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        基于SSR標(biāo)記的21份粵糖甘蔗品種遺傳多樣性分析

        2018-01-17 00:58:32石祥鵬
        鋒繪 2018年4期

        石祥鵬

        摘要:選用21對(duì)多態(tài)性高的引物時(shí)21份粵糖系列甘蔗材料進(jìn)行SSR標(biāo)記分析和遺傳多樣性分析。結(jié)果表明,擴(kuò)增條帶數(shù)共134,多態(tài)性條帶數(shù)116,平均多態(tài)性條帶5.5238,每個(gè)位點(diǎn)有效等位基因數(shù)(Ne)為

        1.3 420,Net's基因多樣性(H) h 0.2181, Shannon信息指數(shù)(I))} 0.3463 0依據(jù)Jaccard相似系數(shù)進(jìn)行UPGMA聚類,可將21份材料分為A和B兩大類群,A類群中只有粵引8號(hào),表明粵引8號(hào)材料相比較而言與其他材料存在較大差異。

        關(guān)鍵詞:甘蔗;粵糖系列;遺傳多樣性;SSR

        甘蔗是世界上主要的食糖原料,近年來(lái),多位研究人員在親本親緣關(guān)系和遺傳多樣性方面作出評(píng)價(jià),劉新龍對(duì)63份云南育種機(jī)構(gòu)常用的甘蔗親本和10份甘蔗原始親本進(jìn)行遺傳多樣性評(píng)價(jià),結(jié)果表明中國(guó)大陸地區(qū)既是主栽品種又是親本的材料表現(xiàn)出較近的親緣關(guān);SSR(simple sequence repeat)分子標(biāo)記具有共顯性、多態(tài)性高、成本低等優(yōu)點(diǎn),在遺傳多樣性評(píng)價(jià)方面得到了廣泛應(yīng)用。

        因此本研究選用21對(duì)多態(tài)性高的引物對(duì)21份粵糖系列甘蔗材料進(jìn)行SSR標(biāo)記分析,旨在比較材料間的遺傳差異,為今后甘蔗品種選育以及新品種的引進(jìn)提供重要參考。1材料和方法

        1.1 材料

        以廣州測(cè)試分中心常用的粵糖系列甘蔗共21份為研究材料,見(jiàn)表1

        1.2 葉片DNA提取

        選取親本材料幼嫩葉片,采用CTAB法提取葉片基因組DNA,一20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

        對(duì)SSR引物擴(kuò)增條帶進(jìn)行統(tǒng)計(jì),建立“0-1”矩陣,應(yīng)用NTSYSpc

        2.1 0e軟件計(jì)算各材料間的Jaccard遺傳相似性系數(shù)(GS),使用UPGMA構(gòu)建聚類圖。應(yīng)用Popgen軟件計(jì)算有效等位基因數(shù)(Ne),Nei' s基因多樣性(H),Shannon信息指數(shù)(I)。2結(jié)果和分析

        2.1 引物篩選和多態(tài)性條帶分析

        分析結(jié)果得出擴(kuò)增條帶134條,多態(tài)性條帶數(shù)116條,多態(tài)性條帶比例86.57%,每個(gè)引物平均擴(kuò)增條帶數(shù)6.3810,平均多態(tài)性條帶5.5238,每個(gè)位點(diǎn)有效等位基因數(shù)(Ne)為

        1.3 420,Nei' s基因多樣性(H)為0.2181,Shannon信息指數(shù)(1)為0.3463。說(shuō)明本測(cè)試中心粵糖系列甘蔗品種SSR位點(diǎn)多態(tài)性屬于較高水平,各材料間遺傳差異屬于中等水平。

        2.2 聚類分析

        依據(jù)Jaccard相似系數(shù),針對(duì)21份粵糖系列材料進(jìn)行UPGMA聚類(見(jiàn)圖1),可將21份材料分為A和B兩大類群,A類群中只有粵引8號(hào),表明粵引8號(hào)材料相比較而言與其他材料存在較大差異;B類群劃分為BI、B2兩類,BI類群中5份材料又劃分為兩類B1一1,B1-2兩類;聚類圖中粵糖57-423和粵糖59-264兩份材料有著共同的親本材料F108,且二者在相似系數(shù)局0.86左右聚為一類,表明二者確實(shí)存在相近的血緣關(guān)系。3討論

        通過(guò)本研究分析發(fā)現(xiàn),粵引8號(hào)材料與其他材料間存在較大遺傳分化,其親本由“CP72-370 X LCP82-89”兩個(gè)美國(guó)品種選育而成,因此外國(guó)品種的引進(jìn)可以有效地?cái)U(kuò)大品種的遺傳基礎(chǔ)。

        參試材料中粵糖54-143(F108 X F134)和粵糖57-423 (F108 X F134)二者具有相同的親本來(lái)源本無(wú)遺傳差異或有較小的遺傳差異而聚為一類,根據(jù)聚類圖上結(jié)果顯示,二者存在相對(duì)較大的遺傳差異,前人的研究中也出現(xiàn)類似情況,吳海蘭等(2014)研究發(fā)現(xiàn)云蔗81一173和桂糖11都是“Co419 X CP49一50”組合的后代卻分別聚在了兩類,因甘蔗是高度雜合的異源多倍體植物,致使其自交、雜交和回交后代出現(xiàn)了高度分離現(xiàn)象。

        從整體來(lái)看,粵糖系列甘蔗材料間存在著較大的遺傳相似系數(shù),遺傳差異性已相對(duì)較小,具體原因?yàn)榛浱窍盗懈收犭m為華南地區(qū)甘蔗主栽品種,常被選做親本與其他材料雜交選育新品種,其血緣已融入后代材料中。因此粵糖系列甘蔗需通過(guò)引進(jìn)外來(lái)優(yōu)良種質(zhì)拓寬其遺傳基礎(chǔ)。

        參考文獻(xiàn)[1]劉新龍,李旭娟,劉洪博,等.云南甘蔗常用親本資源遺傳多樣性

        的SSR分析.植物遺傳資源學(xué)報(bào)2015, 16(6):1214-1222.[2]孫琦,孟昭東,張發(fā)軍,等.SSR標(biāo)記在玉米遺傳育種中的應(yīng)用

        [J].玉米科學(xué),2006,(01):37-39.[3]吳海蘭,王先宏,何麗蓮,等.基于SSR標(biāo)記的云南甘蔗栽培品種

        遺傳多樣性分析.分子植物育種Molecular Plant Breeding,

        2014,Vol.12,No.1,144-15

        1.2 014,12(1):144-151.

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