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        PMA在活菌檢測中的應(yīng)用

        2018-02-15 20:08:15
        畜牧獸醫(yī)科學(xué) 2018年3期
        關(guān)鍵詞:活菌濁度光照

        (南召縣動物衛(wèi)生監(jiān)督所, 河南 南召 474650)

        1 疊氮溴化丙錠的介紹

        疊氮溴化丙錠(PMA)是一種光敏反應(yīng)染料,它對DNA具有非常高的親和力。當(dāng)細(xì)胞膜處于不完整狀態(tài)或者細(xì)胞已經(jīng)死亡,細(xì)胞膜對外界的物質(zhì)的進(jìn)出就沒有了選擇性,PMA就可以順利進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),與DNA進(jìn)行結(jié)合,在光照作用下發(fā)生交聯(lián)反應(yīng)。交聯(lián)后的DNA就不能作為模板進(jìn)行擴(kuò)增,殘留在溶液中的未被結(jié)合的PMA在光照下與水分子形成羥胺化合物,從而阻止其與在提取過程中活菌產(chǎn)生的DNA結(jié)合,影響檢測結(jié)果。而對于活的細(xì)胞而言,細(xì)胞膜具有選擇性,PMA便不能進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)與DNA進(jìn)行交聯(lián)反應(yīng)。將PMA這種特性與熒光定量PCR技術(shù)進(jìn)行偶聯(lián),便可以實現(xiàn)對活菌的檢測[1]。

        2 影響活菌檢測的因素

        2.1 采集的樣品

        PMA偶聯(lián)熒光PCR技術(shù)對樣品的要求比較高。有研究發(fā)現(xiàn),環(huán)境中的樣品,食品樣品和臨床上的病料中常常含有一些無機物質(zhì),有機物質(zhì)。這些物質(zhì)的存在既可以降低PMA的有效濃度,也可以干擾PMA與核酸的交聯(lián)反應(yīng)。詳細(xì)的說,樣品中的無機物和有機物會造成樣品的濁度提高,樣品越渾濁,光的透過性就越差,越影響PMA與樣品在光照條件下的交聯(lián)反應(yīng)。為了避免和減少因樣品采集帶來的誤差,Luo等人在一項研究中提出,要嚴(yán)格規(guī)范濁度的閾值,這樣對每一份樣品檢測具有更重要的意義和參考價值。有研究表明,當(dāng)樣品的濁度達(dá)到10個散射濁度單位的時候,樣品的濁度對于PMA交聯(lián)DNA是沒有影響的。當(dāng)樣品的濁度高于10個散射濁度時,樣品的濁度對于PMA交聯(lián)DNA具有非常大的影響。

        2.2 PMA與DNA作用階段

        PMA與DNA作用階段主要是指PMA進(jìn)入細(xì)胞膜受損傷的過程和PMA結(jié)合DNA的過程。PMA是一種對光較為敏感的染料,即便在普通光源下,也能降低PMA的有效濃度。因此,在PMA與細(xì)胞核DNA作用的過程中要避光。在這個過程中,PMA的濃度、PMA與核酸的作用時間,溫度等都會影響最終的檢測結(jié)果。有些學(xué)者在參考別的研究者活菌檢測技術(shù)時,設(shè)置了同樣的溫度、濃度和時間,但是結(jié)果卻不甚理想。其主要原因是樣品不同,最佳的PMA的濃度和作用時間也會有很大的差異。如較低濃度時,PMA是不能夠完全結(jié)合掉所有的死菌DNA,那么部分沒有結(jié)合的死菌的DNA便可以作為模板被擴(kuò)增出來,從而造成活菌檢測數(shù)據(jù)不準(zhǔn)確。如果PMA的濃度過高,PMA也可以滲入到活的細(xì)胞中,將部分活的細(xì)胞DNA結(jié)合掉,造成檢測結(jié)果的不準(zhǔn)確。因此,無論是做哪一項活菌檢測,PMA的濃度和作用時間等參數(shù)要先優(yōu)化,后使用。PMA進(jìn)入細(xì)胞的效率和有效結(jié)合DNA的效率還與溫度有關(guān)。有研究表明。在室溫的條件下,PMA結(jié)合DNA的效率最高。另外,PMA與細(xì)胞的作用時間也要考慮到位。作用時間過長,PMA也能夠滲透到活細(xì)胞中,造成結(jié)果的不準(zhǔn)確[2]。

        2.3 PMA與DNA的交聯(lián)

        在光照條件下,PMA與DNA能夠發(fā)生交聯(lián)反應(yīng)。但是有效的交聯(lián)反應(yīng)仍然依賴于光源和光處理時間的長短。光源的光譜不同時,PMA的激活效果也存在很大的差異。最為合適的光源是光的波長能夠有效激發(fā)PMA分解。研究表明,500~750w的金屬鹵素?zé)羰亲罴训墓庠?。光照時,樣品要放在光下20~30cm處,保障PMA與樣品中的DNA有效交聯(lián)。但是值得注意的是,在較高功率的鹵素?zé)粽丈湎?,部分活菌會?yán)重受熱死亡。為了避免這種現(xiàn)象的發(fā)生,Vesper等人首次將發(fā)光二極管代替鹵素?zé)簦@樣既保障了激發(fā)PMA的最佳發(fā)射波長,又避免了熱量造成的活菌的死亡。光照時間是整個處理中不可小覷的環(huán)節(jié)。樣品,實驗條件的不同,光照時間也會有很大的差異。一般情況下,光照時間控制在20min以內(nèi)。光照時間過短,PMA與DNA的交聯(lián)反應(yīng)不徹底,同時,殘留在液體中的游離的PMA也不能完全失活。較長時間的光照時間又會引起活菌的死亡。因此,需要選擇恰當(dāng)?shù)墓庹諘r間。

        3 目標(biāo)基因的選擇

        除了以上信息需要考慮外,目標(biāo)基因的位置和片段的大小也會影響最后的檢測結(jié)果。Soejima在用PMA偶聯(lián)PCR技術(shù)檢測單增李斯特菌的過程中發(fā)現(xiàn),片段越長,PMA對熒光PCR的抑制效果越明顯。還有學(xué)者認(rèn)為,對于同一種細(xì)菌檢測時,運用不同的片段,檢測得到的結(jié)果差異非常顯著[3]。

        4 PMA偶聯(lián)熒光PCR的應(yīng)用

        Zhu等人用PMA-qPCR檢測樣品中的副溶血性弧菌的活菌量時發(fā)現(xiàn),PMA的最佳濃度時8ug/mL,并且當(dāng)細(xì)菌的濁度低于10個NTU時,OD值低于0.8時,PMA能夠有效抑制死菌的擴(kuò)增。黃韻等人運用PMA-qPCR檢測技術(shù)成功檢測出處于VBNC狀態(tài)下的單增李斯特菌活菌。Li等人在用PMA-qPCR檢測沙門氏菌活菌檢測,并對基因片段的長度進(jìn)行優(yōu)化和選擇,結(jié)果表明,PMA對死菌DNA的抑制作用與核酸片段長度有關(guān),核酸片段長度越長,PMA對死菌的抑制作用越好。當(dāng)長度高于260bp時,檢測的靈敏性會突然下降。長度低于130bp時,則無法有效抑制死菌DNA的擴(kuò)增。

        [1]陳麗芬.兩種實驗方法檢測食品中金黃色葡萄球菌的比較和分析[J].醫(yī)學(xué)動物防制,2016(05):581-582+58.

        [2]吳碧文.金黃色葡萄球菌在不同食品中的檢出率分析[J].福建分析測試,2015(02):51-54.

        [3]張崇娥.不同食品中金黃色葡萄球菌的檢出分析[J].求醫(yī)問藥(下半月),2012(07):9-10.

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