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        基于節(jié)點(diǎn)相似度的社團(tuán)劃分方法研究?

        2018-03-20 07:11:00甘立強(qiáng)王旭陽
        關(guān)鍵詞:復(fù)雜度俱樂部社團(tuán)

        甘立強(qiáng) 王旭陽 燕 楠 王 嵐

        (1.中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院中國科學(xué)院人機(jī)智能協(xié)同系統(tǒng)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 深圳 518055)(2.蘭州理工大學(xué)計(jì)算機(jī)與通信學(xué)院 蘭州 730050)

        1 引言

        近年來復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)得到了廣泛的應(yīng)用,如萬維網(wǎng)、社會(huì)網(wǎng)、蛋白質(zhì)交互網(wǎng)以及科學(xué)家合作關(guān)系網(wǎng)等。這些網(wǎng)絡(luò)具有較高的復(fù)雜性,因此被稱為“復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)”[1]。復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)成為當(dāng)前最重要的多學(xué)科交叉研究領(lǐng)域之一[2]。隨著對(duì)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)性質(zhì)的物理意義和數(shù)學(xué)特性的深入研究,人們發(fā)現(xiàn)許多復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)都具有一個(gè)共同的性質(zhì),即社團(tuán)結(jié)構(gòu)[3]。社團(tuán)內(nèi)部各節(jié)點(diǎn)之間連接緊密,而不同社團(tuán)節(jié)點(diǎn)之間連接稀疏。社團(tuán)結(jié)構(gòu)分析在生物學(xué)、物理學(xué)、計(jì)算機(jī)圖形學(xué)和社會(huì)學(xué)等領(lǐng)域內(nèi)有著廣泛的應(yīng)用。

        目前,學(xué)者們已經(jīng)提出了很多有效的社團(tuán)檢測(cè)方法,比如基于分裂思想的GN算法[4],自包含GN算法[5]、基于相異性的分裂算法[6]。該類算法劃分效果較好,但是時(shí)間復(fù)雜度太高,不適合在大型網(wǎng)絡(luò)中使用,隨后學(xué)者們根據(jù)上述缺點(diǎn)提出了基于凝聚 思 想 的 Newman 快 速 算 法[7]、CNM 算 法[8]、MSG-VM[9],但是這些算法容易將過多的節(jié)點(diǎn)劃分到同一社團(tuán),導(dǎo)致社團(tuán)過大,與真實(shí)網(wǎng)絡(luò)的劃分情況不相符。因此,針對(duì)這些缺點(diǎn)學(xué)者們又相繼提出了 LPAm 算法[10]、SYM[11]、CHM[12]、ILM[13]等,這些算法同樣存在很多問題,諸如LPAm算法的穩(wěn)定性不高,時(shí)間復(fù)雜度雖然較小,但是不容易得到最優(yōu)結(jié)果,CHM算法空間復(fù)雜度高,需要較大的內(nèi)存空間,不適合大型網(wǎng)絡(luò),ILM算法參數(shù)選擇困難,算法穩(wěn)定性差等。

        針對(duì)上述存在的問題,通過比較研究各種網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)相似度的構(gòu)造方法,通過綜合考慮網(wǎng)絡(luò)的局部信息和全局信息,設(shè)計(jì)了新的構(gòu)造節(jié)點(diǎn)相似度的方法,進(jìn)而提出了基于節(jié)點(diǎn)相似度的社團(tuán)劃分算法。該算法在不需要知道任何關(guān)于網(wǎng)絡(luò)的先驗(yàn)知識(shí)的情況下,仍然取得了較好的劃分結(jié)果。

        2 基本概念

        2.1 節(jié)點(diǎn)相似度

        構(gòu)造節(jié)點(diǎn)相似度方法目前主要是基于網(wǎng)絡(luò)的局部信息[14],比如 Salto[15]、Jaccard[16]、Hub Pr-omot?ed[17]、Leicht-Holme-Newman[18]、RA[19]等。其中 RA方法是目前效果最好的節(jié)點(diǎn)相似度的構(gòu)造方法[19]。

        RA方法是通過模擬網(wǎng)絡(luò)中資源的分配過程來衡量兩個(gè)節(jié)點(diǎn)的相似度。假設(shè)有一個(gè)節(jié)點(diǎn)對(duì)(i,j),節(jié)點(diǎn) j通過它們的共同鄰居節(jié)點(diǎn)作為中介間接地向節(jié)點(diǎn)i發(fā)送一定資源。同時(shí)規(guī)定每個(gè)中介能擁有的資源是一定的。因此每個(gè)中介發(fā)送給節(jié)點(diǎn)i的資源取決于它的度。資源分配過程如圖1,我們可以把節(jié)點(diǎn)i收到節(jié)點(diǎn) j發(fā)送的資源的多少定義為節(jié)點(diǎn)i和節(jié)點(diǎn) j的相似度:

        其中,Γ(i)代表節(jié)點(diǎn)i的所有鄰居節(jié)點(diǎn)的集合,z∈Γ(i)∩Γ(j)代表節(jié)點(diǎn)i和節(jié)點(diǎn) j共同鄰居節(jié)點(diǎn)的集合,k(z)代表節(jié)點(diǎn)z的度。

        但是這種只是依靠網(wǎng)絡(luò)的局部信息作為衡量相似度的標(biāo)準(zhǔn)容易過度追求局部最優(yōu),忽視了網(wǎng)絡(luò)整體的結(jié)構(gòu),造成與實(shí)際網(wǎng)絡(luò)不符的情況,例如將RA算法應(yīng)用在經(jīng)典的Zachary空手道俱樂部網(wǎng)絡(luò)中,按照式(1)計(jì)算節(jié)點(diǎn)之間的相似度,發(fā)現(xiàn)節(jié)點(diǎn)3對(duì)應(yīng)的最大相似度節(jié)點(diǎn)是節(jié)點(diǎn)34,應(yīng)該被分到同一個(gè)社團(tuán)中,但是現(xiàn)實(shí)網(wǎng)絡(luò)中它們被分到了以教練和主管為首的兩個(gè)社團(tuán)中。所以劃分社團(tuán)中應(yīng)該考慮網(wǎng)絡(luò)的全局拓?fù)湫畔ⅰH绻麅蓚€(gè)節(jié)點(diǎn)的距離越近,即它們之間的最短路徑越短,這兩個(gè)節(jié)點(diǎn)同屬于一個(gè)社團(tuán)的機(jī)會(huì)就越大,反之,則它們屬于一個(gè)社團(tuán)的機(jī)會(huì)就越?。?0]。因此綜合兩個(gè)節(jié)點(diǎn)間共同鄰居的網(wǎng)絡(luò)局部信息和節(jié)點(diǎn)間最短路徑的網(wǎng)絡(luò)全局信息,本文重新定義了節(jié)點(diǎn)相似度Sim(i,j):

        其中d(i,j)表示節(jié)點(diǎn)i和節(jié)點(diǎn) j之間最短路徑長度,n代表網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)數(shù)目,節(jié)點(diǎn)i,j可達(dá)是指節(jié)點(diǎn)i,j之間存在路徑將其連通。當(dāng)d(i,j)越小時(shí),1 d(i,j)越大,則 Sim(i,j)就越大,兩個(gè)節(jié)點(diǎn)越相似。同時(shí)如果兩個(gè)節(jié)點(diǎn)之間沒有可以到達(dá)的路徑,這說明這兩個(gè)節(jié)點(diǎn)之間的資源交換主要依靠鄰居節(jié)點(diǎn),相對(duì)于直接相連的節(jié)點(diǎn),交換的資源較少,可以忽略。因此我們把相似度設(shè)置為0。因?yàn)镾i,j本身很小,再除以d(i,j)結(jié)果可能小到超出計(jì)算機(jī)的表示范圍,就會(huì)出現(xiàn)浮點(diǎn)數(shù)下溢出的情況,將該運(yùn)算結(jié)果處理成機(jī)器零,這時(shí)就無法對(duì)相似度進(jìn)行比較。所以乘以n對(duì)結(jié)果進(jìn)行適當(dāng)?shù)姆糯?,防止這種情況發(fā)生。

        圖1 網(wǎng)絡(luò)資源流動(dòng)過程圖

        2.2 模塊度和準(zhǔn)確率

        社團(tuán)模塊度[20]是Newman等引進(jìn)的一個(gè)衡量網(wǎng)絡(luò)劃分質(zhì)量的度量標(biāo)準(zhǔn)。假設(shè)有某種劃分形式,將網(wǎng)絡(luò)劃分為k個(gè)社團(tuán),定義一個(gè)k×k維的對(duì)稱矩陣E=(eij),其中eij表示網(wǎng)絡(luò)中連接兩個(gè)不同社團(tuán)的節(jié)點(diǎn)的邊在所有邊中所占的比例,這兩個(gè)節(jié)點(diǎn)分別位于第i和第 j個(gè)社團(tuán)。模塊度Q可表示為

        3 基于節(jié)點(diǎn)相似度的社團(tuán)劃分方法

        3.1 基本思想

        兩個(gè)節(jié)點(diǎn)的相似度越大,屬于同一個(gè)社團(tuán)的概率越大[21],根據(jù)這一思想,本算法利用節(jié)點(diǎn)之間的相似性,判斷兩個(gè)節(jié)點(diǎn)是否屬于同一個(gè)社團(tuán)。

        對(duì)于一個(gè)含有n個(gè)節(jié)點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò),首先根據(jù)式(2)計(jì)算網(wǎng)絡(luò)中所有節(jié)點(diǎn)對(duì)的相似度。由此我們可以得到一個(gè) n×n的矩陣 Sim(n,n)=[ ]Sim(i,j) 。Sim(i,j)代表的是兩個(gè)節(jié)點(diǎn)之間的相似度。為了方便處理數(shù)據(jù),我們把這個(gè)矩陣的每一行用鏈表存起來,頭節(jié)點(diǎn)保存節(jié)點(diǎn)i,頭節(jié)點(diǎn)的next節(jié)點(diǎn)保存節(jié)點(diǎn)i對(duì)應(yīng)的相似度最大的節(jié)點(diǎn) j。如果有多個(gè)相似度相同的節(jié)點(diǎn),則把它們都保存起來。算法具體步驟:

        1)首先將每個(gè)節(jié)點(diǎn)看作是一個(gè)社團(tuán),選擇任意一個(gè)節(jié)點(diǎn)作為初始節(jié)點(diǎn);

        2)然后從剩余的節(jié)點(diǎn)中選擇和這個(gè)節(jié)點(diǎn)相似度最大的節(jié)點(diǎn),將它們合并成一個(gè)新的社團(tuán);

        3)最后再將新加入的節(jié)點(diǎn)作為初始節(jié)點(diǎn),尋找和它相似度最大的節(jié)點(diǎn)。如果找到的這個(gè)節(jié)點(diǎn)不在當(dāng)前的社團(tuán)中,則把這個(gè)節(jié)點(diǎn)合并到當(dāng)前社團(tuán),如果在的話,就隨機(jī)從剩余未處理的節(jié)點(diǎn)中選擇一個(gè)作為初始節(jié)點(diǎn),回到2);

        4)重復(fù)執(zhí)行步驟2)和3),直到處理完所有的節(jié)點(diǎn)。

        為了更清楚地表達(dá)本文算法的思想,我們構(gòu)建了一個(gè)含有8個(gè)節(jié)點(diǎn)的小網(wǎng)絡(luò)(如圖2)。

        首先計(jì)算每個(gè)節(jié)點(diǎn)和它鄰居節(jié)點(diǎn)的節(jié)點(diǎn)相似度,然后找出每個(gè)節(jié)點(diǎn)以及它對(duì)應(yīng)的相似度最大的節(jié)點(diǎn)(結(jié)果如表1)。

        圖2 示例網(wǎng)絡(luò)

        表1 對(duì)應(yīng)的最大相似度節(jié)點(diǎn)列表

        然后隨機(jī)地選擇一個(gè)節(jié)點(diǎn),用帶箭頭的線段將當(dāng)前節(jié)點(diǎn)和對(duì)應(yīng)的相似度最大的節(jié)點(diǎn)連接起來,箭頭指向的是對(duì)應(yīng)的相似度最大的節(jié)點(diǎn)。同時(shí),線段兩端的節(jié)點(diǎn)合并到同一個(gè)網(wǎng)絡(luò)。等到標(biāo)記完網(wǎng)絡(luò)中所有的節(jié)點(diǎn),劃分過程結(jié)束,得到最后的劃分結(jié)果(如圖3)。

        圖3 本文算法劃分結(jié)果

        針對(duì)上述步驟,有一種特殊情況需要說明,如果一個(gè)節(jié)點(diǎn)和它所有的鄰居節(jié)點(diǎn)都沒有共同的鄰居節(jié)點(diǎn),則這個(gè)節(jié)點(diǎn)和其它所有節(jié)點(diǎn)的相似度都等于0,因此按照上述算法無法完成劃分,這種情況下我們把這個(gè)節(jié)點(diǎn)劃分到它鄰居節(jié)點(diǎn)中度最大的那個(gè)節(jié)點(diǎn)所在的社團(tuán)中。因?yàn)橐粋€(gè)節(jié)點(diǎn)的度越大,它就越重要,新來的節(jié)點(diǎn)就傾向于和這個(gè)節(jié)點(diǎn)靠攏[22]。同時(shí)為了進(jìn)一步提高劃分社團(tuán)的準(zhǔn)確率,我們引進(jìn)一個(gè)相似度閾值ε,當(dāng)一個(gè)節(jié)點(diǎn)和它所有鄰居節(jié)點(diǎn)的最大相似度小于ε時(shí),我們就把這個(gè)具有最大相似度的節(jié)點(diǎn)劃分到它所有鄰居節(jié)點(diǎn)中度最大節(jié)點(diǎn)所在的社團(tuán)中,因?yàn)槿绻嗨贫群苄?,依然使用?jié)點(diǎn)的這個(gè)屬性作為劃分標(biāo)準(zhǔn)的話,容易過擬合。針對(duì)不同的網(wǎng)絡(luò)這個(gè)ε也不同,我們可以通過調(diào)整ε的值來獲得更好的劃分效果。

        3.2 算法性能分析

        本算法需要時(shí)間的步驟主要包括三部分:計(jì)算節(jié)點(diǎn)相似度,尋找下一個(gè)需要處理的節(jié)點(diǎn),合并社團(tuán)。由于下一個(gè)要處理的節(jié)點(diǎn)是當(dāng)前節(jié)點(diǎn)對(duì)應(yīng)的相似度最大的節(jié)點(diǎn),并且之前我們已經(jīng)把這兩個(gè)節(jié)點(diǎn)存在一個(gè)以當(dāng)前節(jié)點(diǎn)為頭節(jié)點(diǎn)的鏈表中,因此可以直接獲取到下一個(gè)需要處理的節(jié)點(diǎn),因此這部分的計(jì)算時(shí)間可以忽略。計(jì)算節(jié)點(diǎn)相似度只需要知道它最近的鄰居節(jié)點(diǎn)的信息,因此計(jì)算量非常小。計(jì)算式(2)的時(shí)間復(fù)雜度是O()1,計(jì)算一個(gè)節(jié)點(diǎn)和它的k個(gè)鄰居節(jié)點(diǎn)相似度的時(shí)間復(fù)雜度就是O(k),k是網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)的平均的度。因此計(jì)算有n個(gè)節(jié)點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)所需要的時(shí)間復(fù)雜度為O(kn)。合并一個(gè)節(jié)點(diǎn)和它相似度的節(jié)點(diǎn)所需要的時(shí)間復(fù)雜度明顯的是O(1)。所以將網(wǎng)絡(luò)中所有n個(gè)節(jié)點(diǎn)都合并花費(fèi)的時(shí)間復(fù)雜度是O(n)。使用Dijkstra算法計(jì)算網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)之間的最短路徑的時(shí)間復(fù)雜度為O(n2),所以算法時(shí)間復(fù)雜度為O(k+n)n≈O(n2)(k<<n)。而CHM、ILM算法的時(shí)間復(fù)雜度也同樣為O(n2)。

        4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

        4.1 Zachary空手道俱樂部網(wǎng)絡(luò)

        空手道俱樂部網(wǎng)絡(luò)是描述美國一所大學(xué)里空手道俱樂部里俱樂部成員之間關(guān)系的網(wǎng)絡(luò)[23],該網(wǎng)絡(luò)由Zachary耗時(shí)兩年研究出來的。此網(wǎng)絡(luò)含有34個(gè)節(jié)點(diǎn)和78條邊,節(jié)點(diǎn)表示俱樂部中的成員,邊表示俱樂部成員之間的關(guān)系。通過研究發(fā)現(xiàn),由于俱樂部主管JohnA(node 34)和俱樂部教練員Mr.Hi(node 1)之間產(chǎn)生分歧,俱樂部被劃分成了以主管和教練為首的兩個(gè)團(tuán)體。首先通過式(2)計(jì)算每個(gè)節(jié)點(diǎn)的和鄰居節(jié)點(diǎn)的相似度,然后找出最大相似度的節(jié)點(diǎn),結(jié)果如表2。然后用本文算法對(duì)其進(jìn)行劃分,圖4描述了此次劃分的過程(ε=0.88)。由結(jié)果可以看出本文算法劃分的結(jié)果與現(xiàn)實(shí)中的劃分結(jié)果一致。

        表2 Zachary網(wǎng)絡(luò)中對(duì)應(yīng)的最大相似度節(jié)點(diǎn)列表

        圖4 Zachary網(wǎng)絡(luò)的劃分過程

        表3表示將本文算法與Newman快速算法和CNM算法進(jìn)行比較,通過結(jié)果可以看出本文算法模塊度更大,準(zhǔn)確率更高,因此本文算法更適合劃分Zachary空手道俱樂部網(wǎng)絡(luò)。

        表3 不同算法的性能比較

        4.2 美國大學(xué)足球賽網(wǎng)絡(luò)

        美國大學(xué)足球賽網(wǎng)絡(luò)[24]由115個(gè)節(jié)點(diǎn)613條邊組成。每個(gè)節(jié)點(diǎn)代表一支球隊(duì),每條邊代表端點(diǎn)上的兩支隊(duì)伍進(jìn)行過比賽。這些球隊(duì)被劃分成若干個(gè)小組,每個(gè)小組有8~12名球員,同組內(nèi)球隊(duì)進(jìn)行比賽的次數(shù)要比組間球隊(duì)之間比賽的次數(shù)多。如圖5(ε=0.7)所示本文算法將網(wǎng)絡(luò)劃分11個(gè)社團(tuán),其中7個(gè)社團(tuán)和現(xiàn)實(shí)網(wǎng)絡(luò)中的社團(tuán)一致,但是CNM算法只劃分出7個(gè)社團(tuán),其中劃分完全正確的社團(tuán)只有4個(gè)。所以本文提出的算法劃分社團(tuán)的準(zhǔn)確率更高。表4表示的是本文算法與Newman快速和CNM算法的從模塊度和準(zhǔn)確率上對(duì)比的結(jié)果,從數(shù)據(jù)上看,本文算法要優(yōu)于Newman快速算法和CNM算法。

        圖5 美國大學(xué)足球賽網(wǎng)絡(luò)

        表4 不同算法性能比較

        4.3 海豚社會(huì)網(wǎng)絡(luò)

        Lusseau等在新西蘭對(duì)62只寬吻海豚的生活習(xí)性進(jìn)行了長時(shí)間的觀察,他們研究發(fā)現(xiàn)這些海豚的交往呈現(xiàn)出特定的模式,并構(gòu)造了包含有62個(gè)結(jié)點(diǎn)的社會(huì)網(wǎng)絡(luò)[25]。如果某兩只海豚經(jīng)常一起頻繁活動(dòng),那么網(wǎng)絡(luò)中相應(yīng)的兩個(gè)結(jié)點(diǎn)之間就會(huì)有一條邊存在。利用本算法劃分的結(jié)果如圖6(ε=0.75)所示。從圖6可以看出,本文算法劃分的結(jié)果與現(xiàn)實(shí)中的劃分較為符合。

        圖6 海豚社會(huì)網(wǎng)絡(luò)

        5 結(jié)語

        目前節(jié)點(diǎn)相似度的構(gòu)造方法大多數(shù)是基于網(wǎng)絡(luò)的局部信息,使用這種構(gòu)造方法的節(jié)點(diǎn)相似度容易使算法陷入局部最優(yōu),使得劃分結(jié)果和真實(shí)網(wǎng)絡(luò)差異較大,針對(duì)這一缺點(diǎn),本文綜合網(wǎng)絡(luò)局部信息和全局信息,重新定義了節(jié)點(diǎn)相似度,并設(shè)計(jì)了基于凝聚思想的劃分算法,通過與CHM算法、ILM算法的對(duì)比,在時(shí)間復(fù)雜度相當(dāng)?shù)那闆r下,經(jīng)過仿真實(shí)驗(yàn)證明,本文算法可以更好地對(duì)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行劃分。因此,可以將本文算法用于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)中的社團(tuán)劃分。

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