三陰性乳腺癌（TNBC）是一類惡性程度較高的乳腺癌分型。相對(duì)于其他類型的乳腺癌，三陰性乳腺癌表現(xiàn)出轉(zhuǎn)移率高、細(xì)胞增殖快和預(yù)后差等特征。目前缺乏三陰性乳腺癌的成功靶向藥物。

中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所焦保衛(wèi)研究組利用生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)：相比于其他乳腺癌亞型，三陰性乳腺癌存在獨(dú)特的選擇性剪接譜。這種獨(dú)特剪接模式的調(diào)控因子可能作為三陰性乳腺癌潛在的藥物靶點(diǎn)。

該課題組沿著這個(gè)研究思路發(fā)現(xiàn)，剪接因子TDP43在三陰性乳腺癌的選擇剪接譜中發(fā)揮主導(dǎo)功能。TDP43在三陰性乳腺癌中高表達(dá)，且高表達(dá)對(duì)應(yīng)預(yù)后差；在三陰性乳腺癌細(xì)胞系中敲降TDP43表達(dá)抑制了細(xì)胞增殖、促進(jìn)細(xì)胞凋亡、抑制細(xì)胞轉(zhuǎn)移侵襲能力。

反之，TDP43高表達(dá)則促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的惡性生長(zhǎng)。通過(guò)蛋白質(zhì)譜、轉(zhuǎn)錄組分析與功能實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等，進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)TDP43與另一個(gè)剪接因子SRSF3形成剪接復(fù)合物，協(xié)同調(diào)控三陰性乳腺癌的選擇性剪接事件。最后，通過(guò)功能回補(bǔ)實(shí)驗(yàn)，確定該復(fù)合物通過(guò)調(diào)控下游基因PAR3與NUMB的選擇性剪接，進(jìn)而影響三陰性乳腺癌增殖與轉(zhuǎn)移能力。上述結(jié)果表明，TDP43可以作為三陰性乳腺癌治療的潛在靶標(biāo)，該項(xiàng)研究將從三陰性乳腺癌的獨(dú)特剪接譜角度為治療靶點(diǎn)提供新的研究方向。

另外，染色體水平研究方面也取得了新進(jìn)展，焦保衛(wèi)課題組發(fā)現(xiàn)了染色體水平的表達(dá)重平衡是促進(jìn)多種類型腫瘤發(fā)生發(fā)展的保守機(jī)制。利用The Cancer Genome Atlas （TCGA）數(shù)據(jù)庫(kù)，研究人員系統(tǒng)分析了包括乳腺癌在內(nèi)的16種實(shí)體瘤的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。

腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程是遺傳和表觀遺傳發(fā)生紊亂，繼而在選擇壓力下克隆進(jìn)化最終重新穩(wěn)定的過(guò)程。分析結(jié)果顯示，腫瘤在染色體水平存在保守的變化規(guī)律，即X染色體的表達(dá)在絕大多數(shù)腫瘤類型中都被下調(diào)，從而有利于腫瘤進(jìn)程。若該下調(diào)被擾亂，則能夠顯著抑制腫瘤發(fā)展。該研究為揭示腫瘤的發(fā)生發(fā)展和開發(fā)新的腫瘤治療藥物提供了新視角。