楊正久, 代建忠, 梁大敏, 毛朝坤, 董紅梅, 馬增鳳
(1.遵義醫(yī)藥高等專科學(xué)校醫(yī)學(xué)技術(shù)系,貴州遵義 563006; 2.廣西大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,廣西南寧 530005)
黨參為桔??泣h參屬植物,川黨參產(chǎn)于四川、貴州、湖南、湖北、陜西等省,歷史悠久,品種較多,已大量人工栽種,不同品種間的性狀與藥用成分含量存在差異。洛龍黨參又名洛黨,產(chǎn)于貴州省道真仡佬族苗族自治縣東北部的洛龍山區(qū)而得名,是川黨參的生態(tài)變種[1],以其肉質(zhì)鮮嫩、藥用價(jià)值高而深受外界青睞。黨參主要成分有多糖、黨參苷、甾醇類、生物堿、內(nèi)酯類、豆素類等,具有益氣生津、補(bǔ)脾養(yǎng)胃的功效,用于脾肺虛弱、氣短心悸、虛喘咳嗽、內(nèi)熱消渴等病癥[2]。余蘭等研究表明,洛龍黨參的多糖含量達(dá)25.6%~27.75%,比其他川黨參高10.97%[3]。
目前分子標(biāo)記用于黨參種質(zhì)遺傳多樣性的研究較少,利用簡(jiǎn)單重復(fù)序列區(qū)間(ISSR)分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)道真洛龍黨參種質(zhì)資源遺傳多樣性方面的研究還尚未見報(bào)道。本研究利用ISSR技術(shù)對(duì)道真陽溪和壩羊的洛龍黨參與四川、重慶等地其他川黨參的種質(zhì)遺傳多樣性進(jìn)行研究,為貴州省遵義市種植黨參品種的鑒定、篩選利用及遺傳改良提供方法和理論依據(jù)。
本研究共采用12個(gè)黨參品種(表1),分別來自貴州省遵義道真縣、重慶、湖北及四川種植黨參種子萌發(fā)的嫩葉。選取成熟種子,脫粒去雜,催芽后,置于放有濾紙的培養(yǎng)皿上于 25 ℃ 萌發(fā),發(fā)芽3~5 cm高時(shí)取幼苗嫩葉,置于-40 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
主要儀器:GelDoc XR+凝膠成像系統(tǒng)(BIO-RAD),Eppendorf Mastercycler?普通PCR儀,Smart SpecTM3000型分光光度計(jì)(BIO-RAD),VE-180型電泳槽(上海天能科技有限公司),EPS-300型電泳儀(上海天能科技有限公司),TGL-16G 臺(tái)式離心機(jī)(上海菲恰爾分析儀器有限公司)。主要試劑:丙烯酰胺、雙丙烯酰胺、硝酸銀、37%甲醛、四乙基乙二胺(TEMED)、ISSR引物(北京賽百盛基因技術(shù)有限公司)。
表1 試驗(yàn)材料及來源
取黨參試驗(yàn)材料,采用經(jīng)改進(jìn)的十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法提取DNA[4-5],用瓊脂糖凝膠電泳測(cè)定其純度,用分光光度計(jì)測(cè)定其濃度,將提取的DNA稀釋到終濃度 40 ng/μL,用作PCR擴(kuò)增的模板。
選用提取的黨參基因組DNA為模板,進(jìn)行ISSR引物篩選和PCR反應(yīng)擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系為20 μL:模板DNA 1 μL(約30~53 ng),ISSR引物1 μL(約5 pmol),PCR mix 18 μL。擴(kuò)增程序:94 ℃ 5 min;94 ℃ min,56 ℃ 45 s,72 ℃ 1 min,共35個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min,4 ℃保存。取擴(kuò)增產(chǎn)物5 μL 在6%非變性聚丙烯酰胺凝膠上電泳分離,以0.5×TBE為緩沖液,穩(wěn)壓150 V,電泳至溴酚藍(lán)距凝膠邊緣2~3 cm處結(jié)束。采用銀染法進(jìn)行染色。
ISSR-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè)后,得到電泳圖譜,用Quantity One 6. 0分析軟件結(jié)合人工讀帶,按條帶的有無(有記為1,沒有則記為0)記錄電泳條帶,同時(shí)將出現(xiàn)頻率超過99%的條帶視為共有帶,出現(xiàn)頻率低于1%的條帶,即被視為沒有條帶而不計(jì)入內(nèi)。將讀出的數(shù)據(jù)錄入Excel,建立數(shù)據(jù)庫(kù)矩陣。
應(yīng)用NTsys 2.10e軟件,利用ISSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)計(jì)算黨參品種間的遺傳相似性系數(shù),采用非加權(quán)組平均法(UPGMA)構(gòu)建黨參品種間的遺傳關(guān)系聚類圖;將SM遺傳相似性矩陣進(jìn)行Dcenter數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化,求其特征量和特征向量,生成主坐標(biāo)二維、三維散點(diǎn)圖。
以來自道真陽溪1號(hào)和2號(hào)黨參基因組DNA作為模板,從100條引物中篩選出10條引物。利用這10條引物能在12個(gè)黨參試驗(yàn)材料中擴(kuò)增出清晰的條帶,且多態(tài)性、穩(wěn)定性和重復(fù)性較好(表2)。
表2 引物篩選及擴(kuò)增結(jié)果
本研究從100條引物中篩選出擴(kuò)增條帶清晰、重復(fù)性好、多態(tài)性豐富的10條引物,對(duì)12份供試黨參樣品進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增,共擴(kuò)增出136個(gè)可區(qū)分的DNA條帶,平均每條引物擴(kuò)增出13.6條條帶(表2)。在擴(kuò)增出的136條DNA條帶中,多態(tài)性條帶有114條,多態(tài)性條帶占比為83.82%,平均每條引物擴(kuò)增11.4條多態(tài)性條帶。其中引物UBC807和UBC811擴(kuò)增的條帶數(shù)及多態(tài)性條帶數(shù)較為豐富(圖1),DNA總條帶數(shù)分別為16條和19條,多態(tài)性條帶數(shù)分別為14條和16條。這表明川黨參種質(zhì)具有較為豐富的遺傳多樣性。
利用ISSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)計(jì)算黨參品種間的遺傳相似性系數(shù)(表3)。ISSR-PCR擴(kuò)增結(jié)果表明,12個(gè)黨參品種之間的遺傳相似性系數(shù)均在0.5以上,平均為0.683 6,處于 0.518~0.908之間。其中道真陽溪洛龍黨參品種(1)和四川樂山黨參品種(12)之間的遺傳相似性系數(shù)最小,為0.518,二者之間親緣關(guān)系最遠(yuǎn);四川樂山(12)和四川雅安(10)之間的遺傳相似性系數(shù)最大,表明二者之間的親緣關(guān)系最近。道真縣的3個(gè)洛龍黨參品種(1、2、3)之間的遺傳相似性系數(shù)均較大,在0.775以上,但道真洛龍黨參品種與四川地區(qū)的6個(gè)品種(7~12)之間的遺傳相似性系數(shù)較小,在0.50~0.65之間,表明遵義道真洛龍黨參品種與四川地區(qū)黨參品種的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
表3 遺傳相似性分析結(jié)果
基于遺傳圖距,應(yīng)用NTsys 2.10e軟件,對(duì)來自道真洛龍、四川、重慶及湖北的12個(gè)黨參品種進(jìn)行UPGMA聚類分析。如圖2所示,12個(gè)黨參品種在0.591處分為A、B 2支,來自遵義道真、重慶及湖北的6個(gè)黨參品種(1~6)聚為A支,來自四川省的6個(gè)黨參品種(7~12)聚為B支,而A支中來自道真洛龍和重慶奉節(jié)與巫山的黨參品種又聚為A1支,A1支又分為A11(道真3個(gè)品種)和A12(重慶2個(gè)品種)2支,來自湖北的黨參品種(6)單獨(dú)成1支(A2支),來自四川的6個(gè)黨參品種分為B1和B22支,但遺傳差距很小。結(jié)果表明,本研究中的12個(gè)黨參種植品種與地理分布有著明顯的相關(guān)性,來自同一地區(qū)的品種間遺傳差異較小,而不同地區(qū)的品種之間的遺傳差異最大。
主坐標(biāo)分析以黨參品種間的遺傳相似性系數(shù)矩陣為基礎(chǔ),不同品種在主坐標(biāo)圖中的位置能反映它們之間的親緣關(guān)系。品種間位置越接近,表明它們的遺傳相似性越大,親緣關(guān)系越近,反之,則表明遺傳差異越大,親緣關(guān)系越遠(yuǎn)[6]。產(chǎn)生的主坐標(biāo)二維、三維散點(diǎn)圖分別見圖3、圖4。不難看出,主坐標(biāo)分析結(jié)果與聚類分析結(jié)果一致。來自道真洛龍的3個(gè)黨參品種(1~3)遺傳相似性較高,聚集在二維圖的右上角,來自重慶及湖北的3個(gè)黨參品種分布在二維圖的右下方;來自四川的6個(gè)黨參品種(7~12)遺傳距離較遠(yuǎn),分布在二維圖的左側(cè),由于四川的6個(gè)黨參品種間的遺傳差異很小,因此密集地聚集在一起。從三維圖上更能看出品種間的分類很明顯。
DNA分子標(biāo)記技術(shù)發(fā)展至今已有幾十種,ISSR分子標(biāo)記技術(shù)由于具有成本低、可靠性及穩(wěn)定性高,試驗(yàn)操作簡(jiǎn)單、快速、高效等優(yōu)點(diǎn),被廣泛應(yīng)用到各類研究中,是理想的分子標(biāo)記技術(shù)[7-8]。利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)研究黨參遺傳多樣性的報(bào)道不多,陳大霞等用21條ISSR引物對(duì)18份川黨參材料擴(kuò)增出223個(gè)DNA條帶,其中有166個(gè)多態(tài)性條帶,平均多態(tài)率為74.44%[9];郭宏波從100條ISSR中篩選出13條引物,對(duì)來自山西和甘肅2省的150份黨參材料進(jìn)行分析,擴(kuò)增出127個(gè)清晰的DNA條帶,其中多態(tài)性條帶122個(gè),平均多態(tài)率為95.77%[10]。以上研究表明,ISSR分子標(biāo)記技術(shù)具有良好的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性,適合用于種質(zhì)資源遺傳多樣性的分析。
本研究選用洛龍黨參和四川、重慶、湖南各產(chǎn)地種植黨參品種,以黨參的幼苗為材料,對(duì)CTAB法進(jìn)行優(yōu)化改良,提取黨參基因組DNA。通過優(yōu)化PCR反應(yīng)體系,從100條不列顛哥倫比亞大學(xué)(UBC)公布的ISSR引物中篩選,以不同產(chǎn)地種植黨參的基因組DNA為模板,用篩選的ISSR引物進(jìn)行分子標(biāo)記PCR擴(kuò)增,用聚丙烯酰胺電泳對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè),有利于擴(kuò)增產(chǎn)物的分辨。本次篩選出的10條ISSR引物對(duì)12個(gè)黨參品種共擴(kuò)增出136個(gè)清晰的DNA條帶,多態(tài)性條帶114條,平均多態(tài)性比例為83.82%,最高為92.86%,最低為71.43%。其中引物UBC811擴(kuò)增出的DNA條帶總數(shù)和多態(tài)性DNA條帶數(shù)最多,分別為19條和16條;而引物UBC835擴(kuò)增的DNA條帶數(shù)最少,只有8條,多態(tài)性DNA條帶數(shù)6條。ISSR標(biāo)記DNA圖譜表明,洛龍黨參與其他川黨參具有豐富的基因資源?;蛐褪沁z傳和生態(tài)2個(gè)因素長(zhǎng)期復(fù)雜的相互作用的產(chǎn)物,土壤和地理環(huán)境對(duì)種內(nèi)變異起重要作用[11]。黨參大面積的種植通常采用種子和種根2種繁殖方式[9],零星種植也常采用野生種及半野生種的馴化栽培,因此黨參種源復(fù)雜,加上道真、四川、重慶及湖北等地不同土壤和地理環(huán)境以及氣候與光照的影響,造成了黨參品種具有豐富的遺傳多樣性。
遺傳相似性分析與基于遺傳距離的聚類分析及主坐標(biāo)分析顯示,12個(gè)黨參品種遺傳距離與地理位置分布有著明顯的相關(guān)性。四川省的6個(gè)黨參品種遺傳距離較遠(yuǎn),形成1支,且品種間的遺傳距離很近,相似性高;道真洛龍黨參與重慶黨參品種遺傳相似性最高,與湖北黨參品種間的遺傳相似性次之,與四川省的黨參品種遺傳相似性最低。張建清等利用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA標(biāo)記(RAPD)技術(shù)分析甘肅栽培黨參的遺傳多樣性時(shí),也發(fā)現(xiàn)黨參栽培居群的遺傳距離與地理分布呈現(xiàn)一定的相關(guān)性[12],這可能與地域間基因的流動(dòng)受限有關(guān),也與大面積黨參種植采用種根繁殖有關(guān), 影響了黨參種質(zhì)的遺傳多樣性。因此,建議在今后的黨參育種過程中,考慮開展不同優(yōu)良品種中種群間的雜交育種,以獲得更廣泛的遺傳基礎(chǔ),培育出優(yōu)良的新品種。
參考文獻(xiàn):
[1]陳璺,韓豐,楊建敏,等. 洛龍黨參貯藏保鮮技術(shù)研究[J]. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,37(9):216-217.
[2]龔其海,趙萬,余蘭,等. 兩種黨參多糖對(duì)小鼠免疫功能影響的比較[J]. 遵義醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào),2012,4(34):268-270.
[3]余蘭,陳華,婁方明,等. 洛龍黨參的多糖含量測(cè)定[J]. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué),2010,38(7):190-191.
[4]周東新,祁建民,吳為人,等. 黃麻DNA提取與RAPD反應(yīng)體系的建立[J]. 福建農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2001(3):334-339.
[5]白風(fēng)虎,李德芳,陳安國(guó),等. 改良CTAB法用于提取紅麻成熟葉片高質(zhì)量DNA的研究[J]. 中國(guó)麻業(yè)科學(xué),2007,29(3):158-161.
[6]何峰,唐燦,王子雯,等. 巴中梔子遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 中國(guó)醫(yī)院藥學(xué)雜志,2014,10(34):782-786.
[7]Nagaoka T O,Gl I Y. Applicability of inter-simple sequence repeat polymorphisms in wheat for use as DNA markers in comparison to RFLP and RAPD markers[J]. Theoretical and Applied Genetics,1997,94(5):597-602.
[8]Gilbert J E,Levis R V,Wilkinson M J. Developing an appiopriate strategy to assess genetic variability in plant germplasm collections[J]. Theoretical and Applied Genetics,1999,98(6/7):1125-1131.
[9]陳大霞,彭銳,李隆云,等. 利用SRAP和ISSR標(biāo)記分析川黨參的遺傳多樣性[J]. 中國(guó)中藥雜志,2009,3(34):255-259.
[10]郭宏波. 野生與栽培黨參遺傳多樣性及其保存和保護(hù)策略研究[D]. 上海:復(fù)旦大學(xué),2007.
[11]王曉明,謝碧霞,李俊彬,等. 金銀花ISSR分子標(biāo)記及遺傳多樣性分析[J]. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào),2008,28(6):14-18.
[12]張建清,蘇雪,吳瓊,等. 藥用植物黨參的RAPD分析[J]. 中藥材,2006,29(5):417-420.