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        河南煙草鐮刀菌的分子鑒定及致病性分析

        2018-05-09 19:07:24邱睿白靜科李成軍李淑君李小杰陳玉國(guó)胡亞靜劉東升
        中國(guó)煙草學(xué)報(bào) 2018年2期
        關(guān)鍵詞:煙苗煙區(qū)根腐病

        邱睿,白靜科,李成軍,李淑君,李小杰,陳玉國(guó),胡亞靜,劉東升

        河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所,煙草行業(yè)黃淮煙區(qū)煙草病蟲(chóng)害綠色防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南省許昌市永昌大道與青梅路交叉口 461000

        鐮刀菌(Fusariumspp.)是一類(lèi)世界性分布的真菌,可以侵染多種植物,引起植物的根腐、莖腐、花腐和穗腐等多種病害。鐮刀菌侵染煙草引起的枯萎病和根腐病是世界性的土傳真菌病害,在美國(guó)、韓國(guó)、加拿大、澳大利亞、南非、日本等產(chǎn)煙國(guó)普遍發(fā)生[1-3]。近兩年鐮刀菌根腐病在我國(guó)煙區(qū)的發(fā)病范圍和發(fā)病程度呈上升趨勢(shì),目前在云南、河南、湖南、山東、貴州、福建、湖北、安徽等地均有發(fā)生[4-11],重病煙田發(fā)病率達(dá)30%以上[4]。目前,國(guó)內(nèi)外學(xué)者在鐮刀菌的分類(lèi)地位與寄主范圍、形態(tài)學(xué)與分子特征、致病機(jī)理等方面均有報(bào)道[12-16]。河南省煙草鐮刀菌根腐病已有報(bào)道[4],但有關(guān)不同生態(tài)區(qū)域鐮刀菌類(lèi)型、主要致病菌種類(lèi)鑒定、菌株致病力的差異及病原菌侵染煙草引起病害的發(fā)生、流行規(guī)律等均缺乏系統(tǒng)性研究。而明確病原菌的種類(lèi)及其致病力是指導(dǎo)煙草鐮刀菌根腐病防治的基礎(chǔ)。rDNA-ITS序列分析可有效彌

        補(bǔ)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)鑒定的局限性,目前主要依據(jù)結(jié)合培養(yǎng)條件的形態(tài)學(xué)鑒定和真菌18S rDNA的ITS區(qū)序列分析解決病原鐮刀菌菌種的分類(lèi)地位[17-18]。因此,本試驗(yàn)選擇河南省煙區(qū)為切入點(diǎn),在河南省各大煙區(qū)煙草根際土壤中及發(fā)病煙株上分離純化疑似煙草鐮刀菌菌株,并對(duì)其進(jìn)行形態(tài)鑒定、致病性測(cè)定與rDNA-ITS序列測(cè)定及分析,旨在明確該病在河南煙區(qū)的基本分布及各煙區(qū)主要致病菌種類(lèi),為今后各煙區(qū)防治該病提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 樣品來(lái)源

        2016—2017年,選擇河南省豫南、豫東、豫中和豫西4個(gè)生態(tài)區(qū)的12個(gè)煙葉產(chǎn)區(qū),每個(gè)煙葉產(chǎn)區(qū)選擇不同區(qū)域、不同田塊類(lèi)型的烤煙煙田,在煙草團(tuán)棵期、旺長(zhǎng)期和成熟期分別進(jìn)行系統(tǒng)調(diào)查和普查,每個(gè)煙葉產(chǎn)區(qū)選擇不同生長(zhǎng)期根莖類(lèi)病害發(fā)病較重的9塊煙田,取具有典型癥狀的病株5~10株,截取莖基部與發(fā)病根系,同時(shí)在每塊煙田按5點(diǎn)取樣法采取土樣(見(jiàn)表1),由河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所植物保護(hù)研究室進(jìn)行相關(guān)病原菌的分離與鑒定。

        表1 采集樣品信息Tab.1 Sample information

        1.1.2 試劑和儀器

        Taq PCR MasterMix(Cat#KT201-02)購(gòu) 于TIANGEN公司,通用引物ITS1和ITS4由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司提供,BIO-RAD PCR儀(美國(guó)BIO-RAD公司),Universal Hood Ⅱ凝膠成像系統(tǒng)(美國(guó)BIO-RAD公司)。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 病原菌的分離

        (1)組織分離法。參照文獻(xiàn)[19]的方法對(duì)病原菌進(jìn)行分離。在樣品病健交界處切取適當(dāng)大小的組織塊,用75%酒精消毒30 s,15%次氯酸鈉消毒2 min,再用無(wú)菌水清洗3次。無(wú)菌吸水紙吸干組織塊表面水分后直接接種于含25%乳酸的PDA培養(yǎng)基平板上,25℃恒溫培養(yǎng)3~7 d,待組織塊周?chē)L(zhǎng)出菌落后,挑取邊緣菌落進(jìn)行純化[11]。依據(jù)純化后的菌落特征分類(lèi)編號(hào),保存?zhèn)溆谩?/p>

        (2)土壤分離法。參照文獻(xiàn)[20]的方法對(duì)煙田土壤真菌進(jìn)行分離。稱(chēng)取混合均勻的土壤1.0 g,放入帶有玻璃珠的100 mL三角瓶中,加99 mL無(wú)菌水,置搖床震蕩10 min使土樣均勻分散在稀釋液中成為10-2土壤懸浮液,將土壤懸浮液繼續(xù)稀釋成10-3稀釋液后涂布于含25%乳酸的PDA培養(yǎng)基平板上,25℃恒溫培養(yǎng)3 d,挑取具有鐮刀菌特征的菌落進(jìn)行純化[11]。依據(jù)純化后的菌落特征分類(lèi)編號(hào),保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 病原菌的形態(tài)學(xué)觀察

        在PDA培養(yǎng)基平板上培養(yǎng)3~4 d的菌株,用打孔器打成直徑約4 mm的菌餅,接種于PDA平板中央,25℃恒溫培養(yǎng),觀察菌落顏色及形態(tài)變化。挑取培養(yǎng)菌絲制作臨時(shí)水玻片,在光學(xué)顯微鏡下觀察菌絲、孢子、產(chǎn)孢細(xì)胞、子實(shí)體的形態(tài)特征,依據(jù)Booth分類(lèi)系統(tǒng)對(duì)鐮刀菌進(jìn)行分類(lèi)鑒定[21]。

        1.2.3 分子生物學(xué)鑒定

        刮取培養(yǎng)基5~7 d的菌絲體50 mg,液氮研磨后轉(zhuǎn)移至EP管中,使用試劑盒提取基因組DNA,提取后的DNA置于-20℃冰箱中保存?zhèn)溆谩@猛ㄓ靡颕TS1和ITS4對(duì)所提取的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR 體 系(25 μL):Taq PCR MasterMix 12.5 μL,10 μL/L 的引物各 1 μL,模板 DNA 1 μL,用 ddH2O將反應(yīng)體系補(bǔ)至25 μL。PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性4 min,94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 mim,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min,4℃保存。取5μL PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),觀察到合適大小條帶后,將所對(duì)應(yīng)的原始擴(kuò)增產(chǎn)物20 μL送往生工生物工程股份有限公司測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果在GenBank上進(jìn)行BLAST比對(duì),利用 MAGA6.06軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。

        1.2.4 病原菌致病性測(cè)定

        目前還沒(méi)有感煙草鐮刀菌的鑒別寄主相關(guān)報(bào)道,本研究選用河南煙區(qū)主栽品種中煙100測(cè)定病原菌的致病性。煙苗在河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所溫室大棚培育至4葉期。將致病性鑒定的分離物在PDA培養(yǎng)基上活化培養(yǎng),從菌落邊緣取新鮮的菌絲塊,分別接種于麥粒培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)7 d,制成麥粒帶菌培養(yǎng)物[22]。接種煙株前,先將滅菌花盆里裝一半滅菌土,再將麥粒帶菌培養(yǎng)物(每缽接15粒)拌入5 cm左右的表層土中,施足水后在28℃下保濕培養(yǎng)4 d,再移入苗床期健壯的煙苗。將接種的煙苗置于28~30℃人工氣候室中保濕培養(yǎng),拌入無(wú)菌麥粒培養(yǎng)物的煙苗為對(duì)照,每個(gè)處理重復(fù)3次,觀察發(fā)病狀況。對(duì)發(fā)病煙苗采用組織分離法重新分離,鏡檢觀察分離物,完成柯赫氏法則驗(yàn)證[20]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 鐮刀菌菌株的分離

        2016—2017年,從河南省豫南、豫東、豫中和豫西4個(gè)生態(tài)區(qū)的12個(gè)煙葉產(chǎn)區(qū),采集典型煙草鐮刀菌根腐病病株222株及土壤樣品108份,分離獲得鐮刀菌,采用單孢分離法進(jìn)行純化,共獲得純培養(yǎng)菌株98株,其中50株分離自病株,48株分離自土壤。

        2.2 病原菌的形態(tài)學(xué)特征

        根據(jù)菌株菌落、菌絲、分生孢子、產(chǎn)孢細(xì)胞、子實(shí)體等的形態(tài)特征及大小,依據(jù)Booth分類(lèi)系統(tǒng)對(duì)純化菌株進(jìn)行分類(lèi)鑒定,初步將98個(gè)菌株分為尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)、茄病鐮刀菌(Fusarium solani)、層出鐮刀菌(Fusarium proliferatum)、木 賊 鐮 刀 菌(Fusarium equiseti) 和Fusarium nematophilum5組。

        菌株1-80號(hào)為尖孢鐮刀菌,在PDA培養(yǎng)基上菌落多為白色和粉白色,表面產(chǎn)生大量孢子粉,后期菌落產(chǎn)生橙、紫、深藍(lán)或黑色色素,菌絲致密,部分菌落背面可見(jiàn)明顯輪紋;在顯微鏡下可觀察到兩種類(lèi)型的分生孢子,小型分生孢子數(shù)量多、卵圓形,多無(wú)分隔,5~12 μm×3~3.5 μm;大型分生孢子紡錘形,頂端鉤狀,基部有足細(xì)胞,23~53 μm×2.7~5.5 μm(圖1A、A’)。菌株81-90號(hào)為茄病鐮刀菌,在PDA培養(yǎng)基上菌落為白色,表面產(chǎn)生肉粉色粉孢子團(tuán),呈環(huán)狀排列;在顯微鏡下小型分生孢子腎形、橢圓形和卵形,無(wú)分隔,5.4~17.7 μm×1.4~4.5 μm,大型分生孢子量多、馬特形,頂部鈍圓,3~5隔膜,34.4~ 50.4 μm×4.3~ 5.8 μm( 圖 1B、B’)。 菌 株91-95號(hào)為層出鐮刀菌,在PDA培養(yǎng)基上為初為白色,后為紫紅色,氣生菌絲白色、濃密,可形成藍(lán)黑色菌核;在顯微鏡下小型分生孢子卵狀,0~1隔膜,5.7~13.9 μm×2.4~4.8 μm,大型分生孢子呈鐮刀形,較直、頂孢較尖,足孢明顯,3~5隔膜,20.6~49.0μm×2.3~4.9 μm(圖1C、C’)。菌株96、97號(hào)為木賊鐮刀菌,在PDA培養(yǎng)基上菌落白色,菌絲中間致密周?chē)∈瑁湔娈a(chǎn)生黃色孢子粉;在顯微鏡下觀察,其小型分生孢子卵圓形,5~12 μm×2~3.5 μm,大型分生孢子紡錘形,中部顯著膨大,基部有足細(xì)胞,3-5個(gè)分隔,23~53 μm×2.5~5.5 μm(圖1D、D’)。菌株98號(hào)為Fusarium nematophilum,在PDA培養(yǎng)基上菌落白色,菌絲致密,菌絲表面呈現(xiàn)連續(xù)環(huán)紋;在顯微鏡下觀察僅見(jiàn)大型分生孢子,鐮刀形,3~5個(gè)分隔,83~115 μm×2.5~5.5 μm(圖1E、E’)。

        圖1 分離鐮刀菌在PDA培養(yǎng)基上的形態(tài)特征Fig.1 Morphological characteristics of Fusarium spp. on PDA medium

        2.3 病原菌rDNA-ITS序列分析

        通過(guò)真菌ITS1和ITS4通用引物對(duì)分離純化的98個(gè)株菌株進(jìn)行rDNA-ITS序列測(cè)定,獲得有效序列長(zhǎng)度為493~567 bp。將98個(gè)DNA序列與GenBank中已登錄的鐮刀菌序列進(jìn)行同源性比對(duì),并用MEGA 6.06軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(圖2)。結(jié)果表明, 1-80號(hào)菌株的rDNA-ITS序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中登錄號(hào)為KX421442.1尖孢鐮刀菌(F. oxysporum)的親緣關(guān)系最近,同源性達(dá)99%以上,分子鑒定結(jié)果與形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果一致,從而鑒定菌株1-80號(hào)為尖孢鐮刀菌;81-90號(hào)菌株rDNA-ITS序列與GenBank中KY617036.1茄病鐮刀菌(F. solani)序列同源性為100%,與形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果一致,說(shuō)明81-90號(hào)菌株為茄病鐮刀菌;91-95號(hào)菌株序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中KY425734.1層出鐮刀菌(F. proliferafum)序列同源性在93%以上,結(jié)合形態(tài)學(xué)特征將這5個(gè)菌株鑒定為層出鐮刀菌;96、97號(hào)菌株的rDNA-ITS序列與GenBank中KJ412501.1木賊鐮刀菌(F. equiseti)的親緣關(guān)系最近,同源性為99%,與形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果一致,從而確定97、98號(hào)菌株為木賊鐮刀菌;98號(hào)菌株的rDNA-ITS序列與GenBank中KY617040.1F. nematophilumMHE 9 MC菌株序列同源性最高(99%),表明98號(hào)菌株為F. nematophilum。

        圖2 部分菌株rDNA-ITS序列的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Fig.2 Phylogenetic tree of partial strains rDNA-ITS sequence

        2.4 病原菌致病性分析

        煙苗接種病原菌7 d后觀察煙苗發(fā)病情況,供試的98個(gè)菌株中,48個(gè)菌株處理的煙苗出現(xiàn)典型病癥:病株葉片由下向上逐步變黃、皺縮枯萎;病株根莖部呈不同程度腐爛,須根明顯減少,對(duì)照煙苗均未發(fā)病且生長(zhǎng)良好(圖3)。對(duì)發(fā)病煙苗進(jìn)行病原物分離、純化,鏡檢觀察獲得的純培養(yǎng)物,其形態(tài)與接種的病原菌相同,證明所分離到的鐮刀菌菌株具有致病性。在引起煙株發(fā)病的48個(gè)鐮刀菌分離物中,尖孢鐮刀菌39株、茄病鐮刀菌5株、層出鐮刀菌3株、木賊鐮刀菌1株,其中36個(gè)菌株分離自病株,占75%,12個(gè)菌株分離自土壤,占25%。豫南致病性鐮刀菌包括尖孢鐮刀菌、層出鐮刀菌和木賊鐮刀菌,以尖孢鐮刀菌為主;豫中為尖孢鐮刀菌;豫東、豫西為茄病鐮刀菌和尖孢鐮刀菌。

        圖3 病原菌致病性測(cè)定Fig.3 Pathogenicity determination of the Fusarium isolate

        3 討論

        鐮刀菌根腐病是一種重要的土傳根莖類(lèi)病害,田艷艷等[4]認(rèn)為引起河南省煙草枯萎病與根腐病的優(yōu)勢(shì)病原種群是尖孢鐮刀菌和茄病鐮刀菌。本研究通過(guò)病原菌形態(tài)學(xué)特征觀察、病原菌rDNA-ITS序列分析及致病性測(cè)定,認(rèn)為河南省煙草鐮刀菌根腐病病原菌為尖孢鐮刀菌、茄病鐮刀菌、層出鐮刀菌和木賊鐮刀菌,其中木賊鐮刀菌侵染煙草在河南為首次報(bào)道。48種致病性病原菌中尖孢鐮刀菌占81.25%,為引起全省煙草鐮刀菌根腐病的優(yōu)勢(shì)致病菌,這與陳高航[9]報(bào)道的湖北省恩施煙草主產(chǎn)區(qū)煙草根腐病致病菌是尖孢鐮刀菌的結(jié)果相符,與桑維鈞等[7]研究認(rèn)為茄病鐮刀菌是貴州省煙草根腐病的優(yōu)勢(shì)病原菌的結(jié)論存在差異。研究發(fā)現(xiàn)鐮刀菌根腐病致病性菌種種類(lèi)和致病力差異與植物所生存的生態(tài)條件及植物本身抗感性等條件密切相關(guān)[9]。貴州煙田微生態(tài)環(huán)境及主栽煙草品種與河南省存在差異,可能導(dǎo)致兩省煙草根腐病的主要致病菌不同;田艷艷等分析待測(cè)菌株致病性所使用的煙草品種是小黃金1025,本研究用到的煙苗是中煙100,可能兩種煙草品種對(duì)不同鐮刀菌的抗感性不同,從而導(dǎo)致致病性測(cè)定結(jié)果的差異,且本研究測(cè)定鐮刀菌的致病性所使用的煙草品種是目前生產(chǎn)中的主栽品種,切合實(shí)際,對(duì)生產(chǎn)更具指導(dǎo)意義。在測(cè)定菌株致病性時(shí),陳高航[9]、田艷艷等[4]通過(guò)劃傷煙苗根莖部,為待測(cè)菌人為制造入侵點(diǎn),其結(jié)果會(huì)造成假陽(yáng)性,本研究通過(guò)無(wú)創(chuàng)接種法,菌株自行尋找宿主入侵,貼近自然環(huán)境發(fā)病情況,試驗(yàn)數(shù)據(jù)更可靠。本研究共分離純化出98株鐮刀菌,在本實(shí)驗(yàn)條件下只有48株在中煙100上有致病性,其余50個(gè)菌株無(wú)致病性的原因可能是菌株本身不致病,或是煙株發(fā)病慢、癥狀不明顯,也可能是中煙100對(duì)菌株有抗性,但目前還沒(méi)有感煙草鐮刀菌的鑒別寄主相關(guān)報(bào)道,純化鐮刀菌菌株對(duì)不同煙草品種的致病性有待進(jìn)一步深入研究。

        本研究分離純化出的木賊鐮刀菌經(jīng)致病性測(cè)定能夠侵染煙草品種100,這一結(jié)果與桑維鈞等[7]的測(cè)試結(jié)果一致。該病原菌還可以引起小扁豆根腐病[23]、苜蓿根莖腐爛病[24]等,但不同煙草品種對(duì)木賊鐮刀菌的抗感性及其致病性的強(qiáng)、弱有待進(jìn)一步測(cè)定。

        4 結(jié)論

        明確不同煙區(qū)煙草鐮刀菌根腐病的主要致病菌,對(duì)有效控制煙區(qū)病害的發(fā)生具有重要意義。本研究通過(guò)對(duì)河南省不同煙葉產(chǎn)區(qū)烤煙根腐病病原菌進(jìn)行分離純化、鑒定和致病性分析,確定尖孢鐮刀菌為全省煙區(qū)重點(diǎn)防控對(duì)象,豫南煙區(qū)還需加強(qiáng)層出鐮刀菌和木賊鐮刀菌的防控,豫東、豫西需監(jiān)測(cè)茄病鐮刀菌的發(fā)生及防治。

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