李啟沅,何旭珩,王 縣,劉小盼,孫建波,廖秋燕,尹潔芳,賈 佳,唐中湘,李 雪
·生物標(biāo)志物·
前處理方法及凍融次數(shù)對(duì)尿液蛋白標(biāo)志物質(zhì)量影響的探究
李啟沅,何旭珩,王 縣,劉小盼,孫建波,廖秋燕,尹潔芳,賈 佳,唐中湘,李 雪
目的探究不同前處理方法及凍融次數(shù)對(duì)尿液樣本蛋白質(zhì)量的影響。方法 取樣后的尿液樣本經(jīng)過(guò)離心與不離心處理后,分別于室溫及4℃冷藏放置4、12、24、48、72 h,及在-80℃反復(fù)凍融1、3、5、10次后,經(jīng)過(guò)橋式酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定方法檢測(cè)叢生蛋白、腎損傷分子-1、胱抑素C及視黃醇結(jié)合蛋白4種蛋白的質(zhì)量濃度變化。結(jié)果 經(jīng)離心處理的樣本,在室溫或4℃冷藏放置48 h后,叢生蛋白質(zhì)量濃度顯著降低。未經(jīng)離心處理的樣本,室溫放置24 h后,叢生蛋白質(zhì)量濃度顯著降低;4℃冷藏條件下蛋白相對(duì)穩(wěn)定,在放置72 h后顯著降低。4種蛋白-80℃反復(fù)凍融1、3、5、10次后,質(zhì)量濃度均無(wú)顯著變化;未經(jīng)離心處理樣本,蛋白質(zhì)量濃度較離心處理樣本高。結(jié)論 在冷凍保存前,盡量將尿液樣本先放置在4℃環(huán)境下處理或暫存,且暫存時(shí)間不超過(guò)72 h;若室溫放置,時(shí)間不超過(guò)24 h;且根據(jù)研究用途決定是否離心。樣本反復(fù)凍融10次對(duì)尿液蛋白質(zhì)量無(wú)明顯影響,可以根據(jù)檢測(cè)需求及實(shí)際條件,確定樣本是否分裝及分裝管數(shù)等。
尿液蛋白標(biāo)志物;尿液儲(chǔ)存;標(biāo)志物質(zhì)量
尿液是有重要意義的排泄物,其主要成分為尿素、無(wú)機(jī)鹽、微量蛋白質(zhì)、代謝物等,其成分的變化反映代謝異常、泌尿系統(tǒng)或其他組織器官的病變,可作為無(wú)創(chuàng)、有效的疾病診斷生物材料。其中,尿液中某些蛋白的變化是包括腎損傷等疾病的重要標(biāo)志,為疾病的診斷提供參考[1-5]。尿液也是生物樣本庫(kù)存儲(chǔ)重要的樣本之一,其采集、處理與保存的規(guī)范化操作是質(zhì)量控制的重要保證;要獲得可靠的科學(xué)研究及應(yīng)用成果,必須保證尿液樣本完整性[6-7]。
叢生蛋白,相對(duì)分子質(zhì)量為80×103,它與清除細(xì)胞的碎片和凋亡的細(xì)胞相關(guān)。研究表明,叢生蛋白可作為膀胱癌診斷標(biāo)志物[8]。腎損傷分子-1(kidney injury molecule-1,KIM-1)是一種跨膜蛋白,可作為早期腎損傷的診斷標(biāo)志物[9-10]。胱抑素C是一種半胱氨酸蛋白酶抑制劑,廣泛存在于各種組織的有核細(xì)胞和體液中,由122個(gè)氨基酸殘基組成,相對(duì)分子質(zhì)量為13.3×103,是一種低相對(duì)分子質(zhì)量、堿性非糖化蛋白質(zhì),也是新近發(fā)展起來(lái)的評(píng)估腎功能的一種敏感性好、特異性高的指標(biāo)[11-12]。視黃醇結(jié)合蛋白(retinol binding protein,RBP)是血液中維生素的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,由肝臟合成,廣泛分布于血液、腦脊液、尿液及其他體液中。測(cè)定RBP能早期發(fā)現(xiàn)腎小管功能損害,并能靈敏反映腎近曲小管的損害程度,還可作為腎功能早期損害和監(jiān)護(hù)治療的指標(biāo)[13-14]。
作者選用這4種常用作疾病診斷,且在健康人尿液中普遍存在的蛋白質(zhì)作為研究對(duì)象,采用橋式酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(enzyme-linked immune sorbent assay,ELISA)方法,探討離心或者不離心情況下,前處理溫度、前處理放置時(shí)間及反復(fù)凍融對(duì)尿液樣本蛋白質(zhì)量的影響,為優(yōu)化樣本采集、規(guī)范尿液樣本前處理操作流程、保存條件及提高樣本保存質(zhì)量提供參考。
1.1 材料 收集來(lái)自健康成年人的晨尿樣本,男女各2人,項(xiàng)目經(jīng)國(guó)家基因庫(kù)倫理委員會(huì)審批通過(guò),捐贈(zèng)者知情并簽訂知情同意書(shū)。96孔聚苯乙烯檢查板與KIM-1、胱抑素 C、叢生蛋白及 RBP、ELISA試劑盒均購(gòu)自美國(guó)R&D公司,其中試劑盒中配備有各種蛋白相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)品和牛血清白蛋白。磷酸鹽緩沖液(phosphate buffer solution,PBS)為美國(guó)Gibco公司產(chǎn)品。FLUOstar Omega全自動(dòng)多功能酶標(biāo)儀,購(gòu)自德國(guó)BMG公司。
1.2 方法
1.2.1 樣本采集 捐贈(zèng)者采集晨尿樣本50 mL于無(wú)菌的尿液采樣杯中。
1.2.2 樣本處理 尿液采集收集完畢后,即刻對(duì)樣本進(jìn)行分裝處理。樣本處理流程參照?qǐng)D1。所采集每份尿液50 mL充分混勻后,平均分成2部分,一部分經(jīng)二步離心(1 600 r/min離心10 min后12 000 r/min再高速離心10 min),以去除細(xì)胞及微粒等殘?jiān)?;另一部分不?jīng)離心,直接進(jìn)行分裝。每部分樣本平均分裝成15管,每管1 mL,以進(jìn)行尿液室溫前處理時(shí)間穩(wěn)定性、4℃前處理時(shí)間穩(wěn)定性及-80℃反復(fù)凍融次數(shù)研究測(cè)試。其中10管樣本分別在室溫及 4 ℃條件下放置 4、12、24、48、72 h;4 管放置于-80℃冰箱進(jìn)行反復(fù)凍融測(cè)試,凍融次數(shù)分別為1、3、5、10次;另分別有 1管樣本,存放于-80℃作為項(xiàng)目對(duì)照樣本,即對(duì)照組(0 h),在室溫處理檢測(cè)和凍融檢測(cè)中,分別與離心組、非離心組以及凍融檢測(cè)組樣本進(jìn)行比較。1管PBS作為陰性對(duì)照。處理完的樣本檢測(cè)前暫存放于-80℃冰箱保存。
圖1 尿液樣本處理流程
1.2.3 ELISA 用PBS分別將KIM-1、胱抑素C、叢生蛋白及RBP捕獲抗體蛋白稀釋為一定比例,并包被在96孔板中,室溫下孵化過(guò)夜。400 μL清洗液清洗每孔3次,加1%牛血清白蛋白稀釋液300 μL,室溫下孵化1 h。加入100 μL處理后的尿液樣本、試劑盒配備的標(biāo)準(zhǔn)品或陰性對(duì)照品到相應(yīng)孔位,室溫孵化2 h,洗板3次。KIM-1、胱抑素C、叢生蛋白及RBP相應(yīng)板中分別添加100 μL檢測(cè)抗體,室溫孵化2 h,洗板3次;加入100 μL鏈霉親和素辣根過(guò)氧化物酶到每個(gè)孔;覆蓋后在室溫下避光孵化20 min,洗板3次。添加100 μL底物顯色液,室溫下避光孵化20 min;然后加入50 μL終止液,終止反應(yīng)。在450 nm波長(zhǎng)處檢測(cè)各孔的光密度值,根據(jù)不同質(zhì)量濃度的標(biāo)準(zhǔn)品光密度值繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,并計(jì)算出測(cè)試尿液樣本的蛋白質(zhì)量濃度。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用GraphPad軟件,室溫前處理時(shí)間穩(wěn)定性、4℃前處理時(shí)間穩(wěn)定性及-80℃反復(fù)凍融測(cè)試樣本與對(duì)照組間差異采用t檢驗(yàn);如果數(shù)據(jù)為非正態(tài)分布,以中位數(shù)[四分位數(shù)間距(25%,75%)]表示,2組間比較采用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 不同前處理方式對(duì)樣本質(zhì)量影響 與對(duì)照組比較隨著時(shí)間的延長(zhǎng),經(jīng)離心處理后的尿液樣本在室溫和4℃存放條件下,叢生蛋白質(zhì)量濃度呈降低趨勢(shì),且在48 h顯著降低(t室溫=3.005、P室溫=0.023 9,t4℃=3.232,P4℃=0.017 9);而其他 3 種蛋白質(zhì)量濃度無(wú)明顯變化。見(jiàn)圖2。未經(jīng)離心處理的尿液樣本,室溫放置24 h后叢生蛋白質(zhì)量濃度即出現(xiàn)顯著降低(t=2.574,P=0.049 8),4 ℃放置 72 h后也顯著降低(圖3);其他3種蛋白質(zhì)量濃度無(wú)明顯變化。未經(jīng)離心的尿液樣本叢生蛋白的起始質(zhì)量濃度高于經(jīng)離心處理的樣本。
圖2 經(jīng)離心處理后的尿液叢生蛋白質(zhì)量濃度
圖3 未經(jīng)離心處理的尿液叢生蛋白質(zhì)量濃度
2.2 凍融次數(shù)對(duì)樣本質(zhì)量影響 相較離心處理樣本,未經(jīng)離心處理的 KIM-1(t=2.063、P=0.085)和叢生蛋白(t=1.920、P=0.103)的初始質(zhì)量濃度偏高,但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(表1)。
尿液樣本在反復(fù)凍融1、3、5、10次后,4種蛋白質(zhì)量濃度均無(wú)顯著變化(圖4)。
表1 不同凍融次數(shù)尿液4種蛋白質(zhì)量濃度變化(pg/mL)
圖4 不同凍融次數(shù)尿液蛋白質(zhì)量濃度
本研究中選用叢生蛋白、KIM-1、胱抑素C、RBP 4種蛋白進(jìn)行特異性檢測(cè),研究不同處理方式對(duì)尿液樣本中蛋白質(zhì)量的影響。結(jié)果顯示,隨著放置時(shí)間的延長(zhǎng),在室溫或4℃條件下放置的尿液樣本中,叢生蛋白質(zhì)量濃度有下降趨勢(shì);經(jīng)離心處理的樣本,在室溫或4℃放置48 h后,叢生蛋白質(zhì)量濃度顯著降低。未經(jīng)離心處理的樣本,室溫放置24 h后,蛋白質(zhì)量濃度便出現(xiàn)顯著降低;4℃條件下蛋白相對(duì)穩(wěn)定,在放置72 h后顯著降低。對(duì)于離心/不離心處理的樣本,4℃相較于室溫,尿液蛋白更穩(wěn)定,質(zhì)量變化更小,更利于樣本質(zhì)量的保存。與叢生蛋白相比,其他3種蛋白相對(duì)穩(wěn)定,經(jīng)過(guò)處理質(zhì)量濃度無(wú)明顯變化。4種蛋白-80℃反復(fù)凍融1、3、5、10次后,質(zhì)量濃度均無(wú)顯著變化,未經(jīng)離心處理樣本蛋白質(zhì)量濃度較離心處理樣本高。
總的來(lái)說(shuō),放置溫度、時(shí)間及是否經(jīng)離心處理在一定程度上影響著尿液蛋白質(zhì)量的變化。然而,目前缺乏比較通用有效的生物標(biāo)志物實(shí)時(shí)檢測(cè)方法,尿液樣本無(wú)法立即進(jìn)行分析處理;且對(duì)于檢測(cè)中心而言,并不是所有的檢測(cè)中心都建立了完善的檢測(cè)方法。因此,尿液樣本的暫存和運(yùn)輸在實(shí)際情況中通常無(wú)法避免。本研究對(duì)尿液樣本檢測(cè)前的前處理?xiàng)l件進(jìn)行了探索。
根據(jù)研究結(jié)果顯示,KIM-1、RBP、胱抑素C 3種蛋白標(biāo)志物無(wú)論是否經(jīng)過(guò)離心處理,在72 h以?xún)?nèi)處理對(duì)臨床結(jié)果無(wú)明顯影響。如果客觀檢測(cè)條件不能滿足,可暫且將尿液存放在4℃冷藏,72 h以?xún)?nèi)分析生物標(biāo)志物即可。如果涉及尿液樣本的運(yùn)輸,最好保證在室溫條件下不超過(guò)72 h。而叢生蛋白,穩(wěn)定性相對(duì)較差,最好在室溫24 h以?xún)?nèi)就處理,如果存放在4℃則可適度延長(zhǎng)至48 h以?xún)?nèi)處理。經(jīng)過(guò)反復(fù)凍融10次,尿液中蛋白標(biāo)志物均未受明顯影響,因此尿液樣本可先在-80℃儲(chǔ)存,在長(zhǎng)期穩(wěn)定性有效期內(nèi)檢測(cè)即可。結(jié)合Adamo等[15]研究的長(zhǎng)期穩(wěn)定性結(jié)果,叢生蛋白在-80℃條件下可儲(chǔ)存3個(gè)月,而KIM-1和胱抑素C在-80℃條件下可儲(chǔ)存達(dá)12個(gè)月。因此,可根據(jù)檢測(cè)需求及實(shí)際條件,確定樣本是否分裝及分裝管數(shù)等,在長(zhǎng)期穩(wěn)定性有效期內(nèi)對(duì)不同標(biāo)志性蛋白進(jìn)行檢測(cè)。
4種蛋白中,叢生蛋白在不同放置溫度、時(shí)間下,尿液蛋白質(zhì)量濃度變化明顯,這一結(jié)果也與Adamo等[15]之前針對(duì)叢生蛋白的長(zhǎng)期穩(wěn)定性研究結(jié)果一致。這可能是由叢生蛋白的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)造成的。叢生蛋白較RBP和胱抑素C小分子蛋白相對(duì)分子質(zhì)量偏大,且是由二硫鍵連接的異源二聚體蛋白,容易發(fā)生聚合形成二聚體、四聚體以及更高相對(duì)分子質(zhì)量的寡聚物,從而對(duì)以ELISA法為基礎(chǔ)的質(zhì)量濃度檢測(cè)造成影響[16]。叢生蛋白對(duì)存儲(chǔ)條件的變化敏感性高,因此該蛋白可作為尿液質(zhì)控的標(biāo)志性蛋白。
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Effects of pretreatment and freeze-thaw cycles on urinary biomarkers
LI Qiyuan, HE Xuheng, WANG Xian, LIU Xiaopan, SUN Jianbo, LIAO Qiuyan,YIN Jiefang, JIA Jia, TANG Zhongxiang, LI Xue
(China National GeneBank, BGI-Shenzhen, Shenzhen Guangdong 518083, China)
ObjectiveAimed to explore the effects of different pretreatment methods and freeze-thaw cycles on the quality of various urinary biomarkers.Methods Centrifuged or uncentrifuged urine samples were processed and stored at room temperature of 4℃ for 4,12,24,48 and 72 hours with freeze-thaw for 1, 3, 5, 10 cycles respectively.Then four urinary biomarkers including clusterin,kidney injury molecule 1(KIM-1), cystatin C and retinol binding protein(RBP)were detected by enzyme-linked immune sorbent assay(ELISA).Results After stored at room temperature for 48 hours,the clusterin biomarker from centrifuged urine samples showed a significant reduction in concentration.While for the uncentrifuged urine samples,the cluster in biomarker showed a significant reduction in concentration after stored at room temperature for 24 hours or 4℃for 72 hours.After multiple freeze-thaw cycles, all 4 urinary biomarkers were stable, and the initial concentrations were higher for those urinary biomarkers from uncentrifugated urine samples.Conclusion Before detection or cryopreservation,urine samples were recommended to store at 4℃for maximum period of 72 hours,and stored at room temperature for no more than 24 hours.No significant degradation was detected for the four urinary biomarkers after freeze-thaw for 10 cycles,and the urine samples could be aliquoted and freezed based on research requirements.
Urinary biomarkers; Urine storage; Biomarker quality
Q592.2
A
2095-3097(2017)05-0257-04
10.3969/j.issn.2095-3097.2017.05.001
深圳市科技計(jì)劃項(xiàng)目(JCYJ20160510141910129)
518083廣東 深圳,深圳華大基因研究院國(guó)家基因庫(kù)(李啟沅,何旭珩,王 縣,劉小盼,孫建波,廖秋燕,尹潔芳,賈 佳,唐中湘,李 雪)
[注 明]李啟沅,何旭珩:并列第一作者
2017-03-13 本文編輯:徐海琴)