張文韜/編譯
脊椎動(dòng)物掃描發(fā)現(xiàn)“新故事”
張文韜/編譯
計(jì)算機(jī)斷層掃描圖像(從左至右):水虎魚(梅氏鋸脂鯉),念珠蜥蜴和北極露脊鯨
● 亞當(dāng)·蘇梅爾斯將其喜歡掃描動(dòng)物的業(yè)余愛好發(fā)展成了一項(xiàng)工作,他探索發(fā)現(xiàn)的工作方法簡單高效,啟發(fā)了同行,同時(shí)也吸引了一批志同道合的科研人員從事該項(xiàng)研究工作。因其研究工作為解剖學(xué)、進(jìn)化學(xué)等領(lǐng)域工作開拓了新視角,其領(lǐng)銜的研究工作獲得美國國家科學(xué)基金會(huì)(NSF)資助。
亞當(dāng)·蘇梅爾斯(Adam Summers)喜歡給死魚進(jìn)行計(jì)算機(jī)斷層掃描,也就是常說的CT,他甚至已經(jīng)把這個(gè)特殊的愛好發(fā)展到了學(xué)術(shù)癡迷的程度,因此獲得了“魚人”的綽號。他是個(gè)生物力學(xué)家,實(shí)驗(yàn)室在美國華盛頓圣胡安島上的星期五港口。他說,“剛開始那會(huì),我都會(huì)用士力架來換CT掃描的機(jī)會(huì)。”20年來,他一直掃描保存在液體中的魚類標(biāo)本,得到精細(xì)的3D圖像,研究錯(cuò)綜復(fù)雜的動(dòng)物內(nèi)部結(jié)構(gòu)。每當(dāng)他在網(wǎng)上發(fā)布這些精美的骨架圖時(shí),粉絲們就會(huì)急切地追問下一次會(huì)掃描什么魚。蘇梅爾斯總是半開玩笑地回應(yīng):“別著急,一個(gè)一個(gè)來,我會(huì)把所有的魚類都掃描了?!?/p>
去年,美國佛羅里達(dá)州自然歷史博物館的爬蟲學(xué)家大衛(wèi)·布萊克本(David Blackburn)在“推特”上看到了蘇梅爾斯發(fā)起的話題——掃描所有魚,突發(fā)奇想,他說:“我將掃描所有青蛙?!辈既R克本剛與博物館館長交流完其想法后,就給蘇梅爾斯打了電話。他們決定尋找資金,增加投入,來實(shí)現(xiàn)“掃描一切”的目標(biāo)?,F(xiàn)在他們已經(jīng)獲得美國國家科學(xué)基金會(huì)250萬美元的資助,2017年9月1日已經(jīng)開始該項(xiàng)目——3D圖像中脊椎動(dòng)物多樣性的開放性研究(簡稱oVert)。在接下來的4年中,布萊克本負(fù)責(zé)的工作是:用CT掃描2萬多個(gè)來自全美國16個(gè)博物館和大學(xué)的脊椎動(dòng)物標(biāo)本,覆蓋已知種屬的80%。oVert將從其中選擇約1 000個(gè)樣本(代表了大部分脊椎動(dòng)物家族)用碘染料浸泡,從而加深軟組織中的對比度,以便科學(xué)家們看到肌肉、循環(huán)系統(tǒng)、腦組織等。
項(xiàng)目得到的3D透視圖將被上傳到由杜克大學(xué)的進(jìn)化人類學(xué)家道格·博耶爾(Doug Boyer)創(chuàng)辦的MorphoSource的數(shù)字文獻(xiàn)庫里,這些數(shù)據(jù)將對幾個(gè)研究領(lǐng)域的學(xué)者免費(fèi)開放,包括比較解剖學(xué)、進(jìn)化學(xué)、發(fā)育生物學(xué)和仿生學(xué)。布萊克本表示,“目標(biāo)是讓標(biāo)本離開陳列架,更多地進(jìn)入研究人員的手中,用到大規(guī)模的研究課題中?!?/p>
“很快,研究人員就能輕松獲得所有脊椎動(dòng)物的多樣性結(jié)果,該項(xiàng)目將立即產(chǎn)生效用?!泵绹祭蚀髮W(xué)的脊椎動(dòng)物形態(tài)學(xué)者貝思·布雷納德(Beth Brainerd)表示。
蘇梅爾斯的業(yè)余愛好變成正式工作是從2015年他的實(shí)驗(yàn)室終于擁有CT掃描儀開始的。他偶然發(fā)現(xiàn)了一種提高掃描效率的簡單方法:用酒精浸透的粗棉布把魚獨(dú)立包裝,能防止干燥,裹疊成他所謂的“魚卷餅”,這樣能夠一次掃描多個(gè)標(biāo)本。迄今為止,他已經(jīng)完成了2 400個(gè)不同種類、涉及4 500多個(gè)標(biāo)本。
很多其他研究人員從蘇梅爾斯實(shí)驗(yàn)室的魚類CT掃描結(jié)果中獲益匪淺。美國塔夫茨大學(xué)的卡珊德拉·多納泰利(Cassandra Donatelli)想設(shè)計(jì)一種用于水下勘探的節(jié)能機(jī)器人,她使用3D模型模擬細(xì)長魚類的關(guān)節(jié)和運(yùn)動(dòng)。德國波恩大學(xué)神經(jīng)解剖學(xué)家邁克爾·霍夫曼(Michael Hofmann)正在開展對魚類內(nèi)耳的比較研究,希望弄清它們的聽覺和定位。2017年4月,oVert項(xiàng)目的參與者之一,德州農(nóng)工大學(xué)的魚類館長凱文·康威(Kevin Conway)展示了一種新的喉盤魚,在掃描照片中,那種魚的嘴里長著約2 000顆微小的牙齒,就像牙刷上的刷毛。
蘇梅爾斯實(shí)驗(yàn)室的博士后研究人員馬修·科爾曼(Matthew Kolmann)說,“讓我吃驚的是,幾乎每掃描一個(gè)種類,我們都會(huì)有新的發(fā)現(xiàn)?!彼Ⅳ~的CT掃描結(jié)果顯示,這種魚會(huì)相互在對方骨頭上留下細(xì)細(xì)的咬痕。布萊克本稱這種發(fā)現(xiàn)是“自然歷史附產(chǎn)物”,偶然揭示了動(dòng)物的生活方式。
在研究一些只有一兩件標(biāo)本的罕見生物體的解剖學(xué)特點(diǎn)時(shí),掃描是一種尤其有效的工具,布萊克本補(bǔ)充說,“因?yàn)闆]有人會(huì)想到真的解剖這些生物體標(biāo)本?!保⊕呙杞Y(jié)果還能揭示出一些生物的飲食情況,布萊克本發(fā)現(xiàn)青蛙的胃里有螞蟻、螃蟹甚至還有其他的青蛙。)
在oVert項(xiàng)目中,6所已經(jīng)擁有掃描儀的大學(xué)將掃描機(jī)構(gòu)擁有的標(biāo)本以及來自另外10個(gè)機(jī)構(gòu)的標(biāo)本。4位研究人員負(fù)責(zé)尋找適當(dāng)?shù)镍B類和哺乳動(dòng)物標(biāo)本,不過這是很有挑戰(zhàn)性的工作,因?yàn)檫@些動(dòng)物大都被干燥后制成了陳列標(biāo)本。oVert旨在找到內(nèi)臟完整的液體保存標(biāo)本,這種標(biāo)本僅在爬行動(dòng)物、兩棲動(dòng)物和魚類中比較常見。
康威將負(fù)責(zé)掃描體型巨大的標(biāo)本,預(yù)計(jì)是500個(gè),長度可達(dá)2米,體重可達(dá)250千克。另外,超大的物種將會(huì)使用幼體或胎兒標(biāo)本。從前,他的團(tuán)隊(duì)掃描過雀鱔、鰻魚、北極露脊鯨胎兒,甚至一條2.5米長的大眼沙龜鯊。
注射了碘染料的青蛙顯露出肌肉、腺體、神經(jīng)系統(tǒng)、卵、寄生蟲等
這些標(biāo)本多由博物館收藏,雖然年代久遠(yuǎn),外表可能殘破,但是內(nèi)部構(gòu)造應(yīng)該還是保存完好的。同時(shí)再用碘染料加深標(biāo)本內(nèi)部的對比度。項(xiàng)目的神經(jīng)解剖學(xué)顧問、北卡羅來納州大學(xué)的卡拉·郁帕克(Kara Yopak)預(yù)言,除了其他用途之外,oVert將開啟稀有物種腦部進(jìn)化研究。
促進(jìn)教育和擴(kuò)大研究是oVert的主要目標(biāo)。佛羅里達(dá)自然歷史博物館的脊椎動(dòng)物古生物學(xué)館長布魯斯·麥克法登(Bruce McFadden)喜歡在K-12教育中使用3D模型。以前,他與科學(xué)和藝術(shù)領(lǐng)域的教師們合作,根據(jù)牙齒CT掃描結(jié)果,幫助一群中學(xué)生重建與原物一般大小的史前鯊魚下顎。
科學(xué)家將能夠探索數(shù)千種物種的脊椎形狀和解剖學(xué),博耶爾很興奮,他說:“先將以往我們認(rèn)為正確的解剖學(xué)上的進(jìn)化知識都放到一邊,這次研究的范圍與以往有很大的不同,我們必須用全新的眼光看待?!?/p>
[資料來源:Science][責(zé)任編輯:游 溪]