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        27重SNP復(fù)合擴(kuò)增技術(shù)推斷犯罪嫌疑人族群1例

        2018-02-26 06:26:40王博超虎建華馮保強(qiáng)劉海渤李彩霞
        法醫(yī)學(xué)雜志 2018年6期

        馬 咪,劉 京,江 麗,趙 蕾,王博超,虎建華,張 濤,周 浩,馮保強(qiáng),劉海渤,李彩霞

        (1.公安部物證鑒定中心 法醫(yī)遺傳學(xué)公安部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 北京市現(xiàn)場(chǎng)物證檢驗(yàn)工程技術(shù)研究中心 現(xiàn)場(chǎng)物證溯源技術(shù)國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室,北京 100038;2.新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)第七師公安局,新疆 奎屯 833200;3.新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)公安局,新疆 烏魯木齊 833000)

        1 案 例

        1.1 簡(jiǎn)要案情

        某年1月,新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)某師轄區(qū)內(nèi)發(fā)生一起故意殺人案,嫌疑人作案手段兇殘,死者被銳器刺穿頸動(dòng)脈和氣管,導(dǎo)致失血性休克死亡。DNA技術(shù)人員在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)并提取到有價(jià)值的生物物證(嫌疑人作案后翻動(dòng)被害人手提包時(shí)遺留下的血跡、汗液痕跡等生物檢材)。

        1.2 DNA提取與STR分型

        現(xiàn)場(chǎng)提取的生物檢材用MagAttract?DNA Mini M48試劑盒(德國(guó)Qiagen公司)進(jìn)行DNA提取和純化[1],純化后的模板DNA用PowerPlex? 21試劑盒(美國(guó)Promega公司)在ProFlexTMPCR系統(tǒng)(美國(guó)AB公司)上采用10 μL體系進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)3130xl基因分析儀(美國(guó)AB公司)電泳檢測(cè),檢測(cè)數(shù)據(jù)使用GeneMapperTMID-Xv1.2軟件進(jìn)行分析。

        1.3 STR結(jié)果與比對(duì)

        STR分型結(jié)果顯示,在現(xiàn)場(chǎng)提取的多處生物物證上均檢出同一男性的STR分型,結(jié)合現(xiàn)場(chǎng)痕跡,分析該DNA為嫌疑人作案時(shí)所留,該男性DNA在本地庫(kù)和國(guó)家DNA數(shù)據(jù)庫(kù)中均未比中。

        1.4 SNP復(fù)合擴(kuò)增及分型[2]

        1.4.1 PCR復(fù)合擴(kuò)增及純化

        對(duì)嫌疑人血跡DNA使用SNaPshotTMMultiplex試劑盒(美國(guó)AB公司)進(jìn)行SNP復(fù)合擴(kuò)增,PCR復(fù)合擴(kuò)增反應(yīng)體系為5μL,其中PCR Primer Mix(公安部物證鑒定中心)0.5μL、dNTP(10mmol/L)0.05μL、10×PCR buffer(15mmol/L Mg2+)0.5μL、MgCl2(25mmol/L Mg2+) 0.7 μL、Hotstar Taq plus(5 U/μL) 0.2 μL、ddH2O 1.05 μL、模板 DNA 2 μL。PCR 反應(yīng)條件:95℃ 5 min;94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 1 min,循環(huán)40次;72℃延伸10min。純化反應(yīng)體系為8μL,內(nèi)含擴(kuò)增產(chǎn)物5μL、ExonucleaseⅠ(10U/μL)0.5μL、蝦堿性磷酸酶(shrimp alkaline phosphatase,SAP,1 U/μL)1.2μL、10×SAP buffer 0.5μL、ddH2O 0.8μL。充分振蕩混勻后37℃孵育30min,96℃ 10min滅活酶活性。

        1.4.2 單堿基延伸反應(yīng)

        單堿基延伸反應(yīng)為5 μL體系,其中SNaPshot Multiplex Ready Reaction Mix 2.5 μL、PCR Purify Products 1.5 μL、Ex-Primer Mix(公安部物證鑒定中心)0.3μL、ddH2O 0.7μL。PCR反應(yīng)條件:96℃ 10s;50℃ 5s,60℃ 30s,循環(huán)25次。之后向反應(yīng)產(chǎn)物中加入1μL SAP(1U/μL),37℃孵育60min,75℃ 15min進(jìn)行純化處理,去除多余引物和dNTP。

        1.4.3 毛細(xì)管電泳分型

        在3130xl基因分析儀上對(duì)上述延伸純化產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳檢測(cè)。檢測(cè)體系為10 μL,其中Hi-Di Formamide 8.75 μL,GeneScanTM120 LIZTMdye Size Standard 0.25 μL,SNaPshot Purify Products 1 μL。電泳參數(shù)設(shè)置:進(jìn)樣時(shí)間18 s,進(jìn)樣電壓3.0 kV,電泳電壓13.4 kV,電泳時(shí)間15 min。使用GeneMapperTMID-Xv1.2軟件進(jìn)行基因分型分析。嫌疑人現(xiàn)場(chǎng)所留檢材的27重SNP分型圖譜見(jiàn)圖1。

        1.5 數(shù)據(jù)分析

        針對(duì)嫌疑人DNA的27重SNP分型結(jié)果,使用公安部物證鑒定中心自主研發(fā)的Forensic Intelligence V1.1軟件計(jì)算群體匹配概率與似然比(likelihood ratio,LR)。結(jié)果顯示:嫌疑人DNA祖先來(lái)源于東亞人群的可能性是混合人群的4.99×106倍,是非洲人群的1.64×1022倍,是歐洲人群的1.11×1024倍。用Structure v2.3.4軟件計(jì)算嫌疑人DNA的祖先成分[2-5],得出該檢材DNA的歐洲成分為1%、非洲成分為7%、東亞成分為92%。用R 3.3.1軟件對(duì)該檢材的DNA進(jìn)行主成分分析,結(jié)果顯示,該檢材的DNA遺留者為東亞人群(圖2)。

        圖1 嫌疑人DNA的27重SNP分型圖譜

        圖2 嫌疑人DNA的主成分分析結(jié)果

        1.6 偵查結(jié)果

        該命案現(xiàn)場(chǎng)周圍環(huán)境復(fù)雜,人流量大,且無(wú)視頻監(jiān)控,圖像偵查無(wú)法發(fā)揮作用,專案組通過(guò)技術(shù)手段鎖定具備作案時(shí)間的可疑人員近三千余名,其中包括漢族、維吾爾族、哈薩克族等。案發(fā)時(shí)間正值春節(jié)前夕,被專案組列為可疑對(duì)象的大多數(shù)人員已離疆去外省過(guò)春節(jié),嫌疑人員分布較散,沒(méi)有其他有價(jià)值的線索,專案組無(wú)法進(jìn)一步縮小嫌疑人員范圍,用常規(guī)排查的方法耗時(shí)耗力,偵查工作難度較大。根據(jù)DNA檢驗(yàn)和SNP族群推斷結(jié)果,專案組很快將維吾爾族和哈薩克族可疑人員排除,將可疑人員范圍從三千多人減少至四百余人,顯著縮小了嫌疑人員范圍。專案組最終從鎖定的四百多名可疑人員中將犯罪嫌疑人抓獲歸案。經(jīng)過(guò)DNA比對(duì),犯罪嫌疑人(王某,男,漢族)的STR分型與現(xiàn)場(chǎng)多處生物物證上檢出的DNA分型結(jié)果一致。經(jīng)審訊,王某如實(shí)供述作案動(dòng)機(jī)與過(guò)程。

        2 討 論

        群族是指具有區(qū)別于其他人群的某些共同遺傳體質(zhì)特征的人群,目前在種群進(jìn)化、群體結(jié)構(gòu)和法醫(yī)遺傳學(xué)等研究中比較常用的祖先信息標(biāo)記(ancestry informative marker,AIM)有單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)、插入/缺失(insertion/deletion,InDel)等[6-15]。通過(guò)對(duì)重大案件現(xiàn)場(chǎng)提取的DNA遺傳信息進(jìn)行深度挖掘,進(jìn)一步刻畫(huà)犯罪嫌疑人體貌特征和祖先群體來(lái)源可以為案件偵查提供方向[4]。孫啟凡等[5]已成功利用SNP復(fù)合擴(kuò)增技術(shù)推斷疑似1953年美軍飛機(jī)墜毀失蹤人員骨骼所屬人群1例。

        本例使用公安部物證鑒定中心自主研發(fā)構(gòu)建的27重SNP復(fù)合擴(kuò)增技術(shù),在嫌疑人STR分型未比中的情況下,成功檢測(cè)嫌疑人祖先信息位點(diǎn)進(jìn)行族群推斷,縮小了偵查范圍,為偵查提供明確方向,為案件的偵破贏得黃金時(shí)間。

        該27重SNP復(fù)合擴(kuò)增技術(shù)采用復(fù)合擴(kuò)增和單堿基延伸后毛細(xì)管電泳檢測(cè)的方法,可區(qū)分東亞、歐洲、非洲及歐亞混合人群[2,7],尤其是在新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)北疆片區(qū),大多數(shù)為漢族、維吾爾族、哈薩克族等多民族混合居住,推斷案件中嫌疑人的族群可為案件下一步的決策、排查等提供有力依據(jù),為案件偵破節(jié)省大量時(shí)間、人力、物力和財(cái)力。

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