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        基于OpenMP并行計(jì)算的匹配追蹤時(shí)頻分析方法

        2018-05-23 05:33:03鄧世廣王淑艷趙文津劉志偉中國(guó)地震臺(tái)網(wǎng)中心北京100045中國(guó)地質(zhì)科學(xué)院北京100037中電科海洋信息技術(shù)研究院有限公司北京100041中國(guó)石油勘探開發(fā)研究院西北分院甘肅蘭州730020
        石油地球物理勘探 2018年3期
        關(guān)鍵詞:并行算法子波時(shí)頻

        鄧世廣 王淑艷 趙文津 劉志偉 何 潤(rùn)(①中國(guó)地震臺(tái)網(wǎng)中心,北京 100045; 中國(guó)地質(zhì)科學(xué)院,北京 100037; 中電科海洋信息技術(shù)研究院有限公司,北京 100041; 中國(guó)石油勘探開發(fā)研究院西北分院,甘肅蘭州 730020)

        1 引言

        匹配追蹤算法由Mallat等[1]率先提出,其本質(zhì)是對(duì)信號(hào)做稀疏分解。與其他時(shí)頻方法相比,匹配追蹤方法具有更高的時(shí)頻分辨率[2],目前在油氣檢測(cè)、薄層識(shí)別以及噪聲壓制等方面有著廣泛應(yīng)用[3-8]。鑒于傳統(tǒng)的匹配追蹤貪婪迭代算法計(jì)算量過(guò)大,Liu等[9,10]先后提出了基于Ricker子波和Morlet子波庫(kù)的匹配追蹤算法,通過(guò)Hilbert變換求取地震信號(hào)的瞬時(shí)屬性(振幅、相位、頻率),再引入匹配追蹤算法,顯著提高了計(jì)算效率。張繁昌等[11,12]分別運(yùn)用雙參數(shù)快速匹配追蹤算法、動(dòng)態(tài)最優(yōu)搜索和時(shí)頻原子正交變換方法,均不同程度地提高了計(jì)算效率。邵君[13]對(duì)基于匹配追蹤的信號(hào)稀疏分解算法進(jìn)行了研究?;贚iu等[9,10]的成果,Wang[14]通過(guò)引入控制Morlet小波的尺度參數(shù),提出了三步法匹配追蹤算法,提高了算法的效率。范興利等[2]探討了以Morlet小波作為時(shí)頻原子的匹配追蹤算法中尺度因子對(duì)信號(hào)與時(shí)頻原子匹配特征的控制作用。

        隨著計(jì)算機(jī)硬件的快速發(fā)展,配備多核處理器的計(jì)算機(jī)已十分普遍,而以往的匹配追蹤算法基本都是串行執(zhí)行,未能發(fā)揮多核處理器的計(jì)算優(yōu)勢(shì)。OpenMP(Open Multi-Processing)采用共享內(nèi)存的編程模式,方便各個(gè)線程對(duì)數(shù)據(jù)的讀取與調(diào)用,可充分發(fā)揮多核處理器的性能[15]。通過(guò)可并行性分析,本文認(rèn)為匹配追蹤時(shí)頻分析算法適合并行運(yùn)算,并基于OpenMP實(shí)現(xiàn)了以Morlet小波作為時(shí)頻原子的匹配追蹤算法的并行運(yùn)算,另外對(duì)計(jì)算多個(gè)Morlet子波的平滑偽Wigner-Ville分布(SPWVD)的過(guò)程也采用并行運(yùn)算。實(shí)際數(shù)據(jù)的計(jì)算結(jié)果表明,基于OpenMP并行計(jì)算的匹配追蹤時(shí)頻分析方法在保持計(jì)算精度的前提下能充分發(fā)揮多核處理器的性能,有效提高計(jì)算效率。

        2 匹配追蹤時(shí)頻分析原理

        2.1 匹配追蹤算法思想

        匹配追蹤算法是將信號(hào)投影到一系列時(shí)頻原子之上,通過(guò)這些時(shí)頻原子的線性組合精確表示復(fù)雜原始信號(hào)。這里所謂的時(shí)頻原子在實(shí)現(xiàn)過(guò)程中可具體化為由頻率、相位、時(shí)間延遲、尺度等參數(shù)確定的小波,在地震信號(hào)處理中Ricker 小波和Morlet 小波是兩種常用時(shí)頻原子形式[2]。

        匹配追蹤算法思想以數(shù)學(xué)的形式可表示為:設(shè)H表示希爾伯特空間,定義H中的一個(gè)時(shí)頻原子庫(kù)D,gγ∈D為時(shí)頻原子庫(kù)中的一個(gè)時(shí)頻原子,原子庫(kù)中的每個(gè)原子都應(yīng)該是歸一化的,即滿足‖gγ‖=1。之后,從原子庫(kù)中選擇與信號(hào)f(f∈H)最佳匹配的原子gγ 0,這時(shí)信號(hào)f就可表示為

        (1)

        (2)

        (3)

        按此過(guò)程不斷迭代分解,直到殘差能量小于所設(shè)閾值,這樣信號(hào)f最終被分解為

        (4)

        將信號(hào)和時(shí)頻原子抽象表示為高維空間中的矢量,則匹配追蹤的算法思想可由圖1表示[2,16]。

        圖1 匹配追蹤示意圖

        2.2 基于Morlet子波的匹配追蹤算法

        Morlet等[17]提出的Morlet子波在時(shí)間域的表達(dá)式為

        exp{i[ωm(t-u)+φ]}

        (5)

        式中:ωm是子波的中心(角)頻率;u是時(shí)間延遲;σ是尺度參數(shù);φ是相位參數(shù)。通過(guò)這4個(gè)參數(shù)可以確定唯一的Morlet子波?;贛orlet子波的匹配追蹤算法是一個(gè)迭代計(jì)算的過(guò)程,每次迭代都會(huì)估算出一個(gè)最佳匹配的子波mn,其中n是迭代次數(shù)。經(jīng)過(guò)N次迭代,一個(gè)地震信號(hào)f(t)可表示為N個(gè)Morlet子波的線性組合

        (6)

        第一步,首先通過(guò)復(fù)地震道分析技術(shù)估算Morlet子波的三個(gè)參數(shù)(un,ωn,φn)。對(duì)于一個(gè)實(shí)際的地震道,可通過(guò)Hilbert變換獲得其復(fù)地震道,并以此進(jìn)一步計(jì)算得到復(fù)地震道屬性[18]。以復(fù)地震道最大包絡(luò)處的時(shí)間為子波的時(shí)間延遲參數(shù)un,瞬時(shí)頻率作為中心頻率ωn,瞬時(shí)相位作為相位參數(shù)φn。然后利用下式搜尋尺度參數(shù)σn

        (7)

        第二步,利用式(7)進(jìn)一步優(yōu)選四個(gè)參數(shù)。圍繞某一參數(shù)ξ的搜索范圍是[ξ-Δξ,ξ+Δξ],其中Δu是時(shí)間采樣間隔、Δσ是尺度參數(shù)σ的采樣間隔、Δω是頻率采樣間隔、Δφ為5°。值得注意的是該參數(shù)優(yōu)選的過(guò)程需大量的運(yùn)算。

        第三步,通過(guò)下式計(jì)算最佳匹配子波mγn的振幅

        (8)

        (9)

        經(jīng)過(guò)N次迭代之后的殘差R(N)可認(rèn)為是數(shù)據(jù)中的噪聲。

        2.3 Morlet子波的平滑偽Wigner-Ville分布

        通過(guò)短時(shí)傅里葉變換得到地震信號(hào)的時(shí)頻分布是目前常用的時(shí)頻分析方法,但通過(guò)短時(shí)傅里葉變換方法分析信號(hào)時(shí)頻特性時(shí)無(wú)法同時(shí)滿足較高的時(shí)間分辨率與頻率分辨率[19]。Wigner-Ville分布無(wú)需選取窗函數(shù),避免了線性時(shí)頻表示中時(shí)間分辨率與頻率分辨率的相互矛盾,因而具有更好的時(shí)頻分辨率。對(duì)于地震信號(hào)s(t)的Wigner-Ville分布可以寫成

        (10)

        式中:t是時(shí)移[20]。但當(dāng)信號(hào)s(t)=s1(t)+s2(t)時(shí),根據(jù)式(10),其Wigner-Ville分布可寫為

        (11)

        可進(jìn)一步簡(jiǎn)寫為

        Ws(t,ω)=Ws1(t,ω)+Ws2(t,ω)+

        2Re[Ws1,s2(t,ω)]

        (12)

        式中: Re[Ws1,s2(t,ω)]為交叉項(xiàng);Ws1(t,ω)和Ws2(t,ω)分別是信號(hào)s1(t)和s2(t)的Wigner-Ville分布,稱為自相關(guān)項(xiàng)。多分量復(fù)雜信號(hào)的Wigner-Ville分布中交叉項(xiàng)的存在會(huì)嚴(yán)重影響信號(hào)的時(shí)頻分布(圖2)。為了抑制交叉項(xiàng)干擾,人們提出平滑偽Wigner-Ville分布(SPWVD)[21],即對(duì)WVD分別增加時(shí)域和頻域窗函數(shù)g(u)和h(τ),其表達(dá)式為

        式中g(shù)(u)和h(τ)是兩個(gè)實(shí)對(duì)稱窗函數(shù),且h(0)=g(0)=1??赏ㄟ^(guò)選擇窗函數(shù)g(u)和h(τ)來(lái)控制時(shí)域和頻域的平滑尺度。

        圖2 Wigner-Ville 分布的交叉項(xiàng)干擾

        基于匹配追蹤的時(shí)頻分析的思路及流程(圖3)是: ①通過(guò)匹配追蹤將復(fù)雜信號(hào)分解為多個(gè)Morlet子波; ②計(jì)算各個(gè)子波的平滑偽Wigner-Ville分布[22]; ③疊加各子波的時(shí)頻分布得到原信號(hào)的時(shí)頻分布。這樣就能保證多分量復(fù)雜信號(hào)s(t)的時(shí)頻譜在具有較高時(shí)頻分辨率的同時(shí)又有效避免了交叉項(xiàng)的干擾。 圖4顯示了對(duì)地震信號(hào)(圖4a)進(jìn)行匹配追蹤運(yùn)算得到了一系列的Morlet子波(圖4b)。如果直接計(jì)算該地震信號(hào)的平滑偽Wigner-Ville分布,其結(jié)果受到了嚴(yán)重的交叉項(xiàng)干擾,已經(jīng)難以識(shí)別信號(hào)在不同時(shí)刻對(duì)應(yīng)的頻率分布(圖4c)。采用基于匹配追蹤的時(shí)頻分析方法,分別計(jì)算分解得到的Morlet子波的平滑偽Wigner-Ville分布,然后疊合得到整個(gè)信號(hào)的時(shí)頻分布,這樣有效避免了交叉項(xiàng)的干擾,信號(hào)對(duì)應(yīng)的時(shí)頻特征十分清晰(圖4d)。

        圖3 基于匹配追蹤的時(shí)頻分析方法的計(jì)算流程

        圖4 基于匹配追蹤的平滑偽Wigner-Ville分布計(jì)算結(jié)果(a)地震信號(hào); (b)匹配追蹤分解得到的Morlet子波; (c)直接計(jì)算的平滑偽Wigner-Ville分布; (d)基于匹配追蹤計(jì)算的Wigner-Ville分布

        3 基于OpenMP的并行實(shí)現(xiàn)與分析

        隨著計(jì)算機(jī)硬件的迅速發(fā)展,配置多核處理器的計(jì)算機(jī)已越來(lái)越普遍。在多核處理器的硬件基礎(chǔ)上,以共享物理內(nèi)存的形式的并行運(yùn)算得到了快速發(fā)展。OpenMP以一種面向共享存儲(chǔ)的并行程序標(biāo)準(zhǔn)于1997年正式發(fā)表,之后又陸續(xù)發(fā)表了面向Fortran、C/C++的四個(gè)標(biāo)準(zhǔn)。經(jīng)過(guò)幾年的推廣,OpenMP已成為關(guān)于共享存儲(chǔ)并行計(jì)算的新的工業(yè)標(biāo)準(zhǔn),目前在中小型的共享存儲(chǔ)并行系統(tǒng)上得到了廣泛應(yīng)用[23]。

        Fork-Join類型的OpenMP程序機(jī)構(gòu)是最基本的OpenMP程序方式,也是應(yīng)用最廣泛的一種OpenMP程序形式[23]。Fork-Join(分叉—連接)模式的含義是:當(dāng)程序開始時(shí),由主線程執(zhí)行程序的串行部分,在接到并行任務(wù)時(shí),主線程執(zhí)行Fork操作,派生出其他線程共同完成并行部分,完成后各線程執(zhí)行Join操作,回到主線程執(zhí)行串行部分[23-26](圖5)。通過(guò)這種Fork-Join模式,編譯器可以充分利用多核處理器的優(yōu)勢(shì)完成并行計(jì)算任務(wù)。

        匹配追蹤算法需要龐大的運(yùn)算量,Wang[14]提出的三步法有效提高了匹配追蹤的計(jì)算效率,但所需計(jì)算量依然較大。為提高匹配追蹤算法的計(jì)算效率,首先對(duì)該算法進(jìn)行了可并行性分析,之后利用OpenMP實(shí)現(xiàn)了基于匹配追蹤時(shí)頻分析方法的并行運(yùn)算,從而在多核處理器環(huán)境下有效提高其運(yùn)算效率。

        圖5 Fork-join模式示意圖

        基于匹配追蹤的時(shí)頻分析算法中大量的運(yùn)算主要集中在搜尋最佳匹配子波的過(guò)程以及計(jì)算所有子波平滑偽Wigner-Ville分布的過(guò)程(圖3中灰框所示的步驟)。因此分析這兩個(gè)步驟是否適合并行運(yùn)算。

        3.1 子波尋優(yōu)的并行計(jì)算

        匹配追蹤搜尋最佳匹配子波的過(guò)程本質(zhì)上是一個(gè)多重嵌套循環(huán)過(guò)程,其示意代碼如下

        for (時(shí)間延遲參數(shù))

        {

        for (頻率參數(shù)尋優(yōu)范圍)

        {

        for (相位參數(shù)尋優(yōu)范圍)

        {

        for (尺度參數(shù)尋優(yōu)范圍)

        {

        尋優(yōu)運(yùn)算

        }

        }

        }

        }

        這里的尋優(yōu)運(yùn)算實(shí)際上就是計(jì)算Morlet子波與待分解信號(hào)之間的投影能量,在整個(gè)參數(shù)范圍內(nèi)尋找使投影能量最大的一組參數(shù)。具體來(lái)說(shuō),即:每次循環(huán)都將此次運(yùn)算的投影值與上次循環(huán)計(jì)算的投影值作比較,選取并存儲(chǔ)較大的投影值及其對(duì)應(yīng)參數(shù),下次循環(huán)計(jì)算的投影值將與此次比較出的較大值作比較。最終整個(gè)循環(huán)結(jié)束即可得到參數(shù)范圍內(nèi)的最優(yōu)子波。這種多次嵌套循環(huán)結(jié)構(gòu)的運(yùn)算非常適合進(jìn)行并行運(yùn)算,我們選擇的并行思路是:對(duì)時(shí)間延遲參數(shù)的循環(huán)執(zhí)行并行運(yùn)算,開辟多個(gè)內(nèi)存空間用來(lái)存儲(chǔ)各個(gè)線程計(jì)算的最優(yōu)子波參數(shù),這樣整個(gè)循環(huán)結(jié)束后每個(gè)線程都得到了各自最優(yōu)的子波參數(shù),最后對(duì)比這幾個(gè)子波參數(shù),從中選取最終的最佳匹配子波(圖6)。本質(zhì)上就是把一項(xiàng)工作分成了n份,然后分配給n個(gè)線程同時(shí)處理。通過(guò)這樣的任務(wù)分配充分利用了多核處理器的計(jì)算能力,有效提高了匹配追蹤的尋優(yōu)效率。

        3.2 多子波時(shí)頻分布的并行計(jì)算

        完成匹配追蹤之后,一個(gè)地震信號(hào)會(huì)被分解為多個(gè)Morlet子波,需要計(jì)算每個(gè)子波的平滑偽Wigner-Ville分布,之后將其疊加得到該信號(hào)的時(shí)頻分布。然而,對(duì)于一個(gè)記錄時(shí)間較長(zhǎng)的地震信號(hào),通過(guò)匹配追蹤將會(huì)分解得到龐大數(shù)目的子波,對(duì)所有子波計(jì)算平滑偽Wigner-Ville分布的過(guò)程將會(huì)消耗大量的時(shí)間。此過(guò)程是一個(gè)針對(duì)所有子波的循環(huán)計(jì)算過(guò)程,如果基于串行運(yùn)算,即只有一個(gè)線程執(zhí)行所有的運(yùn)算,那么所有的子波只能按順序依次計(jì)算其時(shí)頻分布。然而,基于OpenMP能夠非常方便地開辟多個(gè)線程同時(shí)計(jì)算多個(gè)Morlet子波的平滑偽Wigner-Ville分布,這將成倍提高該步驟的計(jì)算效率。

        圖6 子波尋優(yōu)并行思路示意圖

        4 實(shí)際資料試算與分析

        為了驗(yàn)證并行算法的性能,選擇了實(shí)際地震資料進(jìn)行試算并對(duì)計(jì)算結(jié)果進(jìn)行分析。試算所用計(jì)算機(jī)的硬件參數(shù)為:Intel(R) Core(TM) i7-4710MQ CPU @ 2.50GHz 4核8線程處理器,8GB內(nèi)存,64位Win7操作系統(tǒng)。為節(jié)省試算時(shí)間,所用的實(shí)際地震數(shù)據(jù)為截取的部分疊后數(shù)據(jù),記錄時(shí)長(zhǎng)為1000ms,采樣點(diǎn)數(shù)為501,采樣間隔為2ms。

        4.1 并行前后計(jì)算結(jié)果對(duì)比

        利用上述地震數(shù)據(jù)進(jìn)行基于匹配追蹤的時(shí)頻分析運(yùn)算。圖7展示的是串行計(jì)算的結(jié)果。在圖7a中,通過(guò)對(duì)比原始地震信號(hào)(黑色)與通過(guò)Morlet子波重構(gòu)的地震信號(hào)(紅色),可見通過(guò)匹配追蹤算法能夠有效地重構(gòu)原始信號(hào),這也證實(shí)了子波分解的有效性; 圖7b為分解得到的Morlet子波; 圖7c為計(jì)算得到的時(shí)頻譜。為了驗(yàn)證并行運(yùn)算與串行計(jì)算的計(jì)算精度,圖8展示了通過(guò)并行運(yùn)算得到的結(jié)果。對(duì)比表明,并行運(yùn)算與串行運(yùn)算的計(jì)算結(jié)果一致。為了進(jìn)一步直觀地展示兩種計(jì)算結(jié)果的一致性, 將兩種計(jì)算結(jié)果做差并繪圖(圖9),從圖中可見,無(wú)論是子波分解結(jié)果(圖9a)還是時(shí)頻譜結(jié)果(圖9b)都并無(wú)差異。

        圖7 串行計(jì)算結(jié)果(a)原始的(黑色)和通過(guò)Morlet子波重構(gòu)的(紅色)地震信號(hào); (b)分解得到的Morlet子波; (c)計(jì)算得到的時(shí)頻譜

        圖8 并行計(jì)算結(jié)果(a)原始的(黑色)和通過(guò)Morlet子波重構(gòu)的(紅色)地震信號(hào); (b)分解得到的Morlet子波; (c)計(jì)算得到的時(shí)頻譜

        圖9 串行與并行計(jì)算結(jié)果差異圖(a)子波; (b)頻譜

        4.2 并行加速性能分析

        為了描述并行程序的性能,一般采用加速比指標(biāo)來(lái)度量[27]。加速比定義為

        式中:n表示并行線程數(shù);t1表示最優(yōu)串行算法的運(yùn)行時(shí)間;tn表示n個(gè)線程并行算法的運(yùn)行時(shí)間。加速比越大,則并行算法加速性能越好。

        統(tǒng)計(jì)所用地震數(shù)據(jù)中某一地震道在不同線程數(shù)的情況下匹配追蹤和平滑偽Wigner-Ville分布各自的時(shí)耗,其中匹配追蹤的子波分解數(shù)目為50,同時(shí)計(jì)算了不同線程數(shù)的加速比(表1)?;贠penMP的并行運(yùn)算可通過(guò)num_threads()函數(shù)設(shè)定并行計(jì)算使用的線程個(gè)數(shù)。在并行加速性能分析過(guò)程中關(guān)閉了所有其他程序,保證CUP占用率穩(wěn)定在3%以內(nèi)以提高分析的準(zhǔn)確性。不過(guò)當(dāng)調(diào)用全部8個(gè)線程進(jìn)行并行計(jì)算時(shí),操作系統(tǒng)占用的約3%的CPU資源還是會(huì)對(duì)并行加速性能有輕微的影響,也就是說(shuō)該算法在8線程并行運(yùn)算時(shí)如果去除掉操作系統(tǒng)的影響還能夠達(dá)到更高的加速比,盡管此時(shí)受到了操作系統(tǒng)的影響,該算法依然體現(xiàn)出了良好的加速性能。圖10顯示了并行算法的加速比曲線,從中可直觀看到,匹配追蹤與SPWVD具有相似的加速比曲線, 且隨著線程數(shù)的增加加速比呈近線性增長(zhǎng)。這表明了該并行算法具有良好的加速性能,在計(jì)算機(jī)硬件條件(可調(diào)用線程數(shù))提升時(shí),并行加速比也會(huì)隨之以線性增長(zhǎng)。

        表1 不同線程數(shù)對(duì)應(yīng)的計(jì)算時(shí)間及加速比

        圖10 不同線程數(shù)的加速比

        為了進(jìn)一步測(cè)試并行算法性能,選擇相同的地震道,計(jì)算所用線程數(shù)固定為8,選擇不同的子波分解數(shù)目進(jìn)行運(yùn)算時(shí)間的統(tǒng)計(jì)并計(jì)算加速比(表2)。圖11展示了在8線程并行運(yùn)算時(shí),不同子波分解數(shù)目時(shí)對(duì)應(yīng)的并行加速比。從該圖可知,在子波分解數(shù)目小于20時(shí),并行運(yùn)算加速比隨著運(yùn)算量的增大加速比也逐漸增大,當(dāng)子波分解數(shù)超過(guò)20后,并行運(yùn)算的加速比達(dá)到飽和,穩(wěn)定在5.5左右。另外可看到,并行計(jì)算Morlet子波的平滑偽Wigner-Ville分布的加速效果相對(duì)匹配追蹤的并行運(yùn)算更加明顯。

        表2 不同子波分解數(shù)對(duì)應(yīng)的計(jì)算時(shí)間及加速比

        圖11 不同子波分解數(shù)時(shí)8線程并行運(yùn)算加速比

        5 結(jié)論

        基于理論分析與試算,認(rèn)為基于匹配追蹤的時(shí)頻分析方法具有可并行性,本文基于OpenMP在多核計(jì)算機(jī)上實(shí)現(xiàn)了該算法的并行運(yùn)算,有效提高了算法的計(jì)算效率,并獲得了與串行算法相同精度的計(jì)算結(jié)果。

        對(duì)并行算法的運(yùn)算時(shí)間統(tǒng)計(jì)分析表明: 本文并行算法具有良好的并行加速性能,匹配追蹤和多子波時(shí)頻譜計(jì)算的并行運(yùn)算都具有近線性的加速比曲線。另外,加速比隨計(jì)算量的增加而增加,意味著計(jì)算量越大,越能充分發(fā)揮并行運(yùn)算的優(yōu)勢(shì),當(dāng)加速比增加到當(dāng)前線程數(shù)所能產(chǎn)生的最大值之后,隨著計(jì)算量的增加,加速比將穩(wěn)定在此峰值附近。

        基于匹配追蹤的時(shí)頻分析方法適用于并行運(yùn)算。為進(jìn)一步提高其運(yùn)算效率,可嘗試在計(jì)算機(jī)集群上實(shí)現(xiàn)MPI+OpenMP混合的并行算法。另外,基于圖形處理器(GPU)的數(shù)值計(jì)算日益發(fā)揮重要作用,探究基于GPU加速的匹配追蹤時(shí)頻分析方法也是有待深入探究的重要課題。

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