遺傳發(fā)育

扇貝發(fā)育演化

中科院海洋研究所劉保忠組與國內(nèi)外科學(xué)家合作開展扇貝發(fā)育演化研究，相關(guān)論文發(fā)表于《自然-生態(tài)學(xué)與進(jìn)化》。研究解析了重要的雙殼貝類蝦夷扇貝的全基因組序列，發(fā)現(xiàn)在超過3億年的演化過程中扇貝基因組變化緩慢，其全部19對染色體的結(jié)構(gòu)與預(yù)測的現(xiàn)有多數(shù)動物共同祖先的17對染色體保持了驚人的一致性，這種保守性遠(yuǎn)超過了其它已知基因組信息的動物。通過對Hox基因的分析，提出了關(guān)于Hox基因表達(dá)的新概念：分段共線性(subcluster temporal co-linearity, STC)。通過對扇貝的全部11個Hox基因在胚胎和幼蟲期的動態(tài)表達(dá)規(guī)律進(jìn)行了系統(tǒng)分析，支持了STC假說。

Hox基因組成與聚類分析等

蝦夷扇貝

小麥遠(yuǎn)緣雜交及著絲粒結(jié)構(gòu)功能

中科院遺傳發(fā)育所韓方普研究組開展小麥遠(yuǎn)緣雜交及染色體工程育種研究，為小麥育種提供了新的種質(zhì)資源，也為染色體結(jié)構(gòu)和功能研究提供了新的素材，研究論文發(fā)表于《植物雜志》。小麥與黑麥的雜交工作始于19世紀(jì)70年代，育種家和遺傳學(xué)家看到小黑麥的優(yōu)良性狀，一百多年來，一直進(jìn)行小麥與小黑麥的回交、自交來進(jìn)行新品種選育。全球推廣的普通小麥品種中大約有70%含有一對特殊的染色體：稱之為1BL/1RS易位系，即普通小麥第一同源群B組染色體的長臂與黑麥的1R染色體短臂連接在一起形成小麥-黑麥染色體易位系。我國許多大面積推廣的小麥新品種含有這條融合著絲粒的染色體。

非編碼RNA和轉(zhuǎn)座子在長壽中的作用機(jī)制

中科院-馬普學(xué)會計算生物學(xué)伙伴研究所韓敬東研究員等該研究在探索能量限制調(diào)控非編碼RNA和轉(zhuǎn)座子表達(dá)的機(jī)制，相關(guān)成果發(fā)表于《細(xì)胞-報告》。對生活方式的不同干預(yù)，比如改變飲食中糖、蛋白質(zhì)和脂肪的攝入比例，熱量的攝取以及能量消耗，可以影響人類對衰老相關(guān)疾病的易感度，甚至影響壽命。在不引起營養(yǎng)不良條件下的能量限制以及其他一些生活方式(比如自主鍛煉)可以減少衰老相關(guān)疾病，比如肥胖、二型糖尿病和心血管疾病的發(fā)生。研究揭示了有益于長壽的生活方式可以引起對轉(zhuǎn)座子的有效抑制，并且這些抑制可以保護(hù)染色質(zhì)免受非正常RNA轉(zhuǎn)錄和基因表達(dá)失調(diào)的影響。

水稻理想株型基因超高產(chǎn)等位位點(diǎn)的克隆與作用機(jī)理

中科學(xué)上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所何祖華研究組、遺傳發(fā)育所李家洋研究組等科研人員實現(xiàn)了超級稻新品種的分子設(shè)計育種，為今后水稻理想株型的分子設(shè)計育種提供了遺傳資源和技術(shù)途徑，相關(guān)論文發(fā)表于《自然-通訊》。水稻株型是決定水稻產(chǎn)量的主要因素之一，也是決定抗倒性的主要農(nóng)藝性狀，水稻理想株型的塑造是提高水稻產(chǎn)量的重要途徑?？刂扑纠硐胫晷偷闹骰騃PA1編碼一個含SBP-box的轉(zhuǎn)錄因子，參與調(diào)控多個生長發(fā)育過程。IPA1對株型有著精細(xì)的劑量調(diào)控效應(yīng)，利用IPA1的不同等位位點(diǎn)，實現(xiàn)IPA1的適度表達(dá)是形成大穗、適當(dāng)分蘗和粗稈抗倒理想株型的關(guān)鍵。

水稻粒寬與粒重調(diào)控新機(jī)制

中國農(nóng)科院作物科學(xué)研究所萬建民院士領(lǐng)導(dǎo)的水稻功能基因組學(xué)創(chuàng)新研究組揭示了控制水稻粒寬與粒重關(guān)鍵基因GW5通過調(diào)節(jié)油菜素內(nèi)酯（brassionsteroids，BR)信號途徑調(diào)控水稻籽粒發(fā)育的新機(jī)制，初步闡述了其功能作用模式與遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，為水稻高產(chǎn)育種提供了的理論依據(jù)。研究論文發(fā)表于《自然-植物》。水稻粒型是決定籽粒重量進(jìn)而影響水稻產(chǎn)量和品質(zhì)的重要性狀。GW5蛋白定位在細(xì)胞質(zhì)膜上，并可與油菜素內(nèi)酯信號途徑中的一個關(guān)鍵激酶GSK2直接互作，抑制GSK2磷酸化下游兩個轉(zhuǎn)錄因子BZR1和DLT活性，使得非磷酸化狀態(tài)的BZR1與DLT積累并進(jìn)入細(xì)胞核中，調(diào)控BR下游響應(yīng)基因表達(dá)，調(diào)控生長發(fā)育。

保存完美的金龍魚

中科院古脊椎動物與古人類研究所研究員張江永和加拿大阿爾伯塔大學(xué)教授Mark Wilson報道了在我國首次發(fā)現(xiàn)的骨舌魚科金龍魚屬一新種：中華金龍魚（Scleropages sinensis），相關(guān)研究成果發(fā)表于《古脊椎動物學(xué)報》。金龍魚是一種名貴的觀賞魚類，屬于骨舌魚超目骨舌魚目骨舌魚科。骨舌魚類是真骨魚中較古老的類群，雖然金龍魚的現(xiàn)生種發(fā)現(xiàn)于各種河流和小溪中，但它比較喜歡水草茂盛的靜水環(huán)境，一般在春季的夜間產(chǎn)卵，由雄性親魚在口中孵化。金龍魚一般游弋于表層水中，以魚蝦、昆蟲、甲殼蟲為食，甚至包括青蛙、蜥蜴、老鼠等，也可以躍出水面捕捉蜻蜓等昆蟲。中華金龍魚也應(yīng)該有相似的生長環(huán)境和食性。

豬尾鼠新物種

中科院昆明動物研究所蔣學(xué)龍課題組將豬尾鼠屬系統(tǒng)發(fā)育與分類研究中取得的新進(jìn)展發(fā)表于《哺乳動物學(xué)雜志》。尾鼠屬（Typhlomys）隸屬于嚙齒目刺山鼠科，是一種小型樹棲型哺乳動物，因其眼睛小而又被稱為“盲鼠”。豬尾鼠屬原為單型屬，豬尾鼠（Typhlomys cinereus）模式產(chǎn)地在福建掛敦，在中國長江以南和越南北部廣泛分布。分子界定形成的5個支系均已達(dá)到物種水平，其中采自云南轎子山3號標(biāo)本和大圍山1號標(biāo)本單獨(dú)聚成一支，且在形態(tài)上明顯區(qū)別于其它支系，而將其描記為一新物種。研究還發(fā)現(xiàn)沙巴豬尾鼠的IRBP基因編碼區(qū)出現(xiàn)了單個堿基的缺失，可能預(yù)示著豬尾鼠視覺出現(xiàn)了退化。

功不可沒的普通野生稻

中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所儲成才研究組和丹麥哥本哈根大學(xué)、美國加州大學(xué)伯克利分校等合作，通過對已發(fā)表的野生稻和栽培稻基因組數(shù)據(jù)的深入挖掘，發(fā)現(xiàn)野生稻基因組中有著人工選擇馴化的痕跡，從而證實有大量栽培稻基因流入野生稻群體，相關(guān)工作發(fā)表于《基因組研究》。普通野生稻一直被認(rèn)為是亞洲栽培稻的野生祖先，也是水稻改良過程中的重要種質(zhì)資源。普通野生稻經(jīng)過近萬年的馴化到農(nóng)家品種，進(jìn)一步經(jīng)過近百年的現(xiàn)代育種得到現(xiàn)代栽培稻品種，這一過程伴隨著遺傳多樣性的減少和很多優(yōu)異基因的丟失。育種家在現(xiàn)代育種實踐中也逐漸意識到這一點(diǎn)，水稻重大改良過程中的很多重要基因，就是來自于普通野生稻。科