DNA分別屬于哪些物種……也就是說(shuō),只要一壞土。我們就能知道哪些動(dòng)物曾走過(guò)。這項(xiàng)技術(shù)提出于1987年。1990年第一次使用于微生物調(diào)查,2008年第一次用于檢測(cè)淡水中的物種。

        eDNA并不是什么高深的學(xué)問(wèn),它的主要基礎(chǔ)技術(shù)就是我們高中學(xué)過(guò)的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)。實(shí)驗(yàn)證明,DNA在高溫時(shí)可以發(fā)生變性解鏈,雙鏈變成單鏈;溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈??茖W(xué)家就通過(guò)溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,加入設(shè)計(jì)引物(即引子,是一小段單鏈DNA或核糖核酸,為DNA復(fù)制的起始點(diǎn))和特定的酶,讓微量DNA在生物體外大幅復(fù)制、增加。所以。無(wú)論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前兇殺案中兇手所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點(diǎn)的DNA,就能用PCR加以放大,進(jìn)行比對(duì)??梢哉f(shuō),現(xiàn)代生物研究、刑偵調(diào)查中,PCR功不可沒(méi)。1993年,其發(fā)明者穆利斯因此獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。

        不過(guò)。生物殘骸上的DNA信息畢竟比較集中,若是一杯水,里面的DNA信息就變得復(fù)雜、分散,光靠PCR技術(shù)誤差很大。所以,在eDNA研究中,科學(xué)家通過(guò)熒光標(biāo)記的方式定量觀察需要的DNA。比如,我們?cè)跇颖局袚饺霑?huì)與斑鱉DNA反應(yīng)發(fā)光的物質(zhì)。若在PCR過(guò)程中發(fā)現(xiàn)熒光。就可以確認(rèn)物種存在了。這種方式叫作實(shí)時(shí)熒光定量PCR,簡(jiǎn)稱(chēng)qPCR。

        事實(shí)上。這些技術(shù)的操作遠(yuǎn)比我們說(shuō)得復(fù)雜??茖W(xué)家們對(duì)eDNA的探索就像草原上找米粒一樣,工作量和難度都難以想象。但無(wú)論如何,eDNA依然是搜索稀有物種最有效的方法之一。中國(guó)科學(xué)家正準(zhǔn)備利用這個(gè)技術(shù)在云南紅河調(diào)查,希望能找到第五只珍貴的斑鱉。

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