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        結(jié)核分枝桿菌耐利奈唑胺相關(guān)基因研究進(jìn)展

        2018-02-15 07:44:34唐正洪陳玲
        實(shí)用心腦肺血管病雜志 2018年11期
        關(guān)鍵詞:基因突變耐藥

        唐正洪,陳玲

        據(jù)統(tǒng)計(jì),結(jié)核病是2017年全球范圍內(nèi)致死率最高的單病種傳染病,約160萬(wàn)例患者因結(jié)核病而死亡,其中約23萬(wàn)例患者死于耐多藥結(jié)核?。∕DR-TB)或耐利福平結(jié)核?。≧RTB)。MDR-TB及RR-TB均需采用二線抗結(jié)核藥物治療,但整體治療成功率僅為55%[1]。利奈唑胺屬惡唑烷酮類抗生素,是治療MDR-TB的二線核心抗結(jié)核藥物之一[1]。最初,惡唑烷酮類抗生素作為植物殺菌劑使用,之后人們發(fā)現(xiàn)利奈唑胺衍生物具有廣譜抗菌作用,因此美國(guó)食品藥品監(jiān)督局(FDA)于2000年批準(zhǔn)利奈唑胺作為第1種惡唑烷酮類抗生素用于治療耐藥性G+細(xì)菌感染[2],隨后幾年才開始用于治療結(jié)核?。?-5]。體外試驗(yàn)和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,利奈唑胺具有抗結(jié)核分枝桿菌作用[6-7],Meta分析結(jié)果及隊(duì)列研究證實(shí)利奈唑胺治療耐藥結(jié)核病的療效較好[6,8-11],且患者耐受性亦較好[12],但結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥現(xiàn)象仍不可忽視。本文綜述了結(jié)核分枝桿菌耐利奈唑胺相關(guān)基因,旨在為結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺的耐藥機(jī)制研究提供參考。

        1 作用機(jī)制

        利奈唑胺是一種蛋白合成抑制劑,具有與現(xiàn)有抗結(jié)核藥物迥異的化學(xué)結(jié)構(gòu)及作用機(jī)制,與一線抗結(jié)核藥物及其他二線抗結(jié)核藥物不存在交叉耐藥,有利于有效防控耐藥結(jié)核病。研究表明,利奈唑胺主要通過(guò)與50S核糖體上肽基轉(zhuǎn)移酶活性中心23S位點(diǎn)結(jié)合而阻止70S始動(dòng)復(fù)合物形成并干擾結(jié)核分枝桿菌蛋白合成[13],進(jìn)而發(fā)揮抗結(jié)核分枝桿菌作用,與其他抗結(jié)核藥物相比,其抑制結(jié)核分枝桿菌蛋白合成的靶位亦不同,因此不易發(fā)生自然耐藥或與其他抑制結(jié)核分枝桿菌蛋白合成的抗結(jié)核藥物產(chǎn)生交叉耐藥。

        2 利奈唑胺耐藥相關(guān)基因

        目前已知的可能與結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥相關(guān)的基因包括rplC基因(Rv0701)、23S rRNA(Rvnr02)、rplD基因(Rv0702)3種。

        2.1 rplC基因 rplC基因ID為888343,全長(zhǎng)654 bp,編碼結(jié)核分枝桿菌生長(zhǎng)所需50S核糖體蛋白L3,50S核糖體蛋白L3主要位于50S核糖體亞基表面,是主要的RNA結(jié)合蛋白,其主要在23S rRNA的 3'末端附近結(jié)合并使50S核糖體完成裝配,同時(shí)其分支靠近肽基轉(zhuǎn)移酶活性中心,而肽基轉(zhuǎn)移酶活性中心是很多作用于核糖體的抗生素結(jié)合位點(diǎn)[14-15]。研究發(fā)現(xiàn),核糖體蛋白L3突變可能改變利奈唑胺與肽基轉(zhuǎn)移酶活性中心結(jié)合部位周邊結(jié)構(gòu)[16],因此50S核糖體蛋白L3的變化很可能會(huì)導(dǎo)致結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥。目前已發(fā)現(xiàn)的rplC基因突變類型主要包括T460C〔賴氨酸(Lys)154精氨酸(Arg)〕和 C463G〔絲氨酸(His)155 天冬氨酸(Asp〕[7,9,17-23],多項(xiàng)研究證實(shí)耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌存在T460C突變,且絕大多數(shù)僅含有T460C突變,但突變頻率不盡相同(見(jiàn)表1),且利奈唑胺對(duì)包含T460C突變的耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌的最低抑菌濃度(MIC)波動(dòng)于 2~32 μg/ml[7,17-18,23]。有研究表明,利奈唑胺對(duì)擁有包含強(qiáng)啟動(dòng)子和突變的rplC(T460C)基因質(zhì)粒的H37Rv菌株的MIC增加4倍,而利奈唑胺對(duì)擁有普通啟動(dòng)子和突變的rplC(T460C)基因質(zhì)粒的H37Rv菌株的MIC則未發(fā)生改變,提示rplC基因表達(dá)水平對(duì)結(jié)核分枝桿菌耐藥性有一定影響[15]。

        有研究發(fā)現(xiàn),2例新型rplC基因突變患者,突變類型為C463G,利奈唑胺對(duì)這2例患者結(jié)核分枝桿菌的MIC均為2 μg/ml[7,23],提示rplC基因C463G突變頻率較低,而與rplC基因T460C突變相比,rplC基因C463G突變可能對(duì)結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥性的影響較小。近期有研究者在419株對(duì)利奈唑胺敏感的結(jié)核分枝桿菌中發(fā)現(xiàn)1株rplC基因突變菌株,突變類型為A328G(Ser110Gly),其MIC為0.25 μg/ml,但在同時(shí)發(fā)現(xiàn)的另1株耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌中并未發(fā)現(xiàn)rplC基因突變[24];另有研究發(fā)現(xiàn),1株有T460C突變菌株未產(chǎn)生利奈唑胺耐藥[9],提示rplC基因不同編碼區(qū)突變對(duì)結(jié)核分枝桿菌耐藥性的影響不同,考慮其原因可能與突變氨基酸的空間結(jié)構(gòu)有關(guān)。

        既往研究結(jié)果顯示,耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌rplC基因突變頻率為23.5%~100.0%,總體突變頻率為54.9%,其中rplC基因T460C總體突變頻率為52.9%,是耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌最常見(jiàn)的基因突變類型[7,17-23],但由于rplC基因T460C突變引起的耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌的MIC波動(dòng)于2~32 μg/ml,因此仍存在其他影響結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥性的因素,需進(jìn)一步研究證實(shí)。國(guó)內(nèi)研究結(jié)果顯示,中國(guó)人群耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌rplC基因突變頻率較低[7,17-23],而rplC基因C463G突變僅在中國(guó)人群中被發(fā)現(xiàn)且突變頻率較低[7,23],分析其原因可能與結(jié)核病發(fā)病率及人種差異有關(guān)。

        2.2 23S rRNA 23S rRNA基因又稱rrl基因,ID為2700466,全長(zhǎng)3 138 bp,參與結(jié)核分枝桿菌50S核糖體形成,由于利奈唑胺主要通過(guò)作用于50S核糖體上肽基轉(zhuǎn)移酶活性中心而發(fā)揮作用,因此23S rRNA突變可能導(dǎo)致結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥[25]。目前已發(fā)現(xiàn)的23S rRNA基因突變類型包括G2061T、G2270C、G2270T、G2746A、A2810T、C2848A、G2814T、G2294A、C1921T、G2576T[7,9,18-19,23,26]( 見(jiàn) 表 1), 其 中G2061T突變?cè)诙囗?xiàng)不同研究中均有發(fā)現(xiàn)[7,23,26],因此G2061T突變可能更具共性,并可能是23S rRNA基因最常見(jiàn)的突變類型。目前研究結(jié)果顯示,23S rRNA總體突變頻率為35.4%,但由于該基因突變類型較多,因此單一類型基因突變頻率較低,突變頻率最高的G2746A、G2061T突變頻率僅為9.8%。

        表1 已知的利奈唑胺耐藥相關(guān)基因突變類型及MICTable 1 Known drug resistance related gene mutation types to linezolid and the MIC

        ZHANG等[18]研究表明,利奈唑胺對(duì)含有G2270C、G2270T、G2746A、A2810T、C2848A突變的結(jié)核分枝桿菌MIC均為2 μg/ml,提示23S rRNA基因突變?nèi)舭珿2270C、G2270T、G2746A、A2810T、C2848A突變則可輕微增加利奈唑胺對(duì)結(jié)核分枝桿菌的MIC。多項(xiàng)研究結(jié)果顯示,利奈唑胺對(duì)23S rRNA基因G2061T突變患者結(jié)核分枝桿菌的MIC≥16 μg/ml[7,23,26],提示 23S rRNA 基因 G2061T 突變對(duì)結(jié)核分枝桿菌耐利奈唑胺的影響較大;而由于利奈唑胺對(duì)不同23S rRNA基因突變類型患者結(jié)核分枝桿菌的MIC波動(dòng)于2~32 μg/ml,因此不同23S rRNA基因突變類型對(duì)結(jié)核分枝桿菌耐利奈唑胺的影響不盡相同。

        2.3 rplD基因 rplD基因ID為888345,全長(zhǎng)672 bp,編碼結(jié)核分枝桿菌生長(zhǎng)所需50S核糖體蛋白L4。研究表明,50S核糖體蛋白L4位于肽基轉(zhuǎn)移酶活性中心附近,是50S核糖體的主要組成部分[25],其最初結(jié)合在23S rRNA的5'末端附近,在50S核糖體亞基早期形成過(guò)程中具有重要作用,并在組裝的50S核糖體亞基中與23S rRNA不同結(jié)構(gòu)域形成接觸。有學(xué)者在利奈唑胺敏感菌株中發(fā)現(xiàn)rplD基因非單核苷酸多態(tài)性[7]。ZONG等[23]報(bào)道了第1例rplD基因G377A突變〔Arg126His〕患者,并證實(shí)利奈唑胺對(duì)rplD基因G377A突變的結(jié)核分枝桿菌的MIC>16 μg/ml,提示rplD基因突變可能導(dǎo)致結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥;但由于目前僅發(fā)現(xiàn)1株rplD基因突變的耐利奈唑胺結(jié)核分枝桿菌,因此rplD基因突變與結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥的關(guān)系仍需進(jìn)一步研究證實(shí)。

        3 小結(jié)與展望

        綜上所述,rplC基因突變頻率較高,其中T460C是rplC基因最常見(jiàn)的突變類型,T460C、G2061T、G2576T突變對(duì)結(jié)核分枝桿菌耐利奈唑胺的影響較大;G2061T是主要的23S rRNA基因突變類型,且與rplC基因T460C突變可能不存在疊加效應(yīng);中國(guó)人群MDR-TB患者基因型為北京型,更易出現(xiàn)利奈唑胺耐藥且耐藥性較高[7],但國(guó)外人群北京型與非北京型結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥率相同[3]。

        目前,利奈唑胺耐藥機(jī)制研究取得一定進(jìn)展,多數(shù)研究者認(rèn)為rplC、23S rRNA基因突變與結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥有關(guān),而雖有研究表明rplD基因突變可導(dǎo)致結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥,但由于該基因突變頻率極低,因此仍有待進(jìn)一步研究證實(shí)。此外,目前關(guān)于結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥基因的研究樣本量均較小,雖然基因突變可以解釋部分結(jié)核分枝桿菌對(duì)利奈唑胺耐藥,但基因突變機(jī)制之外還可能存在其他機(jī)制,如藥物外排泵機(jī)制、基因調(diào)控機(jī)制及其他基因突變機(jī)制等,而利奈唑胺作為二線核心抗結(jié)核藥物,作用機(jī)制獨(dú)特,治療耐藥結(jié)核病的前景廣闊,因此不應(yīng)忽視其耐藥現(xiàn)象及耐藥機(jī)制研究,以更有效地防控耐藥結(jié)核病。

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