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        克拉瑪依果樹(shù)腐爛病病原菌鑒定及其拮抗菌的篩選

        2018-04-17 05:09:51牛春林葉曉蕓王振華熱依汗姜國(guó)勇宋素琴
        新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年2期
        關(guān)鍵詞:新疆

        牛春林,葉曉蕓,艾 尼,王振華,熱依汗,姜國(guó)勇,高 雁,宋素琴,楚 敏

        (1.新疆石油管理局造林減排作業(yè)區(qū),新疆克拉瑪依 834000;2.新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院微生物應(yīng)用研究所,烏魯木齊 830091)

        0 引 言

        【研究意義】近10余年來(lái),在國(guó)家實(shí)施西部大開(kāi)發(fā)戰(zhàn)略和新疆產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整下,新疆特色林果種植飛速發(fā)展,林果業(yè)已成為新疆農(nóng)業(yè)增效、農(nóng)民增收的重要手段[1,2]。但隨著種植面積的增加,加之田間日常管理和水肥管理的不足,以及近年來(lái)氣候因素等,果樹(shù)腐爛病發(fā)病嚴(yán)重,已造成果樹(shù)枯死,果園減產(chǎn),嚴(yán)重的造成毀園,制約了新疆特色林果業(yè)的發(fā)展[3]。因此,研究果樹(shù)的腐爛病病原及篩選相關(guān)生防菌劑對(duì)高效生物防治該病具有重要的意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】 果樹(shù)腐爛病又名爛皮病,主要危害枝干, 致使皮層腐爛壞死,常表現(xiàn)為潰瘍型和枝枯型兩種類(lèi)型。果樹(shù)腐爛病因其分布廣、難治愈、高復(fù)發(fā)等特點(diǎn),是果樹(shù)生產(chǎn)中重要的病害之一[4,5]。目前,新疆主要特色林果如蘋(píng)果、香梨、桃樹(shù)、核桃等果樹(shù)均有不同程度的發(fā)病[6-10]。研究表明,果樹(shù)腐爛病主要由殼囊孢菌Cytospora屬(有性型為蘋(píng)果黑腐皮殼菌Valsa屬)引起,我國(guó)目前已知相關(guān)病原菌共涉及該屬下6個(gè)種[11]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】在現(xiàn)有報(bào)道中,新疆蘋(píng)果樹(shù)腐爛病致病菌有C.chrysosperma、C.mali、C.schulzeri和C.leucostoma引起,但存在著區(qū)域分布不迥,而有關(guān)李子樹(shù)腐爛病,此前國(guó)內(nèi)尚無(wú)報(bào)道。研究通過(guò)形態(tài)學(xué)、生理生化特性及分子生物學(xué)方法確定蘋(píng)果樹(shù)與李子樹(shù)病原菌的分類(lèi)地位;采用組織分離法和平板對(duì)峙法篩選得到拮抗效果較好的拮抗菌?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】以新疆克拉瑪依綠城實(shí)業(yè)有限公司生態(tài)果園內(nèi)蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病為研究對(duì)象,對(duì)其致病菌進(jìn)行分離鑒定,并開(kāi)展其相關(guān)拮抗菌的篩選,為新疆果樹(shù)腐爛病病原多樣性和開(kāi)展相關(guān)生物防治提供科學(xué)依據(jù)和奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        1.1.1腐爛病樣本

        蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病樣本采集自新疆克拉瑪依綠城實(shí)業(yè)有限公司生態(tài)果園內(nèi)。

        1.1.2土樣采集

        用于拮抗菌分離的土樣采集于生態(tài)果園內(nèi)果樹(shù)根部地下5~20 cm土壤。

        1.1.3篩選培養(yǎng)基

        完全培養(yǎng)基:蛋白胨10.0 g,酵母膏5.0 g,磷酸氫二鉀 3.0 g,葡萄糖1.0 g,瓊脂15 g/L,水1 000 mL,pH 7.0~7.2。

        其它常見(jiàn)培養(yǎng)基:馬鈴薯-葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA),高氏一號(hào)培養(yǎng)基(Gause' s No.1)。

        1.2 方 法

        1.2.1病原菌分離

        取蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病樣本枝條,在無(wú)菌工作臺(tái)中,先用75%的酒精消毒30 s,其次1.2% NaClO消毒3 min,然后用無(wú)菌蒸餾水清洗3次進(jìn)行表面消毒,放在無(wú)菌濾紙上晾干。 切取5 mm×5 mm左右具有典型腐爛病病征的組織塊,移至準(zhǔn)備好的PDA(含氯霉素)培養(yǎng)基上,置于28℃恒溫培養(yǎng),并觀(guān)察菌落長(zhǎng)出后挑取邊緣菌絲,進(jìn)行菌種純化和保藏[12]。

        1.2.2拮抗菌分離

        拮抗菌的分離采用雙層平板法進(jìn)行分離篩選。為了篩選快速生長(zhǎng)并產(chǎn)生拮抗作用的菌株,采用黑曲霉作為指示菌,孢子懸液控制在104~105CFU/mL,取0.2 mL均勻涂布于下層PDA培養(yǎng)基上,待懸液被培養(yǎng)基吸收后,倒入45℃左右的完全培養(yǎng)基或高氏培養(yǎng)基,待其凝固后備用[13,14]。

        無(wú)菌條件下稱(chēng)取土樣5 g, 置于裝有50 mL 0.85 %生理鹽水三角瓶中(裝有無(wú)菌玻璃珠),30℃ 條件下 120 r/min 振蕩 0.5 h,靜置。壤懸液經(jīng)梯度稀釋后,吸取0.2 mL涂布至上述平板上,于 30℃ 恒溫培養(yǎng),并觀(guān)察菌落生長(zhǎng)和抑菌情況,挑選具有明顯抑菌圈,菌株菌落形態(tài)、大小及顏色不同菌落,進(jìn)行分離純化后,斜面4℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.3拮抗菌復(fù)篩

        拮抗菌株的復(fù)篩采用平板對(duì)峙法進(jìn)行。以分離到的蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病病原為指示菌。首先,將病原菌接種于PDA 平板進(jìn)行活化,30℃下培養(yǎng)至病原菌長(zhǎng)滿(mǎn)平板,用滅過(guò)菌的0.5 cm打孔器對(duì)病原菌打孔制成菌餅。然后,接種菌餅于PDA平板中心,采用四點(diǎn)對(duì)峙法將拮抗,每處理重復(fù)3次,并以未接拮抗菌的病原菌為對(duì)照,28℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)4 d后,觀(guān)察并測(cè)定抑菌效果[10,15]。

        1.2.4菌株的分子生物學(xué)鑒定

        病原真菌ITS 序列采用通用引物ITS1:5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’, ITS4:5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’進(jìn)行ITS序列PCR擴(kuò)增。細(xì)菌16S rDNA序列采用通用引物27F:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',1492R:5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3'進(jìn)行16S rDNA 的PCR擴(kuò)增。

        PCR產(chǎn)物經(jīng)切膠純化回收后,送往北京鼎國(guó)生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序,所測(cè)得序列人工校正后,真菌序列在http://www.westerdijkinstitute.nl/Collections/DefaultInfo.aspx數(shù)據(jù)庫(kù)上進(jìn)行比對(duì),細(xì)菌序列在EzTaxon(http://www.ezbiocloud.net/eztaxon/identify)數(shù)據(jù)庫(kù)上進(jìn)行比對(duì),并分別調(diào)取同源性最高模式菌株及相關(guān)菌株序列, 使用MEGA5.0進(jìn)行CLUSTAL X多重比對(duì),使用NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)[16],自舉值(Bootstrap) 為1 000。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 腐爛病病原菌的分離與鑒定

        2.1.1腐爛病原菌分離與純化

        經(jīng)分離純化,分別從蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病病害典型樣本中,分離得到真菌菌株5株,通過(guò)平板生長(zhǎng)情況及菌落形態(tài)學(xué)特征分析,初步確定菌株可分為兩類(lèi),其中編號(hào)PF1、PF2、LF1為第一類(lèi),菌絲生長(zhǎng)迅速,菌落初期為白色,羽毛狀擴(kuò)展,中間部位氣生菌絲明顯,棉絮狀,之后逐漸變?yōu)榛野咨<s4 d長(zhǎng)滿(mǎn)平板。后期菌絲體逐漸變?yōu)榛野字梁诤稚⒎置诨液谏?圖1);編號(hào)LF2、LF3為另一類(lèi),菌絲生長(zhǎng)迅速,菌落初期為白色,羽毛狀擴(kuò)展,中間部位氣生菌絲明顯,棉絮狀,之后逐漸變?yōu)榛野咨<s4 d長(zhǎng)滿(mǎn)平板。后期菌絲體逐漸變?yōu)榛野字梁诤稚⒎置诨液谏?圖2)。同時(shí),研究發(fā)現(xiàn),蘋(píng)果樹(shù)腐爛病僅涉及第一類(lèi),而李子樹(shù)腐爛病兩類(lèi)均有發(fā)現(xiàn)。圖1,圖2

        2.1.2病原菌分子鑒定

        所得菌株分別利用真菌ITS 序列通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得長(zhǎng)度約為600 bp 的PCR產(chǎn)物,通過(guò)進(jìn)一步序列測(cè)定和校正后,分別在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast)及http://www.westerdijkinstitute.nl/ Collections/DefaultInfo.aspx數(shù)據(jù)庫(kù)上進(jìn)行比對(duì)。通過(guò)在線(xiàn)比對(duì),發(fā)現(xiàn)所得菌株均與Valsa屬。進(jìn)一步系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建表明,菌株P(guān)F1、PF2、LF1與ValsamaliTY121同源性為100%;菌株LF2和LF3與ValsaleucostomaBJFU SXLM1064同源性為100%,初步確定研究所得腐爛病病原菌為Valsamali和Valsaleucostoma,其中蘋(píng)果樹(shù)腐爛病病原菌僅為Valsamali,而李子樹(shù)腐爛病病原菌兩者均有。圖3

        圖1PF1,PF2,LF1菌落形態(tài)
        Fig.1Colony morphology of PF1,PF2 and LF1

        圖2LF2,LF3菌落形態(tài)
        Fig.2Colony morphology of LF2 and LF3

        圖3基于真菌ITS序列建立的病原菌NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
        Fig.3NJphylogenetictreeofpathogenicfungibasedon16SrDNAsequence

        2.2 拮抗菌的分離和鑒定

        以黑曲霉為指示菌,采用雙層平板法,對(duì)采集的生態(tài)果園內(nèi)果林根部土壤開(kāi)展了拮抗菌的分離篩選。通過(guò)樣品稀釋涂布,菌種的分離,共獲的對(duì)黑曲霉具有拮抗作用的菌株15株,其中細(xì)菌10株,放線(xiàn)菌5株。

        15株菌株16S rDNA序列經(jīng)PCR擴(kuò)增和測(cè)序,所得序列提交至 EzTaxon 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ezbiocloud.net/identify)進(jìn)行相似度比較,同時(shí)分別調(diào)取各菌株同源性最高模式菌株序列,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育樹(shù)。所得菌株分別歸屬于鏈霉屬、諾卡氏菌屬、類(lèi)芽孢菌屬及芽孢菌屬,總計(jì)4個(gè)屬9個(gè)種,其中芽孢菌屬涉及種類(lèi)最多,共5個(gè)種;其次鏈霉屬,涉及2個(gè)種。圖4

        圖4基于16S rDNA序列建立的拮抗菌NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
        Fig.4NJ phylogenetic tree of antagonistic bacterium based on 16S rDNA sequence

        2.3 果樹(shù)腐爛病原菌拮抗菌的復(fù)篩

        果樹(shù)腐爛病病原菌拮抗菌的復(fù)篩采用平板對(duì)峙法進(jìn)行。以分離到的蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病病原菌PF1和LF2為指示菌。先將病原菌菌餅接種至PDA平板中心,采用四點(diǎn)對(duì)峙法進(jìn)行拮抗菌的復(fù)篩,研究表明,所分離的拮抗菌對(duì)PF1和LF2抑制效果存在著區(qū)別,但總體差別不大。鏈霉菌A1和芽孢桿菌B4、B6對(duì)所得的腐爛病病原菌具有較好的抑制的效果,抑菌圈菌落比最大分別可以達(dá)到1.95、2.11和2.79。圖5

        進(jìn)一步對(duì)菌株芽孢桿菌B4和B6對(duì)腐爛病抑制效果分析發(fā)現(xiàn),盡管兩株菌均具有較好的抑菌效果,但兩者對(duì)病原菌的抑菌圈形狀不同,病原菌受菌株B4抑制時(shí),抑菌圈邊緣較為整齊,真菌基絲和氣生菌絲基本在一個(gè)垂面,且受抑制處邊緣明顯有大量真菌孢子產(chǎn)生。而病原菌受B6抑制時(shí),抑菌圈邊緣不整齊,真菌氣生菌絲比基絲明顯受抑制,菌絲體由內(nèi)至邊緣逐漸變薄,同時(shí)在兩株菌的相互作用的過(guò)程中,在菌株B6菌落周?chē)纬闪艘粋€(gè)明顯的暈圈,相關(guān)不同的抑制機(jī)理還有待進(jìn)一步研究。圖6

        圖5拮抗菌對(duì)果樹(shù)腐爛病病原菌抑菌活性
        Fig.5Antagonistic activity of bacterium against to the pathogen of fruit tree canker

        注:A:芽孢桿菌B4和 B6對(duì)Valsamali的拮抗平板; B:芽孢桿菌B6抑菌圈邊緣特征;C:芽孢桿菌B4抑菌圈特征;D:Valsamali受芽孢桿菌B6拮抗抑菌圈邊緣菌絲顯微特征;E:Valsamali受芽孢桿菌B4拮抗抑菌圈邊緣菌絲顯微特征

        Note:A: Antagonistic plates of Bacillus B4 and B6 againstValsaMali; B: Edge characteristics of the inhibition zone by B6;C: Edge characteristics of the inhibition zone by B6;D: Microscopic characteristics of the edge mycelia ofValsaMaliaround inhibition zone by B6;E: Microscopic characteristics of the edge mycelia ofValsaMaliaround inhibition zone by B4

        圖6芽孢桿菌B4和B6對(duì)Valsa mali抑制效果
        Fig.6Inhibitory effect of B4 and B6 against Valsa mali

        3 討 論

        腐爛病作為我國(guó)北方林果樹(shù)木的常見(jiàn)病害之一,涉及林木種類(lèi)多,發(fā)病區(qū)域廣泛,最南至江蘇徐淮地區(qū)均發(fā)現(xiàn)腐爛病的發(fā)生[17]。已在常見(jiàn)林果樹(shù)木如蘋(píng)果樹(shù)、梨樹(shù)、楊梅樹(shù)、紅棗樹(shù)、核桃樹(shù)、楊樹(shù)、榆樹(shù)、國(guó)槐樹(shù)、胡楊樹(shù)等樹(shù)木均發(fā)現(xiàn)有腐爛病的發(fā)生[18]。相關(guān)研究表明,上述腐爛病的主要病原菌為由殼囊孢菌Cytospora屬(有性型為腐皮殼菌Valsa屬)引起,我國(guó)目前已知相關(guān)病原菌共涉及該屬C.mali、C、malicola、C.chrysosperma、C.schuzeri、C.atrocirrhata和C、persoonii(C.leucostoma)等5個(gè)種,而相同種間亦存在致病力差異。

        目前,新疆林果是我國(guó)腐爛病發(fā)病主要地區(qū)之一,主要栽培果樹(shù)中均發(fā)現(xiàn)腐爛病。相關(guān)研究證明我區(qū)的果樹(shù)腐爛病存在著多種病原菌,郭開(kāi)發(fā)等[8]對(duì)新疆南疆核桃樹(shù)腐爛病菌進(jìn)行了分子學(xué)鑒定,確定其致病菌為金黃殼囊孢C.chrysosperma。唐俊煜等[9]對(duì)庫(kù)爾勒香梨樹(shù)腐爛病菌生物學(xué)特性與致病性的初步研究發(fā)現(xiàn),其致病菌為金黃殼囊孢C.chrysosperma。劉應(yīng)敏等[10]對(duì)新疆蘋(píng)果樹(shù)腐爛病病原菌的分離、鑒定及其生物學(xué)特性進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)菌株C能夠在新疆蘋(píng)果樹(shù)上造成危害。新疆林果業(yè)主要布局在南疆地區(qū),目前對(duì)北疆地區(qū)果樹(shù)腐爛病的研究較少。

        研究針對(duì)新疆克拉瑪依綠城實(shí)業(yè)有限公司生態(tài)果園內(nèi)蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病的病原菌進(jìn)行了篩選鑒定,確定蘋(píng)果樹(shù)腐爛病病原菌為Valsamali,李子樹(shù)腐爛病病原菌分別包括Valsamali和Valsaleucostoma。該研究不僅進(jìn)一步證明了新疆果樹(shù)腐爛病病原菌存在著多樣性,也在國(guó)內(nèi)首次報(bào)道了李子樹(shù)腐爛病病原菌,相關(guān)研究對(duì)新疆腐爛病研究具有明顯的指導(dǎo)意義。同時(shí),研究篩選獲得了多株具有不同效果的拮抗菌,為我區(qū)果樹(shù)腐爛病的生物防治替代了科學(xué)依據(jù)和材料。

        4 結(jié) 論

        新疆克拉瑪依綠城實(shí)業(yè)有限公司生態(tài)果園內(nèi)蘋(píng)果樹(shù)和李子樹(shù)腐爛病的病原菌初步確定蘋(píng)果樹(shù)腐爛病病原菌為Valsamali,李子樹(shù)腐爛病病原菌分別包括Valsamali和Valsaleucostoma。

        所得各類(lèi)拮抗真菌菌株15株,分別歸屬于鏈霉屬、諾卡氏菌屬、類(lèi)芽孢菌屬及芽孢菌屬,總計(jì)4個(gè)屬9個(gè)種,其中芽孢菌屬涉及種類(lèi)最多,共5個(gè)種;其次鏈霉屬,涉及2個(gè)種。

        篩選到高效拮抗細(xì)菌2株,芽孢桿菌B4和B6對(duì)腐爛病具有較好抑菌效果,其最大抑菌圈菌落比可分別達(dá)到2.11和2.79,但兩者對(duì)病原菌的抑菌圈形狀不同。

        參考文獻(xiàn)(References)

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