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        基于數據生命周期模型的國外數據期刊政策研究

        2018-01-02 10:16:26黃如花李楠
        圖書與情報 2017年3期
        關鍵詞:政策

        黃如花+李楠

        摘 要:數據期刊政策是促進科學數據共享和利用的基礎,對國外數據期刊政策的調研分析,有利于我國數據期刊政策的研究和制定。文章以數據生命周期模型為理論基礎,通過文獻調研和網站調研,分析了國外純數據期刊在數據計劃、數據確認、數據描述、數據保存、數據整合和利用5個階段的數據政策內容。我國數據期刊出版應制定基于科研數據生命周期的數據期刊政策、與科研數據知識庫和圖書館開展合作、注重保護作者權益、鼓勵數據引用采用國際標準格式。

        關鍵詞:科研數據;數據期刊;數據生命周期;政策

        中圖分類號:G255.2 文獻標識碼:A DOI:10.11968/tsyqb.1003-6938.2017048

        Abstract The data journal policies are the foundation to promote the sharing and utilization of research data, and the investigation and analysis of foreign data journal policies are conducive to the research and formulation of data journal policies in China. Based on the data lifecycle model, this paper uses literature research and website research methods to analyze the content of data policies of foreign pure data journals in the period of data planning, data validation, data description, data preservation, data integration and utilization. China's data journal publication should establish data journal policies based on the life cycle of research data, cooperate with data repositories and libraries, pay attention to safeguarding the author's rights and interests and encourage the data citation according to international standard format.

        Key words research data; data journal; data lifecycle; policy

        大數據背景下,科學研究已進入“第四范式”,即數據密集型研究,科學數據成為科學研究的心臟,科學數據的共享越來越重要。英國皇家學會2012年發(fā)布的《科學是開放事業(yè)》(Science as an Open Enterprise)報告中提出:一篇完整的學術論文應該包括對實驗的完整描述、結果數據和確保數據能被驗證和重復使用的元數據,但實際情況卻是原始數據和科學結果的發(fā)表被割裂開了[1]。國外科學界較早認識到科研數據的重要性,并創(chuàng)建了數據期刊來發(fā)表描述數據集的論文。數據期刊目前已成為科研數據的三種重要傳播方式之一和重要角色之一[2]。

        數據期刊是一種新型的學術論文出版和科學數據共享模式,出版專門描述數據集的短篇論文,目前國際上有15家期刊出版商出版110多種數據期刊,并且數據期刊的數量還在不斷增加[3]。數據期刊對推動科研數據開放共享,促進數據重用、數據引用和科研評價具有重要作用,數據期刊政策是創(chuàng)建數據期刊的首要環(huán)節(jié),涉及數據提交、數據描述、數據保存、數據利用等數據生命周期階段。目前國內關于數據期刊政策的研究較少,本文擬調研國際數據期刊政策,以期為完善我國數據期刊政策提供參考,從而推動我國數據期刊和數據出版的發(fā)展。

        1 研究概述

        1.1 研究背景

        數據期刊是應對科研數據共享的大趨勢之下發(fā)展起來的新型學術期刊,是一種對數據的使用、引用和重用,以及對數據內容來源的準確識別和溯源都非常重要的工具[4]。當前大多國外數據期刊以開放獲取的方式正式出版,以便于科學數據最大程度傳播、共享和利用。數據期刊主要出版描述數據集的數據論文(data paper),旨在使其他研究人員了解可能用于科學和教育目的的數據,數據論文內容不涉及基于科學假設和科學問題的研究結果,描述的數據集來源既可以是對已發(fā)表論文中數據的說明描述,也可以是對新產生數據的說明描述。數據論文描述了用于創(chuàng)建數據集的方法、結構、重復使用價值以及與其在存儲庫中的位置的鏈接。

        數據期刊有兩種類型,一類是以出版研究性論文為主,將數據集作為論文的補充性文件出版的混合型(Mixed)數據期刊,如Gigascience、Ecology、F1000 Research、Biodoversity Data Journal;另一類是專門出版數據論文的純(Pure)數據期刊,目前共有7種純數據期刊,分別是《科學數據集論文》(Dataset Papers in Science)、《地球科學數據期刊》(Geoscience Data Journal)、《地球系統(tǒng)科學數據》(Earth System Science Data)、《科學數據》(Scientific Data)、《開放健康數據》(Open health data)、《開放考古學期刊》(Journal of open Archaeology)、《開放心理學數據期刊》(Journal of Open Psychology Data)。endprint

        國際對數據期刊政策內容分析的研究相對較少,由于數據期刊政策只是微觀層面的一個內容點,目前更多的研究主題集中在科學數據共享政策、技術、障礙等方面。國內關于數據期刊政策方面已有一些研究,如劉晶晶等[4]以Scientific Data期刊為案例,根據實用主義方法論,以合理競替的方法篩選和提煉政策要素,認為數據期刊應該著重于期刊提交規(guī)范、質量管理流程以及保障各方權益;歐陽錚錚等[5]選擇15種數據期刊進行調研,對其發(fā)展現狀、學科分布、出版方式、收錄內容、版權協議以及出版費用等方面進行了分析;劉鳳紅等[2]分析了不同類型數據論文的產生背景、概念、權益管理以及出版流程;雷秋雨等[6]分析了當前幾種典型的數據期刊出版模式,即以出版短數據論文為特征的數據期刊、以整合出版為特征的數據期刊、數據以補充資料出版特征的數據期刊,最后簡要論述了數據期刊出版當前的發(fā)展狀況、存在的問題、建議及數據期刊的發(fā)展趨勢。由上述可知,目前已有的研究并沒有針對純數據期刊政策的調研分析。

        1.2 研究方法

        文章以生命周期理論為理論基礎,采用DataOne科學數據生命周期模型[7]。數據生命周期是指從數據產生,經數據加工和發(fā)布,最終實現數據再利用的一個循環(huán)過程,其實質是依據科研過程來管理數據[8]。DataOne科學數據生命周期模型共包括8個階段,分別是數據計劃、數據收集、數據確認、數據描述、數據保存、數據發(fā)現、數據整合、數據分析。雖然將數據集發(fā)表在數據期刊上只涉及數據生命周期中的一個階段,但是數據期刊對其發(fā)表的數據集或者數據論文的政策要求涉及到了數據生命周期的多個階段,分別是數據計劃、數據確認、數據描述、數據保存、數據整合階段,本文將從這5個階段分析數據期刊的具體政策。

        文章采用網絡調查法和內容分析法,選取國際上純數據期刊作為研究對象,通過廣泛閱讀相關文獻和訪問數據期刊的官網,具體分析其在科研數據生命周期數據計劃、數據確認、數據描述、數據保存、數據整合階段的政策。由于7種純數據期刊中的《開放健康數據》《開放考古學期刊》《開放心理學數據期刊》均是由Ubiquity press出版社出版的數據期刊,其期刊政策極為相似,故本文只選取其中一種(《開放健康數據》期刊)進行調研分析,共5種純數據期刊政策(見表1)。

        2 科學數據生命周期模型下的數據期刊政策分析

        2.1 數據計劃階段

        數據計劃是指制定科研數據計劃、確定生成的數據類型、數據格式和數據的組織方式等。文章所調查的《科學數據集論文》等五種數據期刊均有關于數據計劃與提交的相關政策要求。

        《科學數據集論文》要求提交電子PDF或Word(DOC、DOCX、RTF)文件,數據論文沒有頁數限制。在數據論文發(fā)表之前,數據應該保存在適當的數據庫中,提交作者向稿件的編輯者和審稿人提供登錄信息,編輯者和審稿人可以訪問數據庫中的數據。數據集可以包括一個或多個表、圖像或基因序列的組合[9]?!兜厍蛳到y(tǒng)科學數據》于2009 年開始出版地球科學相關數據,旨在推動地球系統(tǒng)科學高質量科研數據的重用。要求提交的數據論文包括實驗和觀測數據的描述等,數據論文可先通過簡單快速的同行評審發(fā)表在期刊的論壇上,待稿件正式通過同行評審后,則發(fā)表在《地球系統(tǒng)科學數據》期刊上[10]?!兜厍蚩茖W數據》要求作者提交的數據論文對數據集進行詳細描述,包括原始數據集的收集、處理、以及數據集的格式、大小等細節(jié)信息,如文本和表格的格式推薦使用DOC、DOCX、RTF,動畫和視頻推薦使用GIF、mpeg或AVI格式。在數據論文發(fā)表前作者要為數據集找到合適的數據倉儲,并獲得DOI[11];《科學數據》期刊中的數據主要是指計算或策劃數據,以及通過實驗或觀察產生的數據, 論文使用DOC、DOCX、TEX格式,圖片使用PDF、EPS、TIFF、JPG 格式[12];《開放健康數據》發(fā)表的數據類型包括:計算機模擬數據、實驗數據、采訪和調查數據、灰色文獻等,圖使用150DPI分辨率(300DPI以上優(yōu)先),文件必須為以下格式:JPG、TIFF、GIF、PNG、EPS(以最大限度地提高質量,原始源文件是首選),數據格式應為ASCII、CSV、Autocad、EPS、JPEG、Excel、SQL等[13]。

        2.2 數據確認階段

        科學數據具有數量大、種類多、更為復雜的特點,科學數據確認即對科學研究最終產生數據的完整性和真實性進行復查核驗的過程[14]。數據期刊重視數據收集過程的技術嚴謹性、數據完整性以及與現有標準的匹配度,數據期刊政策通常涉及數據確認和數據驗證部分,文章調查的5種期刊均具有嚴格的數據審查政策。首先,同行評議是維護科學和學術研究質量和誠信的基礎。通過同行評審,確保數據集和數據論文的一致性、數據質量、數據使用價值和數據重用價值等(同行評議標準相關政策見表2)。

        其次,數據期刊為了確保數據質量,還采用了反剽竊和預防偽造數據的相應措施?!犊茖W數據集論文》使用iThenticate軟件來檢測提交的手稿中重疊和類似文本的實例,被發(fā)現是從其他作者手稿中剽竊的手稿,無論是出版的還是未出版的,都將遭受剽竊制裁,提交的手稿,發(fā)現制造或偽造的實驗結果,將招致數據偽造制裁?!堕_放健康數據》期刊使用反剽竊軟件(CrossCheck)來確保學術誠信,所有文章都由CrossRef的CrossCheck系統(tǒng)自動篩選,系統(tǒng)將傳入的文章與大量學術內容數據庫進行比較,并向編輯提醒任何可能出現的數據質量問題[19]。

        2.3 數據描述階段

        在數據描述階段數據期刊的政策主要是關于描述數據集的數據論文結構等方面的政策。數據期刊要求數據論文的描述結構通常包括標題、作者、摘要、方法標識符、技術驗證、日期、主題、資助機構、語言、存儲位置、參考文獻等內容(見表3)。其中,《開放健康數據》期刊對數據論文的長度有限制,要求科研人員提交的數據論文要短,《科學數據集論文》《地球科學數據》《地球系統(tǒng)科學數據》《科學數據》四種數據期刊對數據論文的長度沒有限制,但《科學數據》對描述數據集的論文標題和摘要長度有要求,標題包括空格在內不得超過110字符,摘要不超過170字符。endprint

        科研人員應詳細說明在數據集論文中描述的實驗、觀察中使用的方法和材料,應盡可能詳細地介紹其方法,包括如何確保精確的測量,以及所使用的任何設備的具體名稱和型號。在數據集的描述過程中,科研人員應提供包含在其數據集中的每個表、圖像的詳細描述,并為表中每列數據提供清晰的標簽和描述(在每一列的描述中,應當提供與該列有關的測量單位,只要這樣的單位存在,并且在沒有測量單位的情況下,應該明確地聲明沒有任何單位)??蒲腥藛T應盡可能提供關于其提交數據的元數據,如果提交的數據集或其任何組件已存儲在公開可用的數據庫中,應提供訪問該數據所需的所有信息,并確保論文中每個參考文獻中的信息是完整和準確的,所描述的數據集是可發(fā)現和可引用的。

        2.4 數據保存階段

        科研數據保存政策是科研數據共享和利用的前提和基礎,切實可行的科研數據保存政策能夠實現對科研數據的有效管理[20-21]。2015年,歐盟提出了“地平線2020”(Horizon 2020)研究與創(chuàng)新計劃,以支持將發(fā)表后的研究成果存放到開放知識庫中長期保存[22]。

        數據期刊均要求科研人員在數據論文發(fā)表前,將其描述的數據集存放到合適的數據知識庫中保存,如《科學數據集論文》要求作者將數據集存放到Portico數據庫;《地球系統(tǒng)科學數據》要求作者將數據集存放到BODC、CDIAC等數據庫;《地球科學數據》推薦的數據知識庫包括Figshare、PANGAEA、Zenodo等;《科學數據》期刊要求作者承諾在至少五年內,將數據集存在其實驗室或機構的服務器上,推薦存儲的數據知識庫包括DNA DataBank of Japan (DDBJ)、GenBank、ArrayExpress等[23];《開放健康數據》期刊推薦作者存儲的數據知識庫有特定學科的數據知識庫(Dryad、UKDA、Physionet)、普通的數據知識庫(Open Health Data Dataverse、Figshare、SND、Zenodo)和機構知識庫(UCL Discovery、eResearch South、Austrlia)。為了確保所有出版物的永久性,期刊還利用CLOCKSS和LOCKSS歸檔系統(tǒng)創(chuàng)建永久性存檔用于保存和恢復,期刊內容定期存檔到世界領先的研究圖書館。

        科研數據集的長期保存是為了促進數據集的可發(fā)現性和可利用性,許可協議是作者將數據集存儲在數據知識庫時,為了保留著作權釋放其他一些權利的機制。存儲在不同的數據知識庫的數據集使用不同的許可協議,如Physionet數據知識庫使用GPL(GNU General Public License)許可協議,Open Health Data Dataverse、Dryad、Figshare、SND許可協議使用的是CC0,UKDA、Zenodo使用CC0、開放數據共用許可協議(Open Data Commons License)、開放政府許可協議(Open Government License),數據期刊不建議對數據使用施加商業(yè)或其他限制的許可,許可協議使用的限制越少,數據開放的程度越高,數據產生的科學影響可能就越大。

        《科學數據集論文》期刊的論文作者保留其作品的版權,根據知識共享署名許可(CC-BY)發(fā)布,允許在任何媒體中不受限制地使用、分發(fā)和復制文章,前提是文章被正確引用,數據采用CC0許可協議[28];《地球系統(tǒng)科學數據》期刊使用CC-BY 3.0版本[29];《地球科學數據》和《科學數據》期刊的數據論文使用CC-BY許可協議;《開放健康數據》數據論文使用CC-BY許可協議,并且強烈地推薦CC0作為開放研究數據的許可協議[30]。

        2.5 數據整合與使用階段

        在數據整合和使用階段,數據期刊特別強調關于數據引用的相關政策,支持數據引用,認為科學數據引用和引用論文等學術引用一樣重要,數據引用可以促進對數據做出貢獻的任何作者的學術獎勵。數據引用應該包含一個統(tǒng)一標識符,且這種標識符是機器可讀的、全球唯一的、能被科學界廣泛使用的,數據引用可以促進對某一數據的識別、訪問和驗證,關于元數據的引用還應該包含出處、數據的版本(或者是更新后的和初始數據相同的部分數據)的信息,以便可以跟蹤并驗證數據[31]。

        科學數據引用機制,可有效解決數據開放共享過程中的權益問題,也是對科研人員和數據工作者的一種有效激勵機制。調查發(fā)現,數據期刊較多采用國際數據引用標準,如《地球系統(tǒng)科學數據》和《科學數據》兩本期刊采用Force11引用原則,數據引用的元素包括創(chuàng)建者、出版年、數據知識庫名稱、版本、持久標識符;《地球科學數據》期刊推薦科研人員使用DataCite引用標準,其引用元素包括創(chuàng)建者、 出版年、數據集名稱、出版商、持久標識符;《開放健康數據》支持通用的哈佛引用格式。

        3 國外數據期刊政策對我國的啟示

        3.1 制定基于科研數據生命周期的數據期刊政策

        國際上已有的數據期刊均制定了詳細的基于科研數據生命周期的數據政策,涉及科研數據生命周期的多個階段(數據計劃、數據確認、數據描述、數據保存、數據引用),旨在推動科學數據的開放、交流和引用,推進科學數據的長期保存和數據資產管理,探索科學數據的有效評價機制,推動數據科學的發(fā)展。在我國,數據期刊的創(chuàng)建與經營尚處于起步和探索階段。2014年,中國科學院發(fā)行《地理學報增刊》,這是我國第一本數據期刊,配合《全球變化科學研究數據注冊與出版系統(tǒng)》運行[35]。2016年,中國科學院和ICSU CODATA 中國全國委員會合辦的數據期刊《中國科學數據》(China Scientific Data)正式在線出版[36],該刊是我國目前唯一的專門面向多學科領域科學數據出版的學術期刊。我國數據期刊的發(fā)展尚不成熟,數據期刊政策是數據期刊出版實踐的重要要素,因此,我國在制定數據期刊政策時,可參考國際上發(fā)展較好的數據期刊的做法,制定詳細的基于科研數據生命周期的數據政策,從而推動數據科學和數據出版的發(fā)展進程。endprint

        3.2 與科研數據知識庫和圖書館開展合作

        科研人員在發(fā)表數據論文前,將數據集存儲在數據知識庫中并獲得一個DOI是數據期刊出版的首要流程(見圖1),同時,公開可用的科學數據分布在眾多不同的存儲庫中,因而用戶很難找到相關的數據集,將數據由第三方數據倉儲進行管理可實現數據集和數據論文的鏈接,極大程度地增加數據集的可發(fā)現性。國外數據期刊與科研數據知識庫開展廣泛的合作,將數據期刊中描述的數據存儲在數據倉儲或數據中心,如DAACs、Dryad、PANGAEA、Figshare、SND、Zenodo等。但是,數據知識庫需要滿足一定的標準,如可以確保數據集的長期保存,為提交的數據集提供機密審查,為提交的數據集提供穩(wěn)定的標識符, 允許公眾對數據的訪問不受不必要的限制[23]。我國數據期刊應選取發(fā)展較好的、穩(wěn)定的數據知識庫開展合作,如Science Data Bank等,在論文出版前將數據集存儲到相應的數據知識庫中,并獲得一個DOI,還可以像《開放科學數據》期刊一樣,將數據論文定期存放在圖書館中,以確??蒲袛祿拈L期保存。

        3.3 注重保護作者權益

        數據期刊均十分注重保護作者權益,鼓勵甚至強制規(guī)定作者采用CC-BY許可協議,但是不建議對數據使用施加商業(yè)或其他限制的許可協議類型。對于開放獲取的數據論文,作者通常保留版權,授權出版商出版論文,授權第三方在注明原作者的條件下使用論文。對于數據集,期刊通常要求所發(fā)表論文中描述的數據集在非商業(yè)使用的情況下提供免費獲取,包括評審階段和被錄用以后,但要求用戶必須對所用的科學數據進行數據引用,以獎勵作者的貢獻,保護數據集作者的權益?!犊茖W數據集論文》等期刊推薦使用CC0許可協議開放數據集[37]。我國的《中國科學數據》期刊建議作者對其數據集使用CC-BY 4.0版本,CC-BY較CC0許可協議其開放程度較低、適用范圍較窄(CC-BY許可協議不適用于軟件等對象的描述),可能會在一定程度上限制科學數據的開放共享和利用。

        3.4 鼓勵數據引用采用國際標準格式

        促進數據引用是數據期刊創(chuàng)建和出版的重要目標之一,國際數據期刊十分鼓勵科研人員的數據引用行為??茖W數據引用有利于促進科學數據開放共享,研究人員愿意共享科研數據;促進科學數據的發(fā)現、重復利用和溯源,減少數據偽造、數據造假和數據剽竊行為,凈化學術風氣。科學數據引用和學術論文引用同等重要,是研究人員科研成果的重要組成部分,科學數據引用應該被納入科研評價體系中,對研究人員的數據貢獻給予相應的獎勵。數據期刊應對科研人員引用其出版的數據論文和數據集提供詳細的指導和要求,大多數數據期刊使用國際組織有關科學數據引用的標準和格式,如DataCite引用標準、Force11引用標準、哈佛引用格式,我國目前尚未制定關于科學數據引用統(tǒng)一的標準規(guī)范,建議我國數據期刊采用國際組織機構的引用標準。

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        作者簡介:黃如花(1968-), 女,武漢大學信息資源研究中心、武漢大學信息管理學院教授,博士生導師,研究方向:信息組織、信息檢索與服務、政府數據開放;李楠(1992-), 女,武漢大學信息管理學院碩士研究生。endprint

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        政策
        華人時刊(2019年21期)2019-11-17 08:25:07
        有些政策為何淪為“萬分正確、十分無用”
        當代陜西(2019年18期)2019-10-17 01:49:02
        外商投資政策再完善
        中國外匯(2019年15期)2019-10-14 01:00:46
        發(fā)展中國家的應對政策準備好了嗎
        中國外匯(2019年6期)2019-07-13 05:44:04
        政策解讀
        農家書屋(2019年5期)2019-06-17 06:42:36
        政策
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