根據(jù)湯森路透公司“基本科學(xué)指標(biāo)數(shù)據(jù)庫”（essential science indicators，ESI）2017年5月12日發(fā)布的最新數(shù)據(jù)顯示，福建中醫(yī)藥大學(xué)醫(yī)學(xué)論文影響力首次進入ESI全球排名前1%行列。此次數(shù)據(jù)更新節(jié)點為2017年5月11日，覆蓋時間為2007年1月1日—2017年2月28日。

福建中醫(yī)藥大學(xué)與廣東藥科大學(xué)、安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)、內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)等其余8所院校作為新晉高校首次入榜。在全國中醫(yī)藥院校當(dāng)中，福建中醫(yī)藥大學(xué)成為繼南京中醫(yī)藥大學(xué)、上海中醫(yī)藥大學(xué)、北京中醫(yī)藥大學(xué)、廣州中醫(yī)藥大學(xué)、浙江中醫(yī)藥大學(xué)之后擁有ESI全球前1%學(xué)科的中醫(yī)藥院校，總被引用頻次在全球機構(gòu)排3711位，全國排名75位。

ESI是基于湯森路透公司所收錄的全球12000多種學(xué)術(shù)期刊的1000多萬條文獻記錄而建立的計量分析數(shù)據(jù)庫，是當(dāng)今普遍用于評價大學(xué)和科研機構(gòu)國際學(xué)術(shù)水平及影響的重要指標(biāo)，也是全球公認(rèn)的判斷學(xué)科發(fā)展水平的重要參照之一。其數(shù)據(jù)庫以學(xué)科分門別類（共分22個學(xué)科），以10年為1個周期對全球所有大學(xué)及科研機構(gòu)的SCI、SSCI論文及其引用情況等進行統(tǒng)計和比較，按“總引用次數(shù)”排列在前1%的學(xué)科方可進入ESI學(xué)科排行，同時給出排名進入全球前1%的大學(xué)及科研機構(gòu)的排序，每2個月更新公布1次。