2009年，《中共中央國務院關于深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革的意見》提出，“積極探索實行按人頭付費、按病種付費、總額預付等方式”。

2011年，人力資源和社會保障部發(fā)布《關于進一步推進醫(yī)療保險付費方式改革的意見》指出，住院及門診大病醫(yī)療費用的支付，要結合醫(yī)療保險統(tǒng)籌基金支付水平的提高，探索實行以按病種付費為主的付費方式。按病種付費可從單一病種起步，優(yōu)先選擇臨床路徑明確、并發(fā)癥與合并癥少、診療技術成熟、質量可控且費用穩(wěn)定的常見病、多發(fā)病。同時，兼顧兒童白血病、先天性心臟病等當前有重大社會影響的疾病。具體病種由各地根據(jù)實際組織專家論證后確定。有條件的地區(qū)可逐步探索按病種分組（DRGs）付費的辦法。生育保險住院分娩（包括順產、器械產、剖宮產）醫(yī)療費用，原則上要按病種付費的方式，由經辦機構與醫(yī)療機構直接結算。暫不具備實行按人頭或按病種付費的地方，作為過渡方式，可以結合基金預算管理，將現(xiàn)行的按項目付費方式改為總額控制下的按平均定額付費方式。

2011年3月，國家發(fā)展改革委和原衛(wèi)生部聯(lián)合印發(fā)《關于開展按病種收費方式改革試點有關問題的通知》，推薦了104個病種目錄，并要求已經開展按病種收費試點的地區(qū)，可結合國家公布的104個病種逐步擴大試點范圍；尚未開展按病種收費試點的地區(qū)，可在國家公布的104個病種范圍內遴選部分病種進行試點。

2017年1月，國家發(fā)展改革委、原國家衛(wèi)生計生委、人力資源和社會保障部聯(lián)合發(fā)布《關于推進按病種收費工作的通知》，公布了320個推薦病種目錄，并要求各地要在前期改革試點基礎上，進一步擴大按病種收費的病種數(shù)量，重點在臨床路徑規(guī)范、治療效果明確的常見病和多發(fā)病領域開展按病種收費工作，鼓勵將日間手術納入按病種收費范圍。各地二級及以上公立醫(yī)院都要選取一定數(shù)量的病種實施按病種收費，城市公立醫(yī)院綜合改革試點地區(qū)2017年年底前實行按病種收費的病種不少于100個。

2017年，國務院辦公廳發(fā)布《關于進一步深化基本醫(yī)療保險支付方式改革的指導意見》，提出下一步醫(yī)保支付方式改革的重點是按病種付費，并指出要完善疾病分類和操作編碼系統(tǒng)、明確病歷書寫標準、制定臨床路徑等，為推行按病種付費打好基礎。

2018年2月，人社部發(fā)布《關于發(fā)布醫(yī)療保險按病種付費病種推薦目錄的通知》，并公布《醫(yī)療保險按病種付費病種推薦目錄》，包括130種疾?。òㄌ幚矸绞剑?，要求各地確定不少于100個病種開展按病種付費。