南京大學(xué)是中國(guó)大陸高校中最早將SCI的論文收錄和被引用次數(shù)等作為評(píng)價(jià)院系、教授學(xué)者的研究質(zhì)量水平，以及理科博士研究生教育質(zhì)量重要指標(biāo)的學(xué)校之一。這一決策對(duì)南京大學(xué)基礎(chǔ)研究的發(fā)展和學(xué)校聲譽(yù)的提高產(chǎn)生了積極作用，同時(shí)也帶動(dòng)了中國(guó)大陸其他高?；A(chǔ)研究的發(fā)展和質(zhì)量的上升，為中國(guó)的SCI論文數(shù)排名的躍升作出了突出貢獻(xiàn)。而這一評(píng)價(jià)體系被廣泛應(yīng)用，正因龔昌德的“敢為天下先”。1986年，時(shí)任南京大學(xué)物理系系主任的龔昌德率先提倡SCI評(píng)價(jià)體系，認(rèn)為研究成果必須接受國(guó)際學(xué)術(shù)界的檢驗(yàn)，必須得到國(guó)際學(xué)術(shù)界的認(rèn)可。這一提議得到時(shí)任南京大學(xué)校長(zhǎng)曲欽岳的支持。經(jīng)歷一系列波折與推廣后，1992年的南京大學(xué)成為學(xué)術(shù)榜的一匹“黑馬”，并在此后的7年中，實(shí)現(xiàn)“八連冠”，在全國(guó)高校和研究單位范圍內(nèi)掀起“南大風(fēng)”。

年逾古稀之時(shí)，他又來(lái)到蘇州大學(xué)與浙江師范大學(xué)開(kāi)始新的奮斗。經(jīng)龔昌德的悉心支持及一系列改革措施的落實(shí)，兩校的物理學(xué)科均實(shí)現(xiàn)了跨越式的發(fā)展。

龔昌德對(duì)于碩博學(xué)生的培養(yǎng)，講求多樣化與獨(dú)立性。學(xué)生是自由的，但這并不代表漫無(wú)目的的自由，學(xué)生的自由建立在獨(dú)立思考的基礎(chǔ)上。龔昌德并不會(huì)強(qiáng)制學(xué)生一定要研究與自己相符的方向，相反地，他鼓勵(lì)學(xué)生拓展視角、發(fā)散思維，在感興趣的領(lǐng)域發(fā)光發(fā)熱。龔昌德認(rèn)為一個(gè)好的老師，管多管少都不行，掌握好度才是塑才的關(guān)鍵。在晚年，龔昌德還經(jīng)常前往中小學(xué)，為孩子們進(jìn)行科學(xué)普及教育。