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        基于核磁共振圖像的人體面部軟組織的分割

        2018-05-08 06:26:34,,,,
        關(guān)鍵詞:區(qū)域方法

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        (浙江工業(yè)大學(xué) 計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,浙江 杭州 310023)

        使用數(shù)字?jǐn)鄬有蛄袌D像構(gòu)造人體面部模型是計(jì)算機(jī)圖形圖像學(xué)及醫(yī)療領(lǐng)域中一個(gè)十分活躍的研究熱點(diǎn).人體面部模型的參數(shù)可以幫助醫(yī)生進(jìn)行準(zhǔn)確和客觀的醫(yī)學(xué)診斷,模型的可視化還可以為醫(yī)生提供手術(shù)方案的仿真及術(shù)后效果的模擬.而分割出面部不同類型的組織(如脂肪、肌肉和皮膚等),且對(duì)組織的生物特征進(jìn)行定性定量的測(cè)量,是構(gòu)建上述三維面部模型的數(shù)據(jù)基礎(chǔ).因此,人體面部軟組織的分割在醫(yī)學(xué)診斷和臨床治療上都有重要的意義[1].目前,國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)軟組織的分割研究大多集中在大腦和心肺等組織,對(duì)于面部軟組織的研究工作相對(duì)較少.同時(shí),頭部作為整個(gè)人體中最為復(fù)雜的部分,其組織大多淺薄,相互連接并且結(jié)構(gòu)復(fù)雜,分割難度較大.另外,醫(yī)學(xué)圖像分割易受圖像噪音、灰度不均勻性以及部分容積效應(yīng)的影響.因此,面部軟組織的分割是一項(xiàng)具有挑戰(zhàn)性的工作.

        在已有的研究工作中,大部分的脂肪組織分割方法都以腿部及腹部為研究目標(biāo)[2-4],其目標(biāo)脂肪組織厚實(shí)且均勻,不適用于細(xì)薄且厚度不均的面部脂肪組織的分割.近年來,基于先驗(yàn)信息的肌肉組織分割方法被陸續(xù)提出[5-7],這類算法可以實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確的肌肉組織分割,但是其分割精度依賴于訓(xùn)練數(shù)據(jù)集的規(guī)模,而醫(yī)學(xué)圖像的獲取涉及病人的隱私,大數(shù)據(jù)集的獲取十分困難.Ng等[8-9]通過追蹤面部肌肉(如咬肌、翼內(nèi)外肌)的手動(dòng)分割輪廓得到一個(gè)模版,該模版儲(chǔ)存了面部肌肉區(qū)域與頭部區(qū)域的相對(duì)位置信息,根據(jù)該模版可以從MRI圖中自動(dòng)檢測(cè)到面部肌肉區(qū)域,以此肌肉區(qū)域作為梯度矢量流的初始輪廓,進(jìn)行演化得到分割結(jié)果,該方法的模版獲取過程困難且耗費(fèi)時(shí)間.Ng等[10]采用改進(jìn)的分水嶺方法實(shí)現(xiàn)MRI圖像上咬肌的分割,該方法通過一系列的措施來改善分水嶺算法過分割的問題,其中包括使用高斯濾波進(jìn)行圖像預(yù)處理,自動(dòng)閾值改進(jìn)sobel算子得到的濾波圖像的梯度幅值圖,以及在分水嶺算法得到的初始分割上進(jìn)行后分割融合,該方法的計(jì)算復(fù)雜度低但是其分割準(zhǔn)確率也偏低.為實(shí)現(xiàn)較為準(zhǔn)確的面部軟組織分割,結(jié)合MICO算法與區(qū)域生長(zhǎng)法設(shè)計(jì)了一種脂肪組織的分割方法,該方法通過灰度不均勻矯正,以及初分類移除背景,二次分割提取脂肪實(shí)現(xiàn)了較傳統(tǒng)算法更為準(zhǔn)確的脂肪組織分割.于此同時(shí),還提出了一種改進(jìn)的DRLSE方法實(shí)現(xiàn)了咬肌組織的分割,該方法設(shè)計(jì)了一個(gè)新的邊緣停止函數(shù)解決了DRLSE方法的誤分割問題.該方法實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單,不依賴于數(shù)據(jù)集大小且實(shí)現(xiàn)了較高的平均分割準(zhǔn)確率.

        1 脂肪組織的分割

        脂肪組織是面部軟組織中分布最廣的一類組織,面部脂肪主要指位于皮膚下的皮下脂肪,皮下脂肪結(jié)構(gòu)完善且連貫,對(duì)于人臉部的外觀形狀有很大的影響,是面部外科整形手術(shù)的常見手術(shù)對(duì)象,其位置大小參數(shù)對(duì)醫(yī)學(xué)診斷和臨床治療有很重要的意義.

        脂肪組織受MRI圖像中普遍存在的噪音、偽影、灰度不均勻和相鄰相似灰度組織的影響,其分割存在一定的難度.筆者采用MICO算法對(duì)面部MRI圖像進(jìn)行灰度不均勻矯正和面部主要組織的預(yù)分類分割,之后通過圖像運(yùn)算得到去除了大部分背景的初脂肪組織分割圖像,在此圖像上采用區(qū)域生長(zhǎng)進(jìn)行二次分割并對(duì)結(jié)果進(jìn)行形態(tài)學(xué)處理,實(shí)現(xiàn)了脂肪組織的分割.并將該方法的實(shí)驗(yàn)結(jié)果與傳統(tǒng)的圖像分割算法結(jié)果進(jìn)行比較,結(jié)果證明筆者提出的方法得到的脂肪組織結(jié)果更為精確.

        1.1 MRI圖像預(yù)處理及組織分類分割

        MRI圖像存在的灰度不均勻性使得位于不同位置的脂肪組織呈現(xiàn)不同的灰度值(圖1),這會(huì)在很大程度上影響脂肪組織分割的準(zhǔn)確率,因此對(duì)MRI圖像進(jìn)行灰度不均勻矯正顯得尤為重要.

        圖1 面部MRI圖像Fig.1 The facial MRI images

        乘法內(nèi)在分量?jī)?yōu)化[11](Multiplicative intrinsic component optimization,MICO)是一種結(jié)合了MRI圖像灰度不均勻矯正及組織分割的能量最小化方法.該方法將MRI圖像分解為兩個(gè)乘法分量構(gòu)成公式,通過能量最小化方法最優(yōu)化這兩個(gè)乘法分量,使MICO算法可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)灰度不均勻矯正及組織分割.MRI圖像I的模型化公式為

        I(x)=b(x)J(x)+n(x)

        (1)

        式中:I(x)為待處理圖像在像素點(diǎn)x上的灰度值;J(x)為真實(shí)圖像,它定義了組織的物理特性,且屬于相同類別組織的像素點(diǎn)的值是固定的,比如屬于第i類組織的像素點(diǎn)的取值為ci;b(x)為偏移場(chǎng);n(x)為均值為0的附加噪音.

        b(x)=wTG(x)

        (2)

        (3)

        根據(jù)式(1),構(gòu)建能量函數(shù)為

        (4)

        代入式(2)偏移場(chǎng)b和式(3)真實(shí)圖像J的數(shù)學(xué)描述,經(jīng)整理,得到能量函數(shù)表達(dá)式為

        (5)

        式中q≥1是使成員函數(shù)的值域?yàn)閇0,1]的模糊器.從式(5)可以看出:能量函數(shù)的最小化已經(jīng)被轉(zhuǎn)換為對(duì)u,c,w的優(yōu)化,通過固定3個(gè)參數(shù)中的其中2個(gè)參數(shù)計(jì)算另1個(gè)參數(shù)的優(yōu)化值,然后遞歸迭代求出最后的優(yōu)化值.

        1.2 引入?yún)^(qū)域生長(zhǎng)法進(jìn)行二次分割

        MICO算法會(huì)對(duì)面部MRI圖像進(jìn)行灰度不均勻矯正,并且對(duì)面部主要的組織進(jìn)行分類分割.但是組織的分類結(jié)果大多會(huì)包含很多灰度相似的非目標(biāo)組織(圖2),因此需要對(duì)經(jīng)MICO算法處理過的分類結(jié)果進(jìn)行二次精細(xì)分割.

        圖2 灰度不均勻矯正及分類結(jié)果圖Fig.2 The images of bias field estimation and tissue classification

        因皮下脂肪組織結(jié)構(gòu)完善且連續(xù),采用區(qū)域生長(zhǎng)法進(jìn)行二次精細(xì)分割.區(qū)域生長(zhǎng)法利用圖像的局部空間信息,適用于提取灰度特征相似的連通區(qū)域,十分適用于脂肪組織的提取.

        二次分割的步驟如下:

        1)將偏移矯正后的圖像與脂肪組織分類圖像相乘,得到移除大部分背景的具有灰度特征的待處理圖像.

        2)在1)中得到的圖像中選取種子點(diǎn).

        3)在種子點(diǎn)處進(jìn)行8鄰域擴(kuò)展,如果種子點(diǎn)的8鄰域像素與種子點(diǎn)的灰度差的絕對(duì)值小于設(shè)定的閾值T,則該像素與種子點(diǎn)合并為同一區(qū)域,并作為新種子點(diǎn)等待生長(zhǎng).

        4)重復(fù)3)直到?jīng)]有新的像素滿足合并條件,區(qū)域生長(zhǎng)停止.

        5)對(duì)4)中的結(jié)果進(jìn)行形態(tài)學(xué)處理,用以填充細(xì)小空洞,得到最終分割結(jié)果.形態(tài)學(xué)處理指的是基于數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的閉運(yùn)算處理[12].閉運(yùn)算可以填充圖像中的細(xì)小空洞,平滑邊緣,其定義為

        A·B=(A⊕B)?B

        (6)

        式中:A為目標(biāo)圖像;B為結(jié)構(gòu)元素;⊕為膨脹運(yùn)算;?為腐蝕運(yùn)算.圖3為設(shè)計(jì)方法的具體框架圖.

        圖3 分割框架圖Fig.3 The frame graph of segmentation

        2 肌肉組織的分割

        肌肉組織是面部軟組織的重要組成部分之一.而咬肌組織作為面部肌肉組織,其大小形狀不僅影響咀嚼力的大小,還會(huì)影響面下部寬度和下頜角的形態(tài),更是確定下頜角及咬肌肥大畸形患者治療方案的重要指標(biāo)之一.鑒于咬肌在面部形狀和醫(yī)學(xué)診斷上的重要性,筆者將肌肉組織的研究重點(diǎn)放在咬肌組織上.

        咬肌組織的背景組織繁多,灰度信息復(fù)雜,且存在相鄰相似灰度的組織.因此咬肌組織的分割是一項(xiàng)相對(duì)較有挑戰(zhàn)的工作.筆者提出了一種新的基于MRI圖像的咬肌分割方法,該方法通過構(gòu)建一個(gè)新的邊緣停止函數(shù)改進(jìn)了距離正則化水平集,將相位一致性引入構(gòu)造邊緣停止函數(shù),結(jié)合圖像的梯度信息和相位信息來解決咬肌的分割問題.該方法在50張咬肌的MRI圖像上進(jìn)行了測(cè)試,測(cè)試結(jié)果顯示該方法可以提取到臨床可接受的咬肌分割結(jié)果.

        2.1 距離正則化水平集

        距離正則化水平集(Distance regularized level set evolution,DRLSE)由Li等[13]提出,該模型在基于邊緣的主動(dòng)輪廓模型中增加了一個(gè)距離正則項(xiàng),完全消除了重初始化水平集函數(shù)的需要,提高了水平集演化的效率和準(zhǔn)確率.距離正則項(xiàng)是一個(gè)勢(shì)函數(shù),它使水平集函數(shù)的梯度幅值趨向函數(shù)中的一個(gè)最小值以保證水平集函數(shù)的期望形狀,并通過驅(qū)動(dòng)水平集演化過程中的前向-后向擴(kuò)散,保持了水平集函數(shù)的規(guī)則性.距離正則化水平集可應(yīng)用于感興趣區(qū)域邊緣的準(zhǔn)確提取,并且保證提取到的邊緣是光滑且閉合的,這是分割生物組織結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵[14].假設(shè)水平集函數(shù)φ:Ω→R,距離正則化水平集的能量函數(shù)E(φ)可定義為

        (7)

        式中:μ>0,λ>0,α∈R分別為常量;p為距離正則化的勢(shì)函數(shù);δ為Dirac函數(shù);H為Heaviside函數(shù);g為邊緣停止函數(shù).

        引入距離正則項(xiàng)的目的是為了平滑水平集函數(shù),并且通過保持符號(hào)距離屬性|▽?duì)諀=1確保水平集演化正確.為了滿足上述目的,勢(shì)函數(shù)p定義為一個(gè)雙井函數(shù),表達(dá)式為

        (8)

        基于梯度的邊緣停止函數(shù)g定義為

        g

        (9)

        式中:I為輸入圖像;Gσ為標(biāo)準(zhǔn)差σ的高斯內(nèi)核;(Gσ*I)為卷積,用于平滑圖像.g通常在邊緣位置取得較小值.

        式(7)中的能量函數(shù)通過梯度流實(shí)現(xiàn)最小化,即

        (10)

        DRLSE中的邊緣停止函數(shù)g是隨梯度值增大而減小的單調(diào)遞減函數(shù),因此g可能會(huì)在梯度值較大的噪音處陷入一個(gè)局部最小值,也可能在存在灰度不均勻性的非邊緣區(qū)域因圖像梯度較大而取到近零值[15].以上這些都會(huì)導(dǎo)致水平集的錯(cuò)誤演化.

        使用DRLSE分割咬肌,可以發(fā)現(xiàn)使用僅利用梯度信息的邊緣停止函數(shù)驅(qū)使水平集演化會(huì)出現(xiàn)錯(cuò)誤,如圖4(d)所示.原因就在于邊緣停止函數(shù)在假邊緣處取到了局部最小值.假邊緣是由咬肌的解剖結(jié)構(gòu)和核磁共振成像的成像特點(diǎn)導(dǎo)致的.咬肌內(nèi)側(cè)分布著上頜支,在MRI圖像中,咬肌呈灰色,上頜支中的骨髓呈白色,骨骼呈黑色.因此,咬肌的內(nèi)側(cè)邊緣會(huì)有灰-黑-白的分布(圖4b),灰黑邊緣為咬肌實(shí)際邊緣,其梯度小于黑白假邊緣,使得g取到局部最小值,水平集演化向假邊緣處.

        圖4 咬肌的原圖及分割結(jié)果圖Fig.4 The original images of masseter and the results of segmentation

        2.2 為DRLSE構(gòu)建新的邊緣停止函數(shù)

        DRLSE利用圖像的梯度信息實(shí)現(xiàn)分割,但僅依靠圖像的梯度信息無法準(zhǔn)確地分割出咬肌組織.并且咬肌的相鄰組織結(jié)構(gòu)復(fù)雜,灰度不均,融合基于區(qū)域的灰度信息無法發(fā)揮較大作用,因此引入相位一致性特征[16]對(duì)DRLSE進(jìn)行改進(jìn).

        相位一致性假設(shè)圖像特征出現(xiàn)在相位傅立葉分量最大的點(diǎn)[17],它對(duì)于圖像灰度和對(duì)比度變化不敏感,抗噪能力強(qiáng).對(duì)于二維圖像,相位一致性可以表示為

        (11)

        (12)

        式中:o為方向索引;Ano(x),ΔΦno(x)分別為第n個(gè)傅立葉分量在o方向上的幅度和局部相位差;To為o方向上的估計(jì)噪音;Wo(x)為加權(quán)函數(shù);ε為常數(shù),用于避免除數(shù)為零.

        相位一致性由log Gabor小波提取到的圖像信號(hào)的頻率信息和不同頻率下的相位信息計(jì)算而得,不受圖像對(duì)比度的影響,能夠獲得可靠完整的圖像邊緣特征,被廣泛地應(yīng)用于圖像的邊緣檢測(cè).因此,相位一致性可以提取到咬肌圖像豐富的邊緣特征信息(圖5b),且它的取值范圍為[0,1],越靠近邊緣取值越接近于1,越遠(yuǎn)離邊緣取值越接近于0,因此將相位一致性提取到的邊緣特征轉(zhuǎn)換為梯度信息可以在咬肌邊緣處得到局部最大梯度值(圖5c).由此可構(gòu)建新的邊緣停止函數(shù)為

        (13)

        式中:Ω為整個(gè)圖像域;Ωinside,Ωoutside分別為咬肌的內(nèi)外側(cè)區(qū)域,由初始輪廓決定;λ為常數(shù),用于擴(kuò)充相位一致性圖譜的灰度域,取值為256.

        圖5 相位一致性應(yīng)用的一組例子Fig.5 An example of phase congruency

        3 實(shí)驗(yàn)與結(jié)果

        實(shí)驗(yàn)測(cè)試在兩組數(shù)據(jù)集上進(jìn)行,數(shù)據(jù)集由醫(yī)院放射科提供(采集自兩位志愿者).筆者將脂肪組織的分割結(jié)果與幾種傳統(tǒng)的脂肪組織分割算法結(jié)果進(jìn)行對(duì)比.而對(duì)咬肌組織的結(jié)果分析,從兩方面考慮:一方面對(duì)比改進(jìn)的DRLSE方法與原DRLSE方法;另一方面通過比較自動(dòng)分割結(jié)果與手工分割結(jié)果的重合率來驗(yàn)證改進(jìn)方法的分割準(zhǔn)確率.

        圖6顯示了筆者提出的脂肪組織分割方法與傳統(tǒng)的區(qū)域生長(zhǎng)法、模糊C均值聚類法(FCM),活動(dòng)輪廓模型(ACM)以及圖割方法的分割結(jié)果對(duì)比,從圖6中可以明顯地觀察到筆者方法的分割結(jié)果相對(duì)較為準(zhǔn)確.筆者方法不僅解決了因MRI圖像灰度不均勻?qū)е碌慕M織欠分割問題以及相似灰度組織導(dǎo)致的過分割問題,且利用形態(tài)學(xué)運(yùn)算處理了區(qū)域生長(zhǎng)法常見的空洞的問題,得到了更為準(zhǔn)確的脂肪組織分割結(jié)果.

        圖6 筆者方法和傳統(tǒng)算法之間的對(duì)比Fig.6 The comparison the proposed method and the traditional algorithm

        圖7為筆者提出的咬肌分割方法和DRLSE方法的對(duì)比.為兩種方法設(shè)定相同的初始輪廓并演化,改進(jìn)后的方法演化到了更為準(zhǔn)確的咬肌邊緣輪廓.由此可以得出:筆者提出的方法成功地改進(jìn)了DRLSE方法,解決了邊緣停止函數(shù)陷入局部最小值的問題,避免了輪廓曲線的演化泄漏到錯(cuò)誤的邊緣位置.

        表1為改進(jìn)的咬肌分割方法在2組數(shù)據(jù)集上的準(zhǔn)確率結(jié)果,2組數(shù)據(jù)集上的平均準(zhǔn)確率為92.41%.采用κ索引[18]方法評(píng)估自動(dòng)分割結(jié)果和手動(dòng)分割結(jié)果的重合率用來計(jì)算分割的準(zhǔn)確率.κ索引的定義為

        (14)

        式中:M,S分別為筆者提出方法和手動(dòng)分割法得到的咬肌區(qū)域;M∩S為M和S的重疊區(qū)域;N(·)表示區(qū)域內(nèi)包含的像素個(gè)數(shù).改進(jìn)方法的平均準(zhǔn)確率為92.41%.在目前已有的研究咬肌分割的文獻(xiàn)中,有一些方法與筆者使用了相同的準(zhǔn)確率驗(yàn)證技術(shù)(表2),經(jīng)對(duì)比,改進(jìn)的DRLSE方法獲得的平均準(zhǔn)確率相對(duì)高于其他方法.

        圖7 改進(jìn)方法與DRLSE的對(duì)比Fig.7 The comparison of the modified method and the DRLSE

        第1組圖像序號(hào)分割準(zhǔn)確率/%第2組圖像序號(hào)分割準(zhǔn)確率/%第1組圖像序號(hào)分割準(zhǔn)確率/%第2組圖像序號(hào)分割準(zhǔn)確率/%4592.445190.695892.296492.984691.565294.075991.976593.464794.485391.736092.156690.894892.265493.626192.896791.694992.945593.136291.906894.145092.525693.066391.506991.435191.275791.616490.407092.955293.135893.726591.447191.445394.695996.636691.587292.475493.456094.976791.427390.555593.816193.366890.867492.285692.456291.356990.237591.145791.426391.84

        表2 不同方法的平均準(zhǔn)確率對(duì)比Table 2 The comparison of average accuracy using different methods %

        4 結(jié) 論

        結(jié)合MICO算法和區(qū)域生長(zhǎng)法,提出了一種脂肪組織分割方法,該方法采用MICO算法對(duì)灰度不均勻的MRI圖像進(jìn)行處理,通過圖像運(yùn)算得到移除了大部分背景的初脂肪組織分割圖像,在此圖像上接著采用區(qū)域生長(zhǎng)法進(jìn)行二次分割并對(duì)分割結(jié)果進(jìn)行形態(tài)學(xué)處理,得到了較傳統(tǒng)算法更為準(zhǔn)確的脂肪組織分割結(jié)果.同時(shí),還提出了一種改進(jìn)的DRLSE方法用于實(shí)現(xiàn)咬肌組織的分割.該方法通過引入相位一致性特征為DRLSE方法構(gòu)造了一個(gè)新的邊緣停止函數(shù),以處理DRLSE采用的僅基于圖像梯度的邊緣停止函數(shù)易在假邊緣處取到局部最小值而導(dǎo)致的誤分割問題.該方法改進(jìn)了DRLSE,并且實(shí)現(xiàn)了較高準(zhǔn)確率的咬肌分割.

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