羅娟 鄭素梅 高玉人
[摘 要]登革病毒的復(fù)制與宿主細胞膜的重建緊密相關(guān)。病毒和細胞因子產(chǎn)生獨特的類似細胞器的結(jié)構(gòu),被稱為病毒復(fù)制復(fù)合體(viral replication complex),這些病毒誘導(dǎo)的隔間促進了高效基因組復(fù)制,在病毒復(fù)制周期中得以使不同步驟受到精確的時空調(diào)控,并且保護病毒RNA不受宿主細胞質(zhì)環(huán)境影響。綜合運用超微結(jié)構(gòu)解析和功能研究大大增加了我們對病毒復(fù)制復(fù)合體構(gòu)建和生物起源的理解。本文將介紹登革熱病毒復(fù)制復(fù)合體的形態(tài)和形成,闡述其在生物發(fā)生中所取得的進展。
[關(guān)鍵詞]登革病毒;正鏈RNA;復(fù)制復(fù)合體;內(nèi)陷囊泡;膜重建;脂質(zhì)
[中圖分類號]R373.33 [文獻標識碼]A
登革病毒(Dengue virus;DENV)屬于黃病毒科黃病毒屬,包括4個亞型:DENV1-4。它是一種蚊媒病毒,含單股正鏈RNA病毒,有包膜。每年大約有一億人感染DENV,感染者癥狀從輕微的感冒到危及生命的登革出血熱(dengue hemorrhagic fever)和登革休克綜合征(dengue shock syndrome)。登革熱廣泛流行于東南亞、非洲、美洲、地中海中部等地區(qū),近50年來,其發(fā)病率呈逐年上升的趨勢。迄今為止,既無DENV預(yù)防疫苗問市,也沒有針對性的抗病毒治療方案應(yīng)用于臨床。研究病毒基因組復(fù)制的分子機制有助于病毒疫苗以及具有特異性的抗病毒藥物的研發(fā)。
病毒依賴于宿主細胞代謝來擴增病毒基因組和組裝傳染性子代病毒。正鏈RNA病毒的復(fù)制發(fā)生在細胞質(zhì)內(nèi)或病毒誘導(dǎo)的類似細胞器的膜結(jié)構(gòu)表面,這種膜結(jié)構(gòu)可以被稱為病毒復(fù)制復(fù)合體,可以有效地促進病毒復(fù)制。首先,病毒復(fù)制復(fù)合體實現(xiàn)了RNA翻譯、復(fù)制和將病毒基因組組裝成病毒粒子,旦它們之間互不干擾;第二,病毒復(fù)制復(fù)合體可以使病毒復(fù)制酶復(fù)合物的組成成分和復(fù)制需要的代謝物在一個物理空間中保持高濃度;第三,為病毒RNA提供獨立于細胞質(zhì)的環(huán)境是病毒復(fù)制復(fù)合體的另一個進化保守特征。在本綜述中,我們重點介紹病毒復(fù)制復(fù)合體的形態(tài),詳細闡述病毒的膜重建,并討論這些病毒破壞細胞的膜活性蛋白和脂質(zhì)穩(wěn)態(tài)通路在病毒復(fù)制復(fù)合體生物形成中的最新發(fā)現(xiàn)。
1 復(fù)制復(fù)合體的結(jié)構(gòu)
由于登革病毒的體積較小,約17-25nm,病毒學(xué)的研究一直與電子顯微鏡的發(fā)展密切相關(guān)。DENV誘導(dǎo)的復(fù)制復(fù)合體是內(nèi)陷囊泡或球囊類型,是從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)衍生出來的。利用電子斷層攝影技術(shù)對受DENV感染的人類肝癌細胞進行掃描,研究人員發(fā)現(xiàn)進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔內(nèi)的是直徑大約90nm的單膜囊泡而非結(jié)構(gòu)化復(fù)雜膜。這些囊泡通過大約10nm的孔樣通道與細胞質(zhì)相連接。內(nèi)陷囊泡中包含病毒復(fù)制酶和雙鏈RNA(double strand RNA;dsRNA),而結(jié)構(gòu)化復(fù)雜膜不包含dsRNA,但它們富含病毒蛋白,可能在病毒蛋白的合成或儲存中發(fā)揮作用。Junjhon等在DENV感染的蚊子細胞中也觀察到內(nèi)陷囊泡,卻沒有觀察到結(jié)構(gòu)化復(fù)雜膜,這表明結(jié)構(gòu)化復(fù)雜膜在登革復(fù)制周期中可能是一種對人細胞特異的結(jié)構(gòu)。值得注意的是,DENV誘導(dǎo)產(chǎn)生的內(nèi)陷囊泡與西尼羅河病毒(WNV)和蜱傳腦炎病毒(TBEV)誘導(dǎo)的復(fù)制復(fù)合體相類似,這表明黃病毒復(fù)制復(fù)合體在生物起源和結(jié)構(gòu)進化上具有保守性。
2 復(fù)制周期的時空控制
不同生物合成步驟促進病毒復(fù)制周期的時空協(xié)調(diào)。病毒由受體介導(dǎo)進入易感靶細胞,由低PH介導(dǎo)病毒包膜與細胞膜融合,核衣殼釋放進入細胞質(zhì),脫殼后病毒RNA基因組轉(zhuǎn)運至內(nèi)質(zhì)網(wǎng),作為信使RNA合成病毒蛋白。病毒 RNA5端的帽子結(jié)構(gòu)介導(dǎo)帽子依賴性RNA翻譯。根據(jù)病毒多聚蛋白前體的共翻譯和翻譯后加工,膜結(jié)合的病毒因子和細胞因子以協(xié)調(diào)一致的方式誘導(dǎo)膜重排,形成病毒復(fù)制復(fù)合體。病毒的正鏈RNA被復(fù)制成負鏈RNA,負鏈RNA作為模板產(chǎn)生大量新的正鏈RNA,新的正鏈RNA又可以合成多聚蛋白或作為新負鏈RNA復(fù)制的模板或被組裝成病毒粒子。但是RNA翻譯與復(fù)制之間的轉(zhuǎn)換調(diào)節(jié)機制目前還不能確定。一種可能性是將核糖體排除在病毒RNA復(fù)制的位置,另一種可能性是病毒RNA基因組環(huán)化,使翻譯核糖體與病毒復(fù)制酶競爭性結(jié)合。RNA-RNA相互作用或蛋白質(zhì)與病毒基因組末端的相互作用可以遠程介導(dǎo)上述復(fù)制與翻譯的拮抗作用。
3 復(fù)制復(fù)合體的病毒決定因素
病毒通過對膜脂質(zhì)的局部改造或蛋白質(zhì)的非對稱相互作用來構(gòu)建利于其復(fù)制的膜系統(tǒng)。非結(jié)構(gòu)蛋白NS4A和NS4B在DENV 誘導(dǎo)的膜重建中起著重要作用。兩者都有復(fù)雜的膜拓撲結(jié)構(gòu)并包含中心螺旋,局部增加膜表面積,有利于誘導(dǎo)囊泡產(chǎn)生。這一過程可能是由NS4A的寡聚作用或NS4A與NS4B的相互作用維持的。但是,僅有NS4A或NS4B表達誘導(dǎo)產(chǎn)生的膜結(jié)構(gòu)與DENV感染細胞所誘導(dǎo)的膜結(jié)構(gòu)不同,說明還有額外的病毒蛋白參與了復(fù)制復(fù)合體的生成。研究發(fā)現(xiàn)NS1形成二聚體與膜結(jié)合并誘導(dǎo)膜重建,而且可能與NS4A-NS4B復(fù)合體相互作用。具有膜滲透活性的整合膜蛋白NS2A也可能參與了復(fù)制復(fù)合體的誘導(dǎo),但具體機制還有待研究。除了蛋白質(zhì)內(nèi)在的膜活性,病毒還選擇性地影響脂質(zhì)和膜穩(wěn)態(tài)。這些過程包括招募細胞膜形成蛋白,刺激脂質(zhì)體生成,并重組細胞脂質(zhì)傳輸系統(tǒng),具體調(diào)節(jié)病毒復(fù)制復(fù)合體膜成分。
4 膜活性蛋白對復(fù)制復(fù)合體形成的作用
關(guān)于病毒如何聯(lián)合選擇宿主細胞蛋白用于復(fù)制復(fù)合體形成的具體機制目前仍不明確。例如:中間纖維的結(jié)構(gòu)組成部分波形蛋白與DENV非結(jié)構(gòu)蛋白 NS4A相互作用。由NS4A介導(dǎo)的波形蛋白的招募依賴于病毒RNA的有效擴增。肌動蛋白絲的聚合在DENV誘導(dǎo)的膜重建中起著重要的作用(與內(nèi)吞作用密切相關(guān))。但是,膜重建中波形蛋白的作用與肌動蛋白絲的作用是否類似還有待研究。
波形蛋白對復(fù)制復(fù)合體的形成有重要作用,但是缺乏其他相關(guān)細胞因子的信息,目前我們只能從誘導(dǎo)同一類型的復(fù)制復(fù)合體的其他正鏈RNA病毒中推斷其作用。例如雀麥草花葉病毒(BMV),它也在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔的內(nèi)陷囊泡中復(fù)制。這些囊泡的生成需要網(wǎng)狀蛋白。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白包括類似發(fā)夾結(jié)構(gòu)的跨膜區(qū),與高曲率的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)小管的產(chǎn)生和穩(wěn)定有關(guān)。BMV復(fù)制酶蛋白1a(replicase protein 1a)將網(wǎng)狀蛋白招募到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的內(nèi)陷部位,通過部分中和整體負膜曲率或穩(wěn)定正膜曲率促進球形體積的擴增。網(wǎng)狀蛋白或其他細胞膜形成蛋白是否也參與了病毒復(fù)制復(fù)合體的生物形成,這個問題仍有待研究。
5 復(fù)制復(fù)合體形成對脂質(zhì)生成的影響
除了重塑現(xiàn)有的細胞內(nèi)膜,病毒復(fù)制復(fù)合體的生成意味著細胞內(nèi)膜表面的凈增加,因此需要重新合成膜脂質(zhì)。DENV感染細胞的高通量脂質(zhì)分析顯示,病毒誘導(dǎo)的脂質(zhì)成分發(fā)生的明顯變化包括主要脂質(zhì)結(jié)構(gòu)和信號脂類特異性的上調(diào)或下調(diào)。DENV不依賴由甾醇控制的調(diào)控元素結(jié)合蛋白(sterol regulatory element- binding protein;SREBP)介導(dǎo)的脂質(zhì)生成,而是利用細胞內(nèi)儲存的脂質(zhì)。DENV感染會誘發(fā)自噬介導(dǎo)的脂滴分解,從而釋放游離脂肪酸。游離脂肪酸可用作建立病毒復(fù)制復(fù)合體的材料,或作為線粒體β氧化的能量來源。另外,DENV也會破壞脂肪酸合成酶(FAS)來刺激復(fù)制復(fù)合體的產(chǎn)生。FAS是一個大的含有多種酶活性的同質(zhì)二聚體蛋白,用于脂質(zhì)合成和細胞膜形成。非結(jié)構(gòu)蛋白NS3與FAS相互作用,在復(fù)制復(fù)合體建立時招募FAS到病毒復(fù)制酶復(fù)合體上。NS3刺激FAS活性合成脂質(zhì),新合成的脂質(zhì)與病毒RNA共同作用,表明在復(fù)制復(fù)合體形成過程中FAS直接參與膜的擴張。此外,西尼羅河病毒(WNV)也依賴于FAS,說明這種保守的功能在黃病毒復(fù)制復(fù)合體的生物形成中發(fā)揮了作用。
6 結(jié)論與展望
DENV基因組的復(fù)制與病毒復(fù)制復(fù)合體的形成有關(guān),復(fù)制復(fù)合體的形成對病毒復(fù)制周期進行時空調(diào)控,確保RNA高效擴增以及必需的細胞因子保持一定的局部濃度,并保護病毒RNA不受細胞質(zhì)環(huán)境影響。DENV誘導(dǎo)內(nèi)陷囊泡或球囊類型的復(fù)制復(fù)合體,病毒內(nèi)在膜蛋白的固有特性(膜活性區(qū),不對稱的形狀和低聚性),有助于復(fù)制復(fù)合體的形成。DENV利用自噬從脂質(zhì)中調(diào)集脂滴,同時利用脂肪酸合成酶來增加病毒誘導(dǎo)的細胞內(nèi)膜表面積。
盡管先進的電子顯微鏡成像技術(shù)能在形態(tài)學(xué)細節(jié)上描述病毒復(fù)制復(fù)合體,但是它們的生物形成和共同選擇的細胞因子的復(fù)雜相互作用還尚待明確。由于技術(shù)上的局限,復(fù)制復(fù)合體形成的機制并不確定,特別是關(guān)于它們生物形成早期階段的信息是稀缺的。這些限制可以通過相關(guān)的光學(xué)和電子顯微鏡來克服,它們對細胞的分析具有極高的精確度。此外,病毒蛋白和RNA標記策略的技術(shù)應(yīng)用于時間分辨成像,將為轉(zhuǎn)運加工過程和病毒復(fù)制周期中不同的時空調(diào)控提供更詳細的信息。病毒蛋白-固有膜相互作用的分子機制的描述也很少。在原生的膜環(huán)境中測定它們的三維結(jié)構(gòu),使用固態(tài)核磁共振波譜與膜模型體外研究相結(jié)合的策略將提供更深層次的解析。此外,病毒復(fù)制復(fù)合體的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)和脂質(zhì)譜分析,將揭示它們的分子組成,從而擴大我們對與病毒復(fù)制復(fù)合體的生物發(fā)生和功能有關(guān)的宿主因素和途徑的認識。這些方法的綜合應(yīng)用將揭示病毒誘導(dǎo)的膜結(jié)構(gòu),進一步揭示細胞膜內(nèi)穩(wěn)態(tài)的原理,為抗病毒治療提供新的途徑。
[參考文獻]
[1] 李敏,金俠.登革病毒疫苗研究現(xiàn)狀與展望[J].生命的化學(xué),2014(01).
[2] 陳世友,陳茂余,陳堅.登革熱的流行病學(xué)分析及防控效果研究[J].海南醫(yī)學(xué)院學(xué)報,2015(06).
[3] 左向陽.基質(zhì)金屬蛋白酶3-MMP3在抗登革病毒感染中的作用及機制的研究[D].蘇州大學(xué),2014.