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        菠菜SoGSNOR基因的克隆及原核表達

        2018-03-15 11:00:16郭兆來白學(xué)貴李昆志徐慧妮
        華北農(nóng)學(xué)報 2018年1期
        關(guān)鍵詞:亞硝基原核谷胱甘肽

        郭兆來,白學(xué)貴,李昆志,徐慧妮

        (昆明理工大學(xué) 生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,云南 昆明 650500)

        一氧化氮(Nitric oxide,NO)是一種在植物生長發(fā)育及脅迫應(yīng)答等方面發(fā)揮重要作用的氣體信號分子[1-7]。低濃度的NO傳導(dǎo)脅迫信號保護植物免受傷害,高濃度的NO具有很強的自由基活性,可以引起一些毒性效應(yīng)。在細胞內(nèi)NO基團可以轉(zhuǎn)移到靶蛋白的巰基上,形成S-亞硝基硫醇(Nitrosthiols,SNOs),這個過程被稱為S-亞硝基化(S-nitrosylation)[8]。越來越多的證據(jù)表明,蛋白質(zhì)S-亞硝基化是NO發(fā)揮生物活性的主要機制[9-10]。

        NO可以與體內(nèi)主要的抗氧化物質(zhì)谷胱甘肽(GSH)反應(yīng)生成S-亞硝基谷胱甘肽(GSNO)。S-亞硝基谷胱甘肽還原酶(GSNOR),以前也被命名為還原型谷胱甘肽依賴型甲醛脫氫酶,屬于醇脫氫酶Ⅲ類(ADH3)家族,普遍存在于所有生物中[11]。GSNOR通過促進GSNO代謝、降低NO的生物活性以間接調(diào)控蛋白亞硝基化的水平,進而參與植物生長發(fā)育、氣孔信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、病原菌抵御、高溫耐受性等多種生理過程[12-15]。低溫、高溫、連續(xù)光照、連續(xù)黑暗以及機械傷害處理下豌豆和向日葵中的GSNOR活性降低[16],砷脅迫下擬南芥中GSNOR活性增加,而鎘脅迫下豌豆葉片GSNOR活性降低,并伴隨NO和GSH含量降低[17],表明不同的植物受到的脅迫不同,GSNOR活性可能不同,而GSNOR在菠菜中是否存在以及其功能如何未見報道。

        為了獲得菠菜中的GSNOR基因序列,通過對已有物種的GSNOR序列分析,設(shè)計兼并引物,采用RT-PCR和RACE技術(shù)獲得菠菜GSNOR基因全長cDNA序列,并命名為SoGSNOR,將SoGSNOR編碼區(qū)重組到pET32a原核表達載體,誘導(dǎo)獲得純化蛋白并制備多克隆抗體,為進一步研究SoGSNOR在菠菜中的作用機制奠定基礎(chǔ)。

        1 材料和方法

        1.1 試劑

        基因克隆、電泳檢測、目的片段回收、載體構(gòu)建所用到的分子試劑為大連寶生物公司產(chǎn)品。蛋白純化試劑盒為Promega公司產(chǎn)品;Western Blot所用試劑為康為世紀生物科技有限公司產(chǎn)品。本研究中所用引物均由上海捷瑞生物公司合成。

        1.2 試驗方法

        1.2.1SoGSNOR基因的克隆為了克隆菠菜的GSNOR基因,首先在NCBI網(wǎng)站比對其他物種GSNOR基因的同源序列,設(shè)計兼并引物,F(xiàn)1:ATGGC(T/A/G)AC(T/A)CAAGG(C/T)(C/A)A(A/G)GT(C/T/A)AT和R1:CCACC(A/G)AAAGC(T/A)GT(T/A)CC(T/C)TTCC,R2:CT(A/G)TA(G/A)TCAAC(T/A)CC(G/A/T)CCATC(T/A)GT。先用F1和R1進行第1輪擴增,反應(yīng)條件為 94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,50 ℃ 30 s,72 ℃ 60 s,共20個循環(huán);最后一次循環(huán)結(jié)束后72 ℃延伸10 min。將擴增產(chǎn)物稀釋10倍后用引物F1和R2進行第2輪擴增,反應(yīng)條件為94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 60 s, 30個循環(huán);72 ℃延伸10 min?;厥漳康臈l帶,連接到pMD18-T載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌,提取質(zhì)粒進行PCR和酶切檢測,測序獲得基因的5′端序列。根據(jù)獲得的基因序列,利用3′RACE獲得基因的3′端序列。設(shè)計引物F2:TTTGGTCTTGGAACTGTAGG和F3:GTGGTGTATCTACGGGTCT,下游引物為B26:GACTCGAGTCGACATCGATTTTTTTTTTTTTTTT

        TT。反應(yīng)條件與5′端克隆一樣進行巢式PCR,以F2 和B26引物擴增后的產(chǎn)物為模板,利用F3 和B26進行第2輪擴增。然后根據(jù)所得到的序列設(shè)計特異的全長和原核表達載體構(gòu)建引物SoGSNOR-F-BamHⅠ:ggatccATGGCGACACAAGGCCAAG和SoGSNOR-R-XholⅠ:ctcgagTGGTTGATTTATTCATGCGC(小寫字母為酶切位點)進行PCR擴增,得到SoGSNOR基因編碼區(qū)序列。

        1.2.2 原核表達載體pET32a-SoGSNOR的構(gòu)建 將pMD18T-SoGSNOR質(zhì)粒和原核表達載體pET32a質(zhì)粒用BamH Ⅰ和XholⅠ進行雙酶切,將回收的SoGSNOR片段與酶切后pET32a空載體用T4DNA連接酶連接過夜,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,篩選陽性克隆,測序,判斷所插入的序列是否正確。

        1.2.3 SoGSNOR重組蛋白的原核表達 測序正確后的pET32a-SoGSNOR質(zhì)粒轉(zhuǎn)化E.coliBL21感受態(tài)細胞,篩選陽性克隆,根據(jù)郭兆來等[18]方法進行原核表達,SDS-PAGE檢測SoGSNOR重組蛋白的表達情況。

        1.2.4 pET32a-SoGSNOR融合蛋白的純化及多克隆抗體的制備 首先對蛋白表達條件進行優(yōu)化,然后對大量培養(yǎng)的含pET32a-SoGSNOR的表達菌株進行誘導(dǎo),離心回收沉淀,超聲波破碎5 min,粗裂解液經(jīng)10 000 r/min離心15 min,收集上清液,利用Ni2+NTA親和柱按照說明書純化回收目的蛋白,最后進行SDS-PAGE分析。用純化得到的融合蛋白為抗原,免疫昆明小鼠獲得抗血清。

        1.2.5 Western Blot檢測SoGSNOR多克隆抗體 將誘導(dǎo)后的原核表達樣品蛋白進行SDS-PAGE電泳后,經(jīng)Biorad電轉(zhuǎn)儀轉(zhuǎn)膜進行Western Blot 操作,具體步驟根據(jù)郭兆來等[18]方法進行。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 SoGSNOR的克隆及序列分析

        根據(jù)其他物種的GSNOR基因序列,設(shè)計兼并引物,通過RT-PCR和3′RACE技術(shù)擴增菠菜SoGSNOR的編碼框(ORF)序列(圖1)。通過5′端的克隆,獲得了780 bp的片段(圖1-A),通過3′端的克隆,獲得850 bp的片段。在拼接序列兩端設(shè)計特異引物SoGSNOR-F-BamH Ⅰ和SoGSNOR-R-Xhol Ⅰ進行PCR擴增(圖1-C),測序序列與基因的3′端和5′端拼接的結(jié)果一致,確定該3′端和5′端為同一基因的兩段序列。

        SoGSNORcDNA序列全長1 378 bp,編碼框1 140 bp,編碼379個氨基酸(圖2),預(yù)測分子量為40.7 ku,等電點為6.82。將序列在NCBI網(wǎng)站注冊,獲得GenBank登錄號為KR381778。

        Marker.DNA ladder Marker.

        2.2 pET32a-SoGSNOR原核表達載體的構(gòu)建

        提取pMD18T-SoGSNOR和原核表達載體pET32a

        的質(zhì)粒,利用BamH Ⅰ和Xhol Ⅰ進行雙酶切、回收目的片段,連接,獲得重組載體pET32a-SoGSNOR。將重組載體質(zhì)粒進行BamH Ⅰ和Xhol Ⅰ雙酶切,從圖3可以看出,可切出目的條帶。此外,測序結(jié)果也表明原核表達載體pET32a-SoGSNOR成功構(gòu)建。

        2.3 pET32a-SoGSNOR原核表達

        將構(gòu)建好的pET32a-SoGSNOR原核表達載體轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)。分別在16,28,37 ℃將含有pET32a-SoGSNOR菌株用1 mmol/L IPTG誘導(dǎo)0,2,4,6,8 h后,SDS-PAGE分析大腸桿菌總蛋白的表達情況。如圖4所示,重組質(zhì)粒pET32a-SoGSNOR在接近66.2 ku處表達出1條特異蛋白條帶,且在16 ℃時,其表達量在0~8 h內(nèi)隨處理時間的增加而增加。

        圖2 SoGSNOR cDNA序列及其編碼的氨基酸序列Fig.2 Nucleotide and deduced amino acid sequences of the SoGSNOR

        圖3 pET32a-SoGSNOR重組質(zhì)粒酶切鑒定Fig.3 The restriction endonuclease digestof pET32a-SoGSNOR plasmid

        Marker.蛋白Marker。Marker.Protein molecular weight Marker.

        2.4 pET32a-SoGSNOR原核表達蛋白的純化

        以16 ℃為誘導(dǎo)溫度,用1 mmol/L IPTG誘導(dǎo)擴大培養(yǎng)的pET32a-SoGSNOR菌株后超聲波處理,分別收集上清液和沉淀。SDS-PAGE分析表明,上清液和沉淀中均有目的蛋白的表達。利用Ni2+NTA親和柱對上清液進行純化,用10,200 mmol/L的咪唑洗脫液洗脫,如圖5所示,SDS-PAGE檢測發(fā)現(xiàn)200 mmol/L的咪唑洗脫液洗脫后,有1條單一條帶,大小約為65 ku,表明獲得了純化的SoGSNOR蛋白。

        Marker.蛋白Marker;Wash1.第1次10 mmol/L咪唑洗脫;Wash2.第2次10 mmol/L咪唑洗脫;Elution1.第1次200 mmol/L咪唑洗脫;Elution2.第2次200 mmol/L咪唑洗脫。

        Marker.Protein molecular weight Marker; Wash1,2.The fraction was eluted with 10 mmol/L imidazole Buffer for the first and second time; Elution 1,2.The fraction was eluted with 200 mmol/L imidazole Buffer for the first and second time.

        圖5pET32a-SoGSNOR融合蛋白的純化分析
        Fig.5TheanalysisofpurifiedSoGSNORfusionprotein

        2.5 Western Blot檢測SoGSNOR多克隆抗體

        為了檢測SoGSNOR抗體的特異性和靈敏度,對pET32a-SoGSNOR原核表達菌體總蛋白、純化的蛋白進行Western Blot檢測(圖6),結(jié)果顯示均出現(xiàn)一條條帶,大小與蛋白一致。多克隆抗體的效價較高,抗體稀釋倍數(shù)可以達到1∶10 000,為SoGSNOR蛋白功能研究提供了可靠的抗體,可以用于后續(xù)試驗。

        1.原核表達總蛋白;2.純化后的原核表達蛋白。1.The crude protein of pET32a-SoGSNOR;2.The purified protein of pET32a-SoGSNOR.

        3 討論

        GSNOR在植物界廣泛存在,前人已經(jīng)在擬南芥[11]、豌豆[17,19]、玉米[20]、水稻[21]、向日葵[22]、辣椒[23]和番茄[15]等發(fā)現(xiàn)GSNOR。李國鈞[24]分別從水稻和番茄中克隆GSNOR基因OsGSNOR1和LeGSNOR1。馬沅和陳放[25]克隆了麻風(fēng)樹JcGSNOR的全長序列,發(fā)現(xiàn)其在麻風(fēng)樹根、莖、葉及種子中均有表達,并在各部位持續(xù)表達可能是為維持體內(nèi)NO在無害水平。本試驗利用RT-PCR和RACE技術(shù)首次獲得菠菜GSNOR基因的全長序列,編碼框1 140 bp,編碼379個氨基酸。

        GSNOR參與植物生長發(fā)育、抵御生物和非生物脅迫等多種生理過程。擬南芥GSNOR完全缺失突變體表現(xiàn)出極度缺乏側(cè)根原基,且回補系能完全恢復(fù)突變體的側(cè)根表型[26]。番茄GSNOR調(diào)控的氧化還原信號控制番茄對堿脅迫的應(yīng)答[27]。鹽脅迫下向日葵中S-亞硝基還原酶活性降低[28]。初叢[29]研究發(fā)現(xiàn)煙草屬的GSNOR1是煙草細胞死亡的負調(diào)控因子。GSNOR介導(dǎo)的去亞硝基化改變生長素信號和生長素的運輸,是gsnor1-3突變體植物表型的主要原因[30]。菠菜GSNOR的表達特性和功能需要進一步研究。

        大腸桿菌原核表達系統(tǒng)制備重組蛋白質(zhì)具備很多優(yōu)點,已被廣泛應(yīng)用于植物蛋白表達研究中[31]。本研究在大腸桿菌中高效表達了SoGSNOR蛋白,通過Ni2+NTA親和層析法獲得純化的目的蛋白,將該蛋白免疫小鼠制備了多克隆抗體。利用Western Blot分析發(fā)現(xiàn),制備的多克隆抗體可以和抗原特異結(jié)合,表明成功制備了SoGSNOR的多克隆抗體,為后續(xù)進一步研究SoGSNOR的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。

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